生物信息学智慧树知到课后章节答案2023年下华东理工大学VIP

生物信息学智慧树知到课后章节答案2023年下华东理工大学华东理工大学

第一章测试

随着人类基因组计划的完成，以下哪些基因组计划是近期启动的计划

A:中国十万人基因组计划B:G10KC:我们所有人计划D:英国十万人基因组计划

答案:中国十万人基因组计划;G10K;我们所有人计划;英国十万人基因组计划

统计学是一门独特学科，不是生物信息学研究工具和手段之一。

A:对B:错

答案:错

生物信息学研究任务之一包括SNP的发现和鉴定，对于疾病机理和药物开发靶点发现具有重要意义。

A:错B:对

答案:对

随着越来越多大规模测序项目的完成，其中最重要的科学使命之一就是要通过比较基因组学方法了解物种的起源和进化过程

A:对B:错

答案:对

高等生物基因组中含有大量的非编码区，以及可能含有大量的外源病毒序列，只有通过生物信息学方法，解析其中功能和区域，为将来可能通过基因组编辑技术进行疾病机制解析提供基础

A:错B:对

答案:对

第二章测试

国际核酸数据库由EMBL，DDBJ和GenBank组成，它们在1988年形成国际核酸数据库联合中心，对数据进行

A:三方共享B:独立分析C:数据同步更新D:数据格式相同

答案:三方共享;数据同步更新;数据格式相同

GenBank对于核酸数据的显示方式有以下几种

A:ASN.1B:FASTAC:GraphD:GBK

答案:ASN.1;FASTA;Graph;GBK

UniprotKB对于生物数据在不同数据库中的链接、调用和标签转换具有非常重要的作用

A:对B:错

答案:对

生物信息学的研究对象中包括各种数据库，比如

A:UniprotB:PDBC:GenBankD:KEGG

答案:Uniprot;PDB;GenBank;KEGG

BLAST是基于局部比对算法，采用渐进式比对方法，对数据分成字段等思路进行的成对比对方法

A:错B:对

答案:对

第三章测试

全局序列比对用于整体相似性程度较低、在较小区域内有局部相似性的两个序列比对。

A:对B:错

答案:错

以下哪些属于蛋白质打分矩阵？

A:PAM矩阵B:遗传密码矩阵C:疏水矩阵D:BLOSUM矩阵

答案:PAM矩阵;遗传密码矩阵;疏水矩阵;BLOSUM矩阵

传统的基于动态规划的局部性比对性算法采用的是精确的序列比对，虽然有着较好的比较结果，但是算法的时间复杂度较高。

A:错B:对

答案:对

在蛋白质数据库中比对蛋白质序列，需要选择一下那种blast模式？

A:tblastnB:blastpC:blastxD:blastn

答案:blastp

多序列比对就是两条以上的序列进行比对，可以用于进化树分析、寻找保守区域等。

A:对B:错

答案:对

第四章测试

基因的预测软件主要有

A:GENOMESCANB:CpGPlotC:PromoterscanD:GENSCAN

答案:GENOMESCAN;CpGPlot;GENSCAN

基因结构的预测是基因组测序后的最重要一个步骤，真核生物和原核生物因为密码子表的不同，方法会有所不同。各种预测方法得到的结果也有所不同

A:对B:错

答案:对

CpG岛指的是一段（）bp长度的DNA序列，G+C含量达到（）以上，与基因的存在相关性达到60-80%以上

A:500，70B:50，50C:200，50D:100，25

答案:200，50

CodonW是密码子偏好性分析软件，以下哪些功能可以用该软件分析

A:有效密码子数B:密码子偏性指数C:最优密码子使用频率D:密码子适应指数

答案:有效密码子数;密码子偏性指数;最优密码子使用频率;密码子适应指数

随着链特异性转录组测序技术等的大量应用，为基因的鉴定提供了一个更为直接的工具和数据库

A:对B:错

答案:对

第五章测试

二代测序技术平台包括

A:454平台B:ABI3730C:IonTorrentD:IlluminaSolexa

答案:454平台;IlluminaSolexa

二代测序技术技术总体思路是统计学（大量重复）、分子生物学（如PCR和连接反应）和微液滴/微流控化学反应

A:对B:错

答案:对

IluminaSolexa对测序对象进行测序时需要采用P5和P7引物进行扩增，其目的是与芯片中植入的寡核苷酸进行配对，从而固定到芯片上，为后续边测序边合成打下良好基础。

A:错B:对

答案:对

IluminaSolexa测序技术的核心步骤是边测序边合成(SBS)，其中每一步加入一种荧光标记以及修饰过的碱基，其目的在于（）：

A:阻断扩增反应B:保护碱基C:加强碱基配对D:增强荧光

答案:阻断扩增反应

IluminaSolexa测序技术的技术缺点是不能测定很长的序列，其根本原因在于PCR扩增掺入碱基时，难以做到所有反应随着时间和测序长度的平齐性。

A:错B:对

答案:对

与IlluminaSolexa相比，454测序技术平台的缺点是荧光试剂成本高，而且会产生相同碱基的连续掺入。

A:对B:错

答案:对

二代测序技术平台因为采用大规模平行测序思路，可以用于统计学分析，因此有很多应用领域

A:ChIP-seqB:RNA-seqC:sRNA-seqD:Tnseq

答案:ChIP-seq;RNA-seq;sRNA-seq;Tnseq

第六章测试

UniProt数据库整合了哪三大数据库资源？

A:Swiss-ProtB:TrEMBLC:KEGGD:PIR-PSD

答案:Swiss-Prot;TrEMBL;PIR-PSD

以下哪项参数无法通过一级序列的理化性质计算获得？

A:相对分子质量B:等电点C:消光系数D:进化关系

答案:进化关系

疏水作用力是蛋白质折叠的主要驱动力，氨基酸亲疏水性等分析为高级结构预测提供参。

A:对B:错

答案:对

PDB数据库中同时包含了利用实验解析和计算模拟的生物大分子的三维结构信息。

A:对B:错

答案:错

蛋白质三维结构预测的方法包括哪些？

A:折叠识别B:序列比对C:从头预测D:同源建模

答案:折叠识别;从头预测;同源建模

利用计算手段预测的蛋白质三维结构能达到很高的准确性，不需要再进行优化了。

A:对B:错

答案:错

以下关于同源建模的说法中，表述错误的是（）？

A:同源建模的理论基础是一级序列相似的蛋白质，其三维结构也相似B:同源建模时只能选择一个结构作为模板来建模C:建模过程中需要对整体结构进行优化并进行合理性检测D:同源建模时需要进行序列比对分析模板序列与目标序列之间的异同

答案:同源建模时只能选择一个结构作为模板来建模

以下分子力场中，不属于非键作用的是（）？

A:氢键相互作用B:静电相互作用C:范德华相互作用D:键的伸缩

答案:键的伸缩

分子对接可以分为哪几种类型？

A:柔性对接B:半刚性对接C:刚性对接D:半柔性对接

答案:柔性对接;刚性对接;半柔性对接

分子动力学模拟可以获得蛋白质在溶液中一段时间内的运动情况，但是消耗计算资源。

A:对B:错

答案:对

第七章测试

代谢物组分析可在代谢靶标分析、代谢物谱分析和代谢指纹分析三个层次上开展。

A:错B:对

答案:对

代谢网络研究所建立的模型可分为计量模型、调控模型和动力学模型三种。

A:对B:错

答案:对

13C代谢通量分析中，测量丙氨酸同位素丰度时，最多能测量出几种同位素异构体的信息？

A:2B:16C:8D:4

答案:8

代谢物组研究的对象是什么？

A:转录物B:内源性化合物C:蛋白D:基因

答案:内源性化合物

下面哪些测量值可作为流平衡分析的约束条件？

A:基因序列B:同位素丰度C:产物生成速率D:蛋白序列

答案:同位素丰度;产物生成速率

下面哪些方法可用在代谢物组学分析中应用？

A:质谱法B:测序法C:核磁共振法D:光谱法

答案:质谱法;核磁共振法;光谱法

常用的代谢物分离方法包括哪些？

A:气相色谱法B:梯度离心法C:液相色谱法D:毛细管电泳法

答案:气相色谱法;液相色谱法;毛细管电泳法

流平衡分析不但考虑了代谢反应的化学计量信息，也包含了代谢反应的调控信息。

A:错B:对

答案:错

全基因组代谢网络模型是基于基因-蛋白-代谢反应三者之间的对应关系建立起来的？

A:对B:错

答案:对

在主成分分析中，两个样品在得分图上的距离越近，它们属于同一类别的可能性就越大。

A:对B:错

答案:对

第八章测试

系统生物学是在系统层面上研究生命现象的一门学科，最基本的模型是网络模型。

A:对B:错

答案:对

以下哪些属于生物网络？

A:蛋白质互作网络B:代谢网络C:基因调控网络D:信号转导网络

答案:蛋白质互作网络;代谢网络;基因调控网络;信号转导网络

在代谢网络中，每一个节点代表一个（）？

A:基因B:代谢物C:酶D:反应

答案:代谢物

网络可以分为有向网络和无向网络，生物网络都是无向网络。

A:对B:错

答案:错

R是生物信息分析中非常重要的工具，可以实现以下哪些功能？

A:生态学数据分析B:聚类分析C:进化树分析D:测序数据分析

答案:生态学数据分析;聚类分析;进化树分析;测序数据分析

R语言中，需要安装软件包时需要调用的命令是（）？

A:install.packages()B:require()C:library()D:help()

答案:install.packages()

利用R可以绘制并分析基因芯片数据的火山图来显示差异基因及p-value。

A:对B:错

答案:对

在生物信息学研究中使用Linux系统的优势在于？

A:Linux系统支持多种平台，并且不断更新B:Linux系统支持集群计算机的使用C:Linux系统是科学研究的通用平台D:Linux系统是免费的

答案:Linux系统支持多种平台，并且不断更新;Linux系统支持集群计算机的使