生物信息学（上海海洋大学）智慧树知到课后章节答案2023年下上海海洋大学VIP

生物信息学（上海海洋大学）智慧树知到课后章节答案2023年下上海海洋大学上海海洋大学

第一章测试

生物信息学涉及到以下哪些学科？

A:生物统计学B:

生物学C:计算机科学D:机械制图

答案:生物统计学;

生物学;计算机科学

生物大分子序列里包含了哪些信息？

A:序列信息B:功能信息C:进化信息D:结构信息

答案:序列信息;功能信息;进化信息;结构信息

中心法则论述的是遗传信息的流动法则，是指生物大分子的序列决定结构，结构决定功能。

A:错B:对

答案:错

数据是经过加工的信息，对我们做判断和决策有用。

A:错B:对

答案:错

以下哪些观点不是达尔文的《物种起源》提出来的？

A:地球上所有的物种有共同的祖先

B:上帝创造万物C:物竞天择，适者生存D:遗传变异是物种进化的基础

答案:上帝创造万物

人类基因组工作草图是什么时候发表的？

A:1991B:2001C:2011D:1981

答案:2001

学好生物信息学最重要的途径是多练习多实践。

A:错B:对

答案:对

世界上最主要的测序公司之一华大基因，是在哪个国家成立的？

A:德国B:美国C:日本D:中国

答案:中国

以下哪位科学家提出了分子钟假说？

A:桑格SangerB:泡林PaulingC:华生WastonD:尼德尔曼Needleman

答案:泡林Pauling

以下哪些组学研究属于生物信息学研究内容？

A:转录组学B:基因组学C:表观组学D:蛋白质组学

答案:转录组学;基因组学;表观组学;蛋白质组学

第二章测试

以下哪个数据库不是NCBI的子数据库？

A:nucleotideB:proteinC:geneD:genecard

答案:genecard

以下哪些数据库属于一级结构数据库？

A:

Genbank

B:PDBC:InterproD:Swiss-Prot

答案:

Genbank

;PDB

在线生物大分子数据库，不可以通过以下哪种方式进行数据查询？

A:序列查询B:批量查询C:关键字查询D:电话查询

答案:电话查询

在对基因进行查询的时候，如果我们查询的是“celldivision[GO]”，我们是通过一下哪种信息对基因进行查询？

A:基因的名字B:基因的功能C:基因的序列编号D:基因相关的疾病

答案:基因的功能

蛋白质的profile描述的是具有多个motif的蛋白质家族中，它们具有哪些Motif，以及这些motif的空间分布

A:错B:对

答案:错

蛋白质三级结构的实验测定方法包括()

A:电子显微镜B:光学显微镜C:核磁共振D:X光衍射

答案:电子显微镜;核磁共振;X光衍射

ENSEMBL中的genetree，收集的是同源基因序列

A:错B:对

答案:对

KEGG包括以下几类子数据库（）

A:chemicalinformationB:systeminformationC:genomicinformationD:

healthinfromation

答案:chemicalinformation;systeminformation;genomicinformation;

healthinfromation

PDB是一个基于功能域进行分类的蛋白质序列数据库。

A:错B:对

答案:错

UniprotKB数据库包括以下哪些数据库（）

A:ENAB:GenBankC:TrEMBLD:Swiss-Prot

答案:TrEMBL;Swiss-Prot

第三章测试

以下哪个蛋白质的理化性质是ProtParam无法提供的？

A:二级结构B:氨基酸组成C:分子量D:等电点

答案:二级结构

蛋白质跨膜区主要是有亲水性氨基酸组成的。

A:错B:对

答案:错

以下哪种结构单元不属于蛋白质的二级结构？

A:无规则卷曲B:beta-折叠C:茎（stem）结构D:alpha-螺旋

答案:茎（stem）结构

PSIPRED是用于蛋白质二级结构预测的软件。

A:对B:错

答案:对

在二级结构预测中，往往要求预测二级结构的置信度要达到5以上，预测的结果才是比较可信的。

A:对B:错

答案:对

以下哪些方法可以用于三级结构预测？

A:归纳法B:引线法（穿线法）C:同源建模法D:从头预测法

答案:引线法（穿线法）;同源建模法;从头预测法

从头预测法是已知蛋白质三维结构预测中计算量最小的一种。

A:错B:对

答案:错

以下哪种蛋白质三维结构预测方法是最准确的？

A:引线法B:从头预测法C:同源建模法D:二级结构法

答案:同源建模法

在同源建模法预测蛋白质三维结构过程中包括以下哪些步骤？

A:计算分子量B:选取合适的模板C:构建三维结构D:目的蛋白质跟蛋白质结构数据库中的蛋白质进行同源序列比对

答案:选取合适的模板;构建三维结构;目的蛋白质跟蛋白质结构数据库中的蛋白质进行同源序列比对

以下哪些结构属于RNA的二级结构？

A:茎状结构（stem）B:beta-折叠C:环状结构(loop）D:alpha-螺旋

答案:茎状结构（stem）;环状结构(loop）

第四章测试

常见的蛋白质得分矩阵有

A:PAM矩阵B:转换颠换矩阵C:等价矩阵D:BLOSUM矩阵

答案:PAM矩阵;BLOSUM矩阵

BLOSUM矩阵。后边的数字越大，就说明他的序列一致性更高，它们的亲缘关系越近，这样的得分矩阵适合应用在亲缘关系较近的蛋白质序列分析中。

A:对B:错

答案:对

以下哪些选项可以体现序列比对的重要意义？

A:序列比对可以用来寻找和确定同源基因，以及帮助确定基因的功能B:序列比对可以用来调查基因的基因的多态性情况C:我们可以通过多个序列的比对，来了解这样一个同源基因家族，他们所具备的共同特征D:我们可以通过同源基因之间相似度的差异，来进行推断它们的亲缘关系，构建这些同源基因演化的历史

答案:序列比对可以用来寻找和确定同源基因，以及帮助确定基因的功能;序列比对可以用来调查基因的基因的多态性情况;我们可以通过多个序列的比对，来了解这样一个同源基因家族，他们所具备的共同特征;我们可以通过同源基因之间相似度的差异，来进行推断它们的亲缘关系，构建这些同源基因演化的历史

进行序列比对需要的两个要素是

A:物种信息B:得分矩阵

C:比对算法D:序列长度

答案:得分矩阵

;比对算法

空位罚分的方法中，哪种是更有生物学意义的罚分方法？

A:每个空位减1分B:仿射罚分C:空位不减分D:线性罚分

答案:仿射罚分

如果我们要研究亲缘关系比较近的一些蛋白质，我们就需要用PAM后面数字()的这种矩阵

A:无所谓

B:小C:大D:200

答案:小

如果查询序列是蛋白质，数据库是核酸序列，应该用哪种BLAST程序？

A:BLASTNB:TBLASTNC:BLASTXD:BLASTP

答案:TBLASTN

第五章测试

分子钟假说是由哪位科学家提出来的？

A:达尔文B:泡林C:木村资生D:桑格

答案:泡林

达尔文的物种起源有哪些重要的论述？

A:物竞天择，适者生存。B:遗传物质是DNAC:上帝创造万物D:世界上所有的生命都起源于一个共同的祖先

答案:物竞天择，适者生存。;世界上所有的生命都起源于一个共同的祖先

系统发育学，就是指研究物种之间计划关系的一门学科。它是通过比较物种的特征的相似度来确定物种之间的亲缘关系。

A:对B:错

答案:对

不同基因的进化速率是一样的。

A:对B:错

答案:对

分子进化的中性学说认为，在生物的演化过程中，主要的突变类型是（）

A:有益突变B:其他几项都不对C:有害突变D:中性突变

答案:中性突变

关于物种树，以下哪些论述是正确的？

A:基于单个同源基因差异而构建的系统发育树B:跟单个基因的进化历史是一致的C:代表的是物种的进化历史D:一般是通过综合多个基因的数据的分析结果而产生的

答案:代表的是物种的进化历史;一般是通过综合多个基因的数据的分析结果而产生的

进化树构建包括以下哪些步骤？

A:选择合适的同源基因序列B:序列比对C:选择合适的方法构建进化树D:评估进化树

答案:选择合适的同源基因序列;序列比对;选择合适的方法构建进化树;评估进化树

根据我们对于基因的适应性进化评估方法，如果一个基因的dn/ds=1，该基因受到哪种选择压力？

A:负选择B:中性进化C:其他选项都不对D:正选择

答案:中性进化

由于环境的变化，原本受到进化压力比较小的基因受到了更大的进化压力。我们称这个基因受到了（）

A:正选择B:强化性选择C:负选择D:放松性选择

答案:强化性选择

第六章测试

第一代测序的发明者是：

A:MorganB:GilbertC:SangerD:Watson

答案:Sanger

下列哪项不是illumina二代测序文库构建的目的：

A:适度扩增使待测文库符合上机浓度要求B:制备适合上机测序长度的片段C:给待测DNA片段添加接头引物D:给待测DNA模板添加带荧光标记的dNTP

答案:给待测DNA模板添加带荧光标记的dNTP

与第二代illumina比较，第三代Pacbio测序技术的优点是：

A:测序费用低B:测序准确度高C:测序读长较长D:测序通量高

答案:测序读长较长

下列哪项测序技术没有用到荧光标记的脱氧核糖核苷酸？

A:第二代illumina测序技术B:第一代测序技术C:第三代Pacbio测序技术D:第三代OxfordNanopore测序技术

答案:第三代OxfordNanopore测序技术

下面哪项全基因组甲基化研究方法在检测前引入了碱基突变：

A:重亚硫酸盐转化全基因组测序法

B:甲基化位点免疫共沉淀技术C:甲基化敏感酶消化法D:甲基化DNA免疫沉淀技术

答案:重亚硫酸盐转化全基因组测序法

10xGenomicsChromium单细胞建库系统无需根据细胞表面标志物对细胞进行分离。

A:对B:错

答案:对

在进行真核mRNA转录组建库时，我们是利用了mRNA哪项特征对其进行捕获：

A:5’帽子结构B:乙酰化修饰C:3’polyA尾D:甲基化修饰

答案:3’polyA尾

SMART技术的核心是利用SMARTScribe逆转录酶具有自动模板转换的功能，在一个反应内就可以完成带有接头序列的第一链cDNA合成

A:错B:对

答案:对

SiRNA的作用方式为与靶基因严格互补配对，而miRNA在植物中通常允许1-2个碱基的错配。

A:对B:错

答案:对

下面关于泛基因组的描述错误的是：

A:非必须基因组与物种特定环境的适应性有关，反应了物种的特异性B:核心基因组与物种的主要表型相关，反应了物种的稳定性C:进行泛基因组研究时需要对每个个体都精确测序D:泛基因组即某一物种全部基因的总称，包括核心基因组和非必须基因组

答案:进行泛基因组研究时需要对每个个体都精确测序

第七章测试

与第一代测序技术比较，第二代测序技术的优势在于_______

A:准确性高B:单碱基费用低C:读长长D:通量高

答案:单碱基费用低;通量高

处理或者计算后的序列一般保存为_______格式

A:FastaB:AB1C:TxtD:Fastq

答案:Fasta

N50长度比平均长度更能反映一个序列组装的实际质量。

A:对B:错

答案:对

K-Mer长度一般取原始测序读长序列的一半。

A:对B:错

答案:错

BUSCO检验用于检测______

A:基因组的保守性和完整性B:基因组的重复序列C:基因组的杂合度D:基因组的大小

答案:基因组的保守性和完整性

基因组大小的差异主要来自______

A:基因外显子的数目B:基因的平均长度C:基因的数量D:重复序列

答案:基因的数量

下面哪个是进行非编码RNA预测的软件_____

A:TrinityB:OrthomclC:InfernalD:RepeatModeler

答案:Infernal

关于基因共线性分析意义的描述，下列哪一项不正确_____

A:判断基因是否受到正选择B:鉴定基因组的多倍体化C:发掘两个物种不同染色体之间的对应关系.D:分析基因的复制

答案:判断基因是否受到正选择

______年开始，国际人类基因组计划启动。

A:1993B:1991C:1990D:1995

答案:1990

草鱼的基因组遗传图谱一共有_____条染色体。

A:32条B:48条C:28条D:24条

答案:24条

水稻的“垃圾DNA”多位于编码基因序列之内。

A:错B:对

答案:错

在不同的物种间，造成基因组大小差异的主要原因来自于基因间隔区。

A:对B:错

答案:对

第八章测试

用于转录组检测的技术包括：

A:转录组测序B:克隆PCRC:微阵列(microarray)技术D:定量PCR

答案:转录组测序;微阵列(microarray)技术

可以用来对转录组测序数据的质量进行检查的工具是：

A