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文档简介
蛋白质的结构与功能第四章StructureandFunctionofProtein一、什么是蛋白质?蛋白质(protein)是由许多氨基酸(aminoacids)通过肽键相连形成的高分子含氮化合物。概述二、蛋白质的生物学重要性1.蛋白质是生物体重要组成成分分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45%,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80%。1)作为生物催化剂(酶)2)代谢调节作用3)免疫保护作用4)物质的转运和存储5)运动与支持作用6)参与细胞间信息传递2.蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能第一节蛋白质的分子组成
TheMolecularComponentofProtein
组成蛋白质的元素主要有C、H、O、N和S。
有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘
。各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数×6.25×1001/16%
蛋白质元素组成的特点
——组成蛋白质的基本单位存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属L-氨基酸(甘氨酸除外)。二、氨基酸H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R非极性疏水性氨基酸极性中性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸(一)氨基酸的分类*20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:甘氨酸
glycine
Gly
G
5.97丙氨酸
alanineAlaA
6.00缬氨酸
valineValV
5.96亮氨酸
leucineLeuL
5.98异亮氨酸
isoleucineIleI
6.02苯丙氨酸
phenylalaninePheF
5.48脯氨酸
prolineProP
6.30非极性疏水性氨基酸色氨酸
tryptophanTryW
5.89丝氨酸
serineSerS
5.68酪氨酸
tyrosineTryY
5.66
半胱氨酸
cysteineCysC
5.07
蛋氨酸
methionine
MetM
5.74天冬酰胺
asparagineAsnN
5.41
谷氨酰胺
glutamineGlnQ
5.65
苏氨酸
threonineThrT5.602.极性中性氨基酸天冬氨酸
asparticacidAspD
2.97谷氨酸
glutamicacidGluE
3.22赖氨酸
lysineLysK
9.74精氨酸
arginineArgR
10.76组氨酸
histidineHisH
7.593.酸性氨基酸4.碱性氨基酸
半胱氨酸+胱氨酸二硫键-HH(四)氨基酸的理化性质1.两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。等电点(isoelectricpoint,pI)
在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性离子阳离子阴离子2.紫外吸收色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm
附近。大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收3.茚三酮反应氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。三、肽*肽键(peptidebond)是由一个氨基酸的
-羧基与另一个氨基酸的
-氨基脱水缩合而形成的化学键。(一)肽(peptide)+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键*肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。*两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽……*肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。*由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。N末端:多肽链中有自由氨基的一端C末端:多肽链中有自由羧基的一端多肽链有两端*多肽链(polypeptidechain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。N末端C末端牛核糖核酸酶(二)几种生物活性肽
1.谷胱甘肽(glutathione,GSH)GSH过氧化物酶H2O22GSH2H2OGSSG
GSH还原酶NADPH+H+NADP+GSH的临床作用:解毒和抗氧化能力
是临床上重要的保肝药物.
第二节蛋白质的分子结构
TheMolecularStructureofProtein蛋白质的分子结构包括
一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)高级结构定义蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。一、蛋白质的一级结构主要的化学键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。二、蛋白质的空间结构蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链(R基团)的构象
。二级结构定义:
主要的化学键:
氢键
(一)蛋白质二级结构肽单元参与肽键的6个原子C
1、C、O、N、H、C
2位于同一平面,C
1和C
2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元
(peptideunit)
。蛋白质二级结构的基本形式
-螺旋(
-helix)
-折叠(
-pleatedsheet)
-转角(
-turn)
无规卷曲(randomcoil)
(1)
-螺旋(2)
-折叠(3)
-转角和无规卷曲
-转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。(二)蛋白质的三级结构疏水键、离子键、氢键和VanderWaals力等。主要的化学键整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。定义亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是氢键和离子键。(三)蛋白质的四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的亚基(subunit)。血红蛋白的四级结构
肌红蛋白与血红蛋白的结构蛋白结构的层次总结三、蛋白质结构与功能的关系TheRelationofStructureandFunctionofProtein镰形红细胞SickleCell一级结构是空间构象的基础(一)蛋白质一级结构与功能的关系牛核糖核酸酶的一级结构二硫键天然状态,有催化活性尿素、β-巯基乙醇去除尿素、β-巯基乙醇非折叠状态,无活性二、蛋白质空间结构与功能的关系第三节蛋白质的理化性质与分离纯化ThePhysicalandChemicalCharactersandSeparationandPurificationofProtein一、蛋白质的两性电离蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。*蛋白质的等电点(isoelectricpoint,pI)当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。二蛋白质的胶体性质蛋白质属于生物大分子之一,分子量可自1万至100万之巨,其分子的直径可达1~100nm,为胶粒范围之内。*蛋白质胶体稳定的因素颗粒表面电荷水化膜+++++++带正电荷的蛋白质--------带负电荷的蛋白质在等电点的蛋白质水化膜++++++++带正电荷的蛋白质--------带负电荷的蛋白质不稳定的蛋白质颗粒酸碱酸碱酸碱脱水作用脱水作用脱水作用溶液中蛋白质的聚沉三、蛋白质的变性、沉淀和凝固*蛋白质的变性(denaturation)在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。造成变性的因素变性的本质——破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。引起蛋白质变性的原因可分为物理和化学因素两类。物理因素可以是加热、加压、乙醇、丙酮、紫外线照射、超声波的作用等;化学因素有强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂十二烷基磺酸钠(SDS)等。应用举例临床医学上,变性因素常被应用来消毒及灭菌。1.加热、加压。2.75%乙醇。3.紫外灯照射4.重金属离子中毒的高蛋白洗胃。5.生物碱试剂检测蛋白尿。此外,低温防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂(如疫苗等)的必要条件。
若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性(renaturation)。天然状态,有催化活性尿素、β-巯基乙醇去除尿素、β-巯基乙醇非折叠状态,无活性*蛋白质沉淀在一定条件下,蛋白疏水侧链暴露在外,肽链融会相互缠绕继而聚集,因而从溶液中析出。变性的蛋白质易于沉淀,有时蛋白质发生沉淀,但并不变性。*蛋白质的凝固作用(proteincoagulation)蛋白质变性后的絮状物加热可变成比较坚固的凝块,此凝块不易再溶于强酸和强碱中。
四、蛋白质的紫外吸收由于蛋白质分子中含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波长处有特征性吸收
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