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文档简介

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第二节基因工程的基本操作程序

苏云金杆菌

与载体拼接

普通棉花

(无抗虫特性)

棉花细胞

抗虫棉

提取

表达Bt基因

导入

Bt基因

重组DNA分子

培育转基因抗虫棉的简要过程

问题探讨

1.目的基因的筛选与获取

2.基因表达载体的构建

目的基因

受体细胞

3.将目的基因导入受体细胞

4.目的基因的检测与鉴定

第一步:目的基因的筛选与获取

什么是基因

基因通常是有遗传效应的DNA片段

基因定义:

基因片段

非基因片段

原核生物的基因结构

非编码区

非编码区

编码区

编码区上游:启动子

编码蛋白质,连续不间断

编码区下游:终止子

真核生物的基因结构

非编码区

编码区

非编码区

外显子:编码蛋白质

内含子:不编码蛋白质

初级转录产物

成熟mRNA

剪接

mRNA

逆转录

cDNA

无剪接过程

第一步:目的基因的筛选与获取

一、目的基因

(1)概念:

用于改变受体细胞性状或获得预期表达产物等的基因;

与生物抗逆性、生产药物、毒物降解和工业用酶等相关的基因。(Bt抗虫蛋白基因)。

主要是编码特定蛋白质的基因

(2)实例:

如何筛选目的基因

用苏云金杆菌制成的生物杀虫剂,广泛用于防治棉花虫害已有多年历史

苏云金杆菌的杀虫作用与Bt基因有关

掌握了Bt基因的序列信息

对Bt基因的表达产物--对Bt抗虫蛋白有了较为深入的了解

Bt基因是培育转基因抗虫棉较为合适的目的基因

二、筛选合适的目的基因

第一步:目的基因的筛选与获取

方法:从相关的已知结构和功能清晰的基因中筛选。

二、筛选合适的目的基因

DNA测序仪

核苷酸序列比对

氨基酸序列比对

米国国家生物信息中心

第一步:目的基因的筛选与获取

随着测序技术的发展,以及序列数据库(如GenBank)、序列比对工具(如BLAST)等的应用,越来越多的基因的结构和功能为人们所知,为科学家找到合适的目的基因提供更多机会和可能。

目的基因如何获取

第一步:目的基因的筛选与获取

三、目的基因的获取

方法:

1.人工合成

2.PCR获取和扩增目的基因

3.构建基因文库(p82)

基因组文库

cDNA文库

基因文库:把某种生物基因DNA通过酶切获得大量DNA片段,然后将这些片段与载体连接,再转入受体菌中,这样整个菌群克隆就包含该生物的全部基因片段,称为基因文库。

PCR技术

第一步:目的基因的筛选与获取

聚合酶链式反应,根据DNA半保留复制的原理,在体外(PCR扩增仪)提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术。

概念:

体外模拟DNA复制,实现快速扩增DNA

PCR扩增仪

第一步:目的基因的筛选与获取

DNA复制所需的基本条件:

参与组分在DNA复制中的作用

解旋酶(体外用高温代替)

DNA母链

4种脱氧核苷酸

DNA聚合酶

引物

提供DNA复制的模板

打开DNA双链

使DNA聚合酶能够从引物的3`端开始连接脱氧核苷酸

合成DNA子链的原料

催化合成DNA子链

DNA聚合酶不能直接发起子链的合成,只能催化单个核苷酸加到3`端而延伸子链

什么是引物?

第一步:目的基因的筛选与获取

PCR反应体系中有哪些必需的物质:

DNA模板

2种引物

原料:

耐高温的DNA聚合酶

Mg+:激活DNA聚合酶

有两条模板链

四种脱氧核苷酸

PCR扩增的过程:

1.目的基因DNA受热变性后解为单链(解旋)

变性

2.引物与单链相应互补序列结合

3.以单链DNA为模板,在DNA聚合酶的作用下延伸,即将四种脱氧核苷酸加到引物的3`端。

复性

延伸

PCR反应过程示意图:

第一轮循环:(每次循环分为变性、复性、和延伸三步。)

变性:解旋

PCR反应过程示意图:

第一轮循环:(每次循环分为变性、复性、和延伸三步。)

复性的过程只有引物与DNA模板链结合吗?

不一定,也存在解开的两条DNA单链的结合,

原因:①引物较短,更容易结合;②引物量多,引物与模板的碰撞结合机会更高。

引物结合概率更高。

PCR反应过程示意图:

第一轮循环:(每次循环分为变性、复性、和延伸三步。)

子链延伸方向从5`端到3`端

第一轮循环的产物作为第二轮反应的模板,经过变性、复性和延伸三步产生第二轮循环的产物。

第二轮循环的产物作为第三轮反应的模板,经过变性、复性和延伸三步产生第三轮循环的产物。

第二轮循环

第三轮循环

指数形式扩增:2n(n代表扩增循环的次数)

PCR反应过程示意图:

PCR扩增形式:

PCR反应过程都在PCR扩增仪中自动完成。

PCR反应过程:变性、复性和延伸

常采用琼脂糖凝胶电泳来鉴定PCR的产物。

如何判断PCR扩增是否成功?

一次成功的PCR扩增应产生与预期大小一致的DNA片段。

Marker

旁栏思考

用PCR可以扩增mRNA吗?

不能,RNA不稳定,不能直接作为模板,需要将mRNA逆转录为cDNA(RT-PCR),然后再进行扩增。

mRNA

逆转录酶

杂交双链

DNA链

mRNA链

核酸酶H

单链DNA

DNA聚合酶

cDNA

一般不可以,游离的DNA片段容易被分解,并且无法进行复制,更不能遗传给下一代。

获得目的基因之后可以直接导入受体细胞吗?

第二步:基因表达载体的构建

(核心)

一、基因表达载体的目的

(1)使目的基因在受体细胞中稳定存在,且可以遗传给下一代;

(2)使目的基因能够在受体细胞中表达和发挥作用。

二、基因表达载体的组成

位置:

功能:

RNA聚合酶识别和结合的部位,驱动基因转录

基因的上游(一段有特殊结构的DNA片段)

人们所需要的基因

位置:

功能:

基因的下游(一段特殊的DNA片断)

终止转录

便于重组DNA分子的筛选和鉴定

三、基因表达载体的构建过程

基因表达载体构建模式图

产生相同末端(同一种限制酶)

培育抗虫棉的简要过程

只使用一种DNA限制酶进行切割(单酶切),会有那些连接情况?

使用2种限制酶(双酶切)同时对目的基因和质粒切割,防止自连环化和随意连接。

载体

目的基因

自连环化

片段间的连接

目的基因自连

质粒自连

目的基因与质粒连接

目的基因与目的基因连接

质粒与质粒连接

2

2’

正向连接

1

2

2’

1’

2

2’

1’

1

思考

反向连接

1’

方法

植物细胞

农杆菌转化法(常用)

花粉管通道法(我国独创)

——显微注射法(p82)

——Ca2+处理法(p82)

第三步:将目的基因导入受体细胞

动物细胞

微生物细胞

花粉管通道法—植物细胞

②在植物授粉后一定时间内,剪去柱头,将DNA溶液滴在花柱切面,使目的基因通过花粉管通道进入胚囊。

①用微量注射器将含目的基因的DNA溶液直接注入子房中;

花粉管通道法导入外源DNA

第三步:将目的基因导入受体细胞

农杆菌转化法示意图

显微注射法—动物细胞

目的基因的表达载体

显微注射

到受精卵中

受精卵发育

获得具有新性状的动物

显微注射技术

①体积大,易操作

②全能性高

第三步:将目的基因导入受体细胞

Ca2+处理法原核细胞

(1)使用Ca2+处理:

可使细胞处于一种能吸收周围环境中DNA分子的生理状态。

(2)过程

Ca2+处理细胞

感受态细胞

表达载体与感受态细胞混合

感受态细胞吸收DNA分子

大肠杆菌细胞

第三步:将目的基因导入受体细胞

感受态

繁殖快,结构简单

大肠杆菌(p82)

检测是否插入目的基因

检测目的基因是否转录

检测目的基因是否翻译

基因表达的过程

生物是否具有新性状

第四步:目的基因的检测和鉴定

分子水平的检测

个体生物学水平的检测

DNA

蛋白质

mRNA

性状

检测目的基因进入受体细胞后,是否稳定维持和表达其遗传特性

目的:

检测内容:

分子水平的检测

(1)基因是否插入(DNA)

(2)目的基因是否转录(mRNA)

方法:

1.PCR技术

2.分子杂交技术

需逆转录为cDNA再进行PCR鉴定

探针

32P

变性

变性

碱基互补配对原则

杂交DNA分子(可检测)

32P

目的DNA

目的RNA

(3)目的基因是否翻译

方法:

抗原-抗体杂交技术

个体生物学水平的检测

抗虫鉴定、抗病鉴定、抗逆鉴定等

转基因生物鉴定方法成功标志

抗虫植物

抗病毒植物

抗盐植物

抗除草剂植物

饲喂害虫

害虫死亡

病毒感染(病毒接种实验)

未出现病斑

盐水浇灌

正常生长

喷洒除草剂

正常生长

第四步:目的基因的检测与鉴定

基因工程的基本操作程序(4个步骤)

第一步:目的基因的筛选和获取

第二步:基因表达载体的构建

第三步:将目的基因导入受体细胞

利用PCR获取和扩增

人工合成;构建基因文库

目的基因、标记基因、启动子、终止子

农杆菌转化法(植物)、显微注射法(动物)、Ca2+处理法(微生物)

分子检测:是否插入、转录、翻译

个体水平:是否具有抗性以及抗性强度等。

核心

DNA片段的扩增及电泳鉴定

1、DNA体外扩增的原理

①PCR利用了DNA热变性的原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合

②PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器,一次PCR一般要经历30次循环

2、DNA片段电泳鉴定的原理

①DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。在电场的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳

②在凝胶中DNA分子的迁移速率与凝胶的浓度、DNA分子的大小和构象等有关

③凝胶中的DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来

一、实验原理:

二、材料用具

DNA片段的扩增及电泳鉴定

PCR仪

微量移液器

电泳装置

4种脱氧核苷酸的等量混合液、2种引物、TaqDNA聚合酶(耐高温)、模板DNA

扩增缓冲液、无菌水、电泳缓冲液、凝胶载样缓冲液、琼脂糖、核酸染料等

微量离心管

电泳槽

电泳仪

PCR反应体系的配方10倍浓缩的扩增缓冲液5ul

20mmol/l的4种脱氧核苷酸的等量混合液1ul

20umol/l的引物I2.5ul

20umol/l的引物II2.5ul

H2O28-33ul

1-5U/ul的TaqDNA聚合酶1-2U

模板DNA5-10ul

总体积50ul

最后加

三、方法步骤

DNA片段的扩增及电泳鉴定

DNA片段的扩增及电泳鉴定

循环程序变性复性延伸

预变性94℃,5min——

30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min

最后一次94℃,1min55℃,30s72℃,1min

5-10min

确保模板DNA完全变性

总延伸:确保所有片段充分延伸

三、方法步骤

与DNA结合,使其在紫外灯下发出荧光

8:凝胶载样缓冲液(内含指示剂)

4:核酸染料:

1.指示电泳进度

溴酚蓝

2.增加PCR产物密度,确保其均匀沉入加样孔内

指示分子大小的标准参照物:

Marker

DNA片段的扩增及电泳鉴定

三、方法步骤

保持试剂最大活性及稳定性

注意2:冰上缓慢融化:

四、注意

DNA片段的扩增及电泳鉴定

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