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文档简介
1基因工程综合性教学实验大肠杆菌碱性磷酸单酯酶基因克隆表达纯化吴海珍王善利赵健俞建瑛张惠展华东理工大学应用生物学系二○○五年一月第一局部桌碱性童磷酸链单酯吉酶基诉因的网定位啄、克驴隆与麻表达要实汽验旁流奸程导图帜碱性抹磷酸镰单脂汗酶基径因在奖染色旺体D帐NA瓣上的咏杂交税定位页――堵So街ut摊he渠rn祖B烧lo狭tt洗in江g酒生凳碱性清磷酸域单脂崇酶基掏因的女体外聚扩增穷――嚷PC慕R扩帆增懒故抹PC供R体棚外扩菠增片扬段的局克隆垮连接芒于T梯-载库体警――虎连接票涝顿连接乳产物红转化沈大肠光杆菌证受体查菌储――理转化跌市施转化士子质姻粒D叠NA诚的抽世提荣――潮快速而法制割备质普粒财树默转化航子的权鉴定柄――蒜限制双性内跟切酶碍酶切缸全鸭目的诉转化挺子D爱NA净的大潜量制科备跌――蛛碱法某抽提扭质粒解DN上A均芽役酶切姐回收遵克隆做的目乓的基喇因片漠段泡――瞒回收笛目的连基因传值候重组劳表达卡型质朴粒的候构建和――亩连接五、转牵化、僚鉴定垄性攻重组雪大肠韵杆菌状目的捕蛋白凶的表显达圾――止蛋白允电泳讯隶实绘验蚕路展线活1王D利NA多的酶登切旺摘要文崭本单瓶元主苹要介辫绍限蓝制性颗核酸里内切止酶的绸各种愧特性层、酶板的保印存方久法和甲使用气注意辨点,管多种似酶联晕合酶豪切的片常用吃策略埋等。冷1.阶1实短验原崭理纸DN宰A重泥组技社术中津的第毒一步效是从慰不同耐来源恰的D另NA拾〔染叉色体康DN很A或艺质粒星DN萝A〕折上将片待克供隆的遍DN插A片舞段特绵异性财切下便,同水时在交载体隆DN棒A分丝子〔胡一般男为质罪粒D取NA侵〕上坚翻开袄相对份应的茅缺口馒,然答后将悦两者衔连接余成重林组D拢NA巡分子候。这搞一特词异性站的切锡割过睡程常军由特蹦定的境限制浑性核史酸内眠切酶餐来完溪成。仅限制辱性核腐酸内蝇切酶社几乎吓存在稿于任呢何一占种原代核细对菌中愧,它律能在率特定至位置杂上催临化双轿链D恐NA堡分子静的断象裂,苹产生嗓相应由的限调制性晃片段娃。早颗在2拖0世趋纪5吊0年贷代初裹微生由物体侮内的控限制拐核修佣饰作拼用就谊已发携现,捐10俘年后币细菌鸦的限喘制和厌修饰防作用予的分辜子机凯制被驶说明帜。以虽大肠共杆菌付为例候,在里K株怠和B原株中脑都含赤有各递自不辱同的伏限制妖――妨修饰鉴系统丧,两杏种不吹同来嘱源的亿-噬产菌体胁〔摆K该和俭B坡〕长劫期寄讽生于米各自夹的宿燕主细昂胞中妖,宿幅主细励胞内瞒的甲愉基化愿酶已盐将其坟染色枯体D缘NA里和噬姐菌体弊DN宫A特暑异性犬的保拉护,受封闭如了自惯身所衔产生族的限行制性做核酸甲内切鼻酶的觉识别答位点葛,故仓它们咱在感咸染相归应的狡宿主盛细胞饥〔K茅株和孙B株盘〕时织DN工A不域被降淡解,妻因此写感染旗频率斩很高仁。当师它们下分别旱感染袍其他晒宿主欠细胞雹时,小由于慎没有捏特异回性的络保护肾作用捐,入溜侵的欢DN收A分肯子被岭宿主岔细胞恶的限歉制性比内切素酶切风割降跌解,喂从而原感染淹频率古急剧忧下降杠,普拜遍能酱低一肥或几理个数吧量极理。这稀一现赵象普辜遍存冶在与午原核图细菌绵中。搂但由杠于宿赔主细删胞内矩的降宜解作府用的舟不完惰全,遮入侵剃的D推NA适分子垄总有沸极少选数能递完整沈保存寨下来漂并得摘以在枝细胞株体内迫复制多,而营且在称复制婆过程剃中被礼宿主饼细胞殃的甲笨基化巴酶所府修饰违。这良修饰吴过的切DN勺A分苍子再吐重新鲁制备贵后导堪入该鼓宿主慧细胞良时,绑感染融频率像又能喊恢复待到原叮来的艇高位爷,即挠限制犯――将修饰阁作用降被解徐除。洒1.羞1.划1限树制性致核酸灶内切碍酶的诵分类特目前协在细挡菌中荡发现赏有6叶00毛多种淋限制连性核藏酸内勉切酶迷,根四据其淹性质次不同咳可分吓为三丸大类弹〔见帅表1级-1户〕。达其中想II响类限窜制性调核酸壶内切滚酶与校其所件对应姐的甲抓基化块酶是绪别离北的,六不属恭同一贡酶分遭子,针而且麦由于吉这类聋酶的杠识别视切割厉位点脆比拟饭专一必,因学此广杜泛用弊于D醉NA故的重佳组实麦验。竿I类互和I个II魔类酶究严格槽地说鸣应该教称为断限制撒――延修饰使酶,药因为原它们骄的限里制性绣核酸牙内切悔活性妹及甲厕基化典活性饼都作缘为亚被基的雹功能摸单位趣,包属含在企同一仿酶分贪子中百。靠表1副-1巡各类羡限制丙性内香切酶庸的特劳性足I类苍酶婶II弟类酶箱II蚂I类皇酶膏酶分蒜子狱三亚轮基双决功能劫酶销内切芒酶和男甲基支化酶露分开族二亚孕基双夕功能区酶却识别脆位点呀二分观非对似称序萝列咐4~退6b边p短烈序列夺,期大多捞数为遍回文美结构买5~喇7b述p非羊对称纤序列厕切割菌位点傻距离颠识别贩位点郑至少济1秩00惨0b膏p,论无特贯异性倚在识看别位欺点中冻或靠柜近识去别位队点乓在识瞧别位辫点下狼游2出4~丧26假bp笛处走限制勒性反射应与蜡甲基盼化反柏应截互斥鲁分开灿的反今应讽同时拦竞争罗限制家作用凳所需稍的辅武因子蔬AT些P、情Mg腔2+旗、劝S-隙腺苷夸甲硫笼氨酸哗Mg甲2+篮AT猫P、藏Mg依2+堤、S材-腺虎苷拖甲硫赚氨酸机〔非勺必需偷〕添DN更A重直组中拾的用楼途劣无箭有福无捕1.驼1.纤2伤II色类限才制性未核酸绞内切乖酶的歉根本杠特性务II序类限极制性怜核酸宋内切母酶是伴Sm塑it渣h等历人于倒19盈68撤年在嫌流感并嗜血侍杆菌伍d型公菌株咳中发塑现的哲。该反类酶瓜是一逐种分杨子量暖较小马的单配体蛋酿白,楚其双粘DN多A的居识别此与切唇割活摇性仅椒需要咱Mg亩2+现,且寨识别身与切卖割位蹄点的挣序列上大都该具有尤严格乏的特逗异性恼,因伏而在态DN多A重遭组实萌验中达广泛卫使用煎。香目前樱已分僻离出礼40压0余兼种I益I类晚限制称性核毁酸内桥切酶定,鉴缺定识艇别及们切割予位点弟的有抛30形0多洽种,同商品堪化的棕酶N券EB煤〔N彩ew雀E哗ng脂la纽nd吐B景io慧la税bs咐〕公街司品框种最滚多,拌达2夫20友余种崇,其贺中在感DN讽A重推组实剧验中泼常用拘的有克20港多种斤。这著些酶译的统锣一命摸名由搜酶来祝源的亿生物查体名谅称缩预写构衫成〔伞见图寇1-惹1〕棕图1撒-1唱限遍制性晃内切疮酶的漠命名腾原那么贤与示世例筒1.重1.艳2.暂1识目别位雅点师II腊类限锄制性掌内切胶酶的请识别辽位点串具有要18塔0拖°现旋转充对称业的回角文结渴构,型常用暂的识顾别序忆列往滑往为蜻6个爽碱基估对,找例如总Hi观nd恒II猜I的亲识别笋序列讨:城其中高一部纺分的相识别盯序列棋某一趟或某理两位症碱基畅并非抚严格拣专一秤,但蹲都在层两种捕碱基坊中具排有可朝替代照性,草这种诞不专煤一性恰并不降影响品内切允酶和编甲基棕化酶保的作纽用位钟点,度只是围增加贤了D颤NA齿分子浮上的巾酶识验别与惩作用资频率验,例鲁如A碑va题I的抖识别挺序列怎就是木典型渣的结肉构:泡 绵有的液酶识见别位茫点为祖4或哗5碱援基对凭,如层Al应uI扇、H饥ae垒II侵I和汇Sa旋u3百AI哑〔见锯图1征-2讨〕等鼻,在电DN寨A上烂的出云现频榴率那么辞较高士,而看象S往au参3A锯I切雄割D督NA秤后产悄生的其是粘鼠性末裤端,场且与振Ba遥mH磨I切低割后花的粘懂性末歼端相床同,滩为大它规模蒙克隆踢提供言了可奸能。皱实际典应用梅中利植用S终au垃3A煤I高缩频现宅象,体结合管DN坡A的逆局部断酶切斧策略凉进行来研究林也是慨常用浮的实妖验手给段。拍图1桶-2慧限拥制性享内切溜酶的笑命名哗原那么类与示饱例作另外插一些絮不常桨见的丘酶识纳别位末点相独对较翻长,滔在D缝NA跨链上滤出现饶频率昂也相社对较壁低,支如F抹se苏I〔土5疫’熊-G岗GC吐CG靠GC艳C-家3谎’旱〕,饿出现瓣频率鲁为1捕/4纺8意=秋1/致65削kb煎。实侄际上帝由于校不同程生物个体的肿DN呀A碱厅基含厘量不脏同,蛛酶的吉识别蹄位点导的分绒布和捉频率袖也不枣同。苏大肠结杆菌驰基因型组中切AT耽含量圈较丰歌富,住所以曲富含觉AT循的识箩别序椅列〔同如D牢ra陕I:骆5他’缺-T顾TT侨AA疯A-插3处’厨;P街sh态BI摘:5四’-移AT摸TA符TT该-3爬’倚;S宇sp蛙I:只5绣’详-A唤AT绳TA堪A-遇3给’诚〕较倡为频殃繁的催出现忘,而岛链霉孤菌基爸因组绳因G特C含庆量高京,相辰应的台富含私GC在碱基音对的扎识别摧序列枪〔N爸ae厕I:炊5秩’次-G蛇CC滋GG度C-覆3昌’藏;S救ma向I:柜5慎’占-C虾CC贯GG辽G-拿3安’冬;S斑ac森II杠:5物’胞-C需CG导CG怖G-靠3婆’厘〕较箱常见塑。照1.绑1.钟2.凝2粘委性末糠端梢限制虎性内馆切酶怪切割寿DN巡A产狸生的纸末端谎根据腿被切录开的拐DN歪A末极端性烟质的井不同旅〔不猪考虑裳碱基鞭序列管〕可切分两刚大类饿:平秧端和勾粘端怒,而详后者屈又可恢分为构3幕’广-O但H突旬出或炉5狭’鉴-P乱突出致两种里,分男布情毫况见四图1增-3谅,故跌DN浓A分收子的积连接挑通常莲发生尖在同疮种限巧制性碗内切屠酶酶呈切后沙的D歪NA喉间。液图1燃-3惹D宇NA辟酶切盯产生闲的三剑种末锁端见实际塔上D如NA岩重组灰应用怖中,蒜由于滔不同狸限内穗酶酶卡切能老产生喷相同屡粘性筛末端川,因逮此D监NA助分子池的连描接可洁发生彼在不臂同限斗内酶踏之间礼,常佛见的笨DN别A分鄙子连湖接情商况见钥图1病-4罚。而吉在重枪组工跑作中滚如没阴有合强适的到酶切雁口产奴生相棵同的垫粘性毒末端萄,那么景可对演酶切谋后的钩突出芹粘性叛末端娘进行别补平拐,采袭用平旗头连武接策计略。钩图1苦-4姑D田NA探粘性锣末端浪的连看接效午果及1.血1.傍2.注3甲考基化猜影响酸大多厨数大拒肠杆匪菌菌腾株中例含有弹Da掀m诉甲基什化酶翼和怪Dc待m嚼甲基杜化酶摇,前并者可嫌以在点GA淋TC历序列翅中腺众嘌呤枕N-判6位距上引幅入甲畜基,春后者体在C尤CA概/T坦GC阁序列亦的第感一个淡胞嘧净啶C酷-5逆位置狮上引堪入甲贫基。选局部壳限制布性内床切酶拿对甲地基化森的D梅NA柿不能守切割何,如萌Fb犯aI消和M镇bo摩I等剩,一溪般生谷物公革司提掩供的浇内切址酶说钩明中植均有徒说明昌。而疾要解嗓除这钓种限悟制修工饰作偶用通探常有番两种君方法吹:〔度1〕晨选用截上述签酶的寨同功绘酶,且如S锈au妨3A喉I,抖DN肤A识亩别切灶割位污点与怨Mb罚oI左相同玩;但音不受抱甲基晶化影假设响;见〔2谁〕利席用甲丰基化谷酶缺正失的耀受体滤细胞暗进行奇DN里A的甩制备生,如辜E.竭co密li粥J鹿M1等10耽和链瞒霉菌饱等,忍前者饼Da肿m稳和甘Dc笛m根甲基桶化酶旁已敲科出,积而后代者细菊胞内御本就械没有泪甲基筒化酶俯,从愁这些敢细胞透中抽菊提的敞DN展A就奶能被恶上述妈酶切悔割。妻1.珍1.艰2.抱4近慢末端全切割肝基因寨工程筹的操态作中刻经常五要对丙DN依A葡片段软进行眉精细庄切割葱,在乓PC蔽R产狂物中贝有些营甚至趋只切梨割一豪个碱芦基对赔。不罗同的旗内切对酶对塑裸露铺的酶要切位肚点不搭能切疗断,叹因此千必需锯在酶命切位皆点外洽侧加聚上一僻个或暗几个地保护漏碱基蛋,表石1-谜2中变列举殊了常轿用的映十五政种内带切酶贝在不吊同保旋护碱年基下顶的切贤割效罩果,玩一般糟保护撑碱基皇大于袋三个让碱基舱对时膏能完旨全切惊割。脉但是深在有胃些P吐CR帽产物献中即谊使保爸护碱耳基大笛于五筝时也参不一舅定能惯被有箱效切辫断,愚这可塞能是马PC决R产恋物纯腥化中走残留夕的杂孔质影趁响酶竟切或量是P顶CR辞产物裂末端盐聚合脾不完品整。街表1况-2梯D裂NA义末端创酶切教位点逮的切以断情猫况情En球zy葛me否末端自碱基梯数销0胆1敢2厨3而Ba颂mH斯I线-械+文+订+株Bg弄lI聪I温-块-递±李+俊Cl夕aI愁-嫁±借+品+冬Ec睁oR饰I争-晨±陵+咳+婆Ec坏oR厉V锹-点+僵+壳+驻Hi污nd社II旺I惧-这-次-掌+征Kp精nI可-娃-历+饺+宴Nc掏oI贤-煌-腰+系+本Ps享tI炸-墨-脚±王+壁Sa栽cI商-柿±害+败+姑Sa伶lI罪+笨+抹+草+板Sm乒aI迟-晒±超+售+岁Sp头hI畜-懂-胀+费+支Xb京aI耽-探±童+间+芹Xh塔oI晚-猜-圈±孙+碧-:苍不能欲切断轻;导±俭不能坟完全孙切断任;讽+唯:完霉全切患断辱1.笛1.鉴3限麻制性央核酸选内切宜酶的脱使用燥限制惊性核仙酸内材切酶劳在基络因工猾程属认常用膀工具继酶,妥主要区用于岂基因鬼物理语图谱哄的绘著制、强基因齐片段善的鉴撇定或并获得扔、用夜于杂窝交的明DN皇A探咸针的扫制备兵等,概而酶川切的夕条件海控制羽那么是墨非常榆重要虹的。卖1.漂1.浆3.技1作灯用条盆件追在D盛NA怪的酶鱼切反确应中渠酶切浑条件仇是酶番切成滔功的屈关键井,主毁要影孩响因脖素有佛:维反响便温度挡放常规粱酶切糖反响罢均向在3站7蔽℃摸进行渣,但即有些馒酶的种最正确窝反响慎温度锻并不匠是此但温度午,如洞Sm振aI废,最衫适反距应温写度为笛30状℃弦,故厦最好脂根据迎所选氧用的某酶确削定反戏应温大度。快当采板用联盛合酶拴切进贱行实艺验时森尤其求要注尤意选我择的足反响师温度晒是否斯都满应足两再者的惨要求坛,如糊果有畜一个炕酶的设最适抹温度附不符铅,建亚议分演步酶高切〔功见1拨.1汗.3粗.3壁〕。售缓冲希体系轰播厂商尚提供乎的性限制纯性核屈酸内直切酶庸有其尸相对受应的供缓冲妹液,敏一般午的缓狡冲液问种类斧为4参-遇10哀种左夫右,诞按盐寇离子狗浓度边可分盟为三怪大类尊:高呆盐、疮中盐电和低君盐。津缓冲敬液配伪制为隆10基×柿的母皆液,也酶切邀时稀森释1篇0倍篮。够常规漂酶切哪中均炊选用意最正确插缓冲右液进暴行酶习切反铸应,耳但联民合酶奶切时森,根鄙据厂联商提政供的纵联合度酶切邀的缓鸣冲液主选择贩表〔妈宝生城物工河程公醉司〕药选择贫缓冲傲液或者采用因万能洁缓冲概液〔名Pr蹈om涛eg摇a〕贞。补反响惑时间般派常规切酶切恨反响腹时间食为1题.5帅小时蜓,但编可根员据酶骂切对光象和坛酶的另用量术将保馋温时气间延执长2爪~3魔小时蚕,有卫时甚欠至可多以过晴夜。传一般弟来说御,在讨DN哥A量析固定肚的前纤提下睡,长蹄时间尝酶切伏所需冈的酶唤量可让适当月减少拼,所浸以在痛大剂贺量酶北切D听NA娱时,盼可以净考虑译酶切雪过夜班。另燥对特修殊实脉验,律如对票基因箩组D司NA双进行共局部邮酶切剑,那么业在酶手量投投入一咸定的绪前提穿下,把减少板反响腊时间特降低辫对D末NA送切割姥的程愚度。贴参加篮酶量滋念在底姐物〔山DN徒A〕持一定梨的条肤件下前,酶笋量投著入越防多那么穿酶切农效果燃越好跌。但调实验得中常环常出慌现酶滴量加乒入过骑多酶淡切效彼果反挺差的孔现象碧,这霞主要融是酶状的储剑存液彩中含德有5拳0%逢的甘弄油,韵但酶支量加腹入过区多,需超过扶酶反省应体务系的蒸10幼%时梳,过话多的活甘油拨抑制隆了限情制性扰内切察酶活响性。卫因此浆,在粱酶切烟反响假设时,兽酶量妖的加族入原四那么:雁不超以过反宴应总躲体积闸的1范0%耀,在咽能切玉开的欠条件罪下加疲入越董少越命好〔忘可减斥少酶周的S酒ta究r活唯性〕凯。贪DN粒A纯哲度张在铁满足广上述恒条件乓下影附响酶炎切效详果的粉主要备因素泄是D熔NA旁的纯灵度,夏DN俭A样随品中屑蛋白阳含量薪过高窑、有品机溶毯剂〔院苯酚煤或氯齐仿〕乒的残境留、幻高浓须度的慨RN叉A等毫。另英外D日NA记浓度搬过高也也会环导致趣酶切静失败惩,一孤般D墨NA怒的质受量浓痒度在马1葵g/抽l禁体系阀中能炕取得哑好的嫌酶切板效果敏。当碌发生娇不明是原因吧的酶奉切失旱败时丙,常齿用的箱解决拐方法的是采担用稀供释酶奥切,倡即将导酶切晌体系垫放大宵〔如牌从1前5建l-荡->涛30沿l芽〕,阿将杂恐质相讲对浓燃度稀方释,累这样肾不需骂多增娘加酶座量就勉能取诱得较果好的骂酶切时效果姻1.楚1.碌3每.2畅酶切推方式但酶切站方式情可分熔为部正分酶撕切与屿完全土酶切罚:瞎局部溜酶切痰建指的轿是同乔一湾DN耻A片反段犬上的犁位点抹有些披被切丧开而瓦另一络些未哨被切弟开,谷此法良主突要用询于基楚因的俯克隆绩。在残某些腐基因初内部察可能幸有此姻酶的陕切点帜,用拿完全滩酶切惨进行仇克隆弟时难灾以得乘到完奶整基辞因。申局部叙酶切初实施仇方沟法:伍a红〕在违不同矿的时鸭间从灵同一喷个酶皮反响鹊管中浩取样旗终止啦反响催,利越用时播间控研制酶场切程测度,久该方忠法比笔较繁修琐,丽不易揪掌握撒得恰简到好蚕处仗;b浸〕固床定酶将切的贺反响殃温度旺和反雪应时助间,炕控制茶酶的禾投入珍量,衔一般呈是在闹反响繁管中等参加杆不等齐量稀亦释的戏酶,觉利用咐不同井酶浓肆度控胖制酶站切程墓度,拼该方积法因量易控基制而庸被广庭泛应国用。丧完全睛酶切葛要适用罗于除弃目的前基因崭克隆今以外灵的绝耕大多悠数D虽NA堆操作山,例码如傍载体事的切宵割,部酶切娘图谱弃的制艇作,声基因叠的鉴谷定与卫DN父A片鄙段的织别离钞等。良1.格1.连3店.蒸3双订酶切面的解黎决方脚法楼在D队NA樱重组汤实验虚中,们经常斥会用贺双酶调切〔绢甚至服是3骗个酶偏切鉴李定〕星鉴定碰重组右子或葬获得纽不同晕粘性灶末端膛的D括NA耳片段煌,而尘在厂剧商提凡供的辉联合某酶切烈缓冲江液表犯中并趋不包撤括所踩有类汪型的孙酶,排即使增提供嫩了蕉“挤万按能缓谨冲液庸〞迹,有价些酶肢的联兴合酶狗切也闯不一怕定能族取得根比拟税好的卫效果医,这乳里介念绍两升种通贝用的逃解决孕方法地:凉分步料酶切部法场对似将进奔行的原两种时酶的忙酶切更采用雪分步劈的方爸法,趟即先警选择符一个既酶,爬采用如此酶往的最倡佳反啊应条共件进端行酶缝切,查酶切伐完全仿的D陶NA驾进行备沉淀裁后再屿溶解恐,然洞后选示用第喊二个药酶进寇行最腹佳反忙应。陶在酶氧切时广,一态般选渠择便务宜的是酶进过行酶兴切沉另淀,稼而后耍在进立行第贪二个名酶的唯酶切挎反响晋。此歌方法豆通用落性较模强,景联合男酶切凶也比犁较完咱全,衫但较巩耗时谨,而衰且D卧NA扇在沉品淀时下后有葡局部愤损失佩,要缸求开侨始时夜DN熊A的配投入花量要效比拟储高。恋同步不酶切戏法触取毯两种盆酶的降最正确等缓冲箭液各虽50究%加植入到牢酶切答反响起体系组中,旱并同乒时加左入两齐种酶迅进行样反响本。特甲别是殿对不版同厂菜商提智供的火酶进万行联毁合酶泳切时游,即站可节纺约时摩间也饺可取涨得比振较好菊的酶醋切效锄果。消1.椅1.兴3闭.轮4酶快切反而应设粒计棒在进反行酶故切反飘应时仅,首嗓先要亡确定统需切关割的采DN坚A量仅,根泄据D幼NA方的到量确贷定总夜反响史体系宝和酶泽量〔俯最多搂占1秤/1忆0〕挽,一骆般体抛系如辉下:伍to兰ta洞l(堆l)寿芦 背dd闸H播2邪O(嫩l)危 申10狐×列Bu脑ff丝er胃(郊l)毁 消En她zy嫁me誉(猎l)绞 俭DN份A(厦50吴ng巴/锐l)夸20侵股 矩14骗.5枝 铁2窜 畅0.唤5愉 猜3事一般而较好莲的酶凉切体坟系D袄NA毒的投族入量劳不高款于1甩.5泛g/吉50蜻l,谊当D刊NA伞的投谊入量嫁为1下.5挎g/棍20辱l时宣酶切喘将发元生困亩难。扛加样掌顺序公:水蜘--仍>缓铸冲液佳--凶>D国NA肚--菠>酶朋。各补组分酸加完碍后要缺混合躺均匀幻,并筋用离泽心机绩低转洋速将后溶液译离心猎至管仁底。帝1.亡1.服3哈.宗4酶供切失吹败的锁原因躁及处茂理办西法阀酶切第失败股主要蔑表现陕为两猾方面版:贵不完吴全酶纠切甚命至是榨DN绘A基摸本未核发生惕酶切麻;主现要原织因有烘:a勿〕缓策冲体锡系不折适宜挪,可例进行丝重新盾酶切乓;b音〕酶纸量加炉入过备多而捆导致岛甘油凑抑制垮酶活钉,可菌将反愿应体榆系适墙当稀弱释;纯c〕挺DN枯A样稿品杂件质含幅量高凑,可掉采用户稀释集酶切伍或将撞DN亭A样吩品重扩新抽培提后弄酶切侨DN钢A被坝降解蒸〔不墓成带姑状〕却;主山要原速因是仇DN即A样哲品中伤含有渐痕量性的D搭NA凭酶,吴建议迹重新授抽提细除去弯DN哭A酶搏。肃1.曲2试基剂与姿器材卫1.摊试弯剂递 堵〔1库〕常那用的天限制星性内丸切酶埋 捎〔2叉〕酶锦切缓娱冲液盐,购罗酶时洞附碧 融〔3稍〕无沃菌双壮蒸水症 笑〔4乳〕D勒NA伟样品锦2.昼器兔材宋 帖〔1艇〕e供pp瓣en撇do毕rf孕管猛 类〔2烦〕枪廉头江 沟〔3末〕恒萍温水臂浴增 赔〔4背〕移茄液器 升1.牺3实墓验步贸骤么2末韵DN律A的碑凝胶珠电泳料摘要阻始本单印元主般要介厚绍D酷NA呈电泳判的基病本原冶理及黄各种井影响脆因素础,学纹习制惭胶,臂电泳浓等基讨本分第析技育术。怨2.哈1箭实验析原理休DN亏A电茶泳是堂基因赠工程汉中最感根本繁的技恢术,界DN斗A制当备及舍浓度宿测定距、目衰的D跑NA嗓片段炊的分料离,遇重组拌子的抗酶切苏鉴定估等均森需要割电泳剪完成暗。根恢据分石离的迁DN愁A大义小及共类型准的不普同,蹈DN从A电差泳主欲要分拘两类抚:呈〔1坡〕聚甩丙烯积酰胺捕凝胶杀电泳均董适合怒别离锅1庸kb跳以下舅的片露段,顿最高饥分辨粒率可皱达1版bp貌,也那用于兴别离舟寡核寺苷酸归,在类引物愁的纯究化中别也常晨用此娃中凝锅胶进绝行纯姥化,勇也称孩PA鸡GE少纯化苍。婆〔2拍〕琼桌脂糖吴凝胶坏电泳神静可分覆离的殖DN易A片沈段大吐小因匪胶浓懂度的墨不同拍而异律,胶漆浓度奴为择0.宏5申~0盟.柳6%怕的凝掀胶可委以分傻离的押DN嘴A片受段范同围为疤20片bp魔~5惕0付kb承。电态泳结泳果用译溴化迟乙锭销〔E限B〕棵染色加后可趟直接慨在紫艺外下牵观察踪,并符且可右观察哑的D吸NA液条带丙浓度接为纳祥克级怠,而踢且整麦个过灾程一较般1棉小时厉即可兵完成饺。由短于该戴方法逼操作歪的简涂便和州快速喉,在垮基因就工程趣中较吐常用叮。曲2避.1直.1稳琼震脂糖礼凝胶诸琼脂国糖是得从琼诊脂中式别离遇得到既,由笔1,专3连互接的缎吡喃冤型换-D长-奔半乳扛糖和抗1,韵4连膊接的全3,总6脱潮水吡烈喃型刻阿赔-L司-较半乳猴糖组兔成,霸形成砍相对逆分子裂量为旅10休4傍~1跌0劲5扔的长挨链。桨琼脂袋糖加炮热溶善解后拆分子赌呈随串机线演团状懒分布未,当铺温度僵降低挣时链妖间糖信分子番上的多羟基亲通过唉氢键江作用凭相连并接,茎形成院孔径蒸结构肌,而盼随着鲁琼脂磨糖浓坡度不米同形五成不勤同大佩小的眨孔径友。表辈2超-1需给出泊了不诊同浓额度凝亿胶对鸽DN险A片拉段的爽线性你别离战范围达。豆表2蜡-1露不同轨类型奔琼脂乓糖分陷离D链NA侮片段歌大小将的范摊围偿琼脂胃糖/认%啦标准晃高强穷度额低熔浆点断低粘滚度低奔熔点器0.姥3张0.喷5眠70的0b挽p~摆25锐kb污0.毙8眠50捐0b棕p~皱15未kb姑80渐0b仗p~聪10致kb士80宏0b宪p~头10舰kb蒜1.郊0秒25寿0b诚p~茅12仅kb糕40切0b圈p~艺8k灿b奶40虏0b再p~使8k蝶b输1.晃2亏15偿0b需p~叫6k泼b奉30乓0b告p~王7k毛b锄3凡00财bp龄~7膜kb悠1.栋5辨80刘bp近~4茄kb顽20献0b绪p~转4k埋b轧20秩0b敏p~臂4k透b盾2.狠0夹10贵0b模p~罪3k屑b杯10飘0b府p~社3k仇b印3.薪0暮50刚0b劈p~葱1k窝b腰50隶0b隙p~习1k泼b族4.慨0浓10车0b刷p~经50蒜0b延p励6.窃0腥10协bp获~1垂00宜bp锤由于斤琼脂抚糖凝撒胶是吸通过电氢键孤的作厘用,喇因此算过酸谅或过玻碱等梢破坏江氢键挤形成学的方夜法常夕用于浙凝胶展的再阻溶化医,象桑Na食C翼l景O饮4斯能用默于凝细胶的继裂解吉,一扔般的丝凝胶冒回收验试剂叨盒利旨用的烘也是鸦这一宅原理骄。堡随着嫂实验租技术共的发荡展,偷也针烤对不眼同用龟途开唱发了舌各种扔类型辨的琼忙脂糖吼凝胶值:〔魔1〕妥低熔塑点琼汽脂糖驴凝胶斜,用高于D绩NA舒片段屠的回路收,成且由貌于该赴种凝妙胶中慌无抑厉制酶饭,可事在胶岛中进激行酶教切、另连接某等;榆〔2绕〕高席熔点贷凝胶旁,可租别离阵小于立1塑kb据的D退NA抹片段细,专贴用于熊PC伍R产执物的轿分析稀;〔恰3〕合快速狱凝胶彻,电嫁泳速弄度比景普通堵凝胶冲中快忧一倍吸,可附节省诱实验格时间择;〔裁4〕秃??锦?隆,适味用于皱DN社A大从片段烛的分寻离。到〔5贸〕其衰它类寄型。茧各生胶产商届还开泛发很材多类展型的葬凝胶准,可傅根据迹实验利要求魔选择围不同秒类型吊的,神选择锤原那么满是考普虑合扒适的歼机械店强度殖和熔祖点。声2隐.1婚.2让D夕NA顾电泳性影响谁因素烂DN食A为最碱性骄物质员,在晨电泳恩〔缓上冲液布pH康=甩8〕夺时带扒负电邻荷,济在一歉定的宗电场嘉力作泡用下例向正诸极泳猴动。男而D城NA高链上杀的负术电荷查伴随固着D嫂NA免分子亩量的举增加僵而增秒加,勤荷质腹比是私一常际数,鄙故电阅泳中辟DN厦A的因别离梢类似阿分子乓筛效拜应。志电泳创中影顿响D堆NA丈分子初泳动年的因无素很败多,培主要堡分两孩方面恐:D男NA誓分子献特性键和电暂泳条垮件。鼓DN肾A分握子大洲小闭D炎NA数分子扭越大拆在胶暴中的窜摩擦忽阻力砍就越免大,盯泳动箭也越滔慢,告迁移课速率糟与线话状D堪NA税分子婆质量波的对脚数值祸成反宅比。雀DN刺A分精子构焦型侄对除于质尊粒D危NA腿分子棋即使涂具有塔相同被分子延质量铅,因逐构型术不同勾也会摧造成柱电泳融时受暗到的语阻力齿不同良,最努终造关成泳割动速偷率的蒜不同连。常苹规电琴泳中出质粒渴DN窜A分皆子的旧3种骗构型揭泳动扩速率调:超俭螺旋捷最快值、线星状分补子次粒之,瓶开环灭分子酷最慢制。脊不同嚼的胶睬浓度览暑对于肺同种茶DN瘦A分瑞子胶啦浓度计越高锹,电喇泳速锋率越乐慢。冤不同屡胶浓夏度对抢于D犬NA永片段允呈线程性关捡系有营所区似别,趴浓度坐较稀阅的胶股线性桃范围绣较宽恩,而赌浓的辰胶对个小分舞子D服NA督片段纲呈现危较好买的线学性关星系。膏所以狼常规亿实验诱中对膝于小柏片段桑DN嚷A分挑子的娱别离杜采用暗高浓口度的景胶分鹊离〔扇有时检甚至徐用2死%的返凝胶充〕,辫而对贺于分链离大味片段予那么用芒低浓闻度的逗凝胶宰。舰电场肉强度移刑电泳匪时为宜了尽债快得羊到实使验结极果,圈所用票的电抗场强盛度约物为5饼V/捕cm抄,这慢样的性场强浴下虽丝能得姓到结班果,讽但分爪辨率犹不高品。在屠精确亭测定惯DN赔A分旅子大劲小时耕,应伸降低坝电压猫至1叹V/诊cm摇。电喇场强胖度偏雹高时什电泳游别离蝇的线萄性范方围会菊变窄饼,电郑压过瞧高时市也会效由于宇电泳泽中产疑生的编大量浴热量甜导致眨DN辩A片锣段的半降解寇。实活验中早要根饰据需肃要选形择合只适电笋压,管如对饼于D证NA忍大片富段的俩别离币可适戚中选霞择较醉低电竟压进盲行〔携在S架ou亦th茧er踢n掩杂交刷中的筛DN堂A电块泳〕委,避们免托筝尾现唯象的浑产生蜂;而健对于继小分口子D参NA摔,由秀于其穿在凝应胶中白的快吐速扩乎散会旺导致请条带明模糊漂,可裙选用术相对救较高策的电怀泳以治缩短塔电泳可时间姓。睛溴化雾乙锭瘦仍简称渠EB向,电岁泳中厨的染胡色剂徐,具趁有扁叉平结尊构,黄能嵌炒入到医DN倍A碱俘基对亦间,自对线触状分牧子与狐开环柿分子据影响抗较小央而对途超螺称旋态罚的分熔子影符响较叨大。贡当D袋NA帮分子袜中嵌拴入的卡EB凑分子己逐渐滋增多孕时,葱原来喇为负勒超螺浇旋状仰态的脖分子塌开始腰向共渔价闭档合环句状转考变,辱电泳妙迁移晓速度骨由快御变慢慈;当似嵌入息的E振B分炕子进耕一步蛇增加帖时,填DN臣A分仪子由狱共价围闭合续环状伯向正之超螺蝶旋状梯态转队变,各这时仆电泳澡迁移悲速率励又由忆慢变事快。这这个量临界耽点的盐游离素EB弹质量影浓度顶为0种.1系缘g/石ml畏~0摇.5楼捆g/早ml庭,即白电泳撒时所叹加的榆浓度腾。因雪此一价般电鉴泳可畅以忽赵略此尘因素兔,而政对于冒特殊部电泳置,消询除此捉因素精影响嚷可采烧用电闯泳后查染色范。滋电泳须缓冲投液合目造前有灵3种裙缓冲晚液适豆用于艰天然也双链疯DN敌A的张电泳嚼:T贡AE萄、T纸BE舌和T瞧PE段,其帝组成叛及特羞点见趴表酸2.趴2装。一牙般常纽用的鞋DN扒A电肤泳选犬用T瓦AE始较多释,其换电泳姥时间瑞较快凳,而婆且成肥本比松较低工,但纸是其归缓冲主容量连较低浅,需锋经常碑更换勺电泳群液。怖表2侦.2复常用榨DN嫩A电疤泳缓谢冲液荷缓冲辨液医存储犬液组棋成成懂份/宏L丰特点读及用依途畜TA厦E喘50慨×睡双链钻DN序A分拢子的刘泳动什速率棋比另申两者读快1户0戏%痒24悲2g怪Tr钓is蛾超螺脸旋在曾其中端电泳作时更割符合阴实际显分子球质量重57呢.1哨ml楚冰离乙酸跑回收沙DN惯A片妄段时刺首选庸,大讲片段敬别离料效果溉好铸10栗0m祝l霜0.竞5m垫ol积/L宗E匆DT推A即(p容H8铜.0仙)酸缓冲挠容量惑小,择过夜季电泳碑不可恭选用牌TB型E拾5释×管小片孩段〔荐<1球kb色〕分瓜离效黎果好说54惜gT刻ri汤s乒回收听效率声差而葵不宜斤用于浊回收角电泳快27胞.5偿硼酸填缓冲薯容量零大,敌过夜嘴电泳尺适合仙20瓣ml腐0步.5寸mo盘l/摆L寒ED意TA消(置pH属8.膝0)忠TP孔E牙1计0宅×丢磷酸玩盐在外乙醇序作用谈下析攻出,与也不灿适合慌回收殊电泳虾10剩8g耕T刑ri滩s消缓冲句容量疫大,雨过夜稼电泳爽适合荷15酷.5碌ml疑磷革酸翁(8价5%表,1戴.6葛79拖g/绢ml终)难40稠ml街0雪.5送mo遇l/侍L运ED脆TA稻(匪pH百8.饭0)梯2踏.1吧.3碑D稀NA畅电泳滑上样优缓冲舰液鸡电泳驱中D庄NA壁点样势前必占须加疮入一风定量碍的上定样缓馅冲液组,主钱要作矮用如吴下:秧螯合灶Mg物2+蚊,防舅止电标泳过秆程中倒DN宽A被授降解荒,一桑般上株样缓遍冲液阳中含京10坏mm殃ol涉/l掏的E乡DT承A。乓增加晕样品克密度舌以保紫证D敬NA壤沉入押加样筐孔内声,一莫般上趣样缓稀冲液无中加慢入一捡定浓句度的碌甘油距或蔗滥糖,鱼这样充可以躺增加火样品隔的比斑重。接而在嫂大片炭段电看泳中晒采用决Fi辈co豪ll迷〔聚瑞蔗糖挖〕,参可减欠少D衬NA废条带触的弯浴曲和姑托尾宁现象布。嫁指示摄剂监向测电绣泳的侧行进晃过程屡,一吉般加待入泳嘉动速睛率较直快的妄溴酚唯蓝指顺示电鬼泳的眨前沿砍,它乌的速花率约登与3紧00疫bp纠的线府状双塘链D兴NA蛮相同脸。割目前某厂商闪提供芬的限活制性跨内切萌酶中课都有飘赠送悠的上响样缓索冲液澡,一钱般为海10萌×典上样艇缓冲特液,去DN保A样堡品中丧仅需绩参加炼1/偶10篇的量承即可询,加柏入过袭多的夕上样疮缓冲石液会容造成云电泳岸轻微腊的托菊尾现颠象。场2休.1且.4怎D性NA皱电泳伞上样许量的弦控制壮在分桨析性象电泳杏中,衫一般顺样品歪投入迟量达口50匀~1辩00谢ng外/带庆即可忘观察嘱到清吴晰结凝果,夏而对微于珍中贵D更NA遮样品截那么上渠样量暮达电征泳的克最低要分辨午率5洋~1跌0n借g/粒带也访可。筐而对芹于一恒定量施的D捐NA键,当挂电泳溪时采晃用较宵薄的定梳子更制胶贿,那么喷电泳是时D疫NA堆条带嗽相对箭较窄应,观秆察较挖清晰影;而揪随着赛电泳术时间奇的延率长,嫁由于酒DN凉A分伸子本茄身有棍一定帅的扩线散,绵电泳宰条带急也会魂变浅环。对罢于染所色体碌DN弯A的摇酶切甚片段哲包含奸各种慧大小兴的条垮带,路上样龙量即衡使超腥过1悟0迟g条灯带也四不会廊托尾寇,而叙单一糕条带炼〔>裹10仪k订b〕季当上展样量耐超过鉴20岩0n慨g就尚有可顷能产杰生托称尾现左象。抽2苍.1班.5夕D哈NA同电泳圾的标奋准分恰子量汉目前栏各厂漂商开照发了弯各种背类型慈的标卧准分乳子量杠,有朵广泛葛用于蕉PC符R产播物鉴颈定的湖小分鸦子M客ar竿ke巴r,灵也有羊常规独用的贷大分错子M超ar延ke巨r,峡图2傍-1搁为T竞AK己AR烂A公含司提补供的穿DN激A标警准分炕子量袖电泳祥〔示情意〕剧图。埋数任乖图2泰-1伤常禽用的轰DN喊A标肆准分荒子量宾电泳妙图患2.饺2革试剂叠与器钳材购1.尿试住剂勒 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