演示文稿蛋白质二级结构预测

（优选）蛋白质二级结构预测本文档共28页；当前第1页；编辑于星期一\17点27分3.4蛋白质二级结构预测164预测目的：看一看所提交的蛋白质序列在哪里会形成α-螺旋和β-折叠？现阶段：准确率不高。本文档共28页；当前第2页；编辑于星期一\17点27分3.4.1SOPMA网址：

2)Clickhere.1)Pasteyoursequencehere.本文档共28页；当前第3页；编辑于星期一\17点27分Example3-23对下面的蛋白质序列做二级结构预测分析MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ本文档共28页；当前第4页；编辑于星期一\17点27分ResultofSOPMA(1/2)本文档共28页；当前第5页；编辑于星期一\17点27分ResultofSOPMA(2/2)本文档共28页；当前第6页；编辑于星期一\17点27分3.4.2PredictProtein(1/6)166网址：

Clickhere本文档共28页；当前第7页；编辑于星期一\17点27分PredictProtein(2/6)8879705988797059ShengwuJishuThenclickhere本文档共28页；当前第8页；编辑于星期一\17点27分PredictProtein(3/6)Clickhere本文档共28页；当前第9页；编辑于星期一\17点27分PredictProtein(4/6)88797059Thenclickhere本文档共28页；当前第10页；编辑于星期一\17点27分PredictProtein(5/6)Clickhere本文档共28页；当前第11页；编辑于星期一\17点27分PredictProtein(6/6)Study1Thenclickhere.Pasteyoursequencehere.本文档共28页；当前第12页；编辑于星期一\17点27分Example3-24165对下面的序列进行二级结构预测分析。MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ本文档共28页；当前第13页；编辑于星期一\17点27分Wait...(about5minutes)Clickhere本文档共28页；当前第14页；编辑于星期一\17点27分Toreceiveyouremail将该网址复制后粘贴到网页浏览器中打开本文档共28页；当前第15页；编辑于星期一\17点27分预测结果目录本文档共28页；当前第16页；编辑于星期一\17点27分图3.87对序列进行PROSITE搜索蛋白激酶C磷酸化位点S/T-R/K酪蛋白激酶II磷酸化位点S/T--D/E酪氨酸激酶磷酸化位点十四烷酰化位点本文档共28页；当前第17页；编辑于星期一\17点27分图3.88SEG搜索的低复杂度序列是指编码这些氨基酸的DNA序列为低复杂度序列本文档共28页；当前第18页；编辑于星期一\17点27分图3.89ProDom搜索结果本文档共28页；当前第19页；编辑于星期一\17点27分PSI-BLAST搜索结果本文档共28页；当前第20页；编辑于星期一\17点27分图3.90以MSF格式显示比对(1/2)本文档共28页；当前第21页；编辑于星期一\17点27分图3.90以MSF格式显示比对(2/2)本文档共28页；当前第22页；编辑于星期一\17点27分图3.91PROF预测结果（普通）

AA:

氨基酸OBS_sec:

二级结构的观测值PROF_sec:

预测的二级结构Rel_sec:

预测二级结构的可信度SUB_sec:

预测的二级结构的集合H:

螺旋E:

折叠L:

随机卷曲O_3_acc:

相对亲水表面的观测值P_3_acc:

预测的相对亲水表面(b

=0~9%,

i=9%~36%,

e=36%~100%)Rel_acc:

预测亲水表面的可信度SUB_sec:

预测的亲水表面的集合本文档共28页；当前第23页；编辑于星期一\17点27分PROF预测结果（详细）

本文档共28页；当前第24页；编辑于星期一\17点27分图3.92球蛋白预测本文档共28页；当前第25页；编辑于星期一\17点27分Practice把刚才课堂上讲的内容练习一遍。本文档共28页；当前第26页；编辑于星期一\17点27分SummarySOPMAPredict