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文档简介
一、DNA的复制1、DNA聚合酶原核生物中的DNA聚合酶,目前已发现的有3种,即DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ш。实际在DNA复制中起主要作用的是DNA聚合酶Ш;DNA聚合酶Ⅰ主要与DNA的损伤修复有关;DNA聚合酶Ⅱ的作用还不十分清楚。真核生物的DNA聚合酶也有3种,分别为α、β、γ,其中,DNA聚合酶α在DNA复制中起作用,DNA聚合酶β在DNA损伤修复中起作用,DNA聚合酶γ的作用不详。第十二章遗传信息的复制和表达2、DNA复制过程DNA的复制,首先要解开双链,形成局部单链,然后才能以单链为模板,以细胞核中游离的核苷酸为原料,复制新的DNA。复制方式为半保留复制。DNA的半保留复制:在DNA复制过程中,各以双螺旋DNA的其中一条链为模板,新生的互补链和母链构成子代DNA分子,这种复制方式叫半保留复制。(1)原核生物的DNA复制(环状DNA)①
DNA解旋主要需要:单链结合蛋白(SSB蛋白):使单链比较稳定,便于复制进行DNA解链酶:水解ATP,使DNA双链解开解旋过程:双链DNA拓朴异构酶Ⅰ超螺旋DNA解链酶局部解开双链较稳定的单链SSB蛋白②
冈崎片段和半不连续复制这种复制方式叫半不连续复制,简单地说,它是指先导链的连续复制和滞后链的不连续复制。DNA聚合酶Ш只能从5´3´方向合成核苷酸链。DNA双链解开后,一条链是3´5´方向,以这条链为模板,可以从5´3´连续合成新的DNA链,这条先合成的链叫先导链。但以另一条5´3´方向的链为模板的话,DNA聚合酶Ш就无法从3´5´方向连续合成新链。实际上,DNA聚合酶Ш是先从5´3´方向合成许多小片段,称冈崎片段,然后再由DNA连接酶把这些片段连成一条完整的链。这条新合成的链叫滞后链。③
复制的引发和终止先导链和滞后链的复制,都不能直接由DNA聚合酶来合成,而需要RNA引物。先导链的RNA引物由RNA聚合酶合成,然后在DNA聚合酶Ш的作用下,通过碱基互补配对,合成新的DNA链。而滞后链的RNA引物由引发体形成,然后由DNA聚合酶Ш合成冈崎片段。冈崎片段形成后,RNA酶H切除RNA引物,并由DNA聚合酶Ⅰ填补缺口,再由DNA连接酶将冈崎片段连成一条完整的链。复制的总过程:双链DNA拓朴异构酶Ⅰ超螺旋DNA解链酶单链DNA(与SSB蛋白结合)RNA聚合酶RNA引物DNA聚合酶ШDNA新链(先导链)引发体RNA引物DNA聚合酶Ш冈崎片段RNA酶HRNA引物降解DNA聚合酶Ⅰ补齐缺口DNA新链(滞后链)DNA连接酶(2)真核生物和原核生物DNA复制的区别与联系联系:均为半保留复制和半不连续复制,复制过程及复制过程中所需要的酶都相似。区别:①真核生物的DNA有多个复制起点,而原核生物只有一个复制起点。(真核生物)(原核生物)
②真核生物的DNA只有在第一次复制完成后才能开始第二次复制,而原核生物在第一次复制尚未完成时即可进行第二次复制。二、DNA与Pr合成DNA指导Pr的合成,要经过转录和翻译2个阶段,即DNA先指导合成mRNA,然后再由mRNA指导Pr合成。1、转录概念:以DNA中的一条链为模板,根据碱基互补配对原则,合成mRNA,并把DNA上的遗传信息传给mRNA,这个过程叫转录。在转录时,双链DNA中只有1条链用来指导mRNA的合成,因此就有了编码链和反义链之分。碱基序列除U变成T外,其余和mRNA相同的DNA链。碱基序列与mRNA互补的DNA链,它是mRNA合成的模板。编码链:反义链:(1)RNA聚合酶(RNApol)①原核生物的RNApol识别模板链和转录起始位点2个α亚基1个β亚基1个β´亚基催化转录过程全酶σ因子:核心酶②真核生物的RNApolⅠ:合成rRNAⅡ:合成hnRNA(mRNA前体)Ш:合成tRNA、5SrRNA(2)启动子原核生物的启动子包括3个部分:①
Pribnow框(-10序列)一般为TATAAT,是RNApol的牢固结合位点。②Sextama框(-35序列)一般为TTGACA,是RNApol的初始结合位点,决定启动子的强弱。③
CAP位点位于-35序列的上游,是启动子上与CAP-cAMP复合物结合的位点。(CAP是指cAMP的受体Pr)当CAP-cAMP复合物结合到CAP位点上之后,可使附近的G-C碱基对稳定性降低,并促进-10序列解开双链,有利于转录的进行。CAP位点-35-10+1+20mRNA真核生物RNApolⅡ的启动子包括4个部分:①帽子位点:是转录的起始位点,一般为A②
TATA框:-25序列(相当于原核生物的-10序列),一般为TATAATAAT功能与DNA双链的解开有关决定转录起始位置(缺乏时,转录从多个位点开始)③
CAAT框:-75序列(相当于原核生物的-35序列),一般为GGGTCAATCT功能与RNApol的结合有关控制着起始的频率④增强子(促进转录进行)特点:具有远距离效应,无方向性;具有组织特异性和细胞特异性(3)转录的起始和延伸(以原核生物为例)σ因子识别起始位点全酶与-35序列结合封闭的启动子复合物(二元复合物,含RNApol、DNA)复合物由-35向-10移动,使-10序列成为单链开放的启动子复合物(二元复合物,含RNApol、DNA)复合物移到+1,β亚基催化2个核苷酸形成一个3´-5´磷酸二酯键形成三元复合物(含RNApol、DNA、mRNA)σ因子脱离复合物继续移动,mRNA延伸阶段开始CAP位点-35-10+1+20(4)转录的终止所有原核生物转录的终止子之前,都会形成一个回文结构,其碱基序列对称排列(如AAGCGCTT),此处合成的mRNA会形成一个发夹结构:转录的终止子有2类:依赖ρ因子的终止子回文结构下游序列G/C含量低无固定特征不依赖ρ因子的终止子G/C含量高含6~8个A①依赖ρ因子的终止ρ因子是一种NTP酶,在三元复合物的移动过程中会结合到mRNA的5´端,ρ因子水解NTP,并利用水解释放的能量,逐渐向mRNA的3´端移动。当三元复合物到达终止子后,由于mRNA形成发夹结构,因此复合物停止前进,等待ρ因子结合到mRNA的3´-OH上,使三元复合物解体,mRNA和RNApol就与DNA分离开来。三元复合物mRNAρ因子5´RNApolDNA3´②不依赖ρ因子的终止这种终止方式是因为mRNA到达终止位点后,形成了发夹结构和多聚U,使mRNA和DNA之间的结合力减弱(A-U之间的作用力较弱),从而使mRNA从DNA上脱离下来。2、翻译以mRNA为模板的Pr合成过程叫做翻译或转译,其场所是核糖体,原料是aa,能量来源是ATP、GTP。(1)遗传密码mRNA上的遗传信息存在于遗传密码中。经过大量研究发现,遗传密码是三联体密码,即三个核苷酸决定一个aa。遗传密码的特点主要有:①
连续性2个密码子之间没有任何其它核苷酸相隔。②简并性A、U、G、C四种核苷酸,每3个组成一个密码,总共可以有64个密码,但组成生物体的aa只有20种,因此,必然会出现几个密码共同决定一个aa的情况。(遗传密码表)③通用性遗传密码在所有生物中几乎都是通用的,只有个别例外,如:UGA一般是个终止密码子,但在人的线粒体中可编码Try。注意:起始密码子一般为AUG,少数细菌中为GUG;终止密码子为UAA、UAG、UGA。遗传密码中决定aa的主要是前2个碱基,第三个碱基的改变,在很多时候往往不改变aa的种类。(2)Pr的生物合成(以原核生物为例)包括肽链的起始、延伸和终止3个过程。①起始核糖体30S小亚基附着到mRNA的起始密码子处GTP起始因子IF1、IF2、IF3与fMet-tRNA(N-甲酰甲硫氨酰tRNA)结合30S起始复合物50S大亚基GTP水解;IF1、IF2、IF3释放70S核糖体②
延伸核糖体大亚基上有2个tRNA结合位点,即P位点和A位点,起始tRNA,即fMet-tRNA首先与P位点结合,然后:aa-tRNA延伸因子EF-TuGTPaa-tRNA-EF-Tu-GTP复合物aa-tRNA进入A位点GTP水解EF-Tu-GDP释放mRNA肽酰转移酶P位点的aa或肽基与A位点的aa之间形成肽键,同时P位点的tRNA卸载,脱离移位酶GTP核糖体沿mRNA的5´3´方向移动1个密码子的距离,使原来A位点的肽酰tRNA进入P位点,空出A位点准备下一个aa-tRNA的进入。上述过程不断重复,肽链延伸。mRNA肽链5´3´PAPA③
终止当肽链延伸到终止密码子处时,由终止因子RF识别终止密码子,并使肽酰转移酶的活性转变成水解酶活性,使P位点上的肽链不再连接到A位点上的aa上,同时还水解P位点上的肽链与tRNA之间的化学键,使肽链释放。肽链一旦释放,核糖体就从mRNA上脱离,解离成50S和30
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