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文档简介
第三节
酶促反应的机理
TheMechanismofEnzyme-CatalyzedReaction
催化剂降低了反应物分子活化时所需的能量非催化反应和酶催化反应活化能的比较
Ea,活化能;ΔG,自由能变化E+S ES E+Pk1k2k3酶底物复合物酶催化高效率的机理1.邻近效应(proximityeffect)与定向排列(orientationarrange)
邻近效应:指底物和底物之间,酶的催化基团和底物的反应基团需要互相靠近,才能反应。定向排列:指酶的催化基团与底物的反应基团之间,或底物的反应基团之间的正确取向所产生的效应。2、底物形变(distortion)和诱导契合学说(induced-fithypothesis)*诱导契合学说酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。3、酸碱催化(acid-basecatalysis)
酶活性中心的某些功能基团可作为酸或碱向底物提供H+或提供H+受体,相互作用形成过渡态中间物,降低活化能。同一种酶常常兼有酸、碱双重催化功能。4、共价催化(covalentcatalysis)
共价催化
亲电催化(electrophiliccatalysis)
亲核催化(nucleophiliccatalysis)酶活性中心亲核和亲电子的基团对底物的攻击,导致酶和底物形成不稳定的过渡态中间物,降低反应的活化能。亲电基团——Mg2+、Mn2+
(有空轨道)亲核基团——¨-OH¨-SH
(有孤对电子)5、酶活性中心的疏水环境效应
F=Q1Q2/r2
疏水的氨基酸残基形成的反应口袋提供了非极性的环境,使极性的离子或离子化的氨基酸残基在疏水口袋中进行催化反应。第三节酶促反应的机理小结酶能比一般催化剂更有效的降低反应的活化能。酶催化高效率是因为它具有下述多种
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