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文档简介
第二节基因工程的酶学基础演示文稿当前第1页\共有90页\编于星期三\10点优选第二节基因工程的酶学基础当前第2页\共有90页\编于星期三\10点第二章基因工程的酶学基础第一节限制性核酸内切酶第二节DNA连接酶第三节DNA聚合酶和反转录酶第四节DNA修饰酶第五节外切核酸酶第六节单链内切核酸酶第七节RNA酶当前第3页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶
任何一种生物体都存在防御外界物质进入的机制
限制/修饰系统
(R-M,Restriction-modificationsystem)当前第4页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶
人们发现侵染大肠杆菌的噬菌体都存在着一些功能性障碍。即所谓的寄主控制的限制与修饰现象简称(R/M体系)。细菌的R/M体系类似于免疫系统,能辨别自身的DNA与外来的DNA,并能使后者降解掉。维护宿主遗传稳定的保护机制。一、寄主的限制与修饰现象当前第5页\共有90页\编于星期三\10点
E.coliB含有EcoB核酸酶和EcoB甲基化酶
当λ(k)噬菌体侵染E.coliB时,由于其DNA中有EcoB核酸酶特异识别的碱基序列,被降解掉。而E.coliB的DNA中虽然也存在这种特异序列,但可在EcoB甲基化酶的作用下,催化S-腺苷甲硫氨酸(SAM)将甲基转移给限制酶识别序列的特定碱基,使之甲基化。EcoB核酸酶不能识别已甲基化的序列。当前第6页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶当前第7页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶一、寄主的限制与修饰现象
当前第8页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶一、寄主的限制与修饰现象
当前第9页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶一、寄主的限制与修饰现象
基因工程中,应采用缺少限制作用的菌株作为受体。
当前第10页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶二、限制性内切酶的类型
限制性核酸内切酶(限制性酶):在细胞内能够识别双链DNA分子中的特定核苷酸序列,并对DNA分子进行切割的一种酶。据限制性核酸内切酶的识别切割特性、催化条件及是否具有修饰酶活性,可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型。
主要特性Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型限制修饰蛋白结构辅助因子识别序列切割位点双功能(具甲基化)异源三聚体ATPMg2+SAM距识别序列1kb处随机性切割单一功能同源二聚体Mg2+
4-6bp回文序列识别序列内或附近特异切割双功能(具甲基化)异源二聚体ATPMg2+
距识别序列下游24-26bp处随机性切割基因工程中使用注:SAM为S-腺苷甲硫氨酸当前第11页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶1.I型限制性内切酶首先由M.Meselson和R.Yuan在1968年从大肠杆菌B株和K株分离的。如EcoB和EcoK。(1)识别位点序列未甲基化修饰的特异序列。EcoB:TGA(N)8TGCTEcoK:AAC(N)6GTGC
当前第12页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶(2)切割位点
在距离特异性识别位点约1000—1500bp处随机切开一条单链。
(3)作用机理
需ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。
Recognizesite
cut
1-1.5kb
当前第13页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶2.II类限制性内切酶首先由H.O.Smith和K.W.Wilcox在1970年从流感嗜血菌中分离出来。分离的第一个酶是HindⅡ
(1)识别位点序列未甲基化修饰的双链DNA上的特殊靶序列(多数是回文序列),与DNA的来源无关。ABCC’B’A’
A’B’C’CBAA’B’N’BAABNB’A’
或当前第14页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶(2)切割位点
识别位点处。
切开双链DNA。形成粘性末端(stickyend)或平齐末端(bluntend)。如:
EcoRI5’-GAATTC-3’3’-CTTAAG-5’PstI5’-CTGCAG-3’3’-GACGTC-5’
产生粘性末端EcoRV5’-GATATC-3’3’-CTATAG-5’
产生平齐末端当前第15页\共有90页\编于星期三\10点AAGCTTTTCGAAAAGCTTTTCGAAABCDDNADNAHindⅢHindⅢ切割位点核酸内切酶HindⅢ对双链DNA分子的切割作用当前第16页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶3.III类限制性内切酶在完全肯定的位点切割DNA(识别位点下游24-26bp),但反应需要ATP、Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。EcoP1:AGACC
EcoP15:CAGCAG
在基因工程操作中用途不大。当前第17页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶主要特性Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型限制修饰蛋白结构辅助因子识别序列切割位点多功能(具甲基化)异源三聚体ATPMg2+SAM距识别序列1kb处随机性切割单一功能同源二聚体Mg2+
4-6bp回文序列识别序列内或附近特异切割双功能(具甲基化)异源二聚体ATPMg2+
距识别序列下游24-26bp处随机性切割核酸限制性内切酶的类型及主要特性当前第18页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶三、限制性内切酶的命名
1973年H.OSmith和D.Nathans提议的命名系统,命名原则如下:
1.用属名的第一个字母和种名的头两个字母组成3个字母的略语表示寄主菌的物种名。
大肠杆菌(Escherichiacoli)用Eco表示;
流感嗜血菌(Haemophilusinfluenzae)用Hin表示。
2.
用一个右下标的大写字母表示菌株或型。如EcoK,EcoR(现在都写成平行,如EcoRI)。
3.
如果一种特殊的寄主菌内有几种不同的限制与修复系统,用罗马字母表示。如EcoRI,EcoRV。
4.
限制酶前面要带上R(Restriction),
修饰酶前面要带上M(Modification)(现已省略)。当前第19页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶三、限制性内切酶的命名
EcoRIEscherichia属名Coli种名Ry13株系编号
若种名头2个字母相同则其中一个可用种名的第一和第三个字母。当前第20页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶四、
Ⅱ限制性核酸内切酶的基本特性(一)识别序列识别顺序的碱基数一般为4-6bp,少数识别更长,多数识别位点具有旋转对称性(回文结构),少数的识别位点在切割位点之外,具旋转对称性
4bp
HpaⅠ
CCGG
HaeⅢ
GGCC
5bp
AvaⅡ
GGWCC
EcoRⅡ
CCWGG
6bp
BamHⅠ
GGATTC
SmaⅠ
CCCGGG
11bp
Bg1Ⅰ
GCCNNNNNGGC
12bp
BstXⅠ CCANNNNNNTGC
N=A,T,G,C当前第21页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶四、Ⅱ限制性核酸内切酶的基本特性(二)切割方式
Ⅱ限制性核酸内切酶切割双链DNA,水解磷酸二酯键中3‘位酯键产生两个末端,末端结构是5’-P和3’-OH,产生3种不同的切口。
当前第22页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶1.5’突出的末端当前第23页\共有90页\编于星期三\10点EcoRI等产生的5‘粘性末端5‘…G--C--T--G--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A--G--C--T--C…5’EcoRI37℃5‘…G--C--T--G--OHP--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A—POH--G--C--T--C…5’退火4--7℃5‘…G--C--T--G--A--A--T--T--C--G--A--G…3’3‘…C--G--A--C--T--T--A--A--G--C--T--C…5’第一节限制性核酸内切酶当前第24页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶2.3’突出的末端当前第25页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶PstI等产生的3‘粘性末端
5‘…C--T--G--C--A--G…3’3‘…G--A--C--G--T--C…5’PstI37℃5‘…C--T--G--C--A--OHP--G…3’3‘…G--POH--A--C--G--T--C…5’退火4--7℃5‘…C--T--G--C--A--G…3’3‘…G--A--C--G--T--C…5’当前第26页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶粘性末端的意义
①连接便利
i)不同的DNA双链:
只要粘性末端碱基互补就可以连接。
这比连接两个平齐末端容易的多。
当前第27页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶当前第28页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶ii)同一个DNA分子内连接:
通过两个相同的粘性末端可以连接成环形分子。
当前第29页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶②5’末端标记
凸出的5’末端可用DNA多核苷酸激酶进行32P标记。
凸出的3’端可以通过末端转移酶添加几个多聚核苷酸的尾巴(如AAA或TTT等)造成人工粘性末端。③
补平成平齐末端
粘性末端可以用DNA聚合酶补平成平齐末端。当前第30页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶3.平头末端当前第31页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶PvuII等产生的平头末端
5‘…G--C--T--C--A--G--C--T--G--G--A--G…3’3‘…C--G--A--G--T--C--G--A--C--C--T--C…5’PvuII37℃5‘…G--C--T--C--A--G--OHP--C--T--G--G--A--G…3’3‘…C--G--A--G--T--C--POH--G--A--C--C--T--C…5’当前第32页\共有90页\编于星期三\10点第一节限制性核酸内切酶当前第33页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶四、
Ⅱ限制性核酸内切酶的基本特性(二)切割方式
同裂酶(isoschizomers):指来源不同但识别相同靶序列的核酸内切酶。同裂酶进行同样的切割,产生不同或相同的末端。
同尾酶(isocaudamer):指来源不同、识别靶序列不同但产生相同的粘性末端的核酸内切酶。利用同尾酶可使切割位点的选择余地更大(相容性末端)。当前第34页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶同尾酶举例:如:BamHIGGATCCBglIIAGATCTMboI,Sau3AINGATCN
常用的限制酶BamHⅠ、BclⅠ、
BglⅡ、Sau3AⅠ和XhoⅡ就是一组同尾酶,它们切割DNA之后都形成由GATC4个核苷酸组成的粘性末端。当前第35页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶五、Ⅱ限制性核酸内切酶的反应条件
1U
核酸内切酶的酶活性:在最适反应条件和温度下,保温1小时,使1μgDNA完全降解所需的酶蛋白量即为一个酶单位,用U表示。
大部分II型限制性核酸内切酶需要相似反应条件:
Tris-HCl50mmol/LpH7.5
MgCl210mmol/L
NaCl0-150mmol/L
DTT1mmol/L
Volume20-100μL
Temperature37℃
Time1-1.5h(DDT:二硫苏糖醇
BSA:牛血清蛋白)0-50mM低盐酶100
mM中盐酶150
mM高盐酶Buffer当前第36页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶五、Ⅱ限制性核酸内切酶的反应条件
在灭菌的1.5ml离心管中进行限制性酶切反应:
20μl体积反应体系如下:
DNA0.2-1μg
10×酶切buffer2.0μl
限制性内切酶
1-2U(单位)
加ddH2O至
20μl
多种酶消化时若缓冲液条件相同,可同时加入;否则,先做低温或低盐的酶消化,再做高温或高盐的酶消化。当前第37页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶五、Ⅱ限制性核酸内切酶的反应条件
酶切反应的终止
EDTA(终浓度10mmol/L)或SDS[终浓度0.1%(W/V)]65oC温育
20min
酚/氯仿抽提,乙醇沉淀
酶解结果鉴定
琼脂糖电泳当前第38页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶五、Ⅱ限制性核酸内切酶的反应条件
完全消化:内切酶在DNA上的所有识别位点都被切开。
局部消化:只有有限数量的酶切位点被切开。
通过缩短保温时间、降低反应温度或减少酶的用量可达到局部消化的目的。当前第39页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶五、Ⅱ限制性核酸内切酶的反应条件
酶切的注意事项:
1.购买的限制性内切酶多保存于50%甘油中,于-20℃是稳定的。
进行酶切消化时,将除酶以外的所有反应成分加入后即混匀,
再从
-20℃冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶时都应更换一个无菌吸头,以免酶被污染。加酶的操作尽可能快,用完后立即将酶放回-20℃冰箱。
2.尽量减少反应体积,但要确保酶体积不超过反应总体积的10%,否则酶活性将受到甘油的抑制。
3.通常延长时间可使所需的酶量减少,在切割大量DNA时可用。
当前第40页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶六、影响限制性核酸内切酶活性的因素(一)酶的纯度
(二)DNA样品的纯度
DNA样中混有蛋白质、苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、SDS、NaCl等,都有可能抑制酶活性。
可采用以下方法,提高酶活性:加大酶的用量,1μgDNA用10U酶加大反应总体积延长反应时间当前第41页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶六、影响限制性核酸内切酶活性的因素(三)DNA样品的甲基化程度
采用去甲基化酶的大肠杆菌菌株来制备质粒DNA,可防止DNA的甲基化。
当前第42页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶六、影响限制性核酸内切酶活性的因素(四)酶切反应的温度与时间
多数标准反应温度是37℃,如SmaI为25℃或30℃,SfiI为50℃
。反应温度过度或过低都会影响酶活性,甚至导致酶失活。酶解时间可通过加大酶量而缩短,反之酶量较少时,可通过延长酶解时间以达到完全酶解DNA的目的。当前第43页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶六、影响限制性核酸内切酶活性的因素(五)DNA的分子构型
某些酶切割超螺旋质粒DNA时,酶量比切割线性DNA时高出多倍,可高达20倍。酶最适温度oC
酶最适温度oC
酶最适温度oC
ApaIBclIMaeIITaqI30505065ApyIBstEIIMaeIII306055BanIMaeISmaI504525当前第44页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶六、影响限制性核酸内切酶活性的因素(六)限制性核酸内切酶的反应缓冲液
高浓度的酶、高浓度的甘油、低离子强度、极端pH值等,会使一些核酸内切酶的识别和切割序列发生低特异性,即所谓的“星活性”(staractivity)现象。
EcoRI*代表EcoRI的星号活力。
星活性的特点:限制酶识别序列特异性降低
例如:EcoRI(高pH值或低盐离子强度)
5’GAATTC3’变成5’NAATTN3’,另有一种情况是对AATT中的A、T分辨不严格商品化的限制酶一般都带有专用缓冲液。当前第45页\共有90页\编于星期三\10点第一节
限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶的应用:重组DNA前的切割
构建新质粒构建物理图谱DNA分子杂交
用限制性内切酶消化受体DNA制备DNA探针
亚克隆以用作序列分析基因定位,DNA同源性研究当前第46页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶剪刀—限制性内切酶针线、胶水—连接酶当前第47页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶DNA连接酶当前第48页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶一、概念与机理
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种能够将DNA链上彼此相邻的3’-羟基(OH)和5’-磷酸基团(-P),在NAD+或ATP供能的作用下,形成磷酸二酯键。大肠杆菌和其他细菌的DNA连接酶以NAD+作为能量来源,动物细胞和噬菌体的连接酶则以ATP作为能量来源。当前第49页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶一、概念与机理
DNA连接酶只能连接缺口(nick),不能连接裂口(gap)。而且被连接的DNA链必须是双螺旋DNA分子的一部分。
注意:缺口(或称切口)和裂口的区别!!!!!当前第50页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶DNA连接酶对不同DNA分子的连接作用当前第51页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶二、DNA连接酶的种类(一)T4噬菌体DNA连接酶
特点:
只连接ds-DNA分子,要求3’-羟基和5’-磷酸基
用途:
1)粘性末端的连接
2)平头末端的相连
抑制剂:PO43->5mM,NaCl>25mM,Ca2+>0.1mM当前第52页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶二、DNA连接酶的种类(二)大肠杆菌DNA连接酶连接具粘性末端DNA分子,以NAD作辅助因子(三)热稳定DNA连接酶以NAD为辅助因子,优先作用于缺口连接酶使用注意事项
1)DNA连接酶不能催化两单链DNA分子连接;
2)只能连接双链DNA分子的单链切口(nick);
3)不能连接双链中一个或多个核苷酸缺失所致的裂口(gap)。DNA连接酶的部分性质连接酶底物辅助因子巯基试剂粘性末端平末端DNA-RNA杂合体RNA-RNA杂合体大肠杆菌DNA连接酶可行可行不行不行NAD+Mg2+不需要T4DNA连接酶可行可行可行可行ATPMg2+
需DTT噬热菌DNA连接酶可行不行不行不行NAD+Mg2+
需要当前第53页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶DNA连接酶应用图解(一)分子间的连接
(二)分子内的连接当前第54页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶三、DNA连接酶的反应体系
10×T4DNALigaseBuffer1μlpMD18-T(30ng/μl)1μl已纯化的PCR产物 Xμl*T4DNALigase2~3WeissUnitsddH2O 至10μl当前第55页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶四、影响连接反应的因素
1.插入片段与载体的浓度比例:2-10:1增加插入片段与载体的接触机会,减少载体自我连接的现象
2.反应温度:一般4~16℃
3.ATP浓度
当前第56页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶平末端DNA片段的连接(补充)1.同聚物加尾法
当前第57页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶平末端DNA片段的连接(补充)2.衔接物连接法
当前第58页\共有90页\编于星期三\10点第二节
DNA连接酶平末端DNA片段的连接(补充)3.DNA接头(adaptor)连接法
问:衔接物和DNA接头有什么区别???衔接物(linker)是一种人工合成的双链DNA短片段,其上具有一个或数个在将与其连接的载体DNA上不存在的限制酶识别位点,可按平齐末端连接法给平齐末端片段加上相同识别位点的衔接物,再用在衔接物中具有识别位点的合适限制酶切割,用常规方法连接的方法,提高平齐末端间的连接作用效率。也可利用接头进行DNA平齐末端门的连接。接头(adaptor)是一种具有粘性末端的短核苷酸双链,它与平齐末端连接后,不用经过切割即可与载体相连。当前第59页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶DNA聚合酶
3’5’外切酶活性5’3’外切酶活性聚合速率
持续能力
大肠杆菌DNA聚合酶
低
有
中
低
Klenowfragment
低
无
中
低
T4DNA聚合酶
高
无
中
低
T7DNA聚合酶
高
无
快
高
化学修饰T7DNA聚合酶
低
无
快
高
遗传修饰T7DNA聚合酶
无
无
快
高
逆转录酶
无
无
低
中
TaqDNA聚合酶
无
有
快
高
DNA聚合酶(DNApolymerase)是指能在引物和模板的存在下,将脱氧核糖单核苷酸连续地加到双链DNA分子引物链的3‘-OH末端,催化核苷酸的聚合作用。分为:依赖于DNA的DNA聚合酶和依赖于RNA的DNA聚合酶。当前第60页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶一、大肠杆菌DNA聚合酶I
1957年,美国的生物学家A.Kornberg首次证实,在大肠杆菌提取物中存在一种DNA聚合酶,即现在所说的DNA聚合酶I。当前第61页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶CCGGGCTATCGGE.coliDNApolIMg2+,4dNTPCCGATAGCCGGCTATCGG1.5’→3’聚合酶活性GATAGCCAGCTATCGGTCGATAGCCAGCTATCGGE.coliDNApolIMg2++pC,pT5′TCGATAGCCAGCTATE.coliDNApolIMg2+TCGATAAGCTAT+pC,pG,pC5′2.5’→3’外切酶活性3.3’→5’外切酶活性
DNA聚合酶的三种活性当前第62页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶一、大肠杆菌DNA聚合酶I用途:
1)除去3’-端突起的单链DNA(在无dNTP时)
2)补齐5’-突起端
3)合成第二条cDNA其中用途2)和3)常用大片段当前第63页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶二、Klenow片段
(一)基本性质大肠杆菌DNA聚合酶I经枯草杆菌蛋白酶处理,获得N端三分之二的大肽段,即Klenow片段。
Klenow片段仍拥有5`→3`的DNA聚合酶活性和3`→5`的核酸外切酶活性,但失去了5`→3`的核酸外切酶活性。
当前第64页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶二、Klenow片段
(二)用途
1.3’端补平:补平限制性内切酶切后形成的3’隐蔽端。
2.DNA3’末端标记:在3’隐蔽端加上放射性标记的dNTP。5’klenow
klenow
5’
当前第65页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶二、Klenow片段
(二)用途
3.cDNA第二链的合成
mRNAcDNA第一链逆转录cDNA第二链klenow
5’3’3’
5’
5’3’
引物
当前第66页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶三、T4噬菌体DNA聚合酶(一)T4DNA酶的基本特性有3`→5`的核酸外切酶活性和5`→3的DNA聚合酶活性(降解单链更快)
。
在无dNTP时,可以从任何3`-OH端外切在四种dNTP均存在时,聚合活性占主导地位
当前第67页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶三、T4噬菌体DNA聚合酶(二)用途当前第68页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶四、T7噬菌体DNA聚合酶与测序酶
(一)T7噬菌体DNA聚合酶从T7噬菌体感染大肠杆菌细胞中纯化出来的,由两个亚基组成,已知DNA聚合酶中持续结合能力最强的一个。
(二)T7噬菌体DNA测序酶通过对T7DNA聚合酶进行化学修饰,去除3’5’外切酶活性,使DNA聚合能力和聚合速率提高了3倍。
当前第69页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶二、TaqDNA聚合酶
来源:从耐热细胞中纯化,已有基因工程酶多种。
结构:单亚基MW=94000d。
特点:热稳定性,70℃反应2h残留活性为原来的90%;93℃反应2h残留活性为原来的60%;94℃反应2h残留活性为原来的40%。活性:聚合最适温度为75-80℃,不具3’→5’外切酶活性,具5’→3’外切活性。用途:
1.PCR反应。
2.测序,高温下进行DNA合成可减少模板二级结构。当前第70页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶三、逆转录酶(reversetranscriptase)
依赖RNA的DNA聚合酶(RNA指导的DNA聚合酶)。
来源商品反转录酶有两种:来自禽类成髓细胞瘤病毒(AMV)(42℃)。来自能表达Moloney鼠白血病毒(M-MLV)反转录酶基因的E.coli(37℃)。
结构和活性:酶类别肽链5’-3’聚合活性RNAseHAMVα62,000β94,000
++++M-MLV84,000++当前第71页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶五、逆转录酶(reversetranscriptase)
用途:
(1)5’→3’聚合酶活性,能以RNA或DNA模板合成DNA分子;
(2)RNA酶H活性:对RNA:DNA杂交体中的RNA特异性地降解,免除了在反转录完成后再用NaOH降解RNA模板的步骤。
(3)用于3’凹陷末端的标记,杂交探针的制备和DNA序列测定。当前第72页\共有90页\编于星期三\10点第三节
DNA聚合酶和反转录酶五、逆转录酶(reversetranscriptase)
RNaseH活性当前第73页\共有90页\编于星期三\10点第四节DNA修饰酶一、末端脱氧核苷酸转移酶来源及特点:
简称末端转移酶(terminaldeoxynucleotidyltransferase,TdT),能催化5’脱氧核苷三磷酸进行5’→3’方向的聚合作用,逐个地将脱氧核苷酸分子加到线性DNA分子的3’-OH末端。
它不需要模板,可以用含有的3’-OHDNA片段为引物,在3’-OH端加入核苷酸达几百个。它作用的底物可以是具有3’-OH末端的单链DNA,也可以是具有3’-OH突出末端的双链DNA。用途:
1.催化[α-32P]-3’-脱氧核苷酸标记DNA片断的3’末端。
2.催化非放射性的标记物掺入到DNA片断的3’-末端:
生物素等,掺入后可产生荧光染料或抗生物素蛋白结合物的接受位点。
3.用于在平头DNA上合成一段寡聚核苷酸,从而形成粘性末端。当前第74页\共有90页\编于星期三\10点第四节DNA修饰酶当前第75页\共有90页\编于星期三\10点末端转移酶功能图解第四节DNA修饰酶3‘突出末端当前第76页\共有90页\编于星期三\10点一、T4噬菌体多核苷酸激酶来源从T4感染大肠杆菌细胞中分离出来。多种哺乳动物细胞中也发现这种酶。功能
催化磷酸从ATP转给双链或单链DNA或RNA的5’-OH端。
不论5’-OH端突出与否。
用途:DNA5’-OH端磷酸化、标记DNA的5’端。5’3’HO--OH5’3’HO--OH3’P--OH5’3’HO--P5’ATPT4多核苷酸激酶第四节DNA修饰酶当前第77页\共有90页\编于星期三\10点二、碱性磷酸酶
1)碱性磷酸酶种类
细菌性碱性磷酸酶(Bacterialalkalinephosphatase,BAP),从大肠杆菌中分离出来。具有抗热性。
小牛肠碱性磷酸酶(Calfintestinalalkalinephosphatase,CIAP),从小牛肠中纯化出来。加热68℃可完全失活。
2)碱性磷酸酶的特性
催化脱掉DNA(或RNA)5’端的磷酸根。
3’HO-
-P
5’
3’HO-
-OH
5’3’HO-
-OH
碱性
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