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文档简介

ICS65.020.01CCSB16DB21辽宁省地方标准DB21/T3378—2021辽宁省松材线虫病检验鉴定技术规程TechnicalregulationonquarantineforthepinewiltdiseaseinLiaoningprovince2021-01-30发布 2021-03-02实施辽宁省市场监督管理局发布DB21/T3378—2021DB21/T3378—2021#附录G(资料性)

分子生物学鉴定G.1松材线虫PCR检测G.1.1线虫基因组DNA的提取制作线虫裂解液(200mmol/LTris-HCl、200mmol/LNaC1、100mmol/LEDTA、2%SDS、2%6-mercaptoethanol、200^g/mL蛋白酶K),预冷线虫裂解液,按照10应线虫裂解液:1条线虫比例,将线虫与裂解液置于离心管中。置于PCR仪,70r条件下保温处理35min,在95°C条件下保温处理10min后,12000/min离心2min,取上清液。G.1.2反应体系每反应的混合液总体积为20pL,其中:2.0应10x快速TaqPCR缓冲液;2应2.5mmol/L的dNTP;0.3应快速扩增Taq酶;1.5应10mmol/L的引物组合B;2.0应的模板DNA;补充高压灭菌重蒸水至20pL。G.1.3反应程序反应混合液在98°C预变性5s,进入循环98°C变性3s,52°C退火3s,72°C延伸40s,共30个循环,最后72。延伸211血1。G.1.4结果检测PCR扩增产物在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,电泳缓冲液为IxTAE或IxTBE,电压为5V/cm,电泳时间为30min。置凝胶于302nm透射紫外灯上观察,拍照。结果参见图G.1。图G.;松材统虫电泳检测图谱注:泳道M-标准DNA;47-49松材线虫;50-52拟松材线虫G.2松材线虫自动化分子检测G.2.1松材线虫病试剂盒组成成分名称数量成分DNA提取试剂A液2ml/管xl管松材线虫裂解缓冲液DNA提取试剂B液200卩1/管xl管松材线虫消化酶pCR扩增混合K液500卩1/管xl管含TaqDNA聚合酶,dNTP的溶液PCR扩增混合P液150卩1/管xl管特异性引物、探针线虫DNA阳性质控Y液75卩1/管xl管松材线虫DNA片段阴性质控C液1ml/管xl管无酶水G.2.2适用设备松材线虫自动化分子检测系统48,松材线虫自动化分子检测系统48A,松材线虫自动化分子检测系统mini等松材线虫荧光定量PCR检测系统。G.2.3检测方法将分离的线虫置于1.5mL悬浮液离心浓缩,取底部液体20pL,加入A液20应,B液2pL;金属浴中65°C,40min, 95°C,10min; 12000r/min离心3min,取上清液(线虫DNA溶液)。G.2.4反应体系样品:线虫DNA溶液3.5应,加入K液5应,P液1.5应。阳性对照:线虫DNA阳性质控Y液3.5应,加入K液5应,P液1.5应。阴性对照:阴性质控C液3.5应,加入K液如L,P液1.5应。G.2.5反应程序将样品、阳性对照及阴性对照放入机器,选择仪器中松材线虫自动检测程序。G.2.6反应结果松材线虫自动化分子检测系统采用自动程序判读检测结果,如表G.1、G.2。表G.1松材线虫自动化分子检测结果序号颜色苗品来源Ct值判定结果11A125.83含松材线虫2120.23含松材线虫31A328.47含松材线虫41A4”:23.19含松材线虫51A527.38.含松材线虫61A621.28、含松材线虫71阳性对照16.65含松材线虫81阴性对照不含松材线虫

表G.2松材线虫自动化检测结果表G.2松材线虫自动化检测结果G.3实时荧光PCR检测G.3.1检测仪器实时荧光PCR仪、高速冷冻离心机。G.3.2引物与探针松材线虫的引物正向引物序列:5'-GAGCAGAAACGCCGACTT-3';反向引物序列:5'-CGTAAAACAGATGGTGCCTA-3';TaqMan探针序列:5'-TGCACGTTGTGACAGTCGT-5'。G.3.3反应体系反应的混合液总体积为20卩L,其中:TaqMan通用PCR预混液10卩L;1011mol/LTaqMan探针1.0UL;10umol/L正向引物Q.5uL;10umol/L反向弓卜物0.5uL;模板DNA1.OuL;ddH207.OuL;G.3.4反应程序反应混合液在95°C预变性lOmin;进入循环95°C变裡15s,60°C运行35s,共35个循环。G.3.5检测结果循环阈值(Cyclethresholdvalue)Ct值:是在PCR扩增过程中,荧宪信号*暫由本底进入指数增长阶段的拐点所对应的循环次数,是实时荧光定量PCR检测结果判读的依据。当检测样品30>Ct>12时,含有松材线虫;Ct>35或者无Ct值,不含松材线虫;35>Ct>30,可能岀现假阳性,应重新检测。DB21/T3378—2021DB21/T3378—2021附录H(规范性)松材线虫分子生物学检验送检表表

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