上海市临检中心 分子诊断技术规范解读

分子诊断技术临床应用政策解读上海市临床检验中心肖艳群Outline分子检测项目规范及内容分子检测技术规范及内容分子检测实验室规范及内容申请注意事项分子检测项目开展技术规范《医疗技术临床应用管理办法》

卫医政发〔2009〕18号第十二条

医疗机构开展的临床检验项目必须是卫生部公布的准予开展的临床检验项目临床分子生物学及细胞遗传学《医疗机构临床检验项目目录2013年版

》分子检测技术开展规范临床基因扩增检验技术、基因芯片诊断技术国家卫生计生委关于取消第三类医疗技术临床应用准入审批有关工作的通知国卫医发（2015）71号

（2015.7.2）一、根据国务院《关于取消非行政许可审批事项的决定》，取消第三类医疗技术临床应用准入审批。九、各省级卫生计生行政部门应当按照国务院行政审批改革精神和有关工作部署，研究取消第二类医疗技术非行政许可审批后加强事中事后监管的工作措施，保证医疗质量和患者安全。主要内容•

厘清相关医疗技术范围，突出管理重点•

强化医疗机构在医疗技术临床应用和管理的主体责任•

强化行政临床应用事中事后监管责任•

明确对涉及使用药品、医疗器械或具有相似属性的相关产品、制剂等的医疗技术的管理主要内容•

关于第三类、第二类医疗技术管理工作•

关于医疗机构技术管理工作•

关于事中事后监督管理工作一、关于第三类、第二类医疗技术管理工作（一）取消第三类和本市第二类医疗技术临床应用准入审批。（二）已开展《上海市限制临床应用医疗技术目录（2015版）》在列医疗技术，且经审批的医疗机构，应向卫生计生行政部门备案并提交《上海市医疗技术临床应用备案表》。原已在《医疗机构执业许可证》相应诊疗科目下办理登记的医疗机构无需再次办理。（三）拟开展《上海市限制临床应用医疗技术目录（2015版）》在列医疗技术的医疗机构，经自我对照评估符合规定条件并由具备临床应用能力评估资质的第三方评价机构出具临床应用能力评估报告后进行备案。卫生计生行政部门在《医疗机构执业许可证》副本备注栏注明后，方可在临床应用相关医疗技术。（四）本市首次开展（未纳入国家和上海限制临床应用医疗技术目录）的医疗技术，应按照《关于印发医疗卫生机构开展临床研究项目管理办法的通知》要求进行临床研究项目管理，完成临床研究后且条件成熟的，可按照开展目录在列医疗技术方式，实施备案管理后进入临床应用。（五）我委将根据本市实际情况，对本市限制临床应用医疗技术目录清单进行调整并制定二、关于医疗机构技术管理工作（一）医疗机构对本机构医疗技术临床应用和管理承担主体责任，医疗机构主要负责人是第一责任人。各级各类医疗机构应当建立完善本机构医疗技术临床应用管理制度并建立健全医疗技术评估与管理档案制度。（二）医疗机构必须严格按照相关医疗技术临床应用管理规范进行自我对照评估，医疗机构基本条件、人员条件、技术管理等不符合相关规范要求的，不得开展相应技术。（三）医疗机构必须严格按照医疗技术规范开展诊疗活动，加强医疗技术临床应用质量和安全管理。与医疗技术有关的专业技术人员或者设备、设施、辅助条件发生变化，可能对医疗技术临床应用带来不确定后果或者存在医疗质量和医疗安全隐患的技术，应立即停止临床应用，并向卫生计生行政部门报告。卫生计生行政部门应当及时取消《医疗机构执业许可证》副本备注栏注明。（四）医疗机构应当自备案手续完成之日起，每年2月底前向卫生计生行政部门和相关专业质量控制中心报告上一年度医疗技术临床应用情况，包括诊疗病例数、适应症掌握情况、临床应用效果、并发症、合并症、不良反应、随访情况等。三、关于事中事后监督管理工作（一）医疗机构完成备案手续，卫生计生行政部门要及时将医疗机构名单向社会公布。市卫生计生行政部门依托各相关专业质量控制中心对医疗机构进行质控管理。（二）各相关专业质量控制中心要加强医疗机构的医疗质量控制和动态管理工作。各相关专业质量控制中心接备案医疗机构信息后应立即建立医疗技术临床应用技术管理档案，并对医疗机构医疗技术临床应用情况加强日常监测，及时向医疗机构和卫生计生监督部门反馈质控结果，质控结果作为卫生计生监督部门参考依据。（三）各办医主体要加强日常管理，加大对医疗技术临床应用情况监督检查力度。各级卫生计生监督部门要加大对未进行备案、开展禁止临床应用医疗技术的医疗机构、备案后但未按照技术管理规范开展诊疗活动的医疗机构的监督执法力度。医疗机构未进行备案或开展禁止临床应用医疗技术的，由卫生计生行政部门按照《医疗机构管理条例》第四十七条和《医疗技术临床应用管理办法》第五十条的规定给予处罚。医疗机构备案后，医师未按照技术管理规范开展诊疗活动的，由卫生计生行政部门按照《执业医师法》第三十七条的规定给予处罚。（四）建立医疗技术临床应用定期抽查评估制度。经评估不合格的医疗机构，禁止开展相关医疗技术。附件2:上海市限制临床应用医疗技术目录（2015版）序号医疗技术名称临床基因扩增检验及分子诊断相关技术基因芯片诊断技术3435评估流程医疗机构提出技术评估申请（）临检中心文件初审专家评估（评审会或现场评估）临检中心出具评估报告•

申请材料中不需主管部门盖章•

无复审环节•

再申请时无时间周期限制•

临检中心为第三方评估机构（/

分子诊断技术临床应用管理/临床基因扩增检验及分子诊断技术、基因芯片诊断技术、检验新技术

/

临床基因扩增检验技术评估办法、基因芯片诊断技术评估办法、检验新技术评估流程、技术评估申请书）技术评估需递交的材料《上海市医疗技术临床应用能力评估申请书》医疗机构基本情况申请单位相关学科基本情况.

项目负责人基本情况.

学科人员基本情况.

项目所在地实验室的专用设备、设施及工作基础.

拟开展检验项目开展该技术的目的、意义和实施方案该项医疗技术的基本概况.

技术路线.

国内外应用情况.

与同种疾病的其他检测技术的特点及费用比较.

质量控制措施技术评估需递交的材料

医疗机构执业许可证副本复印件

技术人员相关资格证书复印件

与该技术有关的实验室平面图

医疗机构医学伦理审查报告（产前筛查、遗传性疾病）

仪器、试剂三证复印件

方法学性能验证报告

室间质评成绩

质量手册、程序文件、操作规程

申请在本市首次开展的医疗技术还需递交：国内外有关该技术研究和使用情况的检索报告及技术资料新一代测序技术食品药品监管总局办公厅

国家卫生计生委办公厅关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知

2014.2.14二、自本通知发布之日起，包括产前基因检测在内的所有医疗技术需要应用的检测仪器、诊断试剂和相关医用软件等产品，如用于疾病的预防、诊断、监护、治疗监测、健康状态评价和遗传性疾病的预测，需经食品药品监管部门审批注册，并经卫生计生行政部门批准技术准入方可应用。已经应用的，必须立即停止。四、国家卫生计生委负责基因测序技术的临床应用管理。国家卫生计生委确定的基因测序临床应用试点单位，可以按照医疗技术临床应用管理的相关规定试用基因测序产品，并做好相应技术的验证与评价。高通量测序试点单位第一批：2015.1.4遗传病诊断专业：上海儿科医院、上海儿童医院产前筛查与诊断专业、植入前胚胎遗传学诊断专业：国妇婴、一妇婴、新华医院、仁济医院第二批：2015.4.10肿瘤：肿瘤医院、中山医院、瑞金医院、长海医院、东方肝胆医院高通量测序试点单位运行情况体会•

高通量测序技术敏感性高，操作复杂，对环境和人员要求高•

如采用商品化panel设计，需充分认识到设计的缺陷•

生物信息学分析对高通量测序结果分析至关重要•

须对检测各环节进行严格质量控制•

NIPT应严格控制适用人群指征高通量测序试点单位运行情况困惑•

遗传病及肿瘤高通量测序LDT，如何完成性能确认？•

阳性结果用Sanger测序或其他方法验证，如何保证阴性结果无假阴性？•

生物信息分析软件多种，如何降低分析软件原因导致结果不一致风险？•

检测位点多，步骤繁琐，如何选择合适的室内质控品及质控频率？•

各单位检测项目不同，如何通过EQA或室间比对保证结果准确或一致？•

检测数据多，信息量大，如何筛选有临床价值的数据和信息？•

如何规范结果报告内容及与临床的沟通？•

产前筛查试点单位如何实现实验室本地化？•

如何解决高通量测序临床收费问题，让其合理合规？技术指南测序技术的个体化医学检测应用技术指南（试行)肿瘤个体化治疗检测技术指南（试行）药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)遗传病相关个体化医学检测技术指南（试行）NGS临床肿瘤精准医学诊断共识临床基因扩增检验实验室规范《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》卫办医政发〔2010〕194号

总则第二条

临床基因扩增检验实验室是指通过扩增检测特定的DNA或RNA，进行疾病诊断、治疗监测和预后判定等的实验室，医疗机构应当集中设置，统一管理。第三条

本办法适用于开展临床基因扩增检验技术的医疗机构。第五条

以科研为目的的基因扩增检验项目不得向临床出具检验报告，不得向患者收取任何费用。

第二章

实验室审核和设置第三章

实验室质量管理第十四条

医疗机构临床基因扩增检验实验室人员应当经省级以上卫生行政部门指定机构技术培训合格后，方可从事临床基因扩增检验工作。第十五条

医疗机构临床基因扩增检验实验室应当按照《医疗机构临床基因扩增检验工作导则》开展实验室室内质量控制，参加卫生部临床检验中心或指定机构组织的实验室室间质量评价。卫生部临床检验中心或指定机构应当将室间质量评价结果及时通报医疗机构和相应省级卫生行政部门。第四章

实验室监督管理第十八条

省级以上卫生行政部门指定机构对室间质量评价不合格的医疗机构临床基因扩增检验实验室提出警告。对于连续2次或者3次中有2次发现临床基因扩增检验结果不合格的医疗机构临床基因扩增检验实验室，省级卫生行政部门应当责令其暂停有关临床基因扩增检验项目，限期整改。整改结束后，经指定机构组织的再次技术审核合格后，方可重新开展临床基因扩增检验项目。

第四章

实验室监督管理第二十条

医疗机构临床基因扩增检验实验室出现以下情形之一的，由省级卫生行政部门责令其停止开展临床基因扩增检验项目，并予以公告：（一）开展的临床基因扩增检验项目超出省级卫生行政部门核定范围的；（二）使用未经国家食品药品监督管理局批准的临床检验试剂开展临床基因扩增检验的；（三）在临床基因扩增检验中未开展实验室室内质量控制的；（四）在临床基因扩增检验中未参加实验室室间质量评价的；（五）在临床基因扩增检验中弄虚作假的；（六）以科研为目的的基因扩增检验项目向患者收取费用的；（七）使用未经培训合格的专业技术人员从事临床基因扩增检验工作的。（八）严重违反国家实验室生物安全有关规定或不具备实验室生物安全保障条件的。申请注意事项验证的最低要求•

定量检测

至少应验证精密度、正确度、测量区间（线性），参考范围（检测下限）⒈

精密度

选取2个浓度，其中一个应尽可能选择临床决定水平的浓度。可每天测定3次，连续5天。结果应符合厂商声称的指标。⒉

正确度

可采用下列方式之一a、与参考方法比对b、测定参考物质

c、与公认或主流方法比对⒊

测量区间

至少采用厂商声明测量区间内的5个浓度进行检测。⒋

参考范围

至少检测20例表观正常人。检测下限

将一份已知定值的标准品，用阴性标本稀释到检测下限以下为止，平行检测10管，10管全部检出的最低稀释浓度即为该方法的检测下限（可根据实际情况在最低稀释浓度附近进行10倍以下的稀释）验证的最低要求•

定性检测

至少应验证重复性和符合率，必要时验证检测下限⒈

重复性

采用弱阳性和阴性样本各一份（阳性样本获取有困难时可使用质控品），每天检测3次，连续测量5天，符合率>90%⒉

符合率

可采用下列方法之一a、标准血清盘b、临床诊断明确的阴性和阳性样本各10份c、与公认或主流方法比对3.

检测下限

将一份已知定值的标准品，用野生型的基因组稀释突变型基因组，设定不同的突变含量，一直稀释到检测下限以下为止，平行检测3管，3管全部检出且其线性∣r∣≥0.98的最低稀释浓度即为该方法的检测下限SCCL开展项目模块项目样本数频次HBVDNA、HCV

RNA、EB

DNA、HCMV

DNA52病毒核酸非病毒核酸

CT

DNA、NG

DNA555222HPV高危HPVDNA

HPV、

基因分型分子病理EGFR突变、KRAS突变、BRAF突变白血病融合基因

AML1-ETC、BCR-ABL、PML-RARA5522华法林：CYP2C9、VKORC1氯吡格雷：CYP2C19他克莫司：CYP3A5药物代谢及药物作用靶点叶酸：MTHFRC677T遗传性疾病

PKU基因检测：PHA5512遗传性耳聋基因检测SAT技术CT

RNA、UU

RNA、NG

RNA、MPRNA质控品类型质评项目临床标本HBV

DNA、HCV

RNA、CT

DNA、NG

DNAEGFR突变、KRAS突变、BRAF突变AML1-ETC、BCR-ABL、PML-RARACT

RNA、NN

RNA、NG

RNA、MP

RNA高危HPVDNA、HPV基因分型细胞系EB

DNA、高危HPV

DNA、HPV基因分型人工合成华法林：CYP2C9、VKORC