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文档简介
实验试剂:QIAGENDNAFFPETissueKit试剂盒、实验仪器:离心机、生物安全柜、Nanodrop2000分光光度计、LightCycler480荧光定量PCR、恒温金属浴。一、DNA提取1.ExtractDNA(详见QIAGENDNAFFPETissueKit,货号56404)HE染色:1) 石蜡块固定至切片机上,调整切片机切片厚度设置为2ym;2) 切取2ym厚度的组织片1张,先放入15%酒精中,然后从15%酒精中放入45C水中捞片;3) HE染色;HE分析;如图*记录:病理号、病理诊断、肿瘤细胞比例。1) 石蜡块固定至切片机上,调整切片机切片厚度设置为5ym,首先切除表面的2-3片,以去除表面氧化层;2) 切取5gm厚度的组织片3片(如果组织块过小,需要多切几片),然后放入EP管中,加入lml二甲苯振荡混匀,以充分溶解组织周围石蜡,14000rpm离心2min吸去上清去除石蜡,如果石蜡过多,可以用二甲苯再洗一次;3) 加入无水乙醇lml(去除二甲苯),14000rpm离心2min吸尽上清后开盖直至残余乙醇全部挥发(大约lOmin);4) 加入18OMATL和20卩1蛋白酶K,震荡混匀;5) 56°C1h(期间可以适当摇晃颠倒样品,使之混匀裂解充分);6) 90C1h(注意管盖,由于90°高温可能会导致开盖,以致液体被蒸发;时间不要太长1小时足够;一个水浴锅时,56C到90C之间应该将样本置于室温中);7) 短暂离心使液体聚于管底,加入200MAL,震荡混匀,然后加入200卩1无水乙醇,震荡
混匀;8) 短暂离心使液体聚于管底,将整个液体全部移入收集柱中,然后8000rpm离心lmin,丢弃收集管后将收集柱置于新的收集管中;9) 加入500卩1AW1漂洗液,离心8000rpm,lmin,丢弃收集管后将收集柱置于新的收集管中;10) 加入500卩1AW2漂洗液,离心8000rpm,lmin,丢弃收集管后将收集柱置于新的收集管中;11) 离心14000rpm,3min,以去除收集柱中的残余液体;⑵加入ATE(洗脱液)50卩1,然后室温静置2min;13)离心14000rpm,1min,收集洗脱液。二、 DNA浓度调整1) 用Nanodrop2000分光光度计检测DNA样品的浓度;*记录时间、样品浓度、260/280值2) 石蜡样
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