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文档简介

本文格式为Word版,下载可任意编辑——分子生物学总结

反义RNA:(antisenseRNA)

参与转录后调控:

细菌响应环境压力(氧化压力、渗透压、温度等)的改变,产生的一些非编码的小RNA分子,能与mRNA中的特定序列配对并改变所配对mRNA分子的构象,导致翻译过程被开启或者关闭,也可能导致目标mRNA分子的快速降解。(例如:细菌铁蛋白用来储存细胞中过剩的铁离子,bfr基因编码铁蛋白,anti-bfr基因编码反义RNA。无论培养基铁离子的高低,bfr基因都正常转录,而anti-bfr基因的转录受到能感受铁离子浓度变化的Fur蛋白的调控。铁离子过多时,Fur蛋白关闭anti-bfr基因,bfr基因正常翻译;而铁离子过低时,anti-bfr基因转录生成大量反义RNA,与bfr的mRNA配对,阻止细菌铁蛋白基因的翻译。)

参与DNA复制调控:

在EolE1质粒DNA的复制完全依靠宿主DNA聚合酶Ⅰ,质粒DNA编码两个负调控因子Rop蛋白和反义RNA(RNA1),他们控制了起始DNA复制所必需的引物合成。RNA1的编码区在引物RNA编码区的5’端,转录方向与引物RNA相反,因此与引物RNA的5’端互补。RNA1通过氢键配对与引物RNA前体相互作用,阻止了RNaseH加工引物前体,使其不能转换为有活性的引物而对复制起负调控作用。RNA1不仅控制质粒的拷贝数,而且决定了质粒的不相容性。RNA1与引物RNA分子的相互作用是可逆的,因此细胞内RNA1的浓度决定了EolE1质粒复制的起始频率。而另一个负调控因子Rop蛋白能提高RNA1与引物前体的相互作用,从而加强了RNA1的负调控作用。

干扰(RNAi)

利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源mRNA从而阻断靶基因表达,使细胞出现靶基因缺失的表型。

rRNA

tRNA

●存在经过特别修饰的碱基,tRNA3’端都以CCA-OH终止,该位点是tRNA与相应氨基酸结合的位点。●三叶草二级结构:D臂、反密码臂、多余臂、TΨC臂、受体臂(3’端);最大的变化发生在多余臂上。

●稀有碱基含量丰富,特别是反密码子3’端邻近部位,对于维持反密码子环的稳定性及反密码子、密码子之间的配对很重要。

●所有的tRNA都能够和核糖体的A位点(新进入的氨酰-tRNA的结合位点)和P位点(肽酰-tRNA的结合位点)结合,此时,tRNA分子三叶草型顶端突起部位通过密码子:反密码子的配对与mRNA相结合,而3’端恰好将所运转的氨基酸送到正在延伸的多肽上。

●起始tRNA能被原核生物的起始因子IF-2或真核生物起始因子eIF-2所识别;其他所有的tRNA都能被翻译辅助因子EF-TU(原核)或eEF1(真核)所识别而与核糖体相结合。

●L型三级结构:靠氢键维持。tRNA所运载的氨基酸必需靠近位于核糖体大亚基上的多肽合成位点,而tRNA上反密码子必需与小亚基上的mRNA相配对,所以分子中两个不同的功能基团是最大限度的分开的。●tRNA上的性质是由反密码子而不是它所携带的氨基酸所决定的。

●分类:

起始tRNA:一类能特异地识别mRNA模板上起始密码子的tRNA。原核生物起始tRNA携带甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物起始tRNA携带甲

硫氨酸(Met)

同工tRNA(cognatetRNA):几个代表一致氨基酸、能够被一个特别的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。

校正tRNA:可分为无义突变(nonsensemutation)校正、错义突变(missensemutation)校正。校正tRNA在进行校正的过程中必需与正常

的tRNA竞争结合密码子,无义突变的校正tRNA必需与释放因子竞争识别密码子,错义突变的校正必需与该密码正常的tRNA竞争。无义突变的校正基因tRNA不仅能校正无义突变,也会抑制该基因3’端正常的终止子,导致翻译过程的通读,合成更长的蛋白质。同样,一个基因的错义突变的校正也能使另一个基因翻译错误,在正常位点引入新的氨基酸。

mRNA

RNA的剪接:(RNAsplicing)从mRNA前体分子中切除被称为内含子(intron)的非编码区,并使基因中被称为外显子(exon)的编码区拼接成成成熟mRNA的过程。

RNA编辑:(RNAediting

是某些RNA,特别是mRNA前体的一种加工方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,导致DNA所编码的遗传信息的改变,由于经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。介导RNA编辑的机制有:位点特异性的脱氨基作用、引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除。(例:哺乳动物载脂蛋白2153位密码子从CAA突变为UAA,使编码谷氨酰胺的密码子变成了终止密码子,导致在肝、肠中的不同表达。)

生物学意义:

1、校正作用:有些基因在突变过程中丢失的遗传信息可能通过RNA的编辑得以恢复。

2、调控翻译:通过编辑可以构建或去除起始密码子和终止密码子,是基因表达调控的一种方式。3、扩展遗传信息:能使基因产物获得新的结构和功能,有利于生物的进化。

指导RNA:(guideRNA)

原生动物及植物线粒体中进行RNA编辑所需的RNA序列,是与已正确编辑的RNA序列互补的一小段RNA,被用来作为向未经编辑的RNA中插入碱基的模板。

RNA的再编码:(RNArecoding)

mRNA在某些状况下不是以固定的方式被翻译,而可以改变原来的编码信息,以不同的方式进行翻译。其中RNA编码和读码方式的改变,即为RNArecoding。例如核糖体程序性+1/-1移位、核糖体腾跃、终止子的通读等。RNA的再编码可以从一个mRNA产生两种或多种相互关联但又不同的蛋白质,这也可能是蛋白质合成的一种调理机制。

RNA的化学修饰:

★包括甲基化、去氨基化、硫代、碱基的同分异构化、二价键的饱和化、核苷酸的替代。

★RNA的化学修饰具有位点特异性。只含有70~100个核苷酸的核仁(snoRNAs)参与RNA的化学修饰,由于这些RNA能通过碱基配对的方式,把rRNA分子上需要修饰的位点找出来。一般认为,snoRNA上的D盒(5’-CUGA-3’)是甲基化酶的识别位点。

核酶(ribozyme):

★是指一类具有催化功能的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二脂键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达。

★具有自我剪接能力的RNA大多数都能形成锤头结构(hammerheadstructure)。锤头结构催化切割反应的活性较高,而发夹型核酶催化连接的活性较高。)

★分为:1、剪切型核酶(只剪不接,能够催化自身的RNA或不同的RNA分

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