医学信息检索与利用：计算机检索基础

计算机检索基础2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室1目录一、基本概念二、数据库建立三、检索原理四、检索步骤2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室2一、基本概念

信息检索是信息用户的需求和信息集合的比较与选择，即匹配(match)的过程。用户根据检索需求，对一定的信息集合采用一定的技术手段，根据一定的线索与准则找出相关的信息。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室3信息收集收集、筛选原始信息。信息存储与标引提取、标注原始信息的特征，并进行规范化处理。把每个特征录入到对应的字段（field）中。二、数据库建立2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室4信息源（原始信息）特征1特征2特征3特征4特征5特征n提取特征2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室5数据库对文献的记录方式（CBM）中国图书馆分类法医学主题词表（MeSH）格式规范字段名2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室6经过规范化处理后的文献书目数据库中，描述一篇文献的所有字段组成一条记录（record）一段时间或某内容范围内的记录集合构成数据库文档（file）数据库的结构：文档（File）记录（Record）字段（Field）数据库的结构2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室7记录、字段示例（PubMed）2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室8PubMed的字段题录字段：TI题名AU作者SO文献来源主题词字段MH–KidneyFailure/*drugtherapyMH–*HepatitisAMH–Male2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室9用户输入检索需求分析转换处理需求数据库分类法概念词典控制词表原始信息筛选录入特征提取与标注分类、索引等匹配运算检索结果三、信息检索原理2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室10四、信息检索步骤分析课题，明确要求选择检索工具确定检索途径及标识确定检索运算符构筑检索语句，获取检索结果常见信息需求分析查找某概念的确切含义：如：“什么是端粒酶”

查找某概念的背景知识如：“谁最先发现了传染性蛋白”查找某些事物的数值及量化指标:如：“2003-2004我国肺癌的发病率”如：“阿司匹林的中毒剂量”查找某一类学科一般知识：如：“有关分子生物学有哪些专著”查找学科专业领域的新进展:如：“有关端粒酶与白血病相关性研究的综述文献”查找专业课题相关的研究文献；如：“端粒酶在诊断白血病方面的价值评估”

特征型知识（事实、数值类数据库、搜索引擎）体系化知识（文献数据库）2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室121.分析课题，明确要求了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断的信息，以解决研究中的具体问题，要求以“准”为主。申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时，往往需要全面地收集某一主题范围的文献信息，这类课题具有普查追溯的特点，应着眼于“全”。131、分析课题、明确要求141.分析课题，明确要求对于研究生做学位论文来说，做课题前应充分了解一下本课题国内外的研究现状(即论文的综述部分)，这时应对该课题进行较全面的检索，包括综述性的文章，要求“全”；对于该课题的核心部分，即该课题所要解决的具体问题，创新的地方，则需要“准”，技术细节越细越好。1、分析课题、明确要求152.选择检索工具核心检索系统数据库多，文献量大，能系统、全面地获取课题相关文献，有助于发现交叉学科的文献。专业数据库专指性强，专业文献收录全，能获取高相关度的论文。全文数据库

能直接下载全文，补充核心系统和专业库未收录的资源事实、数值数据库、网络检索引擎能检索具体数值、特征、事实信息（名词解释、统计数据等），专业机构网站可了解课题背景信息和动态。（1）核心检索系统供用户输入检索指令，按用户要求检索数据库，返回命中结果的检索平台/软件。在一个检索系统可以同时检索一个或多个数据库16WebofScience其中SCI数据库为科技部指定学术成果评定库，科技论文统计库。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室17（1）核心检索系统NCBI美国国立生物技术信息中心是关于分子生物学，生物化学和遗传学知识的存储和分析系统2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室18（1）核心检索系统中国知网国内大型检索平台收录各种类型的信息资源，以中文信息为主。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室19（1）核心检索系统（2）医学常用数据库1.PubMed（文摘）2.Webofscience核心合集（文摘）3.OVID-EBM—循证医学数据库（文摘）4.Elsevier,EBSCO…期刊全文数据库5.PQDT学位论文数据库（部分全文）6.SpringerLinkBook电子图书2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室20（2）医学常用数据库7.中国知网—期刊、学位论文（全文）8.万方数据—期刊、会议、学位论文等（全文）9.中国生物医学文献数据库（文摘）10.超星电子书（全文）2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室21（3）数据库选择策略核心检索系统WOS、NCBI、中国知网全文数据库

ELSEVIER,EBSCO…纸本文献图书馆馆藏、联合目录INTERNET原始文献学术图书、期刊论文、学位论文、会议论文2023/3/1722医学常用数据库PubMed、CBM3、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室23分类检索：

浏览学科/专业的研究方向和热点规范化工具：中图法—中国图书馆分类法（第4版）

Q生物学

R医药卫生

R1预防医学与卫生学

……R6外科学

R65外科学各论

R651头部及神经外科学

R651.15颅脑损伤常用限制字段：CL，分类名，分类号分类号分类名2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室24分类检索举例：CBM2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室25选择并输入分类号直接检索分类检索举例：CBM26子类点击类名执行检索3、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室27

1.关键词检索课题：肾衰竭饮食治疗的相关文献检索标识：关键词

常用限制字段：关键词（keyword）

概念1：肾衰竭（renalfailure） 关键词：肾衰竭、肾衰、肾功能衰竭/不全等

概念2：饮食治疗（diettherapy）关键词：饮食、膳食、营养等主题检索途径：查找课题有关的专指概念的文献2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室28

主题检索途径

关键词检索举例（CBM）直接选择检索字段输入检索词肾衰竭肾衰竭输入检索词肾功能衰竭肾功能衰竭2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室29主题检索途径

2.主题词（subjectheadings）检索主题词：主题词表控制的统一检索用词医学主题词表（MedicalSubjectHeadings） 由NLM编制和修订，Medline和CBM采用该词表对文献的主题进行规范化处理和标注。常用限制字段：MESH，MJME，DE，主题词2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室302.规范化主题词检索

文章A著者用词：肾衰竭renalfailure

由于作者的用词习惯不同，文献在录入数据库时将进行规范化处理，用统一的词来标注相同主题的文献。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室31

文章B著者用词：肾功能衰竭kidneyfailure

CBM数据库中的主题词表查询2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室322.规范化主题词检索

文章B著者用词肾功能衰竭kidneyfailure主题词：肾功能衰竭MeSH:RenalInsufficiency

查询词表后，文章A，B均被标注上规范化的主题词

文章A著者用词肾衰竭renalfailure主题词：肾功能衰竭MeSH:RenalInsufficiency

2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室332.规范化主题词检索数据库中规范化主题词的标注（CBM）带*的是主要主题词是文献重点论述的内容2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室34副主题词（subheading）用于细分和限定主题词研究范围的规范词: MEDLINE数据库83个()如：诊断：诊断,放射摄影术,放射核素成像,超声检查等治疗:治疗,药物疗法,膳食疗法,放射疗法,外科学等病因:病因学，先天性，遗传学等药物作用：治疗应用，副作用等2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室35副主题词Subheading2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室36点击得注解主题检索途径

3.自由词（任意词）检索 自由词——著者写文章时所用的自然词语,包括关键词、标题、文摘、全文等。 常用限制字段：TI,AB,Topic,FullText

例：文摘：肾衰竭2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室373、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室38著者检索途径

查找某人发表的文献检索标识：著者姓名常用限制字段：au，作者，第一作者英文数据库经常对著者姓名的格式进行规范化处理。著者姓名的转换：姓全称在前，名首字母在后

JasonSmithHenryM.Williams顾玉东2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室39smithJwilliamsHMguyd著者检索途径举例：WebofScience2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室40检索顾玉东教授发表的文献，输入:guyd3、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室41刊名检索

检索某刊物上发表的文献检索标识：刊名缩写或全称常用限制字段：SO，PublicationName,journal,刊名，出处等刊名全称检索

NewEnglandJournalofMedicine有的英文数据库对刊名的书写格式进行了规范化处理，也可以用数据库制定的标准刊名缩写检索如：NEnglJMed（PubMed）2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室423、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室43机构检索

查找某机构学者发表的文献检索标识：机构名缩写或全称常用限制字段：AD,addressword，institution,organization,affiliation,机构，地址等。有的英文数据库对机构的书写格式进行了规范化处理，只能用数据库制定的标准机构名缩写检索：

FudanUniv（WebofScience）2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室443、确定检索途径及标识检索途径检索标识（检索词）分类检索分类名、分类号主题检索关键词、自由词、规范词著者检索著者姓名刊名检索刊名缩写与全称机构检索机构名称缩写与全称引文检索被引用文献的检索标识2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室45引文检索途径

查找文献的引用与被引用关系1.引文回溯： 是在文献原文后的参考文献（被引用文献）中筛选与课题相关文献的方法。例：课题：α干扰素治疗肾综合征出血热疗效研究2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室46引文回溯举例：冯智霖，徐邦强.干扰素α-1b治疗肾综合症出血热的临床疗效.中国临床药学杂志.2003，12(1)：9-102023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室47引文检索途径

查找文献的引用与被引用关系2.引文检索：

是通过被引用文献的特征，来检索引用文献的方法。被引文献特征包括：某一著者的文献被什么人、什么文章引用？被引用的次数？某期刊被文献引用的次数？某主题的文献被引用的次数等。常见限制字段：引文,参考文献,citedauthor等2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室484、确定检索运算符检索运算符：用于连接不同的检索词、进行比较运算或对字段进行统计运算的符号逻辑算符（布尔算符）精确匹配符（词组、短语）位置算符（邻近算符）截词符与通配符2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室49逻辑算符（布尔算符）逻辑“与”：表示两个检索词必须同时出现，表示“相交”关系。有“and”，“*”，“并且”，“与”，“并含”等表达形式。ABAandB

肾衰竭and

手术2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室50逻辑“与”-CNKI2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室51逻辑“或”：表示两个检索词至少出现其中一个，表示“并列”关系。有“or”，“+”，“或者”，“或”等表达形式。BAorBA肾衰or肾衰竭or肾功能衰竭2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室52逻辑算符（布尔算符）逻辑“或”-万方2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室53逻辑“或”-万方2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室54逻辑算符（布尔算符）逻辑“非”：表示含有前一检索词同时不含有后一检索词，表示“不包含”关系。有“not”，“-”，“不包含”，“排除”等表达形式。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室55AB肾衰竭not慢性AnotB逻辑“非”-维普2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室56运算次序：一般为：not→and→or例：*课题：序列分析的工具和方法序列分析并且（工具或者方法）sequenceanalysisand(toolormethod)注意：在一个检索式中同时出现and,or时，如果要先算or的部分，应把or的部分输在前面，或输在一个检索框内。如果在专家检索中输入检索式，应用括号括起or的部分。2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室57逻辑算符（布尔算符）逻辑算符应用举例2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室58逻辑算符应用举例2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室59逻辑算符应用举例2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室60TI=(sequenceanalysisAND(methodORtool))精确匹配符（词组、短语）严格按输入的词组或短语形式匹配，不能插词，词序不能互换表达形式：半角的“”,“精确匹配”选项。短语中含禁用词（and,or,not等），必须用“”括起，否则系统将把and作为逻辑运算符处理。 例：“acuteandchroniclowbackpain”2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室61

精确匹配符：“”2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室62不用“”的结果用于限定检索词之间的间隔单词数。有adj,near,N,W等表达形式。例：tonguew/2base（Elsevier）表示两个检索词中间最多允许插2个词，词序可以互换。可检出以下短语：baseofthetongue；baseoftongue；tonguebase2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室63位置算符（邻近算符）位置算符举例：Elsevier2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室64tonguew/2base检索间最多插入2个单词

截词符与通配符截词符（truncation）：*,$用于词尾、词中或词首，替代0个或任意多个字符。例：WebofKnowledge，Elsevier:右截：compute*可检索到以下词：

compute,computers,computed等中截：com*ers可检索到：

comers，computers，combiners,等

PubMed：

*只能右截，用于词尾2023/3/17复旦大学图书馆文献检索教研室65截词符与通配符通配符（wildcard）：?,$,#等用于词中、词尾，一个通配符替代一个或0个字符。例：WebofKnowledge:colo$r

可检索到：color,colourcomp