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文档简介
章核酸的理化性质研究方法详解演示文稿当前1页,总共23页。(优选)章核酸的理化性质研究方法当前2页,总共23页。核酸的化学结构和作为高聚物决定其理化性质:核酸的糖苷键和磷酸二酯键:可被水解;磷酸基和碱基:酸碱性质;碱基:紫外吸收特性;双螺旋结构:变性和复性。当前3页,总共23页。一、核酸的水解(一)酸水解糖苷键比磷酸酯键更易被酸水解,产生嘌呤和嘧啶碱(二)碱水解RNA的磷酸酯键更易被碱水解(RNA的核糖上有2’-OH,在碱作用下形成磷酸三酯,极不稳定易水解,产生核苷2’,3’-环磷酸酯,继续水解产生2’-核苷酸和3’-核苷酸)当前4页,总共23页。(三)酶水解专一水解核酸的磷酸二酯键的酶称为核酸酶(nuclease)。能识别特定的核苷酸顺序,并从特定位点水解核酸的内切酶称为限制性核酸内切酶(限制酶)。
当前5页,总共23页。1、核酸酶的分类(1)按底物专一性分类:核糖核酸酶(ribonuclease,RNase):作用于核糖核酸;脱氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease,DNase):作用于脱氧核糖核酸;(2)按底物作用的方式分类:核酸外切酶(endonuclease):从多核苷酸链的末端开始,逐个将核苷酸切下的酶;核酸内切酶(exonuclease):从多核苷酸链的内部开始水解核酸的酶。当前6页,总共23页。(3)按磷酸二酯键断裂的方式分类:一种是在3’-OH与磷酸基之间断裂,其产物是5’-磷酸核苷酸或寡核苷酸,如(1);另一种是在5’-OH与磷酸基之间断裂,其产物是3’-磷酸核苷酸或寡核苷酸,如(2)。PPPNNN(1)(2)(1)(2)5’3’当前7页,总共23页。2、核糖核酸酶类牛胰核糖核酸酶、核糖核酸酶T1、核糖核酸酶T2等;3、脱氧核糖核酸酶类牛胰脱氧核糖核酸酶、牛脾脱氧核糖核酸酶、限制性内切酶等。4、N-糖苷酶当前8页,总共23页。核酸酶底物切点产物胰核糖核酸酶RNA内切核酸酶嘧啶3’端,留下3’-P3’嘧啶单核苷酸或3’-嘧啶核苷酸结尾的寡聚核苷酸蛇毒磷酸二酯酶RNA,DNA外切核酸酶3’端,留下3’-OH5’-单核苷酸牛脾磷酸二酯酶RNA,DNA外切核酸酶5’端,留下5’-OH3’-单核苷酸大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ单链DNA外切核酸酶5’端,留下5’-OH3’-单核苷酸及一个末尾二核苷酸大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ双链DNA外切核酸酶3’端,留下3’-OH5’-单核苷酸当前9页,总共23页。当前10页,总共23页。二、核酸的酸碱性质1、碱基的解离C的N3有一对未共用电子,可与质子结合;C的烯醇式羟基具有释放质子的能力;U的N3酸性解离的pK1’=9.5;T的N3酸性解离的pK1’=9.9;A的N1pK1’=4.15G的N7pK1’=3.2
N1pK2’=9.6;N9pK3’=12.4当前11页,总共23页。2、核苷的解离戊糖的存在增强了碱基的酸性解离:A的N1pK1’由4.15降为3.63;C的pK1’由4.6降为4.15;当前12页,总共23页。3、核苷酸的解离HpK1’=1.5当前13页,总共23页。核苷酸有磷酸与碱基,为两性电介质;U的碱基碱性极弱,不能形成兼性离子;A,G,C中,pK1’:第一磷酸基-PO3H2的解离;pK2’:含氮环=N+H-的解离;pK3’:第二磷酸基-PO3H-的解离;故其pI=(pK1’
+pK2’)/2DNA变性双链打开后,碱基即参与酸碱滴定。
当前14页,总共23页。三、核酸的紫外吸收Py和Pu有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸和核酸能吸收紫外光,最大吸收峰为260nm。不同核苷酸当前15页,总共23页。A260=εCL公式中,A260为光密度
ε,为260nm处的碱苦摩尔消光系数
C,为每升溶液中碱基的摩尔数
L,为比色杯内径的厚度如:已知鸟嘌呤溶液的A260=0.325,
ε=7.2X103,L=1cm,则:C=0.325/(7.2X103X1)=4.5X10-5(mol/l)紫外光区最大吸收:260nm,定性定量分析当前16页,总共23页。第五节DNA的理化性质及其应用一、核酸的一般理化性质核酸具有酸性;粘度大;当前17页,总共23页。二、DNA的变性
在理化因素作用下,DNA双螺旋的两条互补链松散而分开成为单链,从而导致DNA的理化性质及生物学性质发生改变,这种现象称为DNA的变性(denaturation)
。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。
当前18页,总共23页。①增色效应:指DNA变性后对260nm紫外光的光吸收度增加的现象;②旋光性下降;③粘度降低;④生物学功能丧失或改变。引起DNA变性的因素主要有:①高温,②强酸、强碱,③有机溶剂等。DNA变性后的性质改变:
当前19页,总共23页。
DNA的变性温度:加热DNA溶液,使其对260nm紫外光的吸收度突然增加,达到其最大值一半时的温度,就是DNA的变性温度(融解温度,Tm)。当前20页,总共23页。
Tm的高低与DNA分子中G+C的含量有关,G+C的含量越高,则Tm越高。Tm=69.3+0.41(%G+C)12nd当前21页,总共23页。三、DNA的复性与分子杂交将热变性后的DNA溶液缓慢冷却,在低于变性温
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