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文档简介
地中海贫血电泳及结果分析1、本实验目的:
学习与掌握DNA电泳的技术方法,利用琼脂糖凝胶电泳检测和凝胶成像系统判断α地贫的基因类型。2、实验原理:
电泳概念及种类影响琼脂糖电泳迁移的主要因素原理DNA分子是两性电解质,在高于其等电点的溶液(pH8.0~pH8.3)中,碱基几乎不解离,磷酸基团全部解离,DNA分子带负电荷,在电场中向正极移动。电泳时DNA分子颗粒在电场中通过凝胶介质而泳动。颗粒带净电荷多,直径小而接近于球形,则在电场中泳动速度快,反之则泳动速度慢。琼脂糖是从海藻中提取的、由D-和L-半乳糖残基通过α和β糖苷键交替构成的线状聚合物。琼脂糖链形成螺旋纤维,然后再聚合成半径为20-30nm的超螺旋结构。
干的琼脂糖悬浮于缓冲液中,加热煮沸变为澄清,室温冷却、凝聚,即成琼脂糖凝胶。原理琼脂糖凝胶的孔径可以通过琼脂糖的最初浓度来控制,低浓度的琼脂糖形成较大的孔径,而高浓度的琼脂糖形成较小的孔径。凝胶浓度
DNA分子大小
DNA分子的构象缓冲液电泳电压主要检测:分子量,含量及有无影响DNA在琼脂糖凝胶中迁移率的因素琼脂糖浓度
相同大小的线状DNA片断在不同浓度的琼脂糖凝胶中迁移率不同.
琼脂糖浓度(%)分离范围(kb)
0.3
5-60
0.6
1-20
0.7
0.8-10
0.9
0.5-7
1.2
0.4-6
1.5
0.2-4
2.0
0.1-3DNA分子的大小双链DNA分子在凝胶中迁移的速率与其碱基数的常用对数成反比。分子越大,迁移越慢。一是摩擦阻力越大,二是大分子通过凝胶孔径的效率低于较小的分子。DNA的构象DNA的构象不同构象DNA分子在电场中移动的距离不同。具有相同分子量的线状、开环状和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度不同。迁移速度:超螺旋的DNA>线状DNA>开环DNA。
电泳电压低压条件下,线状DNA在琼脂糖凝胶上泳动速度和电压成正比。随着电压升高,高分子量的DNA片段泳动速度和电压不成正比关系,分辩率下降了,因此为了得到良好的分离效果,电场电压不要超过5V/CM。
缓冲液DNA的泳动受缓冲液的组成和离子强度的影响。最常用的缓冲也是TAE(Tris-醋酸-EDTA)和TBE(Tris-硼酸-EDTA)。指示剂常用的电泳上样缓冲液含溴酚蓝,有的还含有二甲苯青,这些指示剂可以指示电泳的速度,也可以利用其迁移率大致估计DNA的分子量,而与琼脂糖浓度无关。染色溴化乙淀(EB)是核酸的染色剂,能插入DNA分子中形成荧光结合物,EB在紫外线照射下的发射荧光。荧光的强度与DNA的含量成正比,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置及估计出待测样品的浓度。EB是强致癌剂。染色吖啶橙(AO)是一种荧光色素,可与核酸亲和的荧光活体染料。荧光显微镜下核呈绿色,细胞质呈黄色。吖啶橙AO常与溴化乙啶EB合用双染.吖啶橙染液有毒,操作时要戴手套,需避光。电泳操作步骤(整个过程要求带一次性手套)1、胶槽准备
①取出胶板和梳子,将胶板放入胶槽中;②将梳子垂直插入到胶槽的小凹槽内,梳齿底端和板面有1mm的间隙;③将胶槽放在调整好的水平台上。
2、凝胶准备
用1×TAE配制1%琼脂糖凝胶。①称0.15g琼脂糖置三角瓶中,加15ml1×TAE;②微波炉加热大约1分钟,熔化琼脂糖;③熔化的琼脂糖自然冷却到60~70℃时,加入EB5μl(0.5mg/ml
),并轻轻混匀。
3、铺胶:将冷却致60℃的凝胶倒入准备好的胶槽内,凝胶厚度3~5mm,室温下静置半小时左右,凝胶固化。4、轻轻拔出固定在凝胶中的梳子。将带凝胶的胶板置于电泳槽中,并使样品孔位于电场负极,向电泳槽中加入1×TAE电泳缓冲液,越过凝胶表面即可。5、原梳齿处(样品孔)即被缓冲液充满,如发现有气泡,应设法去除。
6、样品准备:向核酸样品中加入约为样品体积1/10的上样缓冲液,用加样器轻轻混匀。
7、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。9、电泳结束后,切断电源,取出凝胶。8、盖上电泳槽,接通电源,开始电泳
开始电泳前,再次确认凝胶样品孔处于电场的负极。电泳条件:电压5v/cm;时间40-60分钟左右10、电泳结果分析:
①紫外检测仪直接观察电源条带②摄影记录
电泳结果分析电泳完毕,关上电源,在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置,并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产物的大小。
α地贫电泳结果分析电泳条
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