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文档简介
htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://EASYspinPlus细菌RNA快速提取试剂盒目录号:RN43眨编号包装单位RN430250次♦:♦适用范围:适用于快速提取细菌总RNA,使用独有基因组DNA清除柱技术确保有效清除gDNA残留,不需要使用DNase消化,RNA可直接用于反转录PCR,荧光定量PCR.。♦试剂盒组成、储存、稳定性:试剂盒组成保存50次TE(PH8.0)室温6ml溶菌酶4c20mg裂解液RLTPlus室温25ml去蛋白液RW1室温40ml漂洗液RW室温10ml一第一次使用前按说明加指定量乙醇70%乙醇室温9mlRNase-freeHO2第一次使用前按说明加指定量乙醇RNase-freeHO室温10ml基因组DNA清除柱和收集管RNase-free吸附柱RA和收集管室温50套室温50套本试剂盒在室温储存6个月不影响使用效果。
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://储存事项:.所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37。。水浴加热几分钟,即可恢复澄清。.不合适的储存于低温(4。。或者一20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃—25℃)进行。.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。注意事项所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机,MEppendorf5415C或者类似离心机。样品处理量绝对不要超过基因组吸附柱DA和和RNA吸附柱RA处理能力,否则造成DNA残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时宁可使用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。裂解液RLTPlus和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。关于DNA的微量残留:一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),本公司的EASYspinPlusRNA提取产品,由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已经被清除,不需要DNase消化,可直接用于反转录PCR和荧光定量PCR。个别特殊情况如DNA含量过于丰富造成残留或者要进行严格的mRNA表达量分析荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://增反应。选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。将RNA提取物用RNase-free的DNaseI处理。本试剂盒还可以用于DNaseI处理后的RNA清洁(cleanup),请联系我们索取具体操作说明书。在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNaseI处理。请联系我们索取具体操作说明书。RNA纯度及浓度检测:完整性:RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1.2%;0.5XTBE电泳缓冲液;150v,15分钟)检测完整性。由于细胞中70%-80%的RNA为rRNA,电泳后UV下应能看到非常明显的rRNA条带。动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18SrRNA。动物RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的参考指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数(10mMTris,pH7.5)在2.1-2.2之间(100%纯的RNA比值一般是2.2左右,很多公司无法达到这个标准,所以1.9-2.0就凑合用了,但是我们的产品标准一般可以达到2.1-2.2)。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10mMTris,pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯。浓度:取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀释n倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260,OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/〃)l=(OD260)x(稀释倍数n)x40杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://♦:♦ 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)提示:“第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇!“提取细菌RNA需先配制加了溶菌酶的TE(10mMTris-HCl,1mMEDTAPH8.0),TE中溶菌酶的终浓度为1mg/ml。离心收集1-2ml菌液(约108-109细胞)到一个1.5ml离心管,尽可能去除上清,注意残留的上清不能超过20回。根据细胞的种类和数量,充分重悬细胞在100m(<5x108细胞)/200m(5x108-7.5x108细胞)TE中(TE中需先加入溶菌酶,终浓度浓度为1mg/ml)或者直接用TE重悬后,用干净枪头挑取少许溶菌酶加入。室温(15-25℃)温育5分钟/溶菌酶,破解细胞壁。每2分钟涡旋振荡10秒帮助破壁。注意各种细菌破壁的难易程度不一样,一般革兰氏阴性菌E.coli使用上面的条件就足够了,甚至可能省略该步骤,但是某些革兰氏阳性菌如B.subtilis难破壁需要提高溶菌酶浓度到15mg/ml和温育时间到10分钟。如果金黄色葡萄球菌需要加入lysostaphin到1mg/ml,37c温育15分钟。总之不同细菌类型破壁难易程度不同,有的难破壁的种类需要根据用户自己的具体情况调节酶的种类、工作浓度和温育温度、时间,此外还可以联合使用玻璃珠击打,机械破壁,蛋白酶K消化等方法帮助破壁。短暂离心收集细胞到管底,吸弃上清。涡旋振荡重悬分散细胞。加入500m裂解液RLTPlus,吹打混匀后用手剧烈振荡20秒,充分裂解。一般加入裂解液后充分涡旋吹打后应该见不到明显团块或者不溶物,极少数情况下如果有明显团块或者不溶物可以将裂解物13,000rpm离心3分钟,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物,取裂解物上清进行下一步。
杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://杭州昊鑫生物科技股份有限公司htpp://立刻将裂解物加入一个DNA清除柱上(清除柱放在收集管内)13,000rpm离心60秒,保留滤过液(RNA在滤过液中)。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为500回,滤过时候损失体积应该减去),加入等体积的70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。立刻将混合物(每次小于700或多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm离心60秒,弃掉废液。加700m去蛋白液RW1,12,000rpm离心30秒,弃掉废液。加入500m漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm离心30秒,弃掉废液。加入500m漂洗液RW重复一遍。将吸附柱RA放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。取出吸附柱区八,放入一个RNasefree离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50可RNasefreewater(事先在70-90℃水浴中加热可提高产量),室温放置1分钟,12,000rpm离心
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