基因体计画(续)

基因體計畫(續)陽明生物資訊所楊永正Jan.3,2005定位選殖

(例如Huntingtondisease,

Cysticfibrosis,

etc.)

由候選基因中尋找致病基因/GeneticTrail/gatefold/gate2.htmHGP利用定位選殖法

尋找致病基因Chromosomewalking&positionalcloning利用位置尋找候選的致病基因致病基因利用基因連鎖分析尋找致病基因之位置註解指定區域預測致病基因(Positional-candidategenecloning)海峽對岸已能選殖出致病基因1.

Atrialfibrillation(AF)isacommoncardiacarrhythmiawhosemolecularetiologyispoorlyunderstood.WestudiedafamilywithhereditarypersistentAFandidentifiedthecausativemutation(S140G)intheKCNQ1(KvLQT1)geneonchromosome11p15.5.FunctionalanalysisoftheS140Gmutantrevealedagain-of-functioneffectontheKCNQ1/KCNE1andtheKCNQ1/KCNE2currents.Thus,theS140GmutationislikelytoinitiateandmaintainAFbyreducingactionpotentialdurationandeffectiverefractoryperiodinatrial

myocytes.Chenetal(2003)KCNQ1Gain-of-FunctionMutationinFamilialAtrialFibrillation.Science299,251-254.2.上海交通大学／中國科學院上海生命科學研究院把“A-1型短指(趾)症”基因定位於2號染色体長臂的特定區域，成功地發現並選殖了導致"A-1型短指（趾〕症“的IHH基因，在世界上首次揭示了IHH基因在引起人類遗傳疾病中的作用。這項重要成果發表在2001年7月出版的《NatureGenetics》雜誌上。疾病模型:脊髓小腦萎縮症腦部MRI掃瞄結果。右方是正常人、左方為病人，比較後可看見以圓圈框起來的小腦部分，在病人小腦有萎縮的情形。致病原因:三核苷酸重複序列擴增Normal:1,2,4,7,10Patients:3,5,6,9以第七型為例

正常人:CAG重複4–35次

病患:CAT重複

37-200次SCAdb候選基因名單設計引子,篩選

致病基因找到致病基因後,可利用轉殖鼠技術建立動物模型“預測”與三核苷酸重複序列擴增相關的疾病所需解決的問題Lookforalltri-nucleotiderepeatsCollectpredictedpolymorphicrepeatsPredictcandidategenesor

discovernoveldiseasegenes??為何只有部份的三核苷酸重複序列具有多型性?檢視臨近序列的特徵500bp500bp(CAG)n預測與三核苷酸重複序列擴增相關的疾病所需解決的問題Lookforalltri-nucleotiderepeatsCollectpredictedpolymorphicrepeatsPredictcandidategenesor

discovernoveldiseasegenes哪一個具多型性的重複序列會致病?由序列預測多型性決定模型生物序列的重要性建立研究致病基因的上,中,下游研究團隊,此研究模式未來可應用在其他疾病研究上Collectpatients

orpatientfamiliesGenotypingLinkageanalysisCandidategene

predictionExperimental

verification腦組織庫是連接上,中游團隊與下游團隊的橋樑致力尋找新的致病基因,未來可從研究腦的疾病擴展到其他系統的疾病研究病理機轉建立理想的動物模式循找可能的治療途徑加速開發及試驗新的藥物進行人體試驗老榮民慷慨捐腦，有助分子層次的疾病研究，無奈沒有經費設置腦組織庫。Family3致病基因

落在此區SCA候選基因資料庫要尋找致病基因,必須收集病人的家族,並採集樣品病人瞭解研究成果可能賺錢嗎?病人的隱私權怎麼保護?

多餘樣品怎麼處理?有樣品就有權力?…能夠尋找致病基因,也能尋找…造成殘暴的基因造成聰明的基因…由序列比對尋找SNP修改自張猷忠博士之圖片由序列比對尋找SNP本圖片由張猷忠

博士提供發生在基因不同部位的SNP

造成的影響

本圖片由張猷忠博士提供疾病檢驗與個人化之疾病治療基因晶片人的分類能夠將人分類,就能…劃分階級(“千鈞一髮”的例子)選擇性地拒絕投保戶…與基因定序相關的倫理,社會與法律問題決定誰的序列?基因是否可以申請專利?