肿瘤分子诊断课件

肿瘤分子诊断服务介绍肿瘤分子诊断课件标准化用药个体化用药标准化用药个体化用药标准疗法1标准疗法2标准疗法32精选版课件ppt标准化用药个体化用药标准化用药个体化用药标准疗法1标准疗法2肿瘤药物与相关靶标3精选版课件ppt肿瘤药物与相关靶标3精选版课件ppt如何实现个体化用药？分子分型药物疗效4精选版课件ppt如何实现个体化用药？分子分型药物疗效4精选目前的服务目前的平台目前的客户肿瘤TaqMan-ARMs医院感染性疾病测序健康管理公司新生儿筛查实时定量PCR研究所qPCR-HRM药厂循环肿瘤细胞（CTC）保险公司5精选版课件ppt目前的服务目前的平台目前的客户肿瘤TaqMan-ARMs医院体细胞基因突变检测mRNA表达检测循环肿瘤细胞（CTC)检测基因多态性检测6精选版课件ppt体细胞基因突变检测mRNA表达检测循环肿瘤细胞（CTC)检测体细胞基因突变检测EGFR,K-RAS,B-RAF，C-KIT7精选版课件ppt体细胞基因突变检测EGFR,K-RAS,B-RAF，C-1、基因突变检测技术

——qPCR-HRM（可用于血浆标本检测）——Taqman-ARMS（与国际获批的技术相当）——DNA测序（基因突变检测的金标准技术）8精选版课件ppt1、基因突变检测技术

——qPCR-HRM（可用于血浆标本突变检测技术之一Taqman-ARMS所有定量PCR仪均可使用。

主要用于各类组织，包括手术、穿刺或镜检组织类。2小时即可完成检测试剂盒商业化程度高，临床认可程度高

国内已有试剂盒获批SFDA9精选版课件ppt突变检测技术之一Taqman-ARMS所有定量PCR仪突变检测技术之一

qPCR-HRMqPCR-HRM技术是基于高效稳健的PCR上的高分辨熔解曲线分析（High-ResolutionMelting）技术，灵敏度可以达到1%-0.1%，既能检测已知突变，也能检测未知突变。

qPCR-HRM的突变检测已获国际多中心双盲实验验证（JournalofMolecularDiagnostics,Vol.11,No.6,November2009）。实例图：利用HRM技术对7个样本分别进行EGFR（左图）、KRAS（右图）突变检测，红色表示该样本发生突变，蓝色表示未突变，蓝色横直线为阴性对照。左图显示2个样本发生了EGFR突变；右图显示4个样本发生了KRAS突变。EGFRKRAS10精选版课件ppt突变检测技术之一qPCR-HRMqPCR-血浆EGFR突变检测：18号外显子：无突变19号外显子：突变20号外显子：无突变21号外显子：无突变附图主要特点：

实现血浆中来自肿瘤的微量DNA的突变检测。

目前所做的临床实验中，血浆EGFR检测结果与其手术标本之间的整体符合率符合率达到91.25%。

是临床上不能手术、也同时不愿穿刺患者的替代检测方案；也可获得性耐药进行预先检测。qPCR-HRM用于血浆微量突变检测11精选版课件ppt血浆EGFR突变检测：主要特点：qPCR-HRM用于血浆微国际公认的分子检测金标准有明确的物价收费实验流程较复杂，需要大型仪器突变检测技术之一

DNA测序12精选版课件ppt国际公认的分子检测金标准突变检测技术之一DNA测序12精肿瘤类型靶向药物基因疗效佳的情况非小细胞肺癌易瑞沙（Iressa）特罗凯（Tarceva）EGFRKRASEGFR突变/KRAS野生胃肠间质瘤格列卫（Gleevec）C-KitC-kit第11外显子突变/PDGFR突变结直肠癌爱必妥KRASBRAF野生型突变检测项目列举13精选版课件ppt肿瘤类型靶向药物基因疗效佳的情况非小细胞肺癌易瑞沙（IresEGFR突变检测EGFRE19/E21敏感突变

适合使用TKI药物治疗耐药位点检测T790M14精选版课件pptEGFR突变检测EGFRE19/E21敏感突变耐药位K-RAS突变检测15精选版课件pptK-RAS突变检测15精选版课件pptBRAFNCCN2010年NCCN《结直肠癌临床实践指南》指出：K-ras基因为野生型而同时具有BRAFV600E突变的患者，靶向EGFR抗体治疗无效。BRAF-V600E检测肿瘤学临床实践指南（中国版）2010第一版16精选版课件pptBRAFNCCN2010年NCCN《结直肠癌临床实践指导肿瘤靶向治疗的靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容吉非替尼/厄洛替尼EGFR基因突变野生型耐药突变型敏感西妥昔单抗K-ras，B-raf基因突变野生型敏感突变型耐药伊马替尼C-Kit基因突变野生型耐药突变型敏感17精选版课件ppt指导肿瘤靶向治疗的靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内基因多态性检测与药物代谢毒性(UGT1A1,CYP,DPD)18精选版课件ppt基因多态性检测与药物代谢毒性18精选版课件ppt单核苷酸多态性（SNP）是最常见的基因变异至少1%的人群绝大多数人群共有序列GtoCSNP

位点变异的序列最常见的基因多态性SNP19精选版课件ppt12/19/2022单核苷酸多态性（SNP）是最常见的基因变异至少1%的人群绝大为什么

SNPs重要?个体1个体2=SNPvariationsinDNASNP标志基因A基因B基因ASNP可能使基因B产生变异的蛋白质分子20精选版课件ppt12/19/2022为什么SNPs重要?个体1个体2=SNPvari个体的SNP谱SNP谱ASNP谱BSNP谱CSNP谱FSNP谱ESNP谱D21精选版课件ppt12/19/2022个体的SNP谱SNP谱ASNP谱BSNP谱CSNPSNP谱有助于确定药物的疗效和副作用乳腺癌病人个体的SNP谱可以分成不同的类型SNP谱A对药物有期望的反应对药物没有期望的反应SNP谱A的人对药物有期望的反应SNP谱ESNP谱BSNP谱CSNP谱D22精选版课件ppt12/19/2022SNP谱有助于确定药物的疗效和副作用乳腺癌病人个体的SNP药物代谢与SNP检测化疗药物在体内经过吸收、代谢、分布和清除，通过其活性物质对治疗靶点的直接攻击而发挥作用，整个过程需要多种蛋白质/酶的共同参与和协同作用。SNP主要是指在基因组水平上变异频率大于1%的单核苷酸变异所引起的DNA序列多态性，多态性会导致不同个体体内各种蛋白，酶活性的差异，因此导致药物使用情况的不同。23精选版课件ppt药物代谢与SNP检测化疗药物在体内经过吸收、代谢、分布和清除胆红素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶基因（UGT1A1）UGT1A1*27(C686A)或UGT1A1*28[(TA)7TAA]:

野生型：6个TA

UGT1A1*6(G211A)：使UGT1A1的转录活性下降了三分之二。导致对伊立替康的毒性增加。FDA提示：UGT1A1的多态性-伊立替康的毒性增加(6TA)此型的酶活性是野生型的49％

。24精选版课件ppt胆红素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶基因（UGT1A1）UGT1CYP19A1多态性影响芳香化酶抑制剂疗效CYP19A1是芳香化酶的编码基因，临床研究已证实有着很大的影响作用。在接受芳香化酶抑制剂治疗的乳腺癌患者中，携带CYP19A1基因rs4646（G>T）突变患者的治疗效果较无此突变的患者显著2-4（下图）。CYP19A1rs4646（G>T）SNP是乳腺癌患者接受芳香化酶抑制剂治疗疗效的有效预测指标。

如图一项对乳腺癌患者的临床研究显示：CYP19A1基因rs4646突变的患者使用芳香化酶抑制剂药物疗效明显优于野生型患者（p<0.0001）1。参考文献

1.IanESetal.NEnglJMed.2003;384:2431-42.

2.RamonCetal.ClinCancerRes.2008;14:811-6.

3.LunardiGetal.JClinOncol.2009;27:555.

4.FaschingPAetal.BreastCancerResTr.2008;112:89-98.25精选版课件pptCYP19A1多态性影响芳香化酶抑制剂疗效CYP19A1是基因表达检测（mRNA表达）(ERCC1\BRCA1\TUBB3\TS)26精选版课件ppt基因表达检测（mRNA表达）26精选版课件ppt基因表达检测指标（靶向药物）相关肿瘤药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容结直肠癌贝伐单抗VEGFRmRNA表达水平高疗效好低疗效差乳腺癌曲妥珠单抗HER-2FISH/mRNA表达水平高疗效好低疗效差肝癌索拉非尼pDGFRmRNA表达水平低疗效好高疗效差27精选版课件ppt基因表达检测指标（靶向药物）相关肿瘤药物名称检测靶标检测内容28靶向药物项目名称样本结果疗效关系曲妥珠单抗HER2乳腺癌（手术/穿刺）+阳性疗效好↑-↓HER2基因表达检测采用RT-PCR方法替代FISH或免疫组化方法，临床准确率达97%以上。主要特点：客观，不用人为观察。时间短，整个检测60分钟左右完成。高通量，一次可以检测6人份。28精选版课件ppt28靶向药物项目名称样本结果疗效关系曲妥珠HER2乳腺癌（手PDGFRα低表达患者的无进展生存期和总生存期明显长于高表达患者索拉菲尼检测基因-PDGFR29精选版课件pptPDGFRα低表达患者的无进展生存期和总生存期明显长于高表贝伐单抗检测基因-VEGFR30精选版课件ppt贝伐单抗检测基因-VEGFR30精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容奥沙利铂/卡铂/顺铂ERCC1/BRCA1mRNA表达水平

5-FU/培美曲赛TSmRNA表达水平紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨STUBB3,STMN1mRNA表达水平替莫唑胺MGMTmRNA表达水平阿霉素/表柔比星TOPOⅡamRNA表达水平吉西他滨RRM1mRNA表达水平31精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容奥沙利铂/卡铂/顺ERCC1表达与铂类药物疗效相关的临床数据ERCC1阴性患者，能从铂类辅助化疗中获益.32精选版课件pptERCC1表达与铂类药物疗效相关的临床数据ERCC1阴性患BRCA1/2表达与铂类药物疗效相关的临床数据BRCA1过度表达铂类耐药的预测因子抗微管类药物的敏感因子33精选版课件pptBRCA1/2表达与铂类药物疗效相关的临床数据BRCA1过低TSmRNA水平的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好，中位生存期较长。

TS低表达的患者对培美曲赛的疗效好。TS高表达影响氟类和培美曲塞药效ShirotaYetal.JClinOncol.2001;19:4298-30434精选版课件pptTS高表达影响氟类和培美曲塞药效ShirotaYeta化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容奥沙利铂/卡铂/顺铂ERCC1/BRCA1mRNA表达水平

高疗效差低疗效好5-FU/培美曲赛TSmRNA表达水平高疗效差低疗效好紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨STUBB3,STMN1mRNA表达水平高疗效差低疗效好替莫唑胺MGMTmRNA表达水平高疗效差低疗效好阿霉素/表柔比星TOPOⅡamRNA表达水平高疗效好低疗效差吉西他滨RRM1mRNA表达水平高疗效差低疗效好35精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容奥小结36精选版课件ppt小结36精选版课件ppt药物名称靶标检测内容化疗药物铂类ERCC1，BRCA1mRNA水平，2项XRCC1，

GSTP1，

MRP2基因多态性，4项（女，6项）BRCA1(女)异环磷酰胺CYP2C9*3基因多态性，1项丝裂霉素NQO1基因多态性，1项依托泊苷TopoⅡαmRNA水平，1项CYP3A4*4,MDR1基因多态性，2项紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨TUBB3,STMN1mRNA水平，2项CYP8*3基因多态性，1项伊立替康UGT1A1*6,

UGT1A1*28基因多态性，2项吉西他滨RRM1mRNA水平，1项CDA基因多态性，1项培美曲赛TSmRNA水平，1项靶向药物吉非替尼/厄洛替尼EGFR(Exon19/20/21)基因突变，3项西妥昔单抗K-ras,B-raf基因突变，3项EGFRmRNA水平，1项贝伐单抗VEGFRmRNA水平，1项NSCLC个体化用药系统方案37精选版课件ppt药物名称靶标检测内容化疗药物铂类ERCC1，BRCA1mRN

遗传性非息肉性结直肠癌（HNPCC)是由DNA错配修复基因（MMR)发生基因突变导致的一种单基因的显性遗传疾病，又称lynch综合症，发生基因异常的个体其患发结直肠癌的风险约为60%。HNPCC实验室检测流程

38精选版课件ppt

遗传性非息肉性结直肠癌（HNPCC)是由DNA1背景介绍之HNPCC与MMRMSI目前已发现的导致人类HNPCC发生的MMR有MSH2、MLH1、MSH6、PMS1、PMS2，其中MSH2和MLH1基因的功能最重要，其突变占已发现突变的90%左右。39精选版课件ppt1背景介绍之HNPCC与MMRMSI目前已发现的导致人类1背景介绍之HNPCC与MMRMSI研究显示，

约有86%-95%的HNPCC具有MSI特征，

而散发型大肠癌中只有16%。MSI所产生的遗传不稳定性将加速恶性肿瘤的发生。1997年美国NCI(nationalcancerinstitution)将MSI确定为检测和筛选HNPCC的重要方法之一，并推荐将BAT26、BAT25、D2S123、D5S346和D17S2505个位点作为检测HNPCC的位点。40精选版课件ppt1背景介绍之HNPCC与MMRMSI研究显示，约有86实验室检测流程41精选版课件ppt实验室检测流程41精选版课件pptHNPCC检测项目检测名称检测技术临床意义MSI（5个位点）PCR+片段分析法HNPCC风险评估明确是否检测MMR突变MLH1,MSH2,MSH6基因突变检测（35个外显子）DNA测序HNPCC鉴别诊断确定突变位点，评估家族中高危个体风险热点突变检测DNA测序确定家族中是否存在已知的突变42精选版课件pptHNPCC检测项目检测名称检测技术临床意义MSI（5个位点）标本要求检测名称标本要求MSI检测病理蜡块一份（或白片10片），外加5ml抗凝外周血，4度运达MLH1,MSH2,MSH6基因突变检测病理蜡块一份（或白片10片），常温运达热点突变检测5ml抗凝外周血，4度运达43精选版课件ppt标本要求检测名称标本要求MSI检测病理蜡块一份（或白片10片肿瘤在变"WecanlookattumorsforchangesattheDNA,RNAandproteinlevels.Itcertainlygivesusawayoflookingatwhatishappeninginsideatumor,andthat'sveryexciting."

Dr.GordonMillsChairSystemsBiologyMDAndersonCancerCenterHouston,TxAsreportedin“TheCancerTest”–TIME

(June

14,2007)/time/magazine/article/0,9171,1633070,00.html44精选版课件ppt肿瘤在变"Wecanlookattumorsfor循环肿瘤细胞1869年AustMedJ，Ashworth最早在转移性癌症患者血液中观察到。2005年NEnglJMed，Cristofanilli证实治疗前CTC数目是转移性乳腺癌患者无进展生存期和总生存期的独立预测因子。循环肿瘤细胞指从实体瘤中脱离出来并进入外周血液循环的肿瘤细胞。原发肿瘤血管生成侵润侵入血管内侵入血管外

(CTC)血管内增殖

(CTM)转移转移播散肿瘤细胞（DTC）微转移休眠灶循环肿瘤细胞（CTC）循环肿瘤

微栓（CTM）凋亡的CTC侵润肿瘤细胞

扩增血管生成上皮－间质转化（EMT）间质－上皮转化（MET）转移到骨髓和其他器官45精选版课件ppt循环肿瘤细胞循环肿瘤细胞指从实体瘤中脱离出来并进入外周获取CTC需要解决的技术问题从红细胞和白细胞中富集恶性肿瘤细胞

将恶性肿瘤细胞与红细胞、白细胞、正常上皮细胞、造血干细胞等区分开来每10mL血液中可能仅含有几个到几十个循环肿瘤细胞，而10mL血液中含有的白细胞约有1亿个，红细胞有500亿个。46精选版课件ppt获取CTC需要解决的技术问题从红细胞和白细胞中富集恶性肿瘤细三种技术过滤法ISET:

IsolationbySizeofEpithelialTumorcells8μm孔径过滤膜，漏检体积较小的肿瘤细胞敏感性低梯度密度法肿瘤细胞和单核细胞密度小于1.077g/mlCTC纯度低，混入较多白细胞肿瘤细胞会迁移至血浆层，而聚集后容易下沉聚蔗糖-泛影葡胺(Ficoll-Hypaque)对细胞有毒性免疫磁珠法肿瘤细胞表面抗原EpCAM与包绕着磁珠的特异性单抗相结合CellSearch细胞保存方法长达96小时实验室室间差异小EpCAM的假阳性和假阴性47精选版课件ppt三种技术过滤法ISET:

IsolationbySizCellSearch是全球第一也是唯一经FDA批准可用于临床的循环肿瘤细胞（CTC）产品1983磁流体48精选版课件pptCellSearch是全球第一也是唯一经FDA批准可用于临白细胞Anti-CD45CD45NucleusDAPI如何鉴别出CTC?藻红蛋白

(PE)变藻蓝蛋白(APC)CTCAnti-EpCAM磁珠Anti-CK-PENucleusDAPICKEpCAM在CellSearch®检测中，CTC被设定为：EpCamCK-8,18和/或19DAPICD45+++-49精选版课件ppt白细胞Anti-CD45CD45Nucleus如何鉴别出CTCellSave

储存管CellSearch

CTC检测试剂盒CellSearch:自动化的CTC分离、富集和计数CellTracksAutoPrep系统磁巢MagnestCellTracksAnalyzerII96小时稳定2004年FDA批准CTC质控试剂盒磁力

捕获FIRSTANDONLYAPPROVED50精选版课件pptCellSave储存管CellSearchCellS切点的意义——评估预后51精选版课件ppt切点的意义——评估预后51精选版课件pptCTC数量变化是预后改变的重要预测52精选版课件pptCTC数量变化是预后改变的重要预测52精选版课件pptCTC计数CTC的分子特性指示预后快速疗效评估辅助检测抗癌药物的反应——作为预测和/或药物动力学生物标志物判断病人是否需要辅助化疗检测癌症复发辅助诊断实时活检——肿瘤的生物学行为阐明预后和预计的分子学特征检测抗药情况——基于获得连续样本的便利性提高对生物过程机制的了解发现并鉴定新治疗靶点CTC的应用：从细胞计数到分子特性53精选版课件pptCTC计数CTC的分子特性指示预后实时活检——肿瘤的生物学行肿瘤分子诊断服务介绍肿瘤分子诊断课件标准化用药个体化用药标准化用药个体化用药标准疗法1标准疗法2标准疗法355精选版课件ppt标准化用药个体化用药标准化用药个体化用药标准疗法1标准疗法2肿瘤药物与相关靶标56精选版课件ppt肿瘤药物与相关靶标3精选版课件ppt如何实现个体化用药？分子分型药物疗效57精选版课件ppt如何实现个体化用药？分子分型药物疗效4精选目前的服务目前的平台目前的客户肿瘤TaqMan-ARMs医院感染性疾病测序健康管理公司新生儿筛查实时定量PCR研究所qPCR-HRM药厂循环肿瘤细胞（CTC）保险公司58精选版课件ppt目前的服务目前的平台目前的客户肿瘤TaqMan-ARMs医院体细胞基因突变检测mRNA表达检测循环肿瘤细胞（CTC)检测基因多态性检测59精选版课件ppt体细胞基因突变检测mRNA表达检测循环肿瘤细胞（CTC)检测体细胞基因突变检测EGFR,K-RAS,B-RAF，C-KIT60精选版课件ppt体细胞基因突变检测EGFR,K-RAS,B-RAF，C-1、基因突变检测技术

——qPCR-HRM（可用于血浆标本检测）——Taqman-ARMS（与国际获批的技术相当）——DNA测序（基因突变检测的金标准技术）61精选版课件ppt1、基因突变检测技术

——qPCR-HRM（可用于血浆标本突变检测技术之一Taqman-ARMS所有定量PCR仪均可使用。

主要用于各类组织，包括手术、穿刺或镜检组织类。2小时即可完成检测试剂盒商业化程度高，临床认可程度高

国内已有试剂盒获批SFDA62精选版课件ppt突变检测技术之一Taqman-ARMS所有定量PCR仪突变检测技术之一

qPCR-HRMqPCR-HRM技术是基于高效稳健的PCR上的高分辨熔解曲线分析（High-ResolutionMelting）技术，灵敏度可以达到1%-0.1%，既能检测已知突变，也能检测未知突变。

qPCR-HRM的突变检测已获国际多中心双盲实验验证（JournalofMolecularDiagnostics,Vol.11,No.6,November2009）。实例图：利用HRM技术对7个样本分别进行EGFR（左图）、KRAS（右图）突变检测，红色表示该样本发生突变，蓝色表示未突变，蓝色横直线为阴性对照。左图显示2个样本发生了EGFR突变；右图显示4个样本发生了KRAS突变。EGFRKRAS63精选版课件ppt突变检测技术之一qPCR-HRMqPCR-血浆EGFR突变检测：18号外显子：无突变19号外显子：突变20号外显子：无突变21号外显子：无突变附图主要特点：

实现血浆中来自肿瘤的微量DNA的突变检测。

目前所做的临床实验中，血浆EGFR检测结果与其手术标本之间的整体符合率符合率达到91.25%。

是临床上不能手术、也同时不愿穿刺患者的替代检测方案；也可获得性耐药进行预先检测。qPCR-HRM用于血浆微量突变检测64精选版课件ppt血浆EGFR突变检测：主要特点：qPCR-HRM用于血浆微国际公认的分子检测金标准有明确的物价收费实验流程较复杂，需要大型仪器突变检测技术之一

DNA测序65精选版课件ppt国际公认的分子检测金标准突变检测技术之一DNA测序12精肿瘤类型靶向药物基因疗效佳的情况非小细胞肺癌易瑞沙（Iressa）特罗凯（Tarceva）EGFRKRASEGFR突变/KRAS野生胃肠间质瘤格列卫（Gleevec）C-KitC-kit第11外显子突变/PDGFR突变结直肠癌爱必妥KRASBRAF野生型突变检测项目列举66精选版课件ppt肿瘤类型靶向药物基因疗效佳的情况非小细胞肺癌易瑞沙（IresEGFR突变检测EGFRE19/E21敏感突变

适合使用TKI药物治疗耐药位点检测T790M67精选版课件pptEGFR突变检测EGFRE19/E21敏感突变耐药位K-RAS突变检测68精选版课件pptK-RAS突变检测15精选版课件pptBRAFNCCN2010年NCCN《结直肠癌临床实践指南》指出：K-ras基因为野生型而同时具有BRAFV600E突变的患者，靶向EGFR抗体治疗无效。BRAF-V600E检测肿瘤学临床实践指南（中国版）2010第一版69精选版课件pptBRAFNCCN2010年NCCN《结直肠癌临床实践指导肿瘤靶向治疗的靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容吉非替尼/厄洛替尼EGFR基因突变野生型耐药突变型敏感西妥昔单抗K-ras，B-raf基因突变野生型敏感突变型耐药伊马替尼C-Kit基因突变野生型耐药突变型敏感70精选版课件ppt指导肿瘤靶向治疗的靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内基因多态性检测与药物代谢毒性(UGT1A1,CYP,DPD)71精选版课件ppt基因多态性检测与药物代谢毒性18精选版课件ppt单核苷酸多态性（SNP）是最常见的基因变异至少1%的人群绝大多数人群共有序列GtoCSNP

位点变异的序列最常见的基因多态性SNP72精选版课件ppt12/19/2022单核苷酸多态性（SNP）是最常见的基因变异至少1%的人群绝大为什么

SNPs重要?个体1个体2=SNPvariationsinDNASNP标志基因A基因B基因ASNP可能使基因B产生变异的蛋白质分子73精选版课件ppt12/19/2022为什么SNPs重要?个体1个体2=SNPvari个体的SNP谱SNP谱ASNP谱BSNP谱CSNP谱FSNP谱ESNP谱D74精选版课件ppt12/19/2022个体的SNP谱SNP谱ASNP谱BSNP谱CSNPSNP谱有助于确定药物的疗效和副作用乳腺癌病人个体的SNP谱可以分成不同的类型SNP谱A对药物有期望的反应对药物没有期望的反应SNP谱A的人对药物有期望的反应SNP谱ESNP谱BSNP谱CSNP谱D75精选版课件ppt12/19/2022SNP谱有助于确定药物的疗效和副作用乳腺癌病人个体的SNP药物代谢与SNP检测化疗药物在体内经过吸收、代谢、分布和清除，通过其活性物质对治疗靶点的直接攻击而发挥作用，整个过程需要多种蛋白质/酶的共同参与和协同作用。SNP主要是指在基因组水平上变异频率大于1%的单核苷酸变异所引起的DNA序列多态性，多态性会导致不同个体体内各种蛋白，酶活性的差异，因此导致药物使用情况的不同。76精选版课件ppt药物代谢与SNP检测化疗药物在体内经过吸收、代谢、分布和清除胆红素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶基因（UGT1A1）UGT1A1*27(C686A)或UGT1A1*28[(TA)7TAA]:

野生型：6个TA

UGT1A1*6(G211A)：使UGT1A1的转录活性下降了三分之二。导致对伊立替康的毒性增加。FDA提示：UGT1A1的多态性-伊立替康的毒性增加(6TA)此型的酶活性是野生型的49％

。77精选版课件ppt胆红素尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶基因（UGT1A1）UGT1CYP19A1多态性影响芳香化酶抑制剂疗效CYP19A1是芳香化酶的编码基因，临床研究已证实有着很大的影响作用。在接受芳香化酶抑制剂治疗的乳腺癌患者中，携带CYP19A1基因rs4646（G>T）突变患者的治疗效果较无此突变的患者显著2-4（下图）。CYP19A1rs4646（G>T）SNP是乳腺癌患者接受芳香化酶抑制剂治疗疗效的有效预测指标。

如图一项对乳腺癌患者的临床研究显示：CYP19A1基因rs4646突变的患者使用芳香化酶抑制剂药物疗效明显优于野生型患者（p<0.0001）1。参考文献

1.IanESetal.NEnglJMed.2003;384:2431-42.

2.RamonCetal.ClinCancerRes.2008;14:811-6.

3.LunardiGetal.JClinOncol.2009;27:555.

4.FaschingPAetal.BreastCancerResTr.2008;112:89-98.78精选版课件pptCYP19A1多态性影响芳香化酶抑制剂疗效CYP19A1是基因表达检测（mRNA表达）(ERCC1\BRCA1\TUBB3\TS)79精选版课件ppt基因表达检测（mRNA表达）26精选版课件ppt基因表达检测指标（靶向药物）相关肿瘤药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容结直肠癌贝伐单抗VEGFRmRNA表达水平高疗效好低疗效差乳腺癌曲妥珠单抗HER-2FISH/mRNA表达水平高疗效好低疗效差肝癌索拉非尼pDGFRmRNA表达水平低疗效好高疗效差80精选版课件ppt基因表达检测指标（靶向药物）相关肿瘤药物名称检测靶标检测内容81靶向药物项目名称样本结果疗效关系曲妥珠单抗HER2乳腺癌（手术/穿刺）+阳性疗效好↑-↓HER2基因表达检测采用RT-PCR方法替代FISH或免疫组化方法，临床准确率达97%以上。主要特点：客观，不用人为观察。时间短，整个检测60分钟左右完成。高通量，一次可以检测6人份。81精选版课件ppt28靶向药物项目名称样本结果疗效关系曲妥珠HER2乳腺癌（手PDGFRα低表达患者的无进展生存期和总生存期明显长于高表达患者索拉菲尼检测基因-PDGFR82精选版课件pptPDGFRα低表达患者的无进展生存期和总生存期明显长于高表贝伐单抗检测基因-VEGFR83精选版课件ppt贝伐单抗检测基因-VEGFR30精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容奥沙利铂/卡铂/顺铂ERCC1/BRCA1mRNA表达水平

5-FU/培美曲赛TSmRNA表达水平紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨STUBB3,STMN1mRNA表达水平替莫唑胺MGMTmRNA表达水平阿霉素/表柔比星TOPOⅡamRNA表达水平吉西他滨RRM1mRNA表达水平84精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容奥沙利铂/卡铂/顺ERCC1表达与铂类药物疗效相关的临床数据ERCC1阴性患者，能从铂类辅助化疗中获益.85精选版课件pptERCC1表达与铂类药物疗效相关的临床数据ERCC1阴性患BRCA1/2表达与铂类药物疗效相关的临床数据BRCA1过度表达铂类耐药的预测因子抗微管类药物的敏感因子86精选版课件pptBRCA1/2表达与铂类药物疗效相关的临床数据BRCA1过低TSmRNA水平的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好，中位生存期较长。

TS低表达的患者对培美曲赛的疗效好。TS高表达影响氟类和培美曲塞药效ShirotaYetal.JClinOncol.2001;19:4298-30487精选版课件pptTS高表达影响氟类和培美曲塞药效ShirotaYeta化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容奥沙利铂/卡铂/顺铂ERCC1/BRCA1mRNA表达水平

高疗效差低疗效好5-FU/培美曲赛TSmRNA表达水平高疗效差低疗效好紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨STUBB3,STMN1mRNA表达水平高疗效差低疗效好替莫唑胺MGMTmRNA表达水平高疗效差低疗效好阿霉素/表柔比星TOPOⅡamRNA表达水平高疗效好低疗效差吉西他滨RRM1mRNA表达水平高疗效差低疗效好88精选版课件ppt化疗药物与检测靶标药物名称检测靶标检测内容检测结果预测内容奥小结89精选版课件ppt小结36精选版课件ppt药物名称靶标检测内容化疗药物铂类ERCC1，BRCA1mRNA水平，2项XRCC1，

GSTP1，

MRP2基因多态性，4项（女，6项）BRCA1(女)异环磷酰胺CYP2C9*3基因多态性，1项丝裂霉素NQO1基因多态性，1项依托泊苷TopoⅡαmRNA水平，1项CYP3A4*4,MDR1基因多态性，2项紫杉醇/多西紫杉醇/长春瑞滨TUBB3,STMN1mRNA水平，2项CYP8*3基因多态性，1项伊立替康UGT1A1*6,

UGT1A1*28基因多态性，2项吉西他滨RRM1mRNA水平，1项CDA基因多态性，1项培美曲赛TSmRNA水平，1项靶向药物吉非替尼/厄洛替尼EGFR(Exon19/20/21)基因突变，3项西妥昔单抗K-ras,B-raf基因突变，3项EGFRmRNA水平，1项贝伐单抗VEGFRmRNA水平，1项NSCLC个体化用药系统方案90精选版课件ppt药物名称靶标检测内容化疗药物铂类ERCC1，BRCA1mRN

遗传性非息肉性结直肠癌（HNPCC)是由DNA错配修复基因（MMR)发生基因突变导致的一种单基因的显性遗传疾病，又称lynch综合症，发生基因异常的个体其患发结直肠癌的风险约为60%。HNPCC实验室检测流程

91精选版课件ppt

遗传性非息肉性结直肠癌（HNPCC)是由DNA1背景介绍之HNPCC与MMRMSI目前已发现的导致人类HNPCC发生的MMR有MSH2、MLH1、MSH6、PMS1、PMS2，其中MSH2和MLH1基因的功能最重要，其突变占已发现突变的90%左右。92精选版课件ppt1背景介绍之HNPCC与MMRMSI目前已发现的导致人类1背景介绍之HNPCC与MMRMSI研究显示，

约有86%-95%的HNPCC具有MSI特征，

而散发型大肠癌中只有16%。MSI所产生的遗传不稳定性将加速恶性肿瘤的发生。1997年美国NCI(nationalcancerinstitution)将MSI确定为检测和筛选HNPCC的重要方法之一，并推荐将BAT26、BAT25、D2S123、D5S346和D17S2505个位点作为检测HNPCC的位点。93精选版课件ppt1背景介绍之HNPCC与MMRMSI研究显示，约有86实验室检测流程94精选版课件ppt实验室检测流程41精选版课件pptHNPCC检测项目检测名称检测技术临床意义MSI（5个位点）PCR+片段分析法HNPCC风险评估明确是否检测MMR突变MLH1,MSH2,MSH6基因突变检测（35个外显子）DNA测序HNPCC鉴别诊断确定突变位点，评估家族中高危个体风险热点突变检测DNA测序确定家族中是否存在已知的突变95精选版课件pptHNPCC检测项目检测名称检测技术临床意义MSI（5个位点）标本要求检测名称标本要求MSI检测病理蜡块一份（或白片10片），外加5ml抗凝外周血，4度运达MLH1,MSH2,MSH6基因突变检测病理蜡块一份（或白片10片），常温运达热点突变检测5ml抗凝外周血，4度运达96精选版课件ppt标本要求检测名称标本要求MSI检测病理蜡块一份（或白片10片肿瘤在变"WecanlookattumorsforchangesattheDNA,RNAandproteinlevels.Itcertainlygivesusawayoflookingatwhatishappeninginsideatumor,andthat'sveryexciting."

Dr.GordonMillsChairSystemsBiologyMDAndersonCancerCenterHouston,TxAsreportedin“TheCancerTest”–TIME

(June

14,2007)/time/magazine/arti