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第一节DNA的生物合成第一节DNA的生物合成一.DNA的复制复制部位:真核生物:细胞核原核生物:细胞质的核质区一.DNA的复制复制部位:(一)复制的反应n1dATPn2dCTPn3dGTPn4dTTPDNA聚合酶DNA模板DNA+(n1+n2+n3+n4)PPiPPi随即被焦磷酸酶水解,从而推动聚合反应的进行。一.DNA的复制(一)复制的反应n1dATPn2dCTPn3dGTP(二)复制的方式DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解旋并分开,然后以每条链为模板,按照碱基配对原则,各形成一条互补链。这样,从亲代的一个DNA双螺旋分子复制成两个与亲代的碱基序列完全相同的子代DNA分子。每个子代DNA分子中,有一条链来自亲代DNA,另一条则是新形成的,这样的复制方式叫做半保留复制(semiconservativereplication)。半保留复制一.DNA的复制(二)复制的方式DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制如何证明半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制1958年,Meselson证明:用,15NH4Cl唯一氮源培养大肠杆菌,之后,用14NH4Cl培养,然后进行CsCl2进行密度梯度离心。由于15NH4Cl密度大于14NH4Cl,因此,形成不同区带,经过若干代培养后,两个14NH4Cl区带增多。如何证明半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制195南京农业大学生化课件RNA生物合成5131(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制全保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制全保留复制(三)复制反应注意点DNA复制除入DNA聚合酶,DNA模板,dNTP外,还需要多种蛋白质因子、引物、Mg2+等.一.DNA的复制特点:A对利福平不敏感B核糖核酸代替脱氧核糖核酸(三)复制反应注意点DNA复制除入DNA聚合酶,DNA模DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'核酸外切5'→3'核酸外切原

物DNA聚合酶Ⅰ+++切去引物RNA,补上正确的DNA片段DNA聚合酶Ⅱ++与修复有关(活性低)DNA聚合酶Ⅲ++负责链的延长(活性高)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制1.DNA聚合酶(DNApolymease)DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'5'Morethan90%oftheDNApolymeraseactivityobservedinE.coliextractscanbeaccountedforbyDNApolymeraseIMorethan90%oftheDNApoly(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNApolymeraseIIIismuchmorecomplexthanDNApolymeraseI,havingtentypesofsubunits(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNApolym(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'

核酸外切5'→3'

核酸外切真

物DNA聚合酶a+切去引物RNA,补上正确的DNA片段DNA聚合酶b

+DNA聚合酶g

+负责链的延长DNA聚合酶d++负责先导链的延长

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶(DNApolymease)DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'

核酸外(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶(DNApolymease)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶3'→5'核酸外切2.DNA聚合酶(DNApolymease)3'→5'核酸外切2.DNA聚合酶(DNApolymea

Everycellcontainsseveraldifferentnucleases(核酸酶),belongingtotwobroadclasses:exonucleases(核酸外切酶)andendonucleases(核酸内切酶).Exonucleasesdegradenucleicacidsfromoneendofthemolecule.核酸外切Exonucleasesdegradenucleicacidsfromoneendofthemolecule.Manyoperateinonlythe5

'→3'orthe3'→5'direction,removingnucleotidesonlyfromthe5'

orthe3'

end,respectively,ofonestrandofadoublestrandednucleicacidorofasingle-strandedDNA.

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制Everycellcontainsseveral

Endonucleasescanbegintodegradeatspecificinternalsitesinanucleicacidstrandormolecule,reducingittosmallerandsmallerfragments.Afewexonucleasesandendonucleasesdegradeonlysingle-strandedDNA.Thereareafewimportantclassesofendonucleasesthatcleaveonlyatspecificnucleotidesequences.(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制Endonucleasescanbegintod5'→3'核酸外切一.DNA的复制5'→3'核酸外切一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNAReplicationRequiresManyEnzymesandProteinFactorsReplicationinE.colirequiresnotjustasingleDNApolymerasebut20ormoredifferentenzymesandproteins,eachperformingaspecifictask.TheentirecomplexhasbeentermedtheDNAreplicasesystemorreplisome.TheenzymaticcomplexityofreplicationreflectstheconstraintsimposedbythestructureofDNAandbytherequirementsforaccuracy.(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNARepli(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNAReplicationRequiresManyEnzymesandProteinFactors(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNARepli(四)参与复制的酶和蛋白质合成RNA引物,又叫引物合成酶、引发酶。2.引物酶(primer)

它以单链DNA为模板,以ATP、GTP、CTP、UTP为原料,从5→3方向合成出RNA片段,即引物。

一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质合成RNA引物,又叫引物合成酶、引

3.DNA连结酶(DNAligase)

催化DNA双链中一条链上的缺口(3′-OH与它下游相邻的核苷酸的5′-磷酸之间)共价连结(形成磷酸二酯键)。

连结过程需要能量,E.coli

和某些细菌中由NAD+提供;动物细胞由ATP提供。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制3.DNA连结酶(DNAligase)催化D(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

3.DNA连结酶(DNAligase)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制3.DNA连结

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质解螺旋酶(helicase):

将DNA的两条链打开。每解开一对碱基需要水解2分子ATP。方向为5’-3’,大肠杆菌中的解螺旋酶又叫rep蛋白,但方向为3’-5’

。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质解螺旋酶(helica单链结合蛋白(SSBP):

与解链后的DNA单链结合,阻止其再次形成双螺旋。大肠杆菌SSB为177aa多肽,以四聚体形式存在,与32个bpDNA区相结合,结合后的DNA分子僵硬,不易

弯曲,有利于单链DNA分子的稳定,避免核酸酶进攻;同时降低了Tm值,进一步促进DNA的解链。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质单链结合蛋白(SSBP):(四)参与复制的酶和蛋白质一.DN旋转酶(gyrase,untwistingprotein):催化DNA的拓扑连环数发生变化。可分为拓扑异构酶Ⅰ和拓扑异构酶Ⅱ。Ⅰ型酶可减少负超螺旋;Ⅱ型酶可引入负超螺旋(此时需要ATP提供能量)。具有内切酶和连接酶活力,参与DNA复制前双螺旋的松弛及复制后超螺旋的再恢复。

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质旋转酶(gyrase,untwistingprotein)dn蛋白(mobilepromoter):功能:识别DNA的合成的起始位置,与引物酶及其它一些蛋白组成复合体启动RNA引物链的合成。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质dn蛋白(mobilepromoter):(四)参与复(五)复制的过程

复制从特定的位点开始,这一位置叫复制原点。

原核生物的DNA上一般只有一个复制原点,但在迅速生长时期,第一轮复制尚未完成,就在起点处启动第二轮复制;

真核生物则有多个复制原点,可以同时启动复制过程。1.复制的启动一.DNA的复制(五)复制的过程复制从特定的位点开始,这一位置叫复制原

复制过程的调控主要取决于复制启动的频率,而DNA延长的速度大体上是恒定的。由于真核生物在多位点上启动复制,所以尽管其DNA比原核生物DNA大得多,但复制的总速度反而比原核生物快。

DNA的复制是由引发体识别并结合于复制原点而被启动的,其机理比较复杂,目前还不十分明了。1.复制的启动(五)复制的过程一.DNA的复制复制过程的调控主要取决于复制启动的频率,而DNA延长

2.复制眼的形成

由于复制原点都是在DNA分子的内部,而不是在末端,所以当复制启动后需要在复制原点处将DNA双螺旋局部解链,形成“眼状”结构——复制眼。

(五)复制的过程一.DNA的复制2.复制眼的形成由于复制原点都是在DNA分子的内复制眼的结构:

复制眼形成后,其两端的叉子状结构称为复制叉。

2.复制眼的形成(五)复制的过程一.DNA的复制复制眼的结构:

复制眼形成后,其两端的叉子状结构称为复制叉。南京农业大学生化课件RNA生物合成5131

2.复制眼的形成-双螺旋解开的过程

解螺旋酶使DNA双螺旋局部解链;

SSB结合到解开的单链上;

拓扑异构酶Ⅱ向DNA中引入负超螺旋,以消除由解链产生的扭曲张力(动画)。

(五)复制的过程一.DNA的复制2.复制眼的形成-双螺旋解开的过程解螺旋酶使DNA(五)复制的过程一.DNA的复制(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进(1)复制叉推进的方式随着复制叉的推进,两条新链的合成方向是不同的:一条链延伸的方向与复制叉前进的方向一致,它的合成能连续进行,称为前导链;(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进(1)复制叉推进的方式随着复制叉的推进,两

另一条链延伸的方向与复制叉前进的方向相反,它显然不能被连续合成,需要复制叉推进了一定的长度,有了一段DNA单链后,才能以此为模板合成一个片段。因此这条新链的合成是不连续的,而且总晚于先导链,所以称为随后链。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的方式另一条链延伸的方向与复制叉前进的方向相反,它这种前导链连续合成,随后链断续合成的方式,称为半不连续复制。随后链中合成的多个DNA片段,称为冈崎片段。冈崎片段的长度原核细胞中约1000~2000个核苷酸,真核细胞中约100~200个核苷酸。

(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的方式这种前导链连续合成,随后链断续合成的方式,称为半不连

引物酶在复制原点附近合成一段RNA引物;

DNA聚合酶Ⅲ

(原核细胞)在引物的3'末端逐个添加脱氧核苷酸。随着复制叉的推进,亲代DNA双螺旋不断被解开,先导链也不断延伸。

①先导链的合成(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程引物酶在复制原点附近合成一段RNA引物;①先导②随后链的合成引物的合成:随后链的每个冈崎片段都需要合成RNA引物。也是由引物酶催化。

冈崎片段的合成:DNA聚合酶Ⅲ(原核细胞)在引物的3'末端使DNA链延伸,直至抵达其下游的另一个冈崎片段的RNA引物的5'端。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程②随后链的合成引物的合成:随后链的每个冈崎片段都需要合成②随后链的合成冈崎片段的连结:DNA聚合酶Ⅰ一面以其DNA聚合活性在上游冈崎片段的3'-OH末端添加脱氧核苷酸,一面以其5'→3'核酸外切活性切除引物,直至将引物全部切除。

DNA连接酶将最后的缺口补好。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程②随后链的合成冈崎片段的连结:DNA聚合酶Ⅰ一面以其DNA③先导链和随后链中DNA的延伸由同一个DNA聚合酶Ⅲ全酶二聚体催化

随后链的模板回折成环,从而使冈崎片段的延伸方向与先导链的延伸方向一致,它们的3'末端分别落在DNA聚合酶Ⅲ全酶的双活性部位。因此,随着聚合酶的移动,两条链同时延伸。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程③先导链和随后链中DNA的延伸由同一个DNA聚合酶Ⅲ全酶南京农业大学生化课件RNA生物合成51314.复制的结束复制的终止没有特殊的信号原核生物中:

其环状的DNA从单点开始双向复制,当两个复制叉在复制原点的对面处相遇并合并时,结束复制,形成两个环状DNA分子。(五)复制的过程一.DNA的复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号原核生物中:(五)复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号真核生物中:

其线状的DNA上有多个复制原点,因此形成多个复制眼,复制叉的推进使复制眼增大,直至各个复制眼融合,复制终止,形成两个线状DNA分子。(五)复制的过程一.DNA的复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号真核生物中:(五)复制(六)DNA复制的忠实性一.DNA的复制差错率为10-9-10-10新合成的子链与母链之间碱基配对严格性使用引物RNADNA聚合酶对底物专一性DNA聚合酶的校对作用5.DNA修复机制(六)DNA复制的忠实性一.DNA的复制差错率为10-9-1二.DNA的损伤与修复DNA分子的完整性对细胞至关重要,这一点是其它生物分子无法比拟的。在生物的进化中,DNA复制中可因DNA聚合酶催化作用引发出偶然的错误。环境因素(如辐射、紫外光照射、化学诱变物等)也可引起DNA序列上的错误,这些错误若不能予以改正而保留下来,会直接影响机体的生理功能,以致影响到后代的正常生长和发育。但是,生物体内存在有效的修复(repair)体系,保证了DNA复制的高度精确性。

二.DNA的损伤与修复DNA分子的完整性二.DNA的损伤与修复1.DNA损伤的原因外环境中的射线:X-射线、紫外线等——高剂量的紫外辐射使DNA链上邻近的嘧啶核苷酸之间形成化学键,生成二聚体;此外还有脱嘌呤作用和脱氨基作用.

二.DNA的损伤与修复1.DNA损伤的原因外环境中的射线南京农业大学生化课件RNA生物合成5131二.DNA的损伤与修复2.修复

所有细胞对DNA的损伤都有一定的修复能力,以恢复正常的DNA结构。修复的方式:光修复、切除修复、重组修复、SOS修复(1)光修复由DNA光裂合酶(photolyase)催化。该酶需要光(400700nm)才能激活,它能切除嘧啶二聚体之间的连键(C-C键),从而修复由紫外照射而造成的损伤。二.DNA的损伤与修复2.修复所有细胞对二.DNA的损伤与修复2.修复(2)切除修复

该类修复是指在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤的部分切除,并以完整的那一条链为模板,合成出新的被切去的部分,然后使损伤的DNA恢复正常结构的过程。切除修复系统可对多种损伤起修复作用。切除修复有核苷酸切除修复(nucleotideexcisionrepair,NER)和碱基切除修复(baseexcisionrepair,BER)两种。

二.DNA的损伤与修复2.修复(2)切除修复二.DNA的损伤与修复2.修复(2)切除修复修复机制:其过程是:切→补→切→缝由专一性核酸内切酶催化,在离损伤处附近切断由DNA聚合酶在断口处进行DNA合成由5′核酸外切酶将损伤部位切掉由连接酶将新合成的DNA链与原来的链连接二.DNA的损伤与修复2.修复(2)切除修复知识窗NER缺陷与癌症和遗传疾病

核苷酸切除修复(nucleotideexcisionrepair,NER)缺陷与癌症的发生有关,如着色性皮肤病是由于体内NER系统缺陷引起皮肤细胞对日光或紫外线特别敏感,其所形成的T-T二聚体就是因缺乏能切除T-T二聚体的特异性核酸内切酶所致,以致在后续的复制中造成遗传信息改变,最终出现皮肤癌。知识窗NER缺陷与癌症和遗传疾病核苷酸切除修复(知识窗NER缺陷与癌症和遗传疾病

一些常染色体退行性疾病患者对太阳光极其敏感。还有的患者在婴儿时期皮肤明显地改变,如干燥、进行性的雀斑和角质化(一种皮肤肿瘤)并伴有眼损伤如角膜溃烂、晶体混浊和神经退行性症等,进而发展为致死的皮肤癌,其发病率是正常人得此症的200倍。科凯尼氏综合症(cockaynesyndromeCS)也是一种遗传疾病,与NER基因缺损有关,因此,CS患者对紫外照射高度敏感,表现出与皮肤癌同样的发病率。知识窗NER缺陷与癌症和遗传疾病一些常染二.DNA的损伤与修复2.修复(3)SOS修复

细胞在紧急状态下,能诱导产生缺乏校对功能的DNA聚合酶,它能在DNA的损伤部位进行复制,从而避免了死亡,但产生很高的变异率。二.DNA的损伤与修复2.修复(3)SOS修复二.DNA的损伤与修复2.修复(3)SOS修复

二.DNA的损伤与修复2.修复(3)SOS修复南京农业大学生化课件RNA生物合成5131二.DNA的损伤与修复2.修复损伤并未消除,但被“稀释”了。

(4)重组修复二.DNA的损伤与修复2.修复损伤并未消除,但被“稀三.DNA突变1.类型置换(replacement)A转换(transition)-同类碱基之间的置换B颠换(tansversion)-异类碱基之间的置换三.DNA突变1.类型置换(replacement)三.DNA突变1.类型(2)插入(insertion)-DNA链中插入一个或几个碱基对,导致遗传密码阅读框的改变,称为移码突变。(3)缺失(deletion)-DNA链丢失一个或几个碱基对后造成导致遗传密码阅读框的改变,称为移码突变。三.DNA突变1.类型(2)插入(insertion第一节DNA的生物合成第一节DNA的生物合成一.DNA的复制复制部位:真核生物:细胞核原核生物:细胞质的核质区一.DNA的复制复制部位:(一)复制的反应n1dATPn2dCTPn3dGTPn4dTTPDNA聚合酶DNA模板DNA+(n1+n2+n3+n4)PPiPPi随即被焦磷酸酶水解,从而推动聚合反应的进行。一.DNA的复制(一)复制的反应n1dATPn2dCTPn3dGTP(二)复制的方式DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解旋并分开,然后以每条链为模板,按照碱基配对原则,各形成一条互补链。这样,从亲代的一个DNA双螺旋分子复制成两个与亲代的碱基序列完全相同的子代DNA分子。每个子代DNA分子中,有一条链来自亲代DNA,另一条则是新形成的,这样的复制方式叫做半保留复制(semiconservativereplication)。半保留复制一.DNA的复制(二)复制的方式DNA复制时,亲代DNA的双螺旋先解半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制如何证明半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制1958年,Meselson证明:用,15NH4Cl唯一氮源培养大肠杆菌,之后,用14NH4Cl培养,然后进行CsCl2进行密度梯度离心。由于15NH4Cl密度大于14NH4Cl,因此,形成不同区带,经过若干代培养后,两个14NH4Cl区带增多。如何证明半保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制195南京农业大学生化课件RNA生物合成5131(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制全保留复制(二)复制的方式一.DNA的复制半保留复制全保留复制(三)复制反应注意点DNA复制除入DNA聚合酶,DNA模板,dNTP外,还需要多种蛋白质因子、引物、Mg2+等.一.DNA的复制特点:A对利福平不敏感B核糖核酸代替脱氧核糖核酸(三)复制反应注意点DNA复制除入DNA聚合酶,DNA模DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'核酸外切5'→3'核酸外切原

物DNA聚合酶Ⅰ+++切去引物RNA,补上正确的DNA片段DNA聚合酶Ⅱ++与修复有关(活性低)DNA聚合酶Ⅲ++负责链的延长(活性高)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制1.DNA聚合酶(DNApolymease)DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'5'Morethan90%oftheDNApolymeraseactivityobservedinE.coliextractscanbeaccountedforbyDNApolymeraseIMorethan90%oftheDNApoly(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNApolymeraseIIIismuchmorecomplexthanDNApolymeraseI,havingtentypesofsubunits(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNApolym(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'

核酸外切5'→3'

核酸外切真

物DNA聚合酶a+切去引物RNA,补上正确的DNA片段DNA聚合酶b

+DNA聚合酶g

+负责链的延长DNA聚合酶d++负责先导链的延长

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶(DNApolymease)DNA聚合酶催化活性功能5'→3'

聚合3'→5'

核酸外(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶(DNApolymease)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制2.DNA聚合酶3'→5'核酸外切2.DNA聚合酶(DNApolymease)3'→5'核酸外切2.DNA聚合酶(DNApolymea

Everycellcontainsseveraldifferentnucleases(核酸酶),belongingtotwobroadclasses:exonucleases(核酸外切酶)andendonucleases(核酸内切酶).Exonucleasesdegradenucleicacidsfromoneendofthemolecule.核酸外切Exonucleasesdegradenucleicacidsfromoneendofthemolecule.Manyoperateinonlythe5

'→3'orthe3'→5'direction,removingnucleotidesonlyfromthe5'

orthe3'

end,respectively,ofonestrandofadoublestrandednucleicacidorofasingle-strandedDNA.

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制Everycellcontainsseveral

Endonucleasescanbegintodegradeatspecificinternalsitesinanucleicacidstrandormolecule,reducingittosmallerandsmallerfragments.Afewexonucleasesandendonucleasesdegradeonlysingle-strandedDNA.Thereareafewimportantclassesofendonucleasesthatcleaveonlyatspecificnucleotidesequences.(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制Endonucleasescanbegintod5'→3'核酸外切一.DNA的复制5'→3'核酸外切一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNAReplicationRequiresManyEnzymesandProteinFactorsReplicationinE.colirequiresnotjustasingleDNApolymerasebut20ormoredifferentenzymesandproteins,eachperformingaspecifictask.TheentirecomplexhasbeentermedtheDNAreplicasesystemorreplisome.TheenzymaticcomplexityofreplicationreflectstheconstraintsimposedbythestructureofDNAandbytherequirementsforaccuracy.(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNARepli(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNAReplicationRequiresManyEnzymesandProteinFactors(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制DNARepli(四)参与复制的酶和蛋白质合成RNA引物,又叫引物合成酶、引发酶。2.引物酶(primer)

它以单链DNA为模板,以ATP、GTP、CTP、UTP为原料,从5→3方向合成出RNA片段,即引物。

一.DNA的复制(四)参与复制的酶和蛋白质合成RNA引物,又叫引物合成酶、引

3.DNA连结酶(DNAligase)

催化DNA双链中一条链上的缺口(3′-OH与它下游相邻的核苷酸的5′-磷酸之间)共价连结(形成磷酸二酯键)。

连结过程需要能量,E.coli

和某些细菌中由NAD+提供;动物细胞由ATP提供。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制3.DNA连结酶(DNAligase)催化D(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

3.DNA连结酶(DNAligase)(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制3.DNA连结

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质解螺旋酶(helicase):

将DNA的两条链打开。每解开一对碱基需要水解2分子ATP。方向为5’-3’,大肠杆菌中的解螺旋酶又叫rep蛋白,但方向为3’-5’

。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质解螺旋酶(helica单链结合蛋白(SSBP):

与解链后的DNA单链结合,阻止其再次形成双螺旋。大肠杆菌SSB为177aa多肽,以四聚体形式存在,与32个bpDNA区相结合,结合后的DNA分子僵硬,不易

弯曲,有利于单链DNA分子的稳定,避免核酸酶进攻;同时降低了Tm值,进一步促进DNA的解链。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质单链结合蛋白(SSBP):(四)参与复制的酶和蛋白质一.DN旋转酶(gyrase,untwistingprotein):催化DNA的拓扑连环数发生变化。可分为拓扑异构酶Ⅰ和拓扑异构酶Ⅱ。Ⅰ型酶可减少负超螺旋;Ⅱ型酶可引入负超螺旋(此时需要ATP提供能量)。具有内切酶和连接酶活力,参与DNA复制前双螺旋的松弛及复制后超螺旋的再恢复。

(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质旋转酶(gyrase,untwistingprotein)dn蛋白(mobilepromoter):功能:识别DNA的合成的起始位置,与引物酶及其它一些蛋白组成复合体启动RNA引物链的合成。(四)参与复制的酶和蛋白质一.DNA的复制

4.使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质dn蛋白(mobilepromoter):(四)参与复(五)复制的过程

复制从特定的位点开始,这一位置叫复制原点。

原核生物的DNA上一般只有一个复制原点,但在迅速生长时期,第一轮复制尚未完成,就在起点处启动第二轮复制;

真核生物则有多个复制原点,可以同时启动复制过程。1.复制的启动一.DNA的复制(五)复制的过程复制从特定的位点开始,这一位置叫复制原

复制过程的调控主要取决于复制启动的频率,而DNA延长的速度大体上是恒定的。由于真核生物在多位点上启动复制,所以尽管其DNA比原核生物DNA大得多,但复制的总速度反而比原核生物快。

DNA的复制是由引发体识别并结合于复制原点而被启动的,其机理比较复杂,目前还不十分明了。1.复制的启动(五)复制的过程一.DNA的复制复制过程的调控主要取决于复制启动的频率,而DNA延长

2.复制眼的形成

由于复制原点都是在DNA分子的内部,而不是在末端,所以当复制启动后需要在复制原点处将DNA双螺旋局部解链,形成“眼状”结构——复制眼。

(五)复制的过程一.DNA的复制2.复制眼的形成由于复制原点都是在DNA分子的内复制眼的结构:

复制眼形成后,其两端的叉子状结构称为复制叉。

2.复制眼的形成(五)复制的过程一.DNA的复制复制眼的结构:

复制眼形成后,其两端的叉子状结构称为复制叉。南京农业大学生化课件RNA生物合成5131

2.复制眼的形成-双螺旋解开的过程

解螺旋酶使DNA双螺旋局部解链;

SSB结合到解开的单链上;

拓扑异构酶Ⅱ向DNA中引入负超螺旋,以消除由解链产生的扭曲张力(动画)。

(五)复制的过程一.DNA的复制2.复制眼的形成-双螺旋解开的过程解螺旋酶使DNA(五)复制的过程一.DNA的复制(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进(1)复制叉推进的方式随着复制叉的推进,两条新链的合成方向是不同的:一条链延伸的方向与复制叉前进的方向一致,它的合成能连续进行,称为前导链;(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进(1)复制叉推进的方式随着复制叉的推进,两

另一条链延伸的方向与复制叉前进的方向相反,它显然不能被连续合成,需要复制叉推进了一定的长度,有了一段DNA单链后,才能以此为模板合成一个片段。因此这条新链的合成是不连续的,而且总晚于先导链,所以称为随后链。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的方式另一条链延伸的方向与复制叉前进的方向相反,它这种前导链连续合成,随后链断续合成的方式,称为半不连续复制。随后链中合成的多个DNA片段,称为冈崎片段。冈崎片段的长度原核细胞中约1000~2000个核苷酸,真核细胞中约100~200个核苷酸。

(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的方式这种前导链连续合成,随后链断续合成的方式,称为半不连

引物酶在复制原点附近合成一段RNA引物;

DNA聚合酶Ⅲ

(原核细胞)在引物的3'末端逐个添加脱氧核苷酸。随着复制叉的推进,亲代DNA双螺旋不断被解开,先导链也不断延伸。

①先导链的合成(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程引物酶在复制原点附近合成一段RNA引物;①先导②随后链的合成引物的合成:随后链的每个冈崎片段都需要合成RNA引物。也是由引物酶催化。

冈崎片段的合成:DNA聚合酶Ⅲ(原核细胞)在引物的3'末端使DNA链延伸,直至抵达其下游的另一个冈崎片段的RNA引物的5'端。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程②随后链的合成引物的合成:随后链的每个冈崎片段都需要合成②随后链的合成冈崎片段的连结:DNA聚合酶Ⅰ一面以其DNA聚合活性在上游冈崎片段的3'-OH末端添加脱氧核苷酸,一面以其5'→3'核酸外切活性切除引物,直至将引物全部切除。

DNA连接酶将最后的缺口补好。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程②随后链的合成冈崎片段的连结:DNA聚合酶Ⅰ一面以其DNA③先导链和随后链中DNA的延伸由同一个DNA聚合酶Ⅲ全酶二聚体催化

随后链的模板回折成环,从而使冈崎片段的延伸方向与先导链的延伸方向一致,它们的3'末端分别落在DNA聚合酶Ⅲ全酶的双活性部位。因此,随着聚合酶的移动,两条链同时延伸。(五)复制的过程一.DNA的复制3.复制叉的推进-复制叉推进的过程③先导链和随后链中DNA的延伸由同一个DNA聚合酶Ⅲ全酶南京农业大学生化课件RNA生物合成51314.复制的结束复制的终止没有特殊的信号原核生物中:

其环状的DNA从单点开始双向复制,当两个复制叉在复制原点的对面处相遇并合并时,结束复制,形成两个环状DNA分子。(五)复制的过程一.DNA的复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号原核生物中:(五)复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号真核生物中:

其线状的DNA上有多个复制原点,因此形成多个复制眼,复制叉的推进使复制眼增大,直至各个复制眼融合,复制终止,形成两个线状DNA分子。(五)复制的过程一.DNA的复制4.复制的结束复制的终止没有特殊的信号真核生物中:(五)复制(六)DNA复制的忠实性一.DNA的复制差错率为10-9-10-10新合成的子链与母链之间碱基配对严格性使用引物RNADNA聚合酶对底物专一性DNA聚合酶的校对作用5.DNA修复机制(六)DNA复制的忠实性一.DNA的复制差错率为10-9-1二.DNA的损伤与修复DNA分子的完整性对细胞至关重要,这一点是其它生物分子无法比拟的。在生物的进化中,DNA复制中可因DNA聚合酶催化作用引发出偶然的错误。环境因素(如辐射、紫外光照射、化学诱变物等)也可引起DNA序列上的错误,这些错误若不能予以改正而保留下来,会直接影响机体的生理功能,以致影响到后代的正常生长和发育。但是,生物体内存在有效的修复(repair)体系,保证了DNA复制的高度精确性。

二.DNA的损伤与修复DNA分子的完整性二.D

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