医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件

医学数据统计处理及SAS软件的应用医学数据统计处理及SAS软件的应用1SAS软件简介

SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件（SAS，SPSS和SYSTAT）之一，是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统，被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。SAS软件简介

SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计2SAS与SPSS比较作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”，SPSS的功能是最弱的，但易用性排在所有统计软件之首。不过SPSS的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能，用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能，而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。SAS与SPSS比较作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”，S3SAS全球专业认证SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证，在欧美等国的职场上流行的一句话“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。销售模式：只租不售（每5年一个周期）财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案

SAS全球专业认证SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业4医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件52003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况2003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况6Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况7SAS软件功能进行数据管理数据输入、建库、保存……进行统计分析t检验方差分析卡方检验相关、回归秩和检验……SAS软件功能进行数据管理8SAS的安装SAS8.12版本是windows操作系统下的32位软件，和其他windows系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的setup图标，然后按照提示安装。SAS的安装SAS8.12版本是windows操作系统下的9SAS的启动单击开始菜单“程序”项。桌面上双击此快捷方式也可启动SAS。SAS的启动单击开始菜单“程序”项。10执行开始菜单中程序单项【程序】－【TheSASSystem】－【TheSASSystemforWindows】执行开始菜单中程序单项11SAS退出方式1：选择关闭按钮方式2：执行菜单命令【File】→【Exit】方式3：在命令框执行BYE或ENDSAS命令SAS退出方式1：选择关闭按钮12SAS窗口PGM窗口（ProgramEditor)：提供编写SAS程序的文本编辑器LOG窗口：显示执行程序过程中的相关信息OUTPUT窗口：显示程序运行的结果命令窗口与探索者窗口SAS窗口PGM窗口（ProgramEditor)：13程序编辑窗口日志窗口结果输出窗口探索者窗口命令窗口程序编辑窗口日志窗口结果输出窗口探索者窗口命令窗口14医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件15医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件16医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件17SAS程序的编写一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA步）和过程步（PROC步）两部分组成。DATA步以DATA语句开始，通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。过程步以PROC语句开始，通过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。SAS程序的编写一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA18其它格式的数据库直接导入转换：excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等将数据读入系统，建立数据集（直接输入Editor窗口）。SAS数据集建立其它格式的数据库直接导入转换：SAS数据集建立19外部数据导入例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量：均值、标准差、最大值、最小值。该数据以Excel.xls文件形式储存。文件名称：tijiandata.xls外部数据导入例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄20医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件21ImportDataImportData22医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件23医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件24医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件25库标记导入的SAS数据库文件名库标记导入的SAS数据库文件名26医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件27探索者窗口探索者窗口28医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件29医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件30在Editor程序编辑窗口输入源程序数据步：将数据读入系统，建立数据集:DATA语句开始,后面加上数据库的名字。INPUT语句描述数据变量,用$表示变量是字符型CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据，数据间无分号。数据最后以“；”开头的空行结束。每个语句都以“；”结束。在Editor程序编辑窗口输入源程序数据步：将数据读入系统31SAS程序数据步格式Data<数据库名称>；Input<变量名1>$<变量名2>….<变量名K>@@;Cards;..............................;SAS程序数据步格式Data<数据库名称>；32数据步

过程步数据步过程步33SAS过程步对数据集中数据进行分析、处理。以PROC语句开始，调用SAS过程。每个语句都以“；”结束。整个程序最后要有RUN语句。SAS过程步对数据集中数据进行分析、处理。34过程步过程步35SAS程序的书写格式不分大小写单个名称中不能空格，不同名称间必须空格一行可写多条语句，用分号分割一条语句可写多行数据行后不加分号，数据最后单独加分号行程序用“RUN；”语句结束SAS程序的书写格式不分大小写36运行SAS程序方式一：鼠标点击执行按钮方式二：按功能键“F8”方式三：执行菜单命令Run→Submit方式四：在命令框输入SUBMIT命令并执行运行SAS程序方式一：鼠标点击执行按钮37医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件38SAS程序实例例子

某学生上学期8门课程的分数分别为88，90，87，76，92，78，80，86。试用SAS编程求其平均分数。（1）

在PGM窗口键入下列程序

datafenshu;inputchengji@@;cards;88

90

87

76

92

78

80

86;procmeans;varchengji;run;

过程步数据步SAS程序实例例子

某学生上学期8门课程的分数分39查看结果（output窗口）AnalysisVariable:chengji

N

Mean

StdDev

Minimum

Maximum

-----------------------------------------------------------------------

8

84.6250000

5.8782286

76.0000000

92.0000000

-----------------------------------------------------------------------

从结果看出，该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。查看结果（output窗口）AnalysisVaria40查看运行过程及出错信息激活LOG窗口(F6)

黑色文字：源程序及运行情况蓝色文字：程序运行情况的说明信息红色文字：出错信息绿色文字：警告信息查看运行过程及出错信息激活LOG窗口(F6)41医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件42保存SAS程序及其他窗口内容激活相应窗口，然后选择：方式一：鼠标点击“存盘”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】→【Save】/【Saveas】可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。SAS保存成纯文本格式文件（.txt)。保存SAS程序及其他窗口内容激活相应窗口，然后选择：43保存的文件的名保存的文件的名44在SAS系统内打开已保存的文件只能在ProgramEdit窗口打开文件，选择：方式一：鼠标点击“打开”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】→【Open】可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。在SAS系统内打开已保存的文件只能在ProgramEdit45SAS程序主要关键词means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm…)

univariatenormal;(正态性检验，均数是否为0的假设检验：参数与非参数检验）ttest;(两个样本均数比较的t检验）anova;(各样本含量相等的方差分析）

glm;(各样本含量不等的方差分析）npar1way;(非参数检验）

reg;(线性回归方程：单元或多元）corr;(线性相关：线性相关或秩相关）freq;(卡方、Fisher检验）logistic;(非线性回归）

lifetest;(生存分析）procSAS程序主要关键词m46定量资料的描述性分析定量资料的描述性分析47分析结果分析结果48定量资料的正态性检验定量资料的正态性检验49正态性检验结果正态性检验结果50配对设计的t-test为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同，随机抽取了10份乳酸饮料制品，分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果，问两种方法检测结果是否不同？编号哥特里-罗紫法脂肪酸水解法10.8400.58020.5910.50930.6740.50040.6320.31650.6870.33760.9780.51770.7500.45480.7300.51291.2000.997100.8700.506配对设计的t-test为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的51医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件52医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件53成组设计资料的t-test国产药进口药-5-176448634777607458-2-14897277486361705436228266-14采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症，试比较两种药物的疗效是否有差别成组设计资料的t-test国产药进口药-5-1764486354医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件55医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件56完全随机设计资料的方差分析（教科书73页）安慰剂组2.4g组4.8g组7.2g组3.532.422.860.894.593.362.281.064.344.322.391.082.662.342.281.273.592.682.481.633.132.952.281.894.042.632.321.743.532.862.612.163.652.933.643.373.852.172.582.974.072.723.651.693.932.223.682.114.192.902.652.812.962.973.022.52完全随机设计资料的方差分析（教科书73页）安慰剂组2.4g组57医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件58方差齐性检验方差齐性检验59医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件60医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件61医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件62医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件63医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件64医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件65四格表资料的χ2-test组别有效无效合计有效率胞磷胆碱4665288.5%神经节苷脂1882669.2%合计64147882.1%某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效，将78例脑血管疾病患者随机分为两组，试比较两种药物的疗效四格表资料的χ2-test组别有效无效合计有效率胞磷胆碱4666医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件67医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件68医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件69配对四格表资料的χ2-test配对设计的卡方检验配对四格表资料的χ2-test配对设计的卡方检验70医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件71医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件72医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件73非参数检验（配对）非参数检验（配对）74医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件75医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件76非参数检验9D11CDSC25325526636646647748751097121071111比较小白鼠接种三种不同菌型伤寒杆菌9D、11C、DSC1后存活的日数。非参数检验9D11CDSC2532552663664664777医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件78医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件79医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件80医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件81医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件82直线相关与回归年龄尿肌酐含量133.54113.0193.0962.4882.56103.36123.1872.65某地方病研究所调查了8名正常儿童的尿肌酐含量，试估计尿肌酐含量对其年龄的回归方程。直线相关与回归年龄尿肌酐含量133.54113.0193.083回归相关回归相关84医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件85医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件86医学数据统计处理及SAS软件的应用医学数据统计处理及SAS软件的应用87SAS软件简介

SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件（SAS，SPSS和SYSTAT）之一，是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统，被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。SAS软件简介

SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计88SAS与SPSS比较作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”，SPSS的功能是最弱的，但易用性排在所有统计软件之首。不过SPSS的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能，用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能，而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。SAS与SPSS比较作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”，S89SAS全球专业认证SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证，在欧美等国的职场上流行的一句话“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。销售模式：只租不售（每5年一个周期）财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案

SAS全球专业认证SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业90医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件912003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况2003年(301医院与军事医科院博士生）各统计软件使用情况92Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况93SAS软件功能进行数据管理数据输入、建库、保存……进行统计分析t检验方差分析卡方检验相关、回归秩和检验……SAS软件功能进行数据管理94SAS的安装SAS8.12版本是windows操作系统下的32位软件，和其他windows系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的setup图标，然后按照提示安装。SAS的安装SAS8.12版本是windows操作系统下的95SAS的启动单击开始菜单“程序”项。桌面上双击此快捷方式也可启动SAS。SAS的启动单击开始菜单“程序”项。96执行开始菜单中程序单项【程序】－【TheSASSystem】－【TheSASSystemforWindows】执行开始菜单中程序单项97SAS退出方式1：选择关闭按钮方式2：执行菜单命令【File】→【Exit】方式3：在命令框执行BYE或ENDSAS命令SAS退出方式1：选择关闭按钮98SAS窗口PGM窗口（ProgramEditor)：提供编写SAS程序的文本编辑器LOG窗口：显示执行程序过程中的相关信息OUTPUT窗口：显示程序运行的结果命令窗口与探索者窗口SAS窗口PGM窗口（ProgramEditor)：99程序编辑窗口日志窗口结果输出窗口探索者窗口命令窗口程序编辑窗口日志窗口结果输出窗口探索者窗口命令窗口100医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件101医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件102医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件103SAS程序的编写一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA步）和过程步（PROC步）两部分组成。DATA步以DATA语句开始，通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。过程步以PROC语句开始，通过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。SAS程序的编写一个完整的SAS程序一般由数据步（DATA104其它格式的数据库直接导入转换：excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等将数据读入系统，建立数据集（直接输入Editor窗口）。SAS数据集建立其它格式的数据库直接导入转换：SAS数据集建立105外部数据导入例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量：均值、标准差、最大值、最小值。该数据以Excel.xls文件形式储存。文件名称：tijiandata.xls外部数据导入例：有一批体检数据，包括受检者的姓名、性别、年龄106医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件107ImportDataImportData108医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件109医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件110医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件111库标记导入的SAS数据库文件名库标记导入的SAS数据库文件名112医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件113探索者窗口探索者窗口114医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件115医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件116在Editor程序编辑窗口输入源程序数据步：将数据读入系统，建立数据集:DATA语句开始,后面加上数据库的名字。INPUT语句描述数据变量,用$表示变量是字符型CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据，数据间无分号。数据最后以“；”开头的空行结束。每个语句都以“；”结束。在Editor程序编辑窗口输入源程序数据步：将数据读入系统117SAS程序数据步格式Data<数据库名称>；Input<变量名1>$<变量名2>….<变量名K>@@;Cards;..............................;SAS程序数据步格式Data<数据库名称>；118数据步

过程步数据步过程步119SAS过程步对数据集中数据进行分析、处理。以PROC语句开始，调用SAS过程。每个语句都以“；”结束。整个程序最后要有RUN语句。SAS过程步对数据集中数据进行分析、处理。120过程步过程步121SAS程序的书写格式不分大小写单个名称中不能空格，不同名称间必须空格一行可写多条语句，用分号分割一条语句可写多行数据行后不加分号，数据最后单独加分号行程序用“RUN；”语句结束SAS程序的书写格式不分大小写122运行SAS程序方式一：鼠标点击执行按钮方式二：按功能键“F8”方式三：执行菜单命令Run→Submit方式四：在命令框输入SUBMIT命令并执行运行SAS程序方式一：鼠标点击执行按钮123医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件124SAS程序实例例子

某学生上学期8门课程的分数分别为88，90，87，76，92，78，80，86。试用SAS编程求其平均分数。（1）

在PGM窗口键入下列程序

datafenshu;inputchengji@@;cards;88

90

87

76

92

78

80

86;procmeans;varchengji;run;

过程步数据步SAS程序实例例子

某学生上学期8门课程的分数分125查看结果（output窗口）AnalysisVariable:chengji

N

Mean

StdDev

Minimum

Maximum

-----------------------------------------------------------------------

8

84.6250000

5.8782286

76.0000000

92.0000000

-----------------------------------------------------------------------

从结果看出，该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。查看结果（output窗口）AnalysisVaria126查看运行过程及出错信息激活LOG窗口(F6)

黑色文字：源程序及运行情况蓝色文字：程序运行情况的说明信息红色文字：出错信息绿色文字：警告信息查看运行过程及出错信息激活LOG窗口(F6)127医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件128保存SAS程序及其他窗口内容激活相应窗口，然后选择：方式一：鼠标点击“存盘”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】→【Save】/【Saveas】可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。SAS保存成纯文本格式文件（.txt)。保存SAS程序及其他窗口内容激活相应窗口，然后选择：129保存的文件的名保存的文件的名130在SAS系统内打开已保存的文件只能在ProgramEdit窗口打开文件，选择：方式一：鼠标点击“打开”工具按钮方式二：执行菜单命令【File】→【Open】可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。在SAS系统内打开已保存的文件只能在ProgramEdit131SAS程序主要关键词means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm…)

univariatenormal;(正态性检验，均数是否为0的假设检验：参数与非参数检验）ttest;(两个样本均数比较的t检验）anova;(各样本含量相等的方差分析）

glm;(各样本含量不等的方差分析）npar1way;(非参数检验）

reg;(线性回归方程：单元或多元）corr;(线性相关：线性相关或秩相关）freq;(卡方、Fisher检验）logistic;(非线性回归）

lifetest;(生存分析）procSAS程序主要关键词m132定量资料的描述性分析定量资料的描述性分析133分析结果分析结果134定量资料的正态性检验定量资料的正态性检验135正态性检验结果正态性检验结果136配对设计的t-test为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同，随机抽取了10份乳酸饮料制品，分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果，问两种方法检测结果是否不同？编号哥特里-罗紫法脂肪酸水解法10.8400.58020.5910.50930.6740.50040.6320.31650.6870.33760.9780.51770.7500.45480.7300.51291.2000.997100.8700.506配对设计的t-test为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的137医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件138医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件139成组设计资料的t-test国产药进口药-5-176448634777607458-2-14897277486361705436228266-14采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症，试比较两种药物的疗效是否有差别成组设计资料的t-test国产药进口药-5学数据统计处理及SAS软件的应用-课件141医学数据统计处理及SAS软件的应用-课件142完全随机设计资料的方差分析（教科书73页）安慰剂组2.4g组4.8g组7.2g组3.532.422.860.894.593.362.281.064.344.322.391.082.662.342