中国水稻品种及其系谱指纹数据库

2）基本收集齐国内审定品种、大面积推广品种、农家品种，等等，除品种外，还收录有不育系等材料3）是国内唯一带有系谱追溯功能的水稻种质数据库，也是国内关于水稻品种最齐全的数据库4）指纹鉴定（开发中，后文详细介绍…）本数据库平台的特色中国水稻品种及其系谱、指纹数据库水稻科学数据的共享和利用各种相关数据的无缝整合是本数据库平台最大特色通过系谱追溯功能，结合品种推广数据，再编写特定的程序包，我们还能够：筛选骨干亲本，推演主推品种更迭规律一次性检索出某个核心种质、不育系或恢复系所衍生的全部品种或配组组合，以及它们的应用面积一次性检索出某类型不育系（如印水型）所配组的全部组合及其应用面积本数据库平台的特色中国水稻品种及其系谱数据库（特色功能）水稻科学数据的共享和利用根据亲本的儿子、孙子和曾孙三代的表现，统计亲本的应用情况:

分别按照后代数目和后代面积进行排序，从而推算骨干亲本以50万亩以上为为主推品种种，计算主主推品种的的淘汰率，，如以某一一年为观察察起点，看看看这年的的主推品种种大概需要要几年，全全部退出历历史舞台，，等等…蜀恢527衍生品种共共计326个本数据库平平台的特色色水稻功能基基因数据库库水稻科学数数据的共享享和利用将不同文献献中的同一一基因汇总总到一起将不同文献献中的同一一基因汇总总到一起DTH2电子注释基因结构图图，我们自自主编写的的SVG脚本程序生生成，指纹实物图图，是否也也能通过程程序自动生生成？可以以尝试，当当然，也可可以直接截截取原始图图片.尝试对日本本晴基因组组的全部5万多个基因因进行电子子注释geneontology(GO)→基因功能，，影响的生生物学进程程traitontology(TO)→基因所影响响的表型plantontology(PO)→基因表达的的时空性本数据库平平台的特色色管理基因数数据库的ontology系统水稻科学数数据的共享享和利用自主开发了了ontology系统；ontology，实质是对基基因进行分类类和注释与传统的关键键字或图书馆馆分类不同，，ontology的术语之间有有关联性，如如“水稻”和和“禾本科植植物”本数据库平台台的特色管理基因数据据库的ontology系统水稻科学数据据的共享和利利用本数据库平台台的特色Ontology系统管理水稻稻基因数据水稻科学数据据的共享和利利用1）服务于品种种数据库和基基因数据库：：文献中的品种种信息析出并并录入到品种种数据库;文献中的基因因相关信息录录入到基因数数据库；2）累计收录中中英文水稻文文献超过2.86万份:下一步：做成成内网可以直直接下载原文文…下一步：使用用ontology进行管理(中国农科院信信息所计划有有项目资助)本数据库平台台的特色水稻文献数据据库水稻科学数据据的共享和利利用文献数据库的的作用：由于于重要数据都都列出了数据据来源，当不不同来源的数数据不一致时时，用户可以以自行判断将NCBI、GRAMENE等数据库收录录的有关水稻稻的所有生物物学数据，全全部融入进来来，并对其中中的基因和蛋蛋白进行GO和TO注释；目前正在做的的工作水稻科学数据据的共享和利利用中国水稻品种及其系谱数据库中国水稻品种及其系谱、指纹数据库特点和工作基基础：(1)指纹跟系谱相相结合，可以以相互印证;(2)使用WindowsServer2008和SQLServer2005架构，数据库库的高效、安安全和稳定有有保障；(3)我们有自己的的高效服务器器和足够的带带宽，当然，，是否对外开开放、如何开开放，可以自自主控制；本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其系谱、、指纹数据库库实现过程：(1)服务器系统：：WindowsServer2008+IIS6.0;(2)底层数据库：：SQLServer2005；(3)开发技术：DHTML(HTML+CSS+javascript)；ASP.net(运行环境)；VB.net(编程语言)；SVG+VML(可缩放矢量图图形，程序直直接绘图)本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其系谱、、指纹数据库库目前正在做的的工作(1)：品种指纹数数据的查询目前正在做的的工作(2)：品种指纹的的比对(相似度)算法：1个位点上的两两个等位基因因分别比对(1)在查询和比对对的结果显示示界面，增加加指纹图谱的的图形显示，，以在需要时时能方便了解解实验的真实实情况;(2)批量比对，用用户通过提交交保存有待比比对品种指纹纹的excel表格，跟数据据库已有指纹纹进行批量比比对；(3)全数据库指纹纹相似度比对对，按照相似似度由高到低低排序，从而而推测所有已已测定品种间间亲缘关系…本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其系谱、、指纹数据库库(待优化功能)其它需要优化化的功能？本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其系谱、、指纹数据库库(待优化功能)谢谢!谢谢观看/欢迎