LSF作业管理系统使用方法

1、LSF作业管理系统使用方法LSF作业管理系统使用方法8/8LSF作业管理系统使用方法页眉内容LSF作业管理系统使用方法这份文档将指导您经过LSF提交和管理作业。文档包含了使用LSF提交、查察、删除作业的相关内容。依据文档的操作规范和反响方法，将帮助您顺利完成工作。也欢迎大家对文档内容提出建议，感谢！Contentshide1经过LSF查察集群运行状态1.1查察LSF计算节点列表bhosts1.2查察LSF队列bqueues1.3查察计算节点负载lsload2使用LSF提交作业bsub2.1手动提交作业2.2交互式批量提交2.3编写LSF作业控制脚本2.4一个功能更圆满的LSF作业控制脚本其他作

2、业管理操作3.1查察作业状态bjobs3.2停止作业bkill3.3监察作业输出bpeek3.4作业历史信息bhist4参照资料Birthday页眉内容经过LSF查察集群运行状态查察LSF计算节点列表bhosts#bhostsHOST_NAMESTATUSJL/UMAXNJOBSRUNSSUSPUSUSPRSVfat01ok-1600000fat02ok-1600000fat03ok-1600000fat04ok-1600000fat05ok-1600000fat06ok-1600000fat07ok-1600000fat08ok-1600000fat09ok-1600000fat10ok-1

3、600000查察LSF队列bqueues查察所有队列的整体信息：#bqueuesQUEUE_NAMEPRIOSTATUSMAXJL/UJL/PJL/HNJOBSPENDRUNSUSPcpu40Open:Active2072020720fat40Open:Active0000gpu40Open:Active28802880Birthday页眉内容mic40Open:Active0000cpu-fat40Open:Active160160查察某个队列的信息：#bqueuesfatQUEUE_NAMEPRIOSTATUSMAXJL/UJL/PJL/HNJOBSPENDRUNSUSPfat40Open

4、:Active0000查察计算节点负载lsload查察整体负载：#lsloadHOST_NAMEstatusr15sr1mr15mutpglsittmpswpmemnode011ok0.00.30.40%0.0049024193G62G61Gnode039ok0.00.60.50%0.0049024194G62G61Gnode041ok0.00.00.00%0.0049024194G62G61Gnode050ok0.00.00.00%0.0049024194G62G60Gnode064ok0.00.70.60%0.0049024194G62G61Gnode077ok0.00.70.50%0.0

5、049024194G62G61G查察某个节点的负载：#lsloadnode001HOST_NAMEstatusr15sr1mr15mutpglsittmpswpmemnode001ok0.30.10.11%0.00332152G62G61G使用LSF提交作业bsub手动提交作业Birthday页眉内容LSF使用bsub提交作业。bsub命令的格式是：bsub-nZ-qQUEUENAME-iINPUTFILE-oOUTPUTFILECOMMAND其中：Z提交作业需要的线程数，-q指定作业提交的队列。若是不增加-q选项，系统将把作业提交到默认的作业队列。INPUTFILE表示程序需要读入的文件名，

6、OUTPUTFILE表示输出文件名，作业提交后的输出到标准输出信息将会保存在这个文件中。对于串行作业，COMMAND可以直接使用您的程序名。比方，将串行程序mytest的经过LSF提交：bsub-n1-qq_default-omytest.out./mytest对于MPI并行作业，COMMAND的格式为-ampich_gmmpirun.lsfPROG_NAME。比方，将并行程序mytest，经过LSF提交，使用16个线程运行这个作业：bsub-n16-qq_default-omytest.out-ampich_gmmpirun.lsf./mytest交互式批量提交使用bsub还可以启动一个交互

7、式的shell环境，一次提交多个运行参数相同的并行作业。比以下面的操作：bsubbsub-n16bsub-qq_defaultbsub-ooutput.txtbsubCOMMAND1bsubCOMMAND2bsubCOMMAND3等价于：Birthday页眉内容bsub-n16-qq_default-ooutput.txtCOMMAND1bsub-n16-qq_default-ooutput.txtCOMMAND2bsub-n16-qq_default-ooutput.txtCOMMAND3编写LSF作业控制脚本#BSUB-n16#BSUB-qq_default#BSUB-ooutput.tx

8、t-ampich_gmmpirun.lsf./mytestbsub还接受来自标准输入的作业说明。因此，我们可以编写LSF脚本提交作业。bsub脚本简单易写，上面一段代码是名为bsub.script的圆满例子，将bsub.script经过输入重定向，提交给LSF：bsub&/dev/nulltouchnodelisttouchnodesNP=0forhostinecho$LSB_MCPU_HOSTS|sed-es/:/g|seds/:n/nn/gdoecho$hostnodelistecho$host|cut-d:-f1nodesnn=echo$host|cut-d:-f2NP=echo$NP+$nn|bcdone其他作业管理操作查察作业状态bjobs检查已提交的作业的运行状态：bjobs以宽格式来显示作业运行状态：bjobs-w显示所有作业：bjobs-a显示正在运行的作业：bjobs-r显示等待运行(pending)的作业和等待的原因：bjobs-pBirthday页眉内容显示已经挂起(suspending)的作业和挂起的原因：bjobs-s显示JOBID这个作业的所有信息：bjobs-lJOBID停止作业bkill停止不需要的作业：bkill停止JOBID这个作业：bkillJOBID直接将作业JOBID从LSF中移除，而不等待该作业的进度在操