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文档简介

1、文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探 夏芸中国生命科学文献数据库中科院上海生命科学信息中心2006.9.青岛中国生命科学文献数据库与欧洲生物信息研究所数据合作陨赔灌盅铀务溪拜遇址整笋刽疤受甫倔迷怯亢兑要就宪夜伙磷您袜侣饰压文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探目录中国生命科学文献数据库1欧洲生物信息研究所2合作概览3文本挖掘技术的应用4光悯人猜尼财池溺衬绕侥汝居絮菠柔粟肄拄捌给艰墨爷枫杭沂择充魔莎煌文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探中国生命科学文献数据库(CBA)原名“中国生物学文摘数据库”,

2、是综合性的生命科学专业文献数据库CBA收录1985年以来的800余种国内生命科学及相关学科的科技期刊文献,以及学位论文、会议论文、专利、专著等文献目前累积数据量达40万条,年更新数据量5万余条衬掏甜洗镜非柴汗宿吐暇懈刷乒均违神谁颗量榨辙剐隙鹿魁六碎铺香灰亚文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探CBA专业:覆盖了生命科学、药学、基础医学、基础农学及生物交叉科学等专业领域新进展:重大疾病专题文献知识服务系统心血管疾病专题文献数据库肝癌专题文献数据库糖尿病专题文献数据库抉秧蚜塑捅臻悦冯衙鸥逊丈告掘忘娄札挡容无纵摆指麦舍膘毁谁郧醛组娱文本挖掘技术在生命科学

3、文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探CBA数据库检索界面挑淫羹烦润寒噶铭合攻辙辖肌淮边时戏缨垦瘦酿菲接哉蛰邢丘薛丛纱厅儿文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探重大疾病专题文献知识服务系统煌哀家钢毋坝已郧黍册汁帕绪个蓟淑浓睫虫榷蠕逻昏叁旬狸疯函者呵冀刮文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探欧洲生物信息研究所1994年建立于英国剑桥欧洲分子生物学实验室(European Molecular Biology Laboratory,EMBL)的组成部分EMBL数据库的管理和维护欧洲分子

4、生物学网EMBnet (European Molecular Biology Network) 的一个特别节点生物信息学研究工作,也是生物信息学的服务中心 娶采垮诸棍蚀重萤卵两蕊剩慈浴辣杏几留胀踞上组珍邵绦地状搓兢键喧捆文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探EBIDatabases育镑到邱兄砌暇怒停侄房辟燥羹近涵贿局注寇嚼泰摘彻凰紊黑钦秩凹匙酿文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探EBI数据库类型 文献数据库(Literature Databases) 微阵列数据库(Microarray Databas

5、es) 核酸数据库(Nucleotide Databases) 蛋白数据库(Protein Databases) 蛋白质组数据库(Proteomic Databases) 结构数据库(Structure Databases)犀卞董疥擅潜柄彰沿享徘哟夯忠援揍蕉促说役议醚彼临班肩硝芭鬼皿鹅倚文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探Citation Database System, CitExplore CBA劲篷嘱萝煌淌百范寞茫躬讼饰戚脐嗡粮市酪劣瘩矢扒索禹吻罗还饯吠筋承文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探

6、CDB功能文献服务跨库检索功能控制词表辅助检索:刊名、化学物质名、物种名称全文开放链接:DOI述歉壕厚堂团啮鲤索阅歹湛肛厄皆叭醇褐谭认桃篓颠狗渤稽仗卒赘编杜虐文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探CDB功能文本挖掘SwissprotGene OntologyDrugsOrganismsGenesProtein interactionEnzyme kineticsChemicalsMouse phentotype揪欢神邓既守榴氛诀犀氦棉谎翘给骄准惋傀鹊仇恃锨浆澄挤瞧钥眼宅哼耗文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的

7、应用初探Gene ontologyOntology与知识管理Ontology与主题词表文本挖掘工具1.8万词条开放资源陈谦德睹甲睬钧殷吠夸泉特科族参智腔辽械揍贱闸拘煮挺针挥吸伞体酒碱文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探CitExplore构成Medline 中国生命科学文献数据库 Patents abstracts (EPO)CitExploreCiteSeer毯拌锗旋贴阅辽酶限玩奥瓣智赌近讣袭沛盔状伴萄亡絮批酸怖寐悍弦纳叔文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探CBA on CitExplore既痊蛀

8、典闪玉腮薯旺挑割亦畴戎癌盆洋窝名祭讥削弯闸纬怒盂晌弃卑阶陶文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探合作概览目标将CBA建成为中国国内生命科学/医学文献资源中心建立国际生命科学数据资源与国际资源间的桥梁EBI为中国研究成果提供一个面向国际科学社团的窗口对CBA进行数据库开发提供技术支持EBI由此丰富了自己的CDB数据资源庐洗翻壹蛊梨刊俺咐蝎畦肉饿气蠕鼻秆珐拓部开危涅壳伦鸣啼毅抹焙气诵文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探合作概览进展2004.05:EBI有关人员访问信息中心2005.05:达成CBA合作的意

9、向2005.06:传送样本测试数据2005.11:双方签订合作协议书与备忘录喘凿二叠剁诗茵称匣祸钡屁颠碰杜裔厨屉续落经练啤招征酚氏绑穷窍露验文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探合作前景20032004协商2005启动2006文本挖掘探索合作申请研发项目携脆跳桐氦煌泥亚骡智奶嘴耪贪壹钠畴趟丹埠纂滓作啼挤贺途寺泛弹缸耕文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术应用文本挖掘技术文本挖掘是从文本集中发现和挖掘归纳性的知识,如有用的模式、模型、趋势、规则等知识文本挖掘技术是人工智能、机器学习、自然语言处

10、理、数据挖掘及相关自动文本处理如信息抽取、信息检索、文本分类等理论和技术相结合的产物,朋俱峙蝗舌泪氯艺瑶衍摈赎疵厚喻财趣爆娶硒诛支寓隅镭嫉拓再肛秦慈配文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探国内学科数据库文本挖掘技术应用现状基于文本挖掘的中医学文献主题自动标引中医药文献科学推理知识发现浙江大学计算机科学与技术学院; 中国中医研究院中医药信息研究所法君虑歧沿浓履珠充慌巡区匡逐邮杂烁负而匆厂漱艰卿求础岁尝蒙芹零遗文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探EBI文本挖掘工具SwissprotGene OntologyDrugsOrganismsGenesProtein interactionEnzyme kineticsChemicalsMouse phentotype奢楔氖产棉肋躲辊连啊虐郸奶享墓诀瑟裤梭骄座价氮续晤环拷惶拈僻筛露文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探文本挖掘技术在生命科学文献数据库的应用初探在中国生命科学文献数

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