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文档简介
1、 第五章 分子生物学技术DNA重组技术及运用现代分子生物学的快速开展,得益于上个世纪中叶以来研讨方法、特别是基因操作和基因工程技术的提高。基因操作主要包括DNA分子的切割与衔接、杂交、电泳、细胞转化、核酸序列分析以及基因人工合成、表达、定点突变和PCR扩增等,是分子生物学研讨的中心技术。基因工程是指在体外将核酸分子插入病毒、质粒或其它载体分子,构成遗传物质的新组合,使之进入原先没有这类分子的寄主细胞内并进展继续稳定的繁衍和表达。基因工程技术是核酸操作技术的一部分,只不过它强调了外源核酸分子在另一种不同的寄主细胞中的繁衍与性状表达。现实上,这种跨越物种屏障、把来自其它生物的基因置于新的寄主生物细
2、胞之中的才干,是基因工程技术区别于其它技术的根本特征。重组DNA技术开展史上的艰苦事件三大成就:一、在20世纪40年代确定了遗传信息的携带者、即基因的分子载体是DNA而不是蛋白质,处理了遗传的物质根底问题;二、50年代提出了DNA分子的双螺旋构造模型和半保管复制机制,处理了基因的自我复制和世代交替问题;三、50年代末至60年代,相继提出了“中心法那么和支配子学说,胜利地破译了遗传密码,阐明了遗传信息的流动与表达机制。5.1 基因操作的根本工具一限制性核酸内切酶可以识别DNA上的特定碱基序列并从这个位点切开DNA分子。第一个核酸内切酶EcoRI是Boyer实验室在1972年发现的,它能特异性识别
3、GAATTC序列,将双链DNA分子在这个位点切开并产生具有粘性末端的小片段。 图5-1 几种主要DNA内切酶所识别的序列及其酶切末端。二基因克隆的载体 我们知道仅仅能在体外利用限制性核酸内切酶和DNA衔接酶进展DNA的切割和重组,还远远不能满足基因工程的要求,由于大多数 DNA片段不具备自我复制的才干,只需将他们衔接到具备自主复制才干的DNA分子上,才干在寄主细胞中进展繁衍。载体vector)是指具备自主复制的DNA分子,象病毒、噬菌体和质粒等相对分子量较小的复制子均可以作为基因导入的载体。载体三要素:自我复制才干;携带外源基因片段大小具有较小的分子量和较高的拷贝数;插入位点多少具有假设干限制
4、酶单一识别位点;易于鉴定识别具有抗菌素抗性基因大肠杆菌质粒载体: 1、pSC101质粒载体低拷贝数严紧型复制控制的大肠杆菌质粒载体,平均每个寄主细胞仅有12个拷贝。长9.09kb,带有四环素抗性基因tetr及EcoRI、HindIII、BamHI、SalI、XhoI、PvuII以及SmaI等7种限制性核酸内切酶的单酶切位点,在HindIII、BamHI和SalI等3个位点插入外源基因,会导致tetr失活。大肠杆菌pSC101质粒载体表示图。是第一个真核基因克隆载体。缺陷:它是一种严紧型复制控制的低拷贝质粒,从带有该质粒的寄主细胞中提取pSC101 DNA,产量很低。2、ColE1质粒载体松弛型
5、复制控制的多拷贝质粒。普通情况下,当培育基中氨基酸被耗尽,或是在细胞培育物中参与氯霉素以抑制蛋白质的合成,寄主染色体DNA的复制便被抑制,细胞的生长也随之停顿。而松弛型质粒DNA却继续复制数小时,使每个寄主细胞中ColE1质粒的拷贝数到达10003000个,占细胞总DNA的50%左右。3、pBR322质粒载体由三个不同来源的部分组成的:第一部分来源于pSF2124质粒易位子Tn3的氨苄青霉素抗性基因AmpR;第二部分来源于pSC101质粒的四环素抗性基因tetr;第三部分那么来源于ColE1的派生质粒pMB1的DNA复制起点ori。AmpR优点是具有较小的分子量,其长度为4 363bp。不仅易
6、于纯化,而且即使携带上一段6-8kb的外源DNA片段,操作起来仍较为便利。具有两种抗生素抗性基因以用作转化子的选择记号。有较高的拷贝数,假设经过氯霉素扩增,每个细胞中可累积10003000个拷贝,为重组体DNA的制备提供了极大的方便。4、pUC质粒载体包括四个部分:(i)来自pBR322质粒的复制起点ori;(ii)氨苄青霉素抗性基因ampr;(iii)大肠杆菌-半乳糖酶基因lacZ的启动子及其编码-肽链的DNA序列,此构造特称为lacZ基因;(iv)位于lacZ 基因中的接近5-端的一段多克隆位点MCS区段,外源基因插入后破坏了lacZ 基因的功能。优点: 更小的分子量和更高的拷贝数。在pB
7、R322根底上构建pUC质粒载体时,仅保管下其中的氨苄青霉素抗性基因及复制起点,其分子小了许多,pUC8为2750bp,pUC18为2686bp。由于缺失rop基因,pUC质粒不经氯霉素扩增时,平均每个细胞即可达500700个拷贝。可用组织化学方法检测重组体。pUC8质粒构造中具有来自大肠杆菌lac支配子的lacZ基因,所编码的-肽链可参与-互补作用。因此,可用X-gal显色法实现对重组体转化子的鉴定。具有多克隆位点MCS区段,可以把具两种不同粘性末端如EcoRI和BamHI的外源DNA片段直接克隆到pUC8质粒载体上。5、 pGEM-3Z质粒 长度为2743bp,编码有一个氨苄青霉素抗性基因
8、和一个lacZ基因。 含有两个噬菌体启动子T7和SP6,为RNA聚合酶的附着作用提供了特异性的识别位点。参与T7或SP6 RNA聚合酶,所克隆的外源基因便会转录出相应的mRNA。6、穿越质粒载体shuttle plasmid vector 指由人工构建的具有两种不同复制起点和选择记号,可在两种不同的寄主细胞中存活和复制的质粒载体。由于这类质粒载体可以保证外源DNA序列在不同物种的细胞之间得到扩增,能在原核和真核细胞之间往返穿越,具有广泛的用途。7、pBluescript噬菌粒载体 pBluescript是指由Stratagene公司开展的一类从pUC载体派生而来的噬菌粒载体,简称为pBS+/-
9、,如今那么更多地叫作pBluescript KS+/-或pBluescript SK+/-。SK表示多克隆位点区的取向,即lacZ基因是按照SacIKpnI的方向转录;+/ -表示单链噬菌体f1复制起点的两种相反的取向。f1+起点表示当pBluescript噬菌粒载体和辅助噬菌体共感染寄主细胞时,可以回收到lacZ基因的有意义链DNA;而f1-起点那么表示当pBluesript噬菌粒载体与辅助噬菌体共感染寄主细胞时,可回收到lacZ基因的无意义链DNA。(i)在多克隆位点区MCS的两侧,存在一对T3和T7噬菌体的启动子,用以定向指点插入在多克隆位点上的外源基因的转录活动;(ii)具有单链噬菌体
10、M13或f1的复制起点和一个来自ColE1质粒的复制起点,保证pBluescript噬菌粒载体在有或无辅助噬菌体共感染的不同情况下,按照不同的复制方式分别合成出单链或双链DNA;(iii编码有一个氨苄青霉素抗性基因,作为转化子克隆的选择标志;(iv)含有一个lacZ基因,可以按照X-gal-IPTG组织化学显色法挑选噬菌粒载体的重组子。LacZ编码-半乳糖苷酶氨基端146个氨基酸的-肽, IPTG异丙基- -D-硫代半乳糖苷诱导该基因表达,合成的-半乳糖苷酶-肽能与宿主细胞所编码的缺陷型-半乳糖苷酶相互补,产生有活性的-半乳糖苷酶,能水解外源参与培育基中的X-gal5-溴-4-氯-3-吲哚-D-半乳糖苷,生成蓝色的溴氯吲哚,使生长于含X-gal培育基中的转化菌落呈蓝色。重组DNA操作过程表示图图5-2 DNA衔接酶能把不同的DNA片段衔接成一个整体 仅仅能在体外利用限制性核酸内切酶和DNA衔接酶进展DNA的切割和重组,还不能满足基因工程的要求,只需将它们衔接到具备自主复制才干的DNA分子上,才干在寄
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