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文档简介

1、甾体17羟化酶C17,20-裂解酶(P45017)按捺剂的摘要目的:创立P45017(按捺剂的三维定量构效干系,为方案新的更有用的按捺剂提供理论根据。要领和效果:使用比力分子力场要领,创立了P45017(按捺剂的三维定量构效干系模子。交织验证回归系数R2V、非交织验证回归系数和尺度缺点SEE别离为0533,0776,0271。说明系列化合物分子四周立体场和静电场的漫衍与生物活性间有精良的相干性。使用该模子对本室合成的三个化合物举行活性猜测,效果与实测值符合。结论:所得模子支持了假设的按捺剂作用机理和作用模子。所得勘FA模子具有必然的猜测本领,可用来引导方案新的P45017按捺剂。关键词P450

2、17按捺剂比力分子场阐发法(FA)三维定量构效干系模子17羟化酶l7,20裂解酶是位于睾丸和肾上腺的细胞色素酶。它是雄激素生物合成途径中的关键酶。成效是将2l碳的生物前体孕烯醇酮和孕酮别离在两步中去20乙酰侧链和17位羟化,转化成19碳的去氢表雄酮和雄烯二酮。末了由位于前线腺中的5复原酶将睾酮转化成二氢睾酮。已经证实体内的一些疾病是由体内过高的雄激素导致的,如前线腺良性增生,前线肠癌等。临床上已证实低落体内的雄激素程度是治疗这些疾病的有用要领。选择性高、作用强的P45017酶按捺剂可以通过按捺雄激素生物合成中较初始环节,低落体内雄激素程度,在临床上用于治疗前线腺疾玻已报道的P45017。按捺剂

3、重要包罗国体类和非甾体类,而非团体类按捺剂多数不具有好的选择性。为了进一步阐发P45017按捺剂的定量构效干系,创立具有提示高活性化合物信息及猜测本领的构效干系模子,本文使用比力分子力场要领(FA),对甾体类按捺剂举行了三维定量构效干系研究。实行要领全部事情都是在Trips公司SilinGraphis2盘算机事情站上完成的。所用盘算步伐为Trips公司的Sybyl64分子方案软件包。盘算历程所涉及的参数除非特殊指明,均为缺省值。1化合物的选择P450l7(YPl7)是一种布局尚未知的细胞色素酶。其按捺剂的挑选有多种要领。因此对化合物的活性数据举行了严酷观察。本文选择了31个团体按捺剂举行FA研

4、究。它们的活性数据源于同一个实行室。每次测试中,比较样品活性值雷同,以为有可比性。所拔取样品是以酮康唑为尺度品,其I50值为78n。比力分子力场阐发接纳I50的负对数情势10gI50。所选用的化合物布局及活性见表l。TablThestruturesandativitiesf31pundsusedinFANBasiStrutureR1R2R3RI50(n)-1g11BHHH(a)664,182BH-(a)4303373BH(a)244624BA(a)754125BAHH(a)1993706BAHH(a)XA1004007AHH(a)584248AHH(a)12002929A(a)5043010B

5、H(b)2146811BH()X,YN4243812BH()X,Y=N10839713BHHH()XN,Y111329514A()XN,Y=N5942315A()X,Y=3944116BH(d)XN-H7341417BA(d)XN-H6741718BA(d)XA5142919BH(e)XH,Ye33934720BH(e)Xe,YH37234321BA-N-(d)X16237922AHH(d)XNH4343723AHH(d)XNA2546024ANH(E)(d)XNH19637l25ANH(Z)(d)(d)XNH7541226A(f)XN,Y=N,Z=9047227BH(f)XN,Y=,Z=N8

6、40428BH(f)X,Y=N,Z=1351029BH(f)XN,Y=N,Z=5548830A(f)XN,Y=,Z=N742631A=(f)X=N,Y=N,Z=195152活性构象确定由于酶布局未知,以是接纳分子的最低能量构象作为最大概的药效构象。以活性最好的化合物31作为模板分子。其起始构象是在Sybyl64的“BuildEdit模块下创立,用分子力学步伐iniize举行能量优化。优化历程中接纳Pell能量梯度法,用Trips力场,能量收敛限定为0001kall-l,优化次数为1000。分子载荷为GastEigerHuhel型电荷。别的化合物以3l为模板,变更成相应布局,也以iniize步伐

7、以同样条件能量优化后,作为最低能量构象。3分子叠合由于按捺剂同属甾体类,它们与酶结适时部位应同等。而它们之间除17位代替差异外,仅是A环和D环有差异。因此以活性最好的化合物31为模板,以B环和环上的8,9,10,11,12,13,为叠合点举行叠合。叠合图见图1Fig1:Stereviefsuperipsitinf31P45017inhinbitrsusedinFA.4FA阐发FA阐发由Sybyl64中的QSAR模块来完成。阐发力场包罗立体场和静电常在0-50kal/l-1范畴内,经屡次探究,将立体场和静电场的能量域值别离设为15kall-1和15kall-1。先以交织验证(rss-valida

8、tin)确定最正确主身分数,再用非交织验证(nn-validatin)创立终极的比力分子力场模子。在最小二乘法(PartialLeastSquare,PLS)阐发中,lunfiltering设为4kall-1。效果与讨论1PA模子比力分子力场阐发所得勘FA模子的统计学参数为:交织验证相干系数R2v=0.533,最正确主身分数为3,由最正确主身分数创立的FA模子的传统相干系数R20799,F31201,尺度方差SEE(standarderrrfestiate)0271。该模子对31个化合物的活性猜测值与实测值的相干性如图2。Fig2:Preditedvsatualbilgialativities

9、f31inhibitirsfrFAdel2.FA系数等势图FA模子系数等势图见图3a和3b.此中参照分子化合物31。图3a中绿色和黄色地区代表立体场对化合物活性的影响,绿色地区表如今该地区四周存在体积大的基团将由于增长的立体场面有利于活性的进步,黄色地区那么表现该地区不宜于引入位阴大的基团,不然会低落化合物的活性。图b中赤色和兰色地区代表静电场对活性的影响:赤色地区表现引入负电性基团有利于进步活生,兰色地区那么表白引入正电性基团有利于活性进步。Fig3(a):VieftheFAsterifieldgraphFig3(b):VieftheFAeletrstatifieldgraph3关于模子的讨

10、论在立体场等势图中可以看到,在甾体骨架的(面有一块黄色地区,说明在此处存在有位阻大的基团将倒霉于抑酶作用;从静电场等势图中可以看出在化合物31的杂环四周有多处赤色地区,说明在这些地区引入富电荷的基团将有利于活性的进步。这与文献中假设的竞争性P450l7按捺剂的作用机理和作用模子符合。该假设以为在间隔甾体D环得当位置引入具有孤对电子的原子,如N等,将大概与P450l7的血红素辅基中的Fe原子结合,而按捺酶的活性。假设的作用形式中是血红素位于甾环的面(如图4),我们得到的3DFA模子更进一步说明白,在甾环D环存在富电荷的原子有利于抑酶活性,这支持了上述作用机理。面位阻大基团倒霉于抑酶活性,这是与假设的作用模子同等,由于在此处有位阻大的基团,会拦阻杂原子与Fe作用,而倒霉于抑酶活性。Fig4:Sterepltfthesubstratehee-plexfrtheP45017使用该模子对本室合成的3个化合物举行了活性猜测。猜测效果是以3羟基17(2噻唑)雄甾5,16二烯中为母体的系列中4位苯基代替衍生物的活性(4.76)大于4

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