生存分析说课材料

1、生存分析 （1）通过随访进行收集）通过随访进行收集 （2）起始时间）起始时间 （3）事件的结局及时间）事件的结局及时间 （4）生存时间的分布十分复杂）生存时间的分布十分复杂 （5）随访资料常因失访等原因造成某些）随访资料常因失访等原因造成某些数据观察不完全数据观察不完全 资料特点资料特点事件：研究者所认定的结局事件：研究者所认定的结局生存时间：开始观察到某终点事件所经历的时间跨度。生存时间：开始观察到某终点事件所经历的时间跨度。 (1)完全数据：指从起点至出现认定事件所经历的时间完全数据：指从起点至出现认定事件所经历的时间跨度。跨度。(事件发生事件发生) (2)截尾数据：从起点至截尾点所经历的

2、时间截尾数据：从起点至截尾点所经历的时间随访过程随访过程中依旧没有发生疾病也属于截尾数据中依旧没有发生疾病也属于截尾数据。 截尾：没有观察到的认定事件。有以下几种情况截尾：没有观察到的认定事件。有以下几种情况: 失访、拒绝访问、中途退出等失访、拒绝访问、中途退出等, 死于其它与研究无死于其它与研究无关的疾病关的疾病 研究工作结束时事件尚未发生等研究工作结束时事件尚未发生等 完全数据是生存分析的主要依据；截尾数据也提供部分完全数据是生存分析的主要依据；截尾数据也提供部分信息，说明病人在某时刻之前没有发生事件。信息，说明病人在某时刻之前没有发生事件。 基本术语基本术语生存函数又称生存率生存函数又称

3、生存率S(t) ：观察对象：观察对象活过时点活过时点t的概率的概率. S(t)= P(x t) ，为累积生存概率，为累积生存概率 例如五年生存率例如五年生存率500人中人中490个个人活过人活过5年，年，490500。 如果有截尾数据，分母就必须分时段校正，故此式一般不能如果有截尾数据，分母就必须分时段校正，故此式一般不能直接应用（直接应用（因为每一段都有失访或者截尾数据因为每一段都有失访或者截尾数据）。）。生存概率和生存率的区别，前者是生存概率和生存率的区别，前者是单位时段单位时段生存概率（生存概率（一年一年一年计算一年计算）；而后者是）；而后者是多个时段多个时段的生存概率，是多个时段的生存

4、概率，是多个时段的累积的结果。的累积的结果。生存率的估计：假定病人在各个时段生存的事件相互独立，生存率的估计：假定病人在各个时段生存的事件相互独立，则生存率为各时段生存概率之积。则生存率为各时段生存概率之积。 12( )iS tPPP Kaplan-Meier法：适用于生存时间确法：适用于生存时间确切的资料，或小样本资料（切的资料，或小样本资料（单变量每单变量每一个个体都有精确的生存时间一个个体都有精确的生存时间）。）。 寿命表法：适用于适用于频数表频数表资料或大样本资料或大样本资料（资料（个体生存时间不是很精确，只个体生存时间不是很精确，只知道一年内死亡人数知道一年内死亡人数）。）。生存时间

5、的估计和检验生存时间的估计和检验（生存率计算生存率计算2种方法种方法）Kaplan-Meier法法例例 某研究者收集一些肺癌病例某研究者收集一些肺癌病例, 数据见数据见survival1.savtime生存时间生存时间(天天)status生存状态生存状态. 0,截尾截尾; 1,死亡死亡type肺癌类型肺癌类型: 1腺癌腺癌, 2大细胞癌大细胞癌, 3小细胞癌小细胞癌, 4鳞癌鳞癌health病人入院时的身体状况病人入院时的身体状况diagtime从诊断为肺癌到开始治疗的时间从诊断为肺癌到开始治疗的时间age病人的年龄病人的年龄sex病人的性别病人的性别试比较不同类型肺癌患者生存时间试比较不同类

6、型肺癌患者生存时间 SPSS数据文件AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框框: time（生存时间变量）（生存时间变量）Status框框: status（生存状态变量）（生存状态变量） Define event: single vaule:1（把什么定义为事把什么定义为事件就选几件就选几）Factor框框: type（欲比较的分类变量）（欲比较的分类变量）Compare factor test staticics: 选选 log rankOption statistics :survival table plot: 选选SurvivalOkSPSS操作操作K-M主对话

7、框生存率曲线统计学检验 option子对话框腺癌的生存分析表结果腺癌的生存时间的均数、中位数Number of Cases: 18 Censored: 1 ( 5.56%) Events: 17 Survival Time Standard Error 95% Confidence Interval Mean均数: 62 12 ( 38, 86 ) Median中位数: 48 6 ( 36, 60 )显示四种病理类型患者的生存率曲线分布差别有统计学意义，218.41，P=0.004Survival Functions生存时间120010008006004002000-200Cum Surviv

8、al1.21.0.8.6.4.20.0-.2肺癌类型鳞癌鳞癌-censored小细胞癌小细胞癌-censored大细胞癌大细胞癌-censored腺癌腺癌-censored四种病理类型肺癌患者的生存曲线，鳞癌生存状况较好，其次为大细胞癌，小细胞癌和腺癌的生存状况较差寿命表法寿命表法数据特点数据特点 寿命表数据寿命表数据, 所有病例的随访都是定期所有病例的随访都是定期(一年一年)进行的进行的. 为便于录入可使用每个为便于录入可使用每个组段的起始年数表示每个组段组段的起始年数表示每个组段. 计算的计算的是是1年的生存概率，年的生存概率，n年的生存率。年的生存率。例例 某医院对某医院对114例胃癌患

9、者术后生存情例胃癌患者术后生存情况进行随访况进行随访, 见文件见文件lifetb1.sav, 计算胃计算胃癌患者术后各年生存率癌患者术后各年生存率SPSS数据文件数据文件dataweight case weight case by : freqOK SPSS操作操作 （一）（一）AnalyzeSurvivalLife TablesTime框框: time（生存时间变量）（生存时间变量）Display Time Iiterals:10 to 1Status框框: died（生存状态变量）（生存状态变量） Define event: single vaule:1Option 选选lietable

10、table plot: 选选SurvivalOkSPSS操作（二）操作（二）Life table 主对话框其它选项说明：Factor: 分组变量By factor: 分层变量Options对话框 compare levers of first factor overall：几组生存曲线的检验 pairwise：几组生存曲线的两两比较组段下限 初始人数 删失人数 校正人数 事件例数 死亡概率 生存概率 生存率 生存率标准误 概率密度 概率密度标准误 风险率 风险率标准误 0 114 5 111.500 3 .03 .97 .97 .02 .027 .015 .03 .02 1 106 4 104

11、.000 9 .09 .91 .89 .03 .084 .027 .09 .03 2 93 1 92.500 10 .11 .89 .79 .04 .096 .029 .11 .04 3 82 0 82.000 22 .27 .73 .58 .05 .213 .040 .31 .07 4 60 2 59.000 2 .03 .97 .56 .05 .020 .014 .03 .02 5 56 2 55.000 8 .15 .85 .48 .05 .082 .028 .16 .06 6 46 2 45.000 12 .27 .73 .35 .05 .128 .034 .31 .09 7 32 1 31.500 10 .32 .68 .24 .04 .111 .033 .38 .12 8 21 0 21.000 5 .24 .76 .18 .04 .057 .025 .27 .12 9 16 1 15.500 3 .19 .81 .15 .04 .035 .020 .21 .12 Life Table结果 练习1 两组儿童横纹肌瘤治疗后复发时间两组儿童横纹肌瘤治疗后复发时间 处理组处理组9，12，16，