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1、1第四章第四章 蛋白质的性质及研究方法蛋白质的性质及研究方法肌红蛋白晶体2第一节第一节 蛋白质的理化性质蛋白质的理化性质紫外吸收:最大吸收峰为280nm两性解离:蛋白质的pI值不能直接计算,只能使用等电聚焦等方法进行测定胶体性质沉淀反应:盐析、pI 沉淀、有机溶剂引起的沉淀和重金属盐作用造成的沉淀变性、复性水解颜色反应3蛋白质变性L 蛋白质受到某些理化因素的作用,其高级结构受到破坏、生物活性随之丧失的现象。L 导致蛋白质变性的物理因素有:加热、冷却、机械作用、流体压力和辐射;化学因素有强酸、强碱、高浓度盐、尿素、重金属盐、疏水分子和有机溶剂。L 蛋白质变性以后,其理化性质发生一系列的变化。这些
2、变化可以作为检测蛋白质变性的指标。主要的变化包括:(1)溶解度降低。(2)粘度增加。(3)生物活性丧失。(4)更容易被水解。(5)结晶行为发生变化。4蛋白质的水解L 蛋白质在强酸、强碱或蛋白酶的催化下均能够发生水解。但需要注意的是,酸水解会破坏几种氨基酸,特别是Trp几乎全部被破坏,其次是三种羟基氨基酸。另外Gln和Asn在酸性条件下,容易水解成Glu和Asp。酸水解常用硫酸或盐酸,使用最广泛的是盐酸;碱水解会导致多数氨基酸遭到不同程度的破坏,并且产生消旋现象,但不会破坏Trp;酶水解效率高、不产生消旋作用,也不破坏氨基酸,但由于不同的蛋白酶对肽键特异性不一样,因此,由一种酶水解获得的通常是蛋
3、白质的部分水解产物。5四种羧肽酶来源和特异性四种羧肽酶来源和特异性6几种蛋白酶特异性的比较几种蛋白酶特异性的比较7反应名称反应试剂颜色用处双缩脲反应硫酸铜,碱性溶液紫红色(540nm)定量测定蛋白质黄色反应硝酸先产生白色沉淀,加热变黄,再加碱呈橙黄色鉴定含有芳香族氨基酸的蛋白质米伦氏反应硝酸、硝酸汞、亚硝酸、亚硝酸汞混和液先是白色沉淀,加热后变成红色鉴定含有Tyr残基的蛋白质乙醛酸反应乙醛酸、浓硫酸紫色环鉴定含有Trp残基的蛋白质坂口反应次氯酸钠、-萘酚、氢氧化钠红色鉴定含有Arg的蛋白质福林反应磷钼酸、磷钨酸蓝色Lowry法鉴定含有Tyr残基的蛋白质醋酸铅反应醋酸铅黑色含有Cys的蛋白质考马
4、斯亮蓝结合反应考马斯亮蓝G-250酸性溶液蓝色Bradford法定量测定蛋白质蛋白质的各种颜色反应蛋白质的各种颜色反应8蛋白质研究方法假定你发现一种新的蛋白质:蛋白质假定你发现一种新的蛋白质:蛋白质X1. 如何得到这种蛋白质? 蛋白质的分离、纯化技术2. 这种蛋白质的大小? (SDS-PAGE)3.它的pI是多少? (等电聚焦)4. 其他细胞或其他生物体内是否存在? (Western印迹)5. 其一级结构如何? (序列分析)6.其三维结构又如何? X-射线衍射和核磁共振9蛋白质纯化蛋白质纯化一、准备工作 要解决三个问题:(1)纯化蛋白质的目的;(2)目标蛋白的测活方法;(3)纯化蛋白质的原料。
5、二、纯化步骤:(1)破碎细胞或组织(混合和匀浆);(2)去除残渣(离心);(3)沉淀/浓缩(硫酸铵或聚乙二醇);(4)纯化(层析);(5)鉴定1011等电聚焦需要在凝胶中加入两性电解质,以在阳极和阴极之间建立递增的pH梯度,处在其中的蛋白质分子在电场的作用下迁移,最后各自移动到并聚焦于与其pI相当的pH位置上。于是通过等电聚焦,不仅可以实现pI不同的蛋白质之间的分离,而且还可以测定出各种蛋白质的pI12蛋白质的双向电泳蛋白质的双向电泳13Western印迹14第二节 蛋白质一级结构的测定 直接测定法 间接测定法。 先得到某一种蛋白质基因的核苷酸序列,然后根据通用的遗传密码表间接推导出由其决定的
6、氨基酸序列。15测定步骤主要试剂和方法备注1详见蛋白质的纯化2极端pH;8mol/L 尿素;6mol/L 盐酸胍;高盐 (常用硫酸氨)。如果肽链之间以二硫键相连,可使用步骤3的方法进行拆分。3过甲酸氧化法;巯基类还原剂还原法:巯基乙醇;二硫苏糖醇(DTT)或二硫赤藓糖醇。第二种方法需要使用烷基化试剂,如碘代乙酸,防止二硫键从新形成。4氨基酸自动分析仪为步骤6和7选择合适的裂解法提供有用的信息。5N-端测定:Sanger试剂法;丹磺酰氯法;PTIC或其衍生物测定法。C-端测定:肼解法;还原法:使用硼氢化纳将C-端氨基酸残基转变成氨基醇,而将它与其它氨基酸区别开来。羧肽酶法(羧肽酶A、B,参考表4-2)如果N-端氨基被封闭,不能直接使用表中的方法,需要根据可能的封闭类型,区别对待。如果氨基是被甲酰或乙酰化封闭的,需要先将甲酰基或乙酰基水解。如果氨基是被焦谷氨酰化封闭的,可以使用专门水解焦谷氨酸残基的焦谷氨
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