ChemSketch教程实用教案

1、 ChemSketch简介简介 ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司是高级化学发展有限公司(ACD)开发的用开发的用于化学结构式绘制软件包，该软件包可单独使用或与其他软件共同于化学结构式绘制软件包，该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件的主要功能包括：使用。该软件的主要功能包括：结构模式：用于化学结构式的绘制结构模式：用于化学结构式的绘制绘图模式：用于图片及文字的处理绘图模式：用于图片及文字的处理分子性质分子性质(xngzh)模式：用于计算分子的一些基本性质模式：用于计算分子的一些基本性质(xngzh)，主要包括以下几个方面：主要包括以下几个方面： 分子量及元素百分比含

2、量分子量及元素百分比含量 折射率、摩尔折射率及摩尔体积折射率、摩尔折射率及摩尔体积 等张比容、表面张力及密度等张比容、表面张力及密度 介电常数及极化率介电常数及极化率 单一同位素质量单一同位素质量, 标称分子量和平均分子质量标称分子量和平均分子质量 除了以上主要功能外，除了以上主要功能外，ChemSketch还包括还包括3D Viewer，用于观，用于观察所绘制分子的三维结构。察所绘制分子的三维结构。CNMR DB和和HNMR DB可用于预测和查可用于预测和查看所绘制化学结构式的碳、氢核磁谱图，并与所带相关数据库相联，看所绘制化学结构式的碳、氢核磁谱图，并与所带相关数据库相联，进行检索比对处理

3、。进行检索比对处理。第1页/共28页第一页，共29页。 ChemSketch内置的元素同期表可以查看元素的基本信息和核磁数据。有机分子结构字典只有商业版本才能使用，输入分子名称（系统命名或商品名）可得到其化学结构式。 化学文件夹（ChemFolder）可方便用户建立自己的试剂与化学反应数据库。GC和LC模拟(mn)器（GC Simulator and LC Simulator）可以模拟(mn)所绘制化学结构的气相和液相色谱。 LogD和LogP用于计算所绘制结构的醇水（辛醇水）分配系数，其中LogD适用于酸碱性物质，LogP适用于中性物质。 Name模块用来对所绘制的结构按IUPAC规则命名。

4、 SolDB模块可用来计算所绘制结构在不同pH条件下的溶解度。 SpecManager用于处理各种谱图，包括核磁、质谱、紫外、红外等。 Spectrum DataBases提供了各种谱图的数据库，供检索查询之用。 XNMR提供了对含P、F、N同位素化合物的核磁预测功能。 pKa模块可对所绘制的结构进行酸碱解离常数的预测计算功能。 和其它的Windows软件一样，ChemSketch也具有页面设置、打印设置、输出模式、输入模式、页眉页脚设置等功能。 这里主要介绍如何利用该软件绘制化学结构式并对所绘制结构的基本化学性质进行预测和计算。第2页/共28页第二页，共29页。一 绘制简单(jindn)结构

5、 1 使用常用画图 当程序开始时，常用画图工具 是默认(mrn)的。在这种模式下，您可以很容易地画直链和分支结构，并用元素周期表中的原子取代所画的原子。 单击CH4以增加一个CH3基团，并以标准键长连接。再双击同一个碳原子，画出第3页/共28页第三页，共29页。 画图模式窗口与结构绘制(huzh)窗口类似。 如果想让分子以某个键为基准改变位置，如让 某一键处于垂直状态，可点击工具栏上的按钮，然后点击某一键，即可使分子旋转至该键处理垂直的位置：单击最右边的碳原子，画出重复(chngf)以上步骤，画出一些结构第4页/共28页第四页，共29页。2 双键和三键 所画的结构式中的最后一个单键(dn ji

6、n)上再次单击获得双键；CH3CH2CH3再次再次(zi c)(zi c)在双键上单击获得在双键上单击获得三键：三键：CH3CHCH3第5页/共28页第五页，共29页。3.删除个别原子与撤销 如果您加了过多的原子, 可以逐一去除(q ch)原子: 点击Delete 键 单击Undo 键。这会将ChemSketch的界面恢复到以前的设置 Undo键可以连续点击50次.当您画比较复杂的结构或者物体时, 我们建议您养成及时保存文件的习惯。第6页/共28页第六页，共29页。4 聚合物 ChemSketch提供了聚合物结构的绘制功能： 在结构工具栏上点击Polymers 键，出现聚合物面板后就可以(ky

7、)进行如下设置的更改了：第7页/共28页第七页，共29页。通过点击或拖拽来选定产生聚合物的区域。当区域被选择, 聚合物出现(chxin)在工作区:再次再次(zi c)(zi c)点击点击Polymers Polymers 键就可以离开聚合物绘制键就可以离开聚合物绘制(huzh)(huzh)模式模式第8页/共28页第八页，共29页。5 改变(gibin)原子 单击原子工具条下的元素周期表(Periodic Table)键,打开元素周期表(Periodic Table of Elements):第9页/共28页第九页，共29页。 单击元素周期表中的氟(Fluorine)键, 注意现在(xinzi)

8、氟 (Fluorine)键出现在(xinzi)原子工具条中。 单击最左边的碳(Carbon), 用氟原子替代碳原子。第10页/共28页第十页，共29页。6 使用(shyng)鼠标拖拽绘图 在正常画图(Draw Normal)和连续画图(Draw Continuous)两种模式下，您可以从一个原子拖动鼠标到另一个原子，画出单键。如果您从一个空白处开始(或结束)拖动，将在开始处(或结束处)生成一个新的原子。在下面结构中，点击一端的碳原子，拖动鼠标到另一端的碳原子。第11页/共28页第十一页，共29页。 点击结构工具栏中“清洁” 命令，将使结构中所有的键长与角度(jiod)平均化，得到如下结构：Cl

9、ean命令不仅使键长和角度平均化，令结构看上去更好看，更使该结构符合于化学意义。例如循环结构，它将SP2轨道上的碳原子的键按120度分布，将SP轨道上的碳原子的键按180度分布。当画平面和立体异构体时，Clean命令保持(boch)以上特性将键长和角度平均化。第12页/共28页第十二页，共29页。7 编辑(binj)原子标签和画链工具 在原子工具栏中，点击原子标签工具 键，然后将鼠标移动到结构中最右端的F原子上。在打开的编辑(binj)标签(Edit Label)对话框中，键入(CH2)3PH，再点击插入键(Insert)，画出如下结构。第13页/共28页第十三页，共29页。使用画链 工具，通

10、过点击和拖动鼠标，您可以很容易地画出长、短键。 点击结构工具栏中画链工具键，将鼠标移动到键头所指的原子上。 按下鼠标键，向左拖动。当鼠标离开结构时，自动生成碳链。注意鼠标箭头(jintu)旁的碳原子数(C#)随着碳原子的增减而变化第14页/共28页第十四页，共29页。第15页/共28页第十五页，共29页。 8 清除屏幕 如果您需要清除屏幕，您可以选择以下的一种方式： 从文件(wnjin)（File）菜单, 选择新建（New）。这将打开一个新的空白文件(wnjin)。 在左上方选择创建新页按钮 ，创建新的一页。 在编辑菜单中选择“全选”按钮(Select All)，再选择“删除”命令(Delet

11、e)。 在工具栏中(General toolbar)点击删除（Delete) 按钮，点击空白处，再点击结构的任意部分，将其全部删除。第16页/共28页第十六页，共29页。 9 翻转结构 您可以在结构工具栏中通过点击一个键来实现整个结构的旋转和翻转。 点击设置水平(shupng)键 然后再点击目标键使其处于水平(shupng)，结构其它部分将相应转动。用该工具反复点击此键可使结构绕键不断翻转。 点击设置垂直键 然后点击目标键使其处于垂直，其它部分将相应翻转。 点击翻转键 然后点击目标键，结构将会绕着被点击的键转动。 首先选中整个分子（或基团），点击上下翻转 按钮，则选中的结构或基团（若无选中项，

12、则所有已绘结构）将从上部旋转至下部。 点击左右翻转 使被选结构或基团（若无选中项，则所有已绘结构）将从右方旋转至左方。 第17页/共28页第十七页，共29页。二 绘制(huzh)更复杂结构 1 使用基团表 化学基团表(Table of Radicals)中包括预先(yxin)画好的氨基酸及其保护基的结构，还有核甘酸及其他常用结构。 在参考工具栏(References Toolbar)中点击基团表(Table of Radicals)，显示如下基团：第18页/共28页第十八页，共29页。第19页/共28页第十九页，共29页。 2 使用环节构 在右边(yu bian)参考工具栏中选择各种环状结构进

13、行绘图：第20页/共28页第二十页，共29页。 3 删除和替换原子和基团(j tun) 依次删除每个原子，或一次自动删除所有原子。OOHOOHOOHOOHOOHOOH第21页/共28页第二十一页，共29页。 替换结构中的原子(yunz):先选种目标原子(yunz)，直接点击被替换的原子(yunz)即可。OCH3CH3CH3CH3CH3NHNNHNHNNOOHOHOHNH2NH2第22页/共28页第二十二页，共29页。 4 标定电荷和定义(dngy)阳离子与阴离子 点击原子工具栏中的Increment (+) Charge 键 的右下角的三角形扩展得到以下各项:第23页/共28页第二十三页，共2

14、9页。NH2+CH3CH3NCH3CH3NH+CH3CH3画出一下(yxi)结构：NHCH3CH3第24页/共28页第二十四页，共29页。 5 使用立体键 要绘制立体键，请在结构工具栏中点击 Up Stereo Bonds或者 Down Stereo Bonds。然后在化学结构中点击目标键就可将其转换成立体键了，或者从原子拖拽到一个空白(kngbi)区，或者简单的点击一个已有原子（如果原子工具栏中被激活的原子和已有原子是同一原子的话）。您可以根据您的需要多次点击键来改变立体键的方向。第25页/共28页第二十五页，共29页。第26页/共28页第二十六页，共29页。 谢谢观看(gunkn)和指导 再见 ！第27页/共28页第二十七页，共29页。谢谢您的观看(gunkn)！第28页/共28页第二十八页，共29页。NoImage内容(nirn