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文档简介

1、1-20度冻存1年是没有问题的,当然越低越好。但是冻存后,用蛋白酶K法,红细胞不易裂解,必须采用特殊方法裂解。2建议裂解红细胞后再冻存于80度。因为冻融后红细胞会裂解,而且红细胞会增加蛋白污染,影响DNA抽提3. 我们实验室加ACD抗凝血液,保存3年了,抽提DNA没问题(我们是先离心后分层保存,以便后续试验)!血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm离心10min。2、小心吸取上层血浆,分装到3个0.5ml离心管中。3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。4、2500rpm离心10min,弃上清。5、加入10ml

2、溶血液,摇匀,冰浴15min。6、3000rpm离心10min,弃上清。7、倒置离心管,去掉残液。8、得白细胞,一80?C冻存。试验要求:血至分离白细胞之间隔时间在室温下放置不超过2h,4°C放置不超过5h,以防白细胞自溶。氯仿法抽提外周血白细胞基因组DNA:试验试剂:Ligsisbuffer:133mMNH4ClNHCl7.12g0.9mMNH4HCO3NH4HCO30.071g0.1mMEDTA0.5mMEDTA0.2m;l最后加灭菌去离子水至1000ml,高压灭菌。ACD抗凝剂:柠檬酸1.68g柠檬酸钠4.62g葡萄糖5.15g;最后加灭菌去离子水至350ml,高压灭菌。提取缓

3、冲液(Extractionbuffer):10mMTrisCl(PH=8.0)1MTris.Cl(PH=8.0)1ml0.1mMEDTA(PH=8.0)0.5mMEDTA(PH=8.0)20ml0.5%SDS10%SDS0.5ml;最后加灭菌去离子水至100ml,高压灭菌试验步骤:1、在500卩1抗凝血中加入ligsisbufferlOOOpl,充分颠混至清亮。以4000rpm,离心5min。弃上清液。2、沉淀中加入1igsisbuf!er1500g1,充分匀浆。以6000rpm,离心5min。3、彻底弃去上清,加入extractionbuffer500y1(裂解细胞),混匀置于37°

4、;C,水溶1h。4、加入8卩1的蛋白酶K,颠混,37C过夜(或55C,3h,但是37C效果要好些)。5、每管加入450卩1饱和酚(取溶液下层)缓慢摇晃10min,以5500rpm,离心15min。6、取上清,每管加入250卩1饱和酚和250卩1氯仿一异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。7、取上清,每管加入500卩1氯仿一异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。8、取上清,每管加50卩1的3M的NaAC+,适量无水乙醇(预冷)至满,摇匀放入20C保存2h以上。9、以12000rpm,离心20min。去上清,加入70%乙醇500卩1,以12000rpm,离心

5、5min,去上清,5060C干燥。10、加入50卩1灭菌去离子水,转弹,混匀。NaI提取法提取外周血白细胞基因组:实验步骤:1、取外周抗凝血(全血)100ul于eppendorf管中,12000rpm离心12min。2、弃上清,加双蒸水200ul溶解,摇匀20s。3、混匀后加6MNaI溶液200u1,摇匀20s。4、加入氯仿/异戊醇(24:1)400u1,边加边摇,摇匀20s,12000rpm离心12min。5、取上层液350u1,加入另一新eppendorf管中,加0.6倍体积异丙醇,摇匀20s,室温放置15min,静置后的反应体系15000rpm离心12min,使沉淀紧贴eppendorf

6、管壁。6、弃异丙醇,加70%乙醇1ml(不振动),以15000rpm离心12min。7、弃乙醇,敞开eppendorf管盖,烘干(37°C恒温箱)后,加1xTE溶液30ul,溶解DNA>12h以上,制成的DNA液-20C冰箱保存备用。从外周血提取DNA是一个经常遇到的问题,当然可以用试剂盒提取,不过代价还是有点大,并且不方便,定试剂总要等上几天,如果血液标本不稀缺资源,不妨用一些简便方法提取方法一(1)取抗凝血5ml在沉淀中加入15mlPBS,混匀,离心2000r/min10min。将血浆转至新的试管中,-70C保存。将血细胞转入另一支试管中(10ml或50ml)加入尽可能多的

7、冷的蒸馏水混匀。将其插入冰内510min或放入-20C15min。将上述混合液从冰中或-20C取出放至室温,离心2000r/min20min。弃上清,收集沉淀。(7)在沉淀中加入15mlPBS,混匀,离心2000r/min10min。此步骤重复3次至沉淀为淡红色或白色。将沉淀转入小管,加少量PBS,每分钟5000r/min离心5min,去上清。沉淀-70C保存。常用的外周血白细胞基因提取方法:试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋

8、白中游离出来。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。试验步骤:1、将l

9、mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入lml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。重复一次。用0.7mlDNA提取液混悬白细胞沉淀,37°C水浴温育lh。2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37C水浴温育lh后,加入lmg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠o50C水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。5000rpm离

10、心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复酚抽提一次。加等体积的氯仿:异戊醇(24:1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复一次。4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,转入另一1.5ml离心管中,加70%乙醇0.2ml,以5000rpm离心5min。洗涤DNA,弃上清,去除残留的盐。重复一次。室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。加TE液20ul溶解DNA,置于摇床平台缓慢摇动,DNA完全

11、溶解通常需12-24h。制成的DNA液-20C冰箱保存备用。真核细胞DNA的制备一般真核细胞基因组DNA有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温呆存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。这一方法获得的DNA不仅经酶切后可用于Southern分析,还可用于PCR的模板、文库构建等实验。根据材料来源不同,采取不同的材料处理方法,而后的DNA提取方法大体类似,但都应考虑以下两个原则:1、防止和抑制DNase对DNA的降解。2、尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。试剂准备:1、TE:10mMTris-HCl(pH7.8);1mME

12、DTA(pH8.0)。2、TBS:25mMTris-HCl(pH7.4);200mMNaCl;5mMKCl。3、裂解缓冲液:250mMSDS;使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。4、20%SDS5、2mg/ml蛋白酶K6、Tris饱和酚(pH8.0)、酚/氯仿(酚:氯仿=1:1)、氯仿7、无水乙醇、75%乙醇试验步骤:材料处理:1、新鲜或冰冻组织处理:1)取组织块0.3-0.5cm3,剪碎,力口TE0.5ml,转移到匀浆器中匀浆。2)将匀浆液转移到1.5ml离心管中。3)加20%SDS25ml,蛋白酶K(2mg/ml)25ml,混匀。4)60°C水浴1-3hr。2、培养细胞处理:1

13、)将培养细胞悬浮后,用TBS洗涤一次。2)离心4000gx5min,去除上清液。3)加10倍体积的裂解缓冲液。4)50-55°C水浴1-2hr。DNA提取:1、加等体积饱和酚至上述样品处理液中,温和、充分混匀3min。2、离心5000gx10min,取上层水相到另一1.5ml离心管中。3、加等体积饱和酚,混匀,离心5000gx10min,取上层水相到另一管中。4、加等体积酚/氯仿,轻轻混匀,离心5000gx10min,取上层水相到另一管中。如水相仍不澄清,可重复此步骤数次。5、加等体积氯仿,轻轻混匀,离心5000gxl0min,取上层水相到另一管中。6、加1/10体积的3M醋酸钠(p

14、H5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,轻轻倒置混匀。7、待絮状物出现后,离心5000gx5min,弃上清液。8、沉淀用75%乙醇洗涤,离心5000gx3min,弃上清液。9、室温下挥发乙醇,待沉淀将近透明后加50-100mlTE溶解过夜。、全血的采集保存和DNA的提取I. 用含抗凝剂的采血管进行采血,抗凝剂一般有EDTA和肝素,EDTA更好一些,不会影响下游的反应,如果没有采血管,也可以自己添加抗凝剂EDTA,提前准备0.04M的EDTA溶液,每5ml的血液中加入0.4ml配好的EDTA溶液,颠倒混匀即可。保存于-20°C至-80C,般2-3年内均可以提取,保存时间越短,提取的质量越高

15、,最好在2个月内提取。II. DNA提取方法的选择:全血提取试剂盒一般有离心柱和溶液型两种(比如Qiagen、Promega、Bioteke;摒弃酚氯仿手提的方法,时间长毒性大),原理及步骤基本相同。虽然各公司推出了N多型号,让人不知如何去选择,但从原理和操作步骤看,基本就是离心柱和溶液型两种。一般来说,离心柱(DP1801)的提取纯度高一些,但是处理量小(0.1-1ml)、得率略低;溶液型(DP2101或DP2201)的提取量大(1-10ml)得率也高于离心柱。医院的血液标本一般在2ml以上,一般选择溶液型的方法提取.在说到国产和进口差别的时候,很多人以为进口一定比国产的好,我们觉得没有最好

16、,只有更好!在不断的进行试验优化之后,全血基因组DNA提取试剂盒DP2101或DP2201开创了第三代技术,不需要蛋白酶K消化,进口的都是要借助蛋白酶K的啊!DP2101或DP2201减少了蛋白酶K现配现用的麻烦和消化的时间,而且提取量和稳定性更好。III. 非抗凝血(凝固血)能否提取?答案是肯定的,而且一点都不麻烦,提取效果和抗凝血没有差别!在你找遍了进口的所有品牌都找不到后,回过头来您才发现原来他就在身边,百泰克的凝固血基因组DNA提取试剂盒已经有很多忠实的用户。下在是网上找的一般保存DNA的方法DNA在如下情况下稳定:(1)中性pH,(2)低温,可以储存于-20度冰箱,(3)暗处(避免紫外线),(4)合适的盐浓度(比如100mmol/LNaCl),(5)无物理剪切。在DNA操作中应该降低DNase对于DNA的降解,大部分DNase降解DNA时要有二价阳离子(如Mg2+,Ca2+)

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