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文档简介
1、 PubMedPubMed文献检索文献检索 天津医科大学图书馆天津医科大学图书馆 刘娟刘娟 教学内容教学内容一、一、PubMed简介简介二、检索规则与常用检索技术二、检索规则与常用检索技术三、三、检索方式与途径检索方式与途径四、四、检索结果处理检索结果处理五、注册五、注册六、练习题六、练习题l1.PubMed基本情况l2.PubMed的由来l3.PubMed的特点l4.PubMed的数据收录范围l5.PubMed主页一、PubMed简介l1.PubMed基本情况lPubMed是美国是美国NLM所属的国家生物技术信息所属的国家生物技术信息中心(中心(NCBI)开发的一个以开发的一个以Web方式向
2、用户方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,是继提供服务的生物医学文献检索系统,是继MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之数据库国际联机检索和光盘检索之后推出的一种后推出的一种网络免费网络免费检索方式。检索方式。一、PubMed简介 |包括包括2,1002,100多万篇来自多万篇来自MEDLINEMEDLINE和其他和其他生命科学期刊的生物医学文献生命科学期刊的生物医学文献|最早可回溯到最早可回溯到19481948年年|提供部分全文和其他相关资源的链接提供部分全文和其他相关资源的链接一、PubMed简介l2.PubMed2.PubMed的由来的由来 创刊创刊:最早可以追溯到最早可以追溯
3、到1879年美国年美国NLM编编译出版的医学文献检索刊物医学索引译出版的医学文献检索刊物医学索引(Index Medicus, IM)。)。一、PubMed简介1964年年:为了实现为了实现IM的自动化编辑出版,的自动化编辑出版,NLM开发了开发了“医学文献分析与检索系统医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis and Retrieval System, 简称简称MEDLARS).目前目前MEDLARS已拥有已拥有40多个数据库,其多个数据库,其中最重要、最大、且发展最早的为中最重要、最大、且发展最早的为MEDLINE(MEDLARS ON LINE)
4、生物医生物医学数据库学数据库 一、PubMed简介l1971年年: MEDLINE正式建成联机数据库,正式建成联机数据库,并通过并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。开展国际联机检索服务。l自自MEDLINE投入联机检索服务以来,一直成投入联机检索服务以来,一直成为为MEDLARS最大的使用频率最高的数据库。最大的使用频率最高的数据库。一、PubMed简介19831983年:随着光盘技术的发展,年:随着光盘技术的发展,MEDLINEMEDLINE光盘数据库建成,并得到了广光盘数据库建成,并得到了广泛的应用。泛的应用。19971997年年9 9月月2626日日, MEDLINEMEDLINE
5、网络版开通,网络版开通,取名取名PubMedPubMed,并向全球免费开放。,并向全球免费开放。 一、PubMed简介l 很多医务工作者宁可在每次检索时都很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时去花上成倍的时间,却不愿花上几个小时去认真研究一下认真研究一下PubMedPubMed。 君欲善其事,必先君欲善其事,必先利其器利其器 ,PubMedPubMed就好像一把功能强大的枪,就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,用准星瞄准,如
6、何把这把枪的功能发挥到如何把这把枪的功能发挥到及至。及至。 一、PubMed简介3.Pubmed3.Pubmed的特点的特点|收录生物医学权威期刊最多收录生物医学权威期刊最多 世界上世界上7070多个国家的多个国家的70007000多种权威期刊多种权威期刊|多种检索方法,多条检索途径多种检索方法,多条检索途径|时效性极强时效性极强( (每周更新每周更新) )|回溯年代久远(回溯年代久远(19481948年至今)年至今)|利用利用MeSHMeSH作为转换词表,标引质量高作为转换词表,标引质量高|部分文献可以免费获取全文部分文献可以免费获取全文|检全率、检准率高检全率、检准率高一、PubMed简介
7、Publisher supplied citations(出版商提供的书目信息)出版商提供的书目信息) PreMedlineMEDLINE与与NCBI其它数据库的链接其它数据库的链接4.PubMed4.PubMed的数据收录范围的数据收录范围一、PubMed简介 4.1 MEDLINE基本情况基本情况l出版:美国国家医学图书馆(出版:美国国家医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)。)。l印刷版印刷版 1879l联机版联机版 1971l光盘版光盘版 1983l网络版网络版 1997MEDLINE数据库简介l收录范围:收录收录范围:收录7538种(种(20
8、09.10.11) 权威期刊,包含权威期刊,包含50种语言,涉及种语言,涉及70多个国家多个国家(其中中国(其中中国48种),约种),约40万篇万篇/年,已经累计年,已经累计2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域;余万篇。内容涉及生物医学各个领域;85%原文为英语。原文为英语。l回溯年代:回溯年代:1948年至今年至今l每条记录标有每条记录标有indexed for MEDLIEN标记标记学科范围:学科范围:l基础生命科学基础生命科学 临床生命科学临床生命科学 l生物科学生物科学 解剖学解剖学l组织学组织学 化学与药物化学与药物l心理学心理学 社会医学社会医学l农业农业 医技设备学医技设备学
9、 l医技工业学医技工业学 医学信息学医学信息学使用词表:使用词表:MeSH(医学主题词表)(医学主题词表)MEDLINE数据库简介 4.2 PreMEDLINE l是一种由是一种由正在加工处理正在加工处理中中的文献记录组成的文献记录组成的数据库,这些新记录还未被标引,暂时的数据库,这些新记录还未被标引,暂时存放在存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新,数据库中。每天更新,经过标引(增加主题词、文献类型、数据经过标引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入库存取号等字段)以后转入Medline,一一旦记录被转入到旦记录被转入到Medline数据库,就被从数据库,就被从PreME
10、DLINE数据库中删除。数据库中删除。每条记录标每条记录标有有in Process标记。标记。Pre-Medline最新信息最新信息MedlineNew DataCollectPubMedProcess一周以后一周以后 (出版商提供的书目信息)(出版商提供的书目信息) 出版商直接向出版商直接向PubMed提供的非提供的非Medline收录的电子刊物,如:收录的电子刊物,如:Science或或Nature中的地质学文献中的地质学文献等。每条记录标有等。每条记录标有 as supplied by publishers标记。标记。4.3 Publisher-Supplied CitationPubM
11、ed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINEPubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisherPubMed-in processPubMed-in processPubMed与与MEDLINE的区别的区别 4.4与与NCBI其它数据库的链接其它数据库的链接lNucleotideNucleotide:DNADNA序列数据库序列数据库lProteinProtein:蛋白质序列数据库蛋白质序列数据库lGenomeGenome:基因组序列数据库基因组序列数据库lStructur
12、eStructure:分子结构模型数据库分子结构模型数据库lOMIMOMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库人类孟德尔遗传学在线数据库lPMC: PubMedPMC: PubMed中心,免费全文期刊检索中心,免费全文期刊检索 与与NCBI其它其它42个数据库的链接个数据库的链接页面介绍PubMed主页主页 /pubmed高级检索入口高级检索入口基本检索输入框基本检索输入框个人空间个人空间检索指南检索指南检索工具:检索工具:特定文献检索特定文献检索临床咨询临床咨询专题咨询专题咨询其他资源:其他资源:主题词数据库主题词数据库期刊数据库期刊数据库临床试
13、验等临床试验等Pubmed简介简介二、检索规则及检索技术二、检索规则及检索技术检索规则检索规则1 1、自动转换匹配、自动转换匹配 PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词,对于输入检索框的检索词,PubMed按按4个转换表个转换表进行对照、匹配和转换,然后进行检索。进行对照、匹配和转换,然后进行检索。 MeSH表:包括表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目的主题词、副主题词、款目词。词。期刊刊名表:期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和所收录的刊名全称、缩写和ISSN短语表:文献篇名或文摘中出现的短语。短语表:文献篇名或文摘中出现的
14、短语。著者索引表:著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。所收录的的作者姓名组成。1 1、自动转换匹配、自动转换匹配l如果在如果在4 4个词表的任何一个中找到匹配的内个词表的任何一个中找到匹配的内容,则匹配结束。容,则匹配结束。l例如:如果输入的检索词在主题词转换表中例如:如果输入的检索词在主题词转换表中找到与其相匹配的主题词,则使用该主题词找到与其相匹配的主题词,则使用该主题词进行检索并结束匹配,不会在其他词表中进进行检索并结束匹配,不会在其他词表中进行匹配。行匹配。检索规则检索规则1 1、自动转换匹配、自动转换匹配检索规则检索规则l如果输入的单个词在如果输入的单个词在4个词表中都
15、未找到匹个词表中都未找到匹配的内容,其将被在配的内容,其将被在All fields中进行检索;中进行检索;如果输入的词组未找到匹配的内容,该词如果输入的词组未找到匹配的内容,该词组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将匹配结果以匹配结果以AND连接。连接。l输入的检索词被自动匹配后的具体检索式输入的检索词被自动匹配后的具体检索式可通过检索结果页面右侧的可通过检索结果页面右侧的Search details栏中查看。栏中查看。l如:如:renal failure renal insufficiencyMeSH Terms OR (renalAll Fields AN
16、D insufficiencyAll Fields) OR renal insufficiencyAll Fields OR (renalAll Fields AND failure结果显示页右侧结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换显示系统自动匹配转换的检索词的检索词检索规则检索规则2 2、短语检索:、短语检索: 如果在短语上加双引号,如果在短语上加双引号, PubMed将不执行将不执行自动转换功能,也不进行自动转换功能,也不进行MeSH词的扩检。词的扩检。 例:例: “lung cancer”常用的检索技术常用的检索技术1.布尔检索布尔检索1.布尔检索布尔检索2.截词检索(又称通
17、配符检索)截词检索(又称通配符检索)2.截词检索截词检索3.字段限制检索字段限制检索 Pubmed常用字段常用字段文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期常用字段标识符常用字段标识符电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为
18、文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文
19、献编号作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式(纸张或电子)出版模式(纸张或电子) 参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号
20、4.扩展检索扩展检索5.加权检索加权检索(主要用于(主要用于Mesh主题词检索)主题词检索)l加权检索的基本方法是:在每个提问词后面给定一个数值表示其重要程度,这个数值称为权,在检索时,先查找这些检索词在数据库记录中是否存在,然后计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值,该记录即为命中记录。于判定检索词或字符串在满足检索逻辑后对文献命中与否的影响程度。l运用加权检索可以命中核心概念文献,因此它是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法。三、检索方式与途径三、检索方式与途径 1 1、基本检索、基本检索 2 2、高级检索、高级检索3 3、主题词检索、主题词检索4 4、期刊检索、期刊
21、检索5 5、题录检索、题录检索6 6、临床咨询、临床咨询7 7、临床试验、临床试验在检索栏中输入在检索栏中输入:一个或多个检索词一个或多个检索词 (系统默认空格为系统默认空格为AND检检索)索) 例:例:aloe psoriasis(芦荟治疗牛皮癣的文献)(芦荟治疗牛皮癣的文献)1、基本检索、基本检索1.1 自由词检索自由词检索l对于输入对于输入PubMedPubMed的多词词组,的多词词组,PubMedPubMed会查询词组索引,会查询词组索引,如果查到相应词组则将其作为一个检索词来检索。如如果查到相应词组则将其作为一个检索词来检索。如果未查到相应词组,则将其拆分成单个词,分别进行果未查到相
22、应词组,则将其拆分成单个词,分别进行检索并以逻辑和检索并以逻辑和(ANDAND)进行组配。进行组配。1、基本检索、基本检索1.2 词组检索词组检索l如:如:single cellsingle cell相当于检索相当于检索single AND cellsingle AND cell。可通。可通过如下方式强制将其作为一个词组进行检索过如下方式强制将其作为一个词组进行检索: 1.1.加双引号:加双引号:“single cell”single cell” 2. 2.加标段标识加标段标识tw: single celltwtw: single celltw 3. 3.使用短横线使用短横线“-”-”将两词连
23、接起来:将两词连接起来:single-cellsingle-cell 4. 4.使用截词符使用截词符* *:single cellsingle cell* *1、基本检索、基本检索1.2 词组检索词组检索1、基本检索、基本检索1.3 字段限制检索字段限制检索常用字段标识符常用字段标识符lAffiliationAD :第一作者所属单位和地址:第一作者所属单位和地址lAuthorAU:作者姓名:作者姓名lLanguageLA:原文语种:原文语种 chinese la 或或 chi la (前(前3个字母)个字母) lMeSH TermsMH:主题词:主题词 自动扩展下位主题词;如需关闭该功能,使自
24、动扩展下位主题词;如需关闭该功能,使mh:noexp lMeSH SubheadingsSH:副主题词:副主题词 自动扩展下位副主题词;如需关闭该功能,使用自动扩展下位副主题词;如需关闭该功能,使用 sh:noexp 常用字段标识符常用字段标识符lPublication DateDP :出版时间:出版时间 1998/03dp; 1998dp; 1996:1998dp; 1998/01:1998/04 dplPublication TypePT:出版类型:出版类型 reviewptlTitleTI :文章题名:文章题名lText WordsTW:文本词:文本词 包括包括Title, Abstra
25、ct, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段等字段lTitle/AbstractTIAB:题名摘要:题名摘要l刊名刊名: SourceSO 、JournalJour 、Journal Title AbbreviationTA1、基本检索、基本检索1.3 字段限制检索(标题、语种)字段限制检索(标题、语种)在检索栏中输入在检索栏中输入:例:例:liver cancerti AND chinesela1、基本检索、基本检索1.3 字段限制检索字段限制检索(刊名)刊名)
26、在检索栏中输入在检索栏中输入:刊名输全称或刊名输全称或MEDLINE认认可的标准缩写形式可的标准缩写形式,so 例:例:JAMA so1、基本检索、基本检索在检索栏中输入在检索栏中输入:刊名输全称或刊名输全称或MEDLINE认认可的标准缩写形式可的标准缩写形式,jour 例:例:JAMA jour1.3 字段限制检索字段限制检索 (刊名)刊名)1、基本检索、基本检索1.3 字段限制检索字段限制检索 (刊名)刊名)在检索栏中输入在检索栏中输入:刊名输全称或刊名输全称或MEDLINE认认可的标准缩写形式可的标准缩写形式,ta 例:例:JAMA ta1、基本检索、基本检索1.4 著者检索著者检索作者
27、书写格式作者书写格式西方人姓名书写格式:西方人姓名书写格式:First nameFirst name、Middle NameMiddle Name、Last nameLast name。l如:美国肯尼迪总统名为:如:美国肯尼迪总统名为: John Frank KenedyJohn Frank Kenedy,KenedyKenedy为为Last nameLast name(姓)(姓)。lFrankFrank为为Middle nameMiddle name,比较少看到,多看到,比较少看到,多看到 John F. KenedyJohn F. Kenedy,中间名缩写了。中间名缩写了。l如果看到姓名中
28、间有逗号,则逗号前一定是姓。如:如果看到姓名中间有逗号,则逗号前一定是姓。如: Kenedy, Kenedy, John F. John F. 中国人姓名格式:中国人姓名格式:Last nameLast name、First nameFirst name。 如:钟世镇,就有如下拼写形式可供检索:如:钟世镇,就有如下拼写形式可供检索: lZhong shizhenZhong shizhenlshizheng zhong shizheng zhong lzhong sz zhong szhong sz zhong s1、基本检索、基本检索1.4 著者检索著者检索在检索栏中输入在检索栏中输入:例:例
29、:Wong JS / Wong Julia S姓在前,名首字母缩写在后,姓在前,名首字母缩写在后,之间要有空格之间要有空格l截词检索截词检索: :可通过在词干后加可通过在词干后加“* *”检索以该词干开头检索以该词干开头的所有词的文献。的所有词的文献。需要注意的是:需要注意的是:截词检索将关闭截词检索将关闭PubMedPubMed的自动单词匹配功能以及的自动单词匹配功能以及MeshMesh主题词的扩展检主题词的扩展检索功能索功能 。l如:输入如:输入heart attackheart attack* *,不会启动自动匹配功能检索,不会启动自动匹配功能检索与之匹配的与之匹配的MeshMesh主题
30、词主题词“Myocardial Infarction”Myocardial Infarction”及及其下位更专指的主题词的相关文献。其下位更专指的主题词的相关文献。l截词功能最多可使用截词功能最多可使用600600个词形变化。超过个词形变化。超过600600个会显个会显示如下图的提示信息。示如下图的提示信息。1、基本检索、基本检索1.5 截词检索截词检索1、基本检索、基本检索PubMed在检索时忽略一些常用的英语词汇,在检索时忽略一些常用的英语词汇,下表为禁用词列表下表为禁用词列表2、高级检索、高级检索检索式编制检索式编制布尔逻辑检索技术布尔逻辑检索技术检索字段检索字段通过检索框后面的通过检
31、索框后面的“Show Index list”选项可查询在所有字选项可查询在所有字段或某一特定字段中段或某一特定字段中的索引,可以从索引的索引,可以从索引中选择一个或几个词中选择一个或几个词来完善检索策略。来完善检索策略。2、高级检索、高级检索检索历史检索历史检索式检索式检出结果检出结果检索时间检索时间检索式编号可替代检索式进行输入检检索式编号可替代检索式进行输入检 索如:索如:#5 AND #6可组配检索式,如:可组配检索式,如:#1 OR #2, #1 AND child点击编号可对检索式进行删除、保存点击编号可对检索式进行删除、保存 等操作等操作检索历史检索历史(简称检索史)(简称检索史)
32、l检索史按检索式运行的顺序列出各检索式,包括检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条数。l检索史最多保存100条检索式,检索史将在离开PubMed或其他Entrez数据库8小时小时后消失。l单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检索结果。l可通过检索策式的序号对检索策略进行组配l单击检索史窗口上方的Download history或者Clear History按钮可将所有检索式下载或者删除。例题例题1: 利用高级检索途径,检索天津医科大学利用高级检索途径,检索天津医科大学(tianjin medical university)姚智)姚智(yao zhi)教授发表在)教授发表在Pepti
33、des的文献的文献。 点击检索点击检索点击检索点击检索u文献太多,如何保证查全和查准?文献太多,如何保证查全和查准?uMesh词表帮助您!词表帮助您! 它是美国国立医学图书馆编制的它是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表权威性主题词表。 Mesh在文献检索中的重要作用主要表现在两个方面:在文献检索中的重要作用主要表现在两个方面:准确性(准确揭示文献内容的主题)和专指性。准确性(准确揭示文献内容的主题)和专指性。3、主题词检索、主题词检索 主题词主题词(Subject HeadingSubject Heading)是经人工规范化处理的最能)是经人工规范化处理的最能表达文章主题概念的语词。所谓规
34、范化处理,就是在文献存表达文章主题概念的语词。所谓规范化处理,就是在文献存储时,对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控储时,对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控制和规范,使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词制和规范,使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。下。 主题词主题词关键词关键词禽流感禽流感禽流感、鸟流感、家禽瘟症、鸡瘟禽流感、鸟流感、家禽瘟症、鸡瘟NeoplasmsNeoplasm、Tumors、Tumor、CancerAspirinAspirin、Acetylsalicylic Acid、Micristin、Solprin3、主题词检索、主题词检索、第一
35、种进、第一种进入方法入方法、第二种进、第二种进入方法入方法例题例题2:l 利用主题词检索途径,检索近有关利用主题词检索途径,检索近有关肝癌药物治疗肝癌药物治疗(liver cancer, drug therapy)方面的英文文献。方面的英文文献。 3、主题词检索、主题词检索输入检索词输入检索词词义解释词义解释主题词轮排表主题词轮排表3、主题词检索、主题词检索副主题词副主题词主题词加权、主题词加权、不扩展选项(默认选项)不扩展选项(默认选项)可对检索结果进行限定。可对检索结果进行限定。如果进行了限定,系统默认以下的操作如果进行了限定,系统默认以下的操作都进行此限定,如要进行新的检索应将限都进行此
36、限定,如要进行新的检索应将限定清除定清除“clear”。主题词加权检索主题词加权检索主题词不扩展检索主题词不扩展检索(系统默认按照扩展进行检索)(系统默认按照扩展进行检索)入口词入口词树状结构树状结构主题词主题词下位主题词下位主题词上位主题词上位主题词MeSH检索的优点l查全同义词查全同义词:如:如:renal/kidney failure; tongue cancer/tumorl查全子概念查全子概念:如:如:chronic/acute kidney failure, ATNl根据树形结构调整检索词根据树形结构调整检索词缩小:不扩展下位词,或选用某个下位词;缩小:不扩展下位词,或选用某个下位
37、词;扩大:选用上位词,或选用多个同位词;扩大:选用上位词,或选用多个同位词;l了解同一概念的同义词、近义词,供自由词检索参考了解同一概念的同义词、近义词,供自由词检索参考l提高文献相关度提高文献相关度 标有标有MeSH词的都是文章的主题,筛去非主题的文章词的都是文章的主题,筛去非主题的文章 Major Topic Headings(加权,重点论述的主题)(加权,重点论述的主题)MeSH检索的缺陷l人工标引费时,最新论文还未标人工标引费时,最新论文还未标MeSH词(词( In Process),用),用MeSH会漏检。会漏检。lMedline不收录的文献,不收录的文献,Supplied by p
38、ublisher的文献,不标的文献,不标MeSH词。词。l新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。如:如:SARS(03年词表中没有),舌根癌年词表中没有),舌根癌l查上述类型的文献需查上述类型的文献需结合自由词检索结合自由词检索4、期刊检索、期刊检索l通过输入刊名全称或缩写、通过输入刊名全称或缩写、ISSN号等浏览期刊出版社号等浏览期刊出版社等详细信息。等详细信息。l提供期刊:提供期刊:在在PMC中的免费全文链接中的免费全文链接在在Nucleotide,Protein,Pubmed等库中的记录链接。等库中的记录链接。相关的其他期刊相关的其他期刊、第一种
39、进、第一种进入方法入方法、第二种进、第二种进入方法入方法4、期刊检索、期刊检索l如果刊名是如果刊名是Mesh词(如:词(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名是单个单词,或刊名是单个单词(Scanning),如只想将其作为刊名检索,需,如只想将其作为刊名检索,需加刊名字段标识加刊名字段标识so、ta、jour。l 推荐使用刊名全称或缩写查找,因为有些推荐使用刊名全称或缩写查找,因为有些过早的文献没有过早的文献没有ISSN。4、期刊检索、期刊检索例题例题3: 检索检索Lancet刊登的所有文献篇数。刊登的所有文献篇数。 4、期刊检索、期刊检索清除之前的检索式清除之前的检
40、索式出版频率:周刊出版频率:周刊创刊年代:创刊年代:1823年年主题词:医学主题词:医学可对检索结果进行限定可对检索结果进行限定5、题录检索、题录检索l通过输入文献出处信息,查找特定文献。通过输入文献出处信息,查找特定文献。(刊名要准确,缩写要标准;著者姓名大小写不敏(刊名要准确,缩写要标准;著者姓名大小写不敏感)感) 有两种方式:有两种方式: 1、单一引文匹配(、单一引文匹配(Single Citation Matcher) 输入已知的信息,可得到相应的特定文输入已知的信息,可得到相应的特定文 献,如投稿遗漏的页码或第二、三作者等。献,如投稿遗漏的页码或第二、三作者等。 2、成组引文匹配(、
41、成组引文匹配(Batch Citation Matcher) 允许一次输入多条检索要求,返回结果为相允许一次输入多条检索要求,返回结果为相 应文献的应文献的PMID。进入Single Citation Matcher单一引文匹配单一引文匹配如果希望检索结果的专指性更强,可以填写更多的已知信息 ,如: journal,date, volume, author name, title words例题例题4: 检索检索1975年发表在年发表在Taiwan yi xue hui za zhi 上,上, 由由Chang PY撰写撰写的文献的合著者。的文献的合著者。 5、题录检索、题录检索合著者合著者检索
42、表达式检索表达式进入Batch Citation Matcher成组引文匹配成组引文匹配6、临床咨询、临床咨询(获取循证医学证据获取循证医学证据) 利用利用PubMed 提供的提供的“Clinical Queries”功能,功能,获取各种类型的循证医学证据。获取各种类型的循证医学证据。 只需在检索框中输入疾病名称或干预手段等只需在检索框中输入疾病名称或干预手段等检索词,点击检索词,点击Search,即可获取系统评价、,即可获取系统评价、Meta分析、临床试验等循证医学证据。分析、临床试验等循证医学证据。供查找疾病的供查找疾病的病因、诊断、病因、诊断、治疗、预后的治疗、预后的文献文献查找疾病的系
43、查找疾病的系统评价文献统评价文献查找医学遗传查找医学遗传学方面的文献学方面的文献供查找疾病的供查找疾病的病因、诊断、病因、诊断、治疗、预后的治疗、预后的文献文献供查全或查准供查全或查准7、临床试验、临床试验(获取循证医学证据获取循证医学证据)7、临床试验、临床试验 美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库。收录了美国及世界据库。收录了美国及世界170多个国家经注册多个国家经注册登记的登记的8万多条临床试验的详细信息,是十分万多条临床试验的详细信息,是十分重要的循证医学信息资源。重要的循证医学信息资源。四、检索结果处理四、检索结果处理1、显示方式选择、显示
44、方式选择2、输出方式选择、输出方式选择3、全文的获取及相关链接、全文的获取及相关链接 1、显示方式选择(、显示方式选择(Display settings ) 显示格式选择(显示格式选择(format ): summary(默认格式:题名、作者、刊(默认格式:题名、作者、刊名)名) Abstract (文摘格式)(文摘格式) Medline(包括所有字段,并有字段标识(包括所有字段,并有字段标识符)符) 增加网页显示的记录数(增加网页显示的记录数(items per page ) 排序选择(排序选择(sort by): 可按日期、作者、刊名、题名等顺序排列。可按日期、作者、刊名、题名等顺序排列。
45、 2、输出方式选择(、输出方式选择(send to)lFile:保存检索结果为文本文件:保存检索结果为文本文件lClipboard 剪贴板,多次检索,可暂存每次剪贴板,多次检索,可暂存每次检索需下载的记录,最后一起保存。检索需下载的记录,最后一起保存。 最多允最多允许存储许存储500条,保留条,保留8小时。小时。lEmail: 通过邮件发送通过邮件发送lCollections:将检索结果存到:将检索结果存到My NCBI中中lOrder:全文传递服务,需帐号、收费。:全文传递服务,需帐号、收费。3、全文的获取及相关链接、全文的获取及相关链接1、联机获取全文(文摘中超链接)、联机获取全文(文摘中超链接) 在文摘显示的界面上通过刊名(彩色活动图标)链接在文摘显示的界面上通过刊名(彩色活动图标)链接电子期刊的网站,部分能获取该文献的电子全文。电子期刊的网站,部分能获取该文献的电子全文。2、PubMed Central(PMC) PMC是美国国立医学图书馆生命科学期刊文献的免费是美国国立医学图书馆生命科学期刊文献的免费数据化文档、访问该数据库可不加任何限制获取全文。数据化文档、访问该数
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