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文档简介
1、FDA批准的激酶小分子抑制剂类药物与分类一览蛋白激酶蛋白激酶(Kinase)是细胞生命活动重要的信号使者,可催化将ATP末端的丫-酸基团转移至底物上,从而将各种信号进行传递(图1)。蛋白激酶参与了众多的生理过程,包括细胞增殖、存活、凋亡、代、转录以与分化等。药理学与病理学研究表明,对丁很多疾病,如肿瘤、炎症性疾病、中枢神经系统疾病、心血管疾病与糖尿病等,蛋白激酶都是一个理想的药物靶点50000045000040000G3S00009000001950I9601970198019902000-2010201gr%药渡2SOOOO2MO0O1MJ000100000MX)000图1Mechanism
2、ofproteinkinasesandrelatedpublications对丁蛋白激酶的研究始丁20世纪50年代,并在90年代随着MAPK/ERK、JAK与PI3K等信号通路的揭示而达到一个研究热潮。迄今为止,在人体中发现了518种蛋白激酶,而编码具有激酶活性蛋白的基因则高达900多种。与之相对应,有关激酶抑制剂的研究也逐步发展,并在激酶作用机制的阐明过程中扮演了重要角色,并成为重要的药物研究热点。该领域研究的文献数量也是逐年上升,从侧面反映了其在基础研究和药物发现中的重要性。蛋白激酶抑制剂与其分类过去的15年间,激酶抑制剂作为药物候选的研究取得了长足的进步,不论是基础研究还是在工业界。在人
3、体现有药物靶点里面,蛋白激酶家族成员占比高达10%(FDA批准药物分子靶点深度解读)。2001年,第一个激酶抑制剂类药物Imatinib获得FDA批准,成为该领域发展的里程碑,此后十年该类药物以平均每年获批一种的速度稳步发展。而在2012年1月至2015年2月期间,小分子激酶抑制剂类药物迎来爆发式发展,共有15种新药获得审批。截至2016年12月底,共有31种小分子激酶抑制剂类药物获得审批,同时还有大量的化合物处丁临床或临床前研究中。除此之外,科研人员还解析了超过5000种的蛋白激酶或蛋白激酶-抑制剂复合体的晶体结构,且超过五分之一的人类蛋白激酶具有明确的小分子抑制剂。因此,小分子激酶抑制剂已
4、成为药物研发的一个热点领域。蛋白激酶尽管在一级序列上有所差异,但在三维结构上却具有高度的保守性,特别是在催化活性结构域附近。该区域存在一个6-折叠构成的N-lobe区域与a-螺旋构成的C-lobe区域,而ATP结合在两者构成的沟状区,也是很多激酶抑制剂的结合位点。活性位点附近还存在一条Activation-Loop,通常末端存在一个保守的Asp-Phe-Gly(DFG)结构基序(图2A)。图2Kinasestructureanddifferenttypesofreversiblesmall-moleculekinaseinhibitor根据结合模式的不同,激酶抑制剂可分为不可逆与可逆两大类。前
5、者指化合物通过与Cys反应形成共价键结合在ATP结合位点上,从而封闭ATP的结合空间,该过程具有不可逆转性。后者根据结合口袋区域与DFG基序构象的不同,可分为四种主要的不同业型(图2B)。类型I为ATP竞争性抑制剂,结合与活性形式激酶DFG基序上的Asp残基。类型II抑制剂结合与非活性状态的激酶中,其上DFG基序上的Asp残基朝向分子外侧。而类型用的抑制剂结合在ATP附近别构位点上,但同ATP结合口袋没有相互作用。类型IV抑制剂结合在远离ATP结合位点的别构作用区域。还有些激酶抑制剂,如双底物类抑制剂,可以统一划分在类型V里面,作用模式与上述四类有所不同2002840&IOIZZJEl
6、lSEUPIOJ-nMIOLU奇E50含EPZKey:Pr(jt«Fiil(inaiemhibitcrLipidklMieinhibitor200120042O0S2006300?20CB2CMS20102011201220132014图3SmallmolecularkinaseinhibitorsapprovedbyFDAin2001-2016在获批的31中小分子激酶抑制剂类药物中(图3),绝大多数为酪氨酸激酶抑制剂,还有些届丁丝氨酸/氨酸激酶抑制剂,只有2014年七月获批的Idelalisib届于脂激酶类抑制剂。根据靶点蛋白与药物届性的不同,分类整理如下:FDA批准的可逆NRTK
7、(非受体型酪氨酸激酶)抑制剂类药物ImatinibDasatinibNiilotinibBosutinibPcnatinibRuxolitinibTofacitinib图4ReversibleNITKinhibitorsTable1可逆性NRTK抑制剂类药物信息列表分子名商品名靶点适应症公司InuidntbGleevecBCR-Abl,Kit,PTX1FRPh'CMLorALL,aggressivesolemn;mastoc>lnsisCFL+DFSP,HEStGIST;MDS/MDPNovartisDasaCinibSprycelHCR-Abl,Src,Lek,Yes.Fyn,
8、KiLEphA2TPDGFR|3Ph*CMLtALLBrisloJ-MyersNilotinibjsignaBCR-Abl,PDGFR,DDRIPh+CMLBosutinibBCR-AbhSrc,Lyn,HckCMLWyethPonatiniblulusigBCR-AbLBCR-AblT31.51.vegfrtpdgfr.fgfr.FphR.Srcfamilykinases,KitRU;Tie2tFIBPh+CMLorAllAriadPhiirmaceutiraJsRiixdlitinibJakEitiJAKI/2MyelolibriKisandV-IncyteCorp.TofacitmihX
9、cljaiizJAK1/3RheutnatuidarthritisP临一M-J*J_117纣反FDA批准的可逆RTK(受体型酪氨酸激酶)抑制剂类药物GefitinibErlotinibLapmtiniboNHVandetanib图5ReversibleRTKinhibitors-1SorafenibSunitinibPazopanibAxitinibRegorafenibNintedanibLenvatinibCri2OtinibCabozantinibAlectinibCeritinib图6ReversibleRTKinhibitors-2Table2可逆性RTK抑制剂类药物信息列表分子名袖
10、品名IE点适应症公司GdiiinibIrcssaEGFRNSCLCAstraZenecaFHoiinibTarcealiGFRNSCLCtodptncreaticcancerOS!FharmaceuucdsLtp*tinibTykerbEGFKErbBJBnc皓iCuiKcrGSKA'iindetaiiibCiipTTElsaECiFRw.VEGFRs.RETBrkTic2,RphRa,SretainilykinasesMedullaryihjToidcancerAstraZenecaSorafenibNcxarBr-RufB-Rnf(V600E).Kii,Fl|3.RET.VEGFR
11、1M,PDGFRPHcpaioccltuhrcarcinonia.RC.DTCBayerSunitinihSulimtPDGFR叫LVEQFR1门Kh.FltlCSF-IR,RETRCC,GISTPNETPfi/crPwi忡tiihVoiricniVEGFR12/3.PDGFRaji,bGFRIlKit,Lek,Fm;IlkRCC,solitissuemrcomB%GSKAnitinibTnlylaVEGFRl.2/3,PDGFRpRCCPfizerRcgonfrnihVEQFR13,BCR-Abl.*RaRB-RafV600EXKh,PDGFRWRET.FGFR"TielEph2A
12、CRCBayerKlBtedanibOfcvFGFRI/2/3,PDGFRft/VEGFR1/2/3.HOIdiopathicpulmonaryfibrosisBoehringerIngelheimLem制拓山LcnvimaVEGFRs.FGFRs,PDGFR.Kil.RET1hyroidcancerLisaiInc.<ri/otjnibXalkoriALK.c-Mct(HGFRkROS,MST1RALK-positiveNSCLC(2111)andROS-IposiucNSCLC(2016)PfizerCirHinitiZykudiaALK.IGF-1R,InsR.ROS1ALK叩质i
13、HvcNSCLCaftercriAJliribrcsistanceNovarii$(aliHAtiiiiiiibCometriqRET,MeLVEGFRl.,Kit,TrkB.FJi3.AxLMelssialicmedulhrthjroidcancer(2012euk!advancedRCCQO16)ExelixisAkctinibAlecenscAt.K,RETALK叩osit电NSCLC约渡FDA批准的不可逆蛋白激酶抑制剂类药物图7InreversibleproteinkinaseinhibitorTable3不可逆蛋白抑制剂类药物信息列表分子名商品名瞬适应症公司IhrutinibImbr
14、uMcaMantlecellLyimphoina,CLUWaldeiistroiifsmaeroglobulinemiaPharmatyclicsAFatirtibGilotrifEGFR,Erb82bEitB4NSCEjC(20l3hMuanHisNSCLC(2016)KoehtHigcrIn«clh<imOslmertinibTagrissoEGFRT970MNSCLCAstiaZeiiGca,_上JA七1. FDA批准的丝氨酸/氨酸激酶抑制剂类药物CobimetinibPalbociclib图8Serine/ThreoninekinaseinhibitorsTable4丝
15、/苏氨酸激酶抑制剂类药物信息列表一Tgi分商品客靶点适应症公司VcmuratenibZclborafA/B/CRaf;B-Raf(V600E),SRM£ACKLMAP4K5,FGRMelnnomnwithBRAFv,v>lTmmationRocheDabrafenibTafitJarB-rafMelanomawithBRAFmuwiionsGSKTramctinibMEKU2MelanomaGSK(obimetinihCotcDicMEKMelanomawithBRAFV600E/KmutationswiihvemuratenibRochePalbociclib1braneCD
16、K4/6ERandHER2breastcancerasiirst-line(2015)andsecond-linetherapy(2016)PfizerNHFONIdelalisib图9LipidkinaseinhibitorTable5脂激酶抑制剂类药物信息列表分子名商品名靶点适应症公司IdelalisibZydcligPI3K,PUOcmFL,SLLGileadScicncta挑战与展望在过去的15年里,基丁蛋白激酶的药物发现取得了巨大进步。相比丁GPCR,膜通道与转运蛋白与蛋白酶等传统药物靶点领域,激酶抑制剂代表了一类年轻而乂充满活力的药物发现空间,并取代GPCR成为癌症领域最火热的细胞
17、治疗靶点。尽管在短短十五年时期已有31种药物获得批准,但在2016年,近五年的快速增长势头没能继续延续。激酶小分子抑制剂类药物研究领域仍面临诸多挑战。首先,人体激酶家族中只有少数成员获得了详尽研究。绝大多数抑制剂研究集中丁酪氨酸激酶与类酪氨酸激酶家族,如CDK、MAPK、GSK3、CMGC、PKA、PKG与PKC等。这一不平衡还体现在现有获批药物数量上,针对BCR-Abl、ErbBs与VEGFRs三类酪氨酸激酶开发的药物占到了总数的三分之二以上。而在另一分类体系中,脂激酶只有一种抑制剂类药物上市,尽管这类酶的抑制剂早在20世纪90年代就早已有报道,且开展了很多临床与临床前研究。以上现状表明,人
18、体激酶组中的很多成员还处丁被冷落状态。我们需要开发出新型的研究方法或筛选探针,以便更好的揭示这些激酶的作用机制,并有效开发其作为药物靶点的潜力。令人鼓舞的是,最近几年有数个激酶成员的抑制剂类药物首次获得批准,如2013年MEK抑制剂Trametinib、BTK的抑制剂Ibrutinib与2015年获批的CDK抑制剂Palbociclib。其次,尽管激酶的梯级调控信号调节着众多的生理过程,如炎症反应、中枢神经系统异常、心血管疾病、糖尿病与癌症等,但现有获批药物超过90%以上集中在癌症治疗领域。针对激酶的小分子抑制剂类药物应用领域亟待拓展。目前,Tofacitinib已被批准用丁关节炎治疗。即便是
19、在肿瘤治疗领域,也有很多问题有待进一步深入研究,如肿瘤的耐药性问题以与同其他药物的联合用药等。第三,现有的很多激酶抑制剂药物存在较多相似性,大多是在已批准药物基础上设计优化而成,如针对ErbB的五种抑制剂均包含相同的核心结构模块。从这个角度讲,现有药物的结构多样性不够丰富,亟需增加药物研发初始阶段高通量筛选(HTS)所用化合物库的结构多样性。而天然产物库,通常包含不同丁绝大多数化学合成抑制剂库的药效团与分子骨架,有望成为拓展HTS库结构多样性的新资源。第四,具有新的作用机制与特异性的激酶抑制剂类药物有待开发。由丁激酶ATP结合口袋区域附近结构的保守型,绝大多数抑制剂为可逆性抑制剂。这也导致了绝大多数小分子抑制剂存在不止一个作用靶点分子,导致脱靶现象以与副作用的产生。与之相随,具有绝对选择性的抑制剂分子极为稀少。未来工作中,我们需要探索具有新型作用机制的抑制剂分子。而激酶抑制剂的选择性则是一个略带争议的特性。早期研究中,具有交义抑制活性或广谱选择性的抑制剂是肿
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