国内外生物信息学发展状况

1、国内外生物信息学开展状况1.国外生物信息开展状况国外非常重视生物信息学的开展各种专业研究机构和公司如雨后春笋般涌现出来,生物科技公司和制药工业内部的生物信息学部门的数量也与日俱增.美国早在1988年在国会的支持下就成立了国家生物技术信息中央NCBD,其目的是进行计算分子生物学的根底研究,构建和散布分子生物学数据库；欧洲于1993年3月就着手建立欧洲生物信息学研究所EBI,日本也于1995年4月组建了信息生物学中央CIB.目前,绝大局部的核酸和蛋白质数据库由美国、欧洲和日本的3家数据库系统产生,他们共同组成了DDBJ/EMBL/GenBank国际核酸序列数据库,每天交换数据,同步更新.以西欧各国

2、为主的欧洲分子生物学网络组织EuropeanMolecularBiologyNetwork,EMBNet是目前国际最大的分子生物信息研究、开发和效劳机构,通过计算机网络使英、德法、瑞士等国生物信息资源实现共享.在共享网络资源的同时,他们又分别建有自己的生物信息学机构、二级或更高级的具有各自特色的专业数据库以及自己的分析技术,效劳于本国生物医学研究和开发,有些效劳也开放于全世界.从专业出版业来看,1970年,出现了?ComputerMethodsandProgramsinBiomedicine»这本期刊；到J1985年4月,就有了第一种生物信息学专业期刊?ComputerApplica

3、tionintheBiosciences».现在,我们可以看至的专业期干Ll已经很多了.2国内生物信息学开展状况我国生物信息学研究近年来开展较快,相继成立了北京大学生物信息学中央、华大基因组信息学研究中央、中国科学院上海生命科学院生物信息中央,局部高校已经或准备开设生物信息学专业.2002年国家自然科学基金委在生物化学、生物物理学与生物医学工程学学科设立了生物信息学工程,并列入生命科学部优先资助的研究工程.国家863方案特别设立了生物信息技术主题,从国家需求的层面上推动我国生物信息技术的大力开展3.但是由于起步较晚及诸多原因,我国的生物信息学开展水平远远落后于国外.在PubMed收录

4、的以关键词“Bioinformatics检索到的历年发表的文章数,可以看出大量的研究文献出现在21世纪以后.其中我国共有138篇占全部5548篇的2.5%,而美国那么发表2160篇占全部的39烧多统计数据截至2004年2月15日.我国学者在生物信息学领域发表的有高影响力的论文只有不到美国学者发表数量的6%差距相当大4.在生物信息学领域,一些著名院士和教授在各自领域取得了一定成绩,显露出蓬勃开展的势头,有的在国际上还占有一席之地.如北京大学的罗静初和顾孝诚教授在生物信息学网站建设方面、中科院生物物理所的陈润生研究员在EST序列拼接方面以及在基因组演化方面、天津大学的张春霆院士在DN崎列的几何学分

5、析方面、中科院理论物理所郝柏林院士、清华大学的李衍达院士和孙之荣教授、内蒙古大学的罗辽复教授、上海的丁达夫教授等等.北京大学于1997年3月成立了生物信息学中央,这个中央在1996年欧洲EMBNe胪大到欧洲之外时已正式成为中国结点每个国家只有一个结点,目前已有60多种生物数据库的经常更新的镜像点.近年来,它已组织过屡次国内和地区的培训班及会议,有着较广泛的国际联系.另外,中国科学院、中国医学科学院、军事医学科学院、清华大学、天津大学、浙江大学、复旦大学、哈尔滨工业大学、东南大学、中山大学、内蒙古大学等等都先后开展了生物信息学研究和教学工作,许多大学都设立了生物信息学专业,并同时招收本科、硕士、

6、博士研究生.各种学术会议及论坛的召开,对于促进我国在这一前沿领域的开展起着越来越重要的作用.中国科学院于1997年9月和12月召开了第80、87次香山会议,首次邀请有关专家就“DNA芯片的现状与未来和“生物信息学进行探讨.1999年3月,清华大学生物信息学研究所、国家人类基因组北方研究中央和北京生物技术和新医药产业促进中央共同举办了“北方生物信息学学术研讨会.1999年4月,北京大学举办了“国际生物信息学讲习班.2001年4月,由北京市科技委员会、中国人类基因组北方研究中央、中国人类基因组南方研究中央、北京华大基因研究中央、军事医学科学院、北京生物工程学会生物信息学专业委员会、北京生物技术和新

7、医药产业促进中央等共同举办的首届“中国生物信息学大会在北京召开.2003年11月28-29日,中国科协“生物信息学与进化计算第81次青年科学家论坛在北京中国科技会堂成功召开.这次论坛是中国科协举办的一次多学科交叉的盛会,旨在促进国内青年科学家在这一全新领域内的相互交流,促进该学科的成长与开展.这是国内首次以“生物信息学为主题的一次多学科交叉的青年科学家论坛.与会者一致认为系统生物学、非编码区功能研究、基因调控和相互作用网络等是当前生物信息学研究的热点问题.尽管如此,真正开展生物信息学具体研究和效劳的机构或公司仍相对较少,仅有的几家科研机构主要开展生物信息学理论研究,声称提供生物信息学效劳的公司

8、所提供的效劳也仅局限于简单的计算机辅助分子生物学实验设计,而且效劳体系并不完善；国内互联网上已有的几家生物信息学网站,大局部偏于所有生物医学领域的新闻报道,而生物信息学专业技术效劳的含量太少,这就与国外有了较大差距5.3 我国生物信息学开展中存在的问题一方面,在生物信息学研究领域,一般的教授、教师水平有限,有些甚至对生物信息学本身知其一不知其二,缺乏正规的练习,很少了解目前的研究重点、热点和今前方向.由于所申请的经费支持力度和持续时间原因,大多数学者只能选择易于获得研究成果的科研工程,一般缺乏新奇性和创造性.这可能与我们国家处于快速开展阶段的“短平快思路和环境有关.另一方面,可能是教育体制上的

9、原因,科研工程的分配问题、行政治理中存在的问题,传统教育不鼓励学生进行批判性、创新性地学习和思考的问题,也可能是症结所在.另外,生物信息学对信息交流有很高的要求,尤其是Internet的畅通,我国曾经有人为的限制访问或限制流量这些今后回忆时会成为苦涩消化的举措6.目前我国的科研经费真正投入并落到实处的占国家GDP勺份额还很小,科研经费问题进一步限制了生物信息学在我国的开展.4 展望生物信息学作为一门新兴的工程技术学科,对刚起步的我们来说充满了时机和挑战,“后基因组时代给我国的生物信息学开展提供了很大的舞台.生物信息学首先是一门信息学,所以我们必须端正一些可能的熟悉错误,必须呼吁引导更多的计算机、数学、物理学人才参加到其中的研究.统计学、概率论、组合数学尤其是图论、拓扑学、运筹学、函数论、信息学、计算数学、群论、人工智能,都已经在生物信息学研究中发挥了巨大的作用.我们应尽快缩小我国在计算机信息学的核心技术、巨型计算机的应用以及互联网核心技术方面与世界领先国家的差距7.加大大学生物信息学教育力度,广泛开办生物信息学专业,充分利用我国的丰裕的智力资源,培养生物信息学根底人才,并以此为根本,进一步挖掘在生物信息学