RNA互作,靶基因预测,定位以及疾病分析数据库培训资料

1、.1RNA互作，靶基因预测，定位以互作，靶基因预测，定位以及疾病分析数据库及疾病分析数据库.2RNA互作、定位、疾病数据库.3*RAID2.0中有这两个数据库的部分数据整合在其中，同时也在更新计划中，有需要可以关注。.4RefernceRAID v2.0：RNA-RNA、RNA-Protein互作模式，/raid/RNALocate ：RNA的亚细胞定位数据库 ，/rnalocate/MNDR v2.0：非编码RNA与疾病的数据库，/mndr/R

2、eferenceRAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118.RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138.MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease association

3、s in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.5RAID v2.0RNA-RNA、RNA-Protein互作/raid/.6RAID v2.0数据展示数据展示RAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118. RAID v2.0共包含mRNA、miRNA、lncRN

4、A、circRNA、tRNA等10余种类型，超过527万条数据。 可通过主页上的“Statistics”点击进入查看数据分布情况。.7 850倍倍RNA相关互作；与实验或相关互作；与实验或计算预测证据相结合；基于综合计算预测证据相结合；基于综合置信度评分进行可靠性评估；物置信度评分进行可靠性评估；物种覆盖率提高到种覆盖率提高到60。RAID v2.0页面展示页面展示搜索与浏览，侧重点各有不同，我们分别展示。.8可根据note选择搜索关键词在Download的数据表中会看到简写为S/W/P。.9以hsa-miR-34a-5p为例搜索精确匹配选项精确匹配选项.10来看看hsa-miR-34a-5p

5、的朋友圈.11再看个与蛋白质互作的！搜索框内输入MALAT1，将打分限定为0.9-1.0后进行搜索。然后“more”一下。.12可查看与蛋白质结合的序列.13可根据互作类型、检测方法或物种进行浏览，这里以RNA-Protein互作为例。.14您能浏览到的您能浏览到的艾玛，请宽恕我越来越小的截屏字体，相信总有一款适合您 。.15关于下载，不赘述，后面还有！关于下载，不赘述，后面还有！分体与合体的区别.16 RNALocateRNA的亚细胞定位数据库/rnalocate/.17RNALocate是如何构成的？RNALocate: a resourc

6、e for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138.18可搜索可浏览，内容丰富，展示直观可根据定位、组织和RNA类型浏览.19以定位浏览为例，左右均可以点选 直达NCBI链接.20搜索功能都能获得什么？序列展示与浏览功能类似同源展示，可进一步追踪一步邻居？两步邻居？请选择您的网络展示形式看不清？任性调！.21本站数据有三种基础下载形式可选怕不怕？.22MNDR v2.0非编码RNA与疾病的数据库/mndr/.23MNDR v2.

7、0看得到的有什么？如果您有目标RNA，想知道它和什么疾病相关 如果您研究某种疾病，想知道有哪些RNA与之有关.24MNDR v2.0看不到的有什么？MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.25MNDR v2.0中您更关心什么？MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids

8、 Research. 2018; 46(D1): D371-D374.26如何使用MNDR v2.0搜索？.27搜索结果展示.28搜索结果“more”细节展示.29如何使用MNDR v2.0浏览？查询非编码查询非编码RNA和疾病的关系，可和疾病的关系，可根据疾病、非编码根据疾病、非编码RNA和物种浏览和物种浏览.30点击想要浏览的疾病，可以直接看到相关的非编码RNA.31也可下载后查看.32关于Download 下载后的文件以“.TXT” 记事本形式存在，直接查看不方便，可以转到excel表格中。上一页浏览到的上一页浏览到的43条信息，条信息，均在下载的数据表中。均在下载的数据表中。S:强验证；强验证；W:弱验弱验证；证；.33当然还有整体的当然还有整体的Download.34关于关于Statistics哈哈哈哈哈！：,请原谅我的不成熟，这几个饼图我玩了至少有5分钟，上面的饼图可以点，下面图例的小圆点也是可以点的，然后我就看着饼图切换来切换去咳咳！我