欣谕染色体核型图像分析系统说明书

1、染色体分析系统使用说明书上海欣谕仪器有限公司一、系统文件安装1.系统文件安装，将光盘插入，执行安装程序Setup.exe;2 配置文件和加密锁驱动文件安装执行光盘上的INSTALL.EXE 文件，系统自动安装其它配制文件，包括加密锁的设备驱动文件。执行该文件后，在D：盘产生4个子目录，它们分别是：D:CHR_IMG;D:CHR_DAT;D:CHR_KAR, D:CHR_BMP。D:CHR_IMG 存放获取的原始核型图D:CHR_DAT;存放处理的中间结果D:CHR_KAR,存放分析后的核型图D:CHR_BMP;存放以BMP方式保存的核型图3.加密锁当程序安装完成后，将加密锁插入计算机的USB槽

2、中，系统自动检测发现 Senselock_v1.5 的提示信息，按提示，一直按Next>，直至完成。当程序安装完成后，将加密锁插入计算机的USB槽中。执行Kar_Lock_Test.exe测试程序，显示：加密锁检验成功！OK！4 图像采集卡安装与测试图像采集卡硬件安装关闭计算机电源，打开机箱将图像采集卡插入计算机的任意一个PIC 槽中，保证到位，并用螺丝固定紧。盖上机箱将数据线一弊端与图像采集卡相连，另一端与显微镜上的摄像机相连。图像采集卡软件安装打开计算机电源开关，启动计算机，当Windows加载完成后，系统将会出现下面的信息提示：出现上图后，点击“下一步(N)>”,立即弹出下一

3、窗口，将查找范围定于：光盘的V3a_Drv目录下，点击“Saa7146.inf”文件，按打开，即可。对后面所出现的提示，一律按“下一步(N)>”，直到安装完成。重新取动计算机，至此，采集卡的驱动安装完成。 安装完成后执行：GRap_test.exe，如果能显示图像，即正确。二、XY-RS-A B染色体核型自动分系统使用说明（硬件安装部分）本系统针对细胞染色体的G带核型分析，研制了染色体核型自动分析系统。该系统可以对G显带染色体细胞，进行分离和分割，然后自动进行识别排队，从而实现了G显带染色体核型分析。同传统的人工核型分析相比，该系统大大减轻人工的繁锁劳动，可为临床遗传疾病的查检和对胎儿进

4、行产前染色体疾病的诊断提供了一个有效的工具。该系统还可用于动物染色体核型分析。1 系统简介染色体核型自动分析系统主要由：硬件和软件两大部分组成。硬件部分：显微镜、摄像头、图像采集卡、计算机和打印机等。软件部分：主程序、图像摄取与合拚、染色体分割、核型分析、显示调整、结果打印与输出、数据库管理等。2.系统硬件安装软件安装：本软件可以运行于Windows2000和 windows XP下.2.1 加密锁当程序安装完成后，将加密锁插入计算机的USB槽中，系统自动检测发现 Senselock_v1.5 的提示信息，按提示，一直按Next>，直至完成。加密锁如下图：当系统提示新设备可以应用后，执行

5、D:chromoKar_Lock_Test.exe,见下图，执行“测试”。若加密锁驱动安装成功，将出现下图：加密锁检验成功！。2.2 图像采集卡安装图像采集卡硬件安装关闭计算机电源，打开机箱将图像采集卡插入计算机的任意一个PIC 槽中，保证到位，并用螺丝固定紧。盖上机箱将数据线一弊端与图像采集卡相连，另一端与显微镜上的摄像机相连。图像采集卡软件安装打开计算机电源开关，启动计算机，当Windows加载完成后，系统将会出现下面的信息提示：出现上图后，点击“下一步(N)>”,立即弹出下一窗口，将查找范围定于：光盘的V3aINSTALL目录下，点击“Saa7146.inf”文件，按打开，即可。对

6、后面所出现的提示，一律按“下一步(N)>”，直到安装完成。重新取动计算机，至此，采集卡的驱动安装完成。三、XY-RS-A G染色体核型自动分系统使用说明（软件安装说明）1 系统软件安装1.1系统文件安装系统文件安装，将光盘插入，执行安装程序Setup.exe，分别出现下图：用鼠标点击上图的“Browse”,改变文件建立路径，如下图：在上图的Path:中输入 d:chromo,即将文件路径改为d般chromo，按确定见下图。按Next>往下执行。在上图中用鼠标选择单选项：Custom，然后执行Next>,通过上图可以看到安装文件的大小。以后如出现提示框，都按Next>，直

7、至安装完成。安装完成后在D：盘产生1个子目录:D:CHROMO; 存放系统执行文件.2.2 配置文件和加密锁驱动文件安装执行光盘上的INSTALL.EXE 文件，系统自动安装其它配制文件，包括加密锁的设备驱动文件。执行该文件后，在D：盘产生4个子目录，它们分别是：D:CHR_IMG;D:CHR_DAT;D:CHR_KAR, D:CHR_BMP。D:CHR_IMG 存放获取的原始核型图D:CHR_DAT;存放处理的中间结果D:CHR_KAR,存放分析后的核型图D:CHR_BMP;存放以BMP方式保存的核型图四、XY-RS-A B染色体核型自动分系统使用说明(软件使用操作使用说明)4.应用软件使用

8、说明 应用软件主要包括：主程序、图像获取、染色体分割、提取染色体特征、显示与调整染色体、摄生与打印输出和库操作等功能。4.1 主程序执行D:ChromoMAIN.EXE文件,显示下面窗口。点击“开始”，进行主程序运行，点击“退出”，返回Windows状态。主程序主要包括上面的菜单和左边的简便操作功能：主要包括：l 图像获取l 装载图像l 保存图像l 核型自动分析核型自动分析包括：l 染色体分割l 提取染色体特征l 显示与调整染色体l 报告与打印输出4.2 图像获取在主程序中，点击图像获取后，将弹出下面窗口：操作人员可以通过用鼠标移动左上角的亮度与对比度，改变图像的亮度与对比度。合适后按获取图像

9、，将图捕获；再按保存图像，将文件存盘。对于太分散图像，一幅图装不下时，可分两幅图获取，然后采用合拚方式，将两幅图合为一幅。具体执行合拚图像操作，然后按左边提示进行。见下面的窗体：当两幅图像获取完成后，程序自动弹出附图像，操作人员用鼠标移动方式，将要移动的染色体框住，松手后，程序将显示主图像，操作人员只要找一块可以放下被移动的染色体位置，点击一下鼠标，即可将附图像的染色体粘至主图像内；如需要有多条染色体复制，则重复上面的操作，直至全部复制完成，然后将主图像存盘即可。4.3 图像分割图像分割处理是将沾连与重叠染色体分开，执行图像分割处理后，弹出下面窗口。操作人员按左边的提示分别进行：除边、二值化、

10、去除杂物、染色体分割等处理。二值化时，用鼠标移动左边垂直滚动条，对图像进行二值化处理，为了观察二值化效果，可将滚动条下面的二值图小方块用鼠标点击一下，即二值化效果立即变为黑白图，二值化时应将染色体全变为黑色。弃杂操作是将核型图中非染色体的大杂物与小杂物去掉。在该操作中应保证染色体不要丢失，当染色体粘连很多时，可用鼠标将其粗略分开，然后再执行去杂操作。可以通过改变上面一排设置的面积，使去杂操作更快。在染色体分割操作中，有：分割、删除、放大分割、移动、复制、分离和连接等。用户要进行何种操作前，须用鼠标将该操作点中，然后操作。直到全部染色体相互分开为止。可以通过“灰度图像分割”与“三值图像分割”切换

11、观看果。当图像分割完成后，点击“继续进行”。4.4 染色体核型分析执行核型分析程序后，程序自动将染色体配对。4.5核型图显示与调整本功能主要用于显示核型图与人工调整核型位置。当染色体数目小于等于46条时，可执行DisP_Kar程序，当染色体数目多于46条时，可执行 Disp_BMP程序。4.5.1 DisP_Kar程序通过选择右边对染色体功能，可实现对染色体的倒置、交换、移动和旋转操作，当排队正确后，按保存键。若要输出打开，应选择“送入数据库”功能。操作人员按上面的提示进行填写，特别注意图像文件名的后缀应为.kar。4.52 DisP_BMP程序4.6 结果输出 提供了2种结果输出，一种是无表

12、格形式输出，另一种是表格形式输出。无表格形式结果输出显示如下：用鼠标点击选择记录按钮，程序弹出下面的窗口，列出数据库内容供用户选择。从数据库中选择记录后，按确定，即显示核型原图和核型分析图，见下图：在图像界面的任意位置，点击鼠标，将显示检测信息与检测结果窗体，其下面有参数与命令，如下图：参数说明： l 检查单位：输入检查单位的名称，l 标题上位置：标题在报告单上的顶位置，改变此参数可以改变标题的上下位置；l 标题左位置：标题在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变标题的左右位置，以便居中；l 图像高：包含图像与核型所占的高度；l 图像顶位置：原始图像的摆放顶位置，改变此参数可以改变原始图像的上

13、下位置；l 核型顶位置：核型图像的摆放顶位置，改变此参数可以改变核型图像的上下位置；l 核型左位置：核型图像在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变核型图像的左右位置，以便摆放居中；l 正文上位置：检测报告文件位置，改变此参数可以改变正文的上下位置；l 正文左位置：正文在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变正文的左位置；l 正文行距： 此参数改变正文行与行间的间隔。功能参数说明：打印预览：执行此命令，将图 中的内容，与图像放置成一体，并进行实际的显示。若摆放不合适，可以通过改变上面参数的值，进行调整，直至显示合适为止。u 检测单位与姓名等上下位置不合适，可改变标题上位置与图像顶位置参数；u

14、图像不合适：改变图像顶位置与核型顶位置参数；u 核型不合适，改变核型顶位置与核型左位置参数；u 报告正文不合适，改变下集上位置、正文左位置、正文行距和图像高等参数；表格形式结果输出方式操作方法完全与无表格相同。但输出的格式如下：图像保存： 将上图以文件形式保存于硬盘或其它介质中，以便在其它地方使用。按下图像保存，弹出下面文件输入窗口，输入文件后，按保存即可。打印： 按打印命令，即可从打印机上打印输入。4.7库操作可以对数据库进行删除记录等操作。删除一条记录：用光标选择要删除记录，然后按“Table_删除记录”。批量记录删除，先执行“批量删除”，弹出下面对话框，在对话框中填入开始记录和终止记录，

15、然后执行确定。当执行删除记录或批量删除后，记录并未真正删除，要正直删除，还应按“彻底删除”，即可将记录正直删除。4.8 文件备份操作：从菜单中点击文件备份与恢复，弹出下面窗口：1） 产生子目录 可以由用户选择任意盘上进行产生子目录。2） 全部备份将D：盘上的四个数据文件与图像文件的内容，备份至用户选择的磁盘中。3） 全部备份与删除除招待（3）功能外，还将D：盘的内容删除。4） 恢复备份将备份的数据文件恢复到D盘。 五、参数说明从数据库中选择记录后，按确定，即显示核型原图和核型分析图，见下图：在图像界面的任意位置，点击鼠标，将显示检测信息与检测结果窗体，其下面有参数与命令，如下图：参数说明： 检

16、查单位：输入检查单位的名称，标题上位置：标题在报告单上的顶位置，改变此参数可以改变标题的上下位置；标题左位置：标题在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变标题的左右位置，以便居中；图像高：包含图像与核型所占的高度；图像顶位置：原始图像的摆放顶位置，改变此参数可以改变原始图像的上下位置；核型顶位置：核型图像的摆放顶位置，改变此参数可以改变核型图像的上下位置；核型左位置：核型图像在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变核型图像的左右位置，以便摆放居中；正文上位置：检测报告文件位置，改变此参数可以改变正文的上下位置；正文左位置：正文在报告单上的左起位置，改变此参数可心改变正文的左位置；正文行距： 此参数改变正文行与行间的间隔。功能参数说明：打印预览：执行此命令，将图 中的内容，与图像放置