vasp 安装心得

1、VASP5.2安装心得2014-05-07 来源：小木虫作者： yysskk花了五天时间终于学会怎么装VASP了，在此写下心得体会，供后人参考。个人觉得最难的一步就是makefile文件，网上流传着各种各样的版本，每个人都说自己编译成功了，却又各不相同，也说不清为什么，给新手极大的困扰。在此会详细介绍makefile的文件结构。其余大部分内容都是参考前人的，就不一一注明出处了。一、系统、编译程序及准备工作我用的是centos6.5+icc2011+ifort2011+openmpi1.6.51.1编译器安装系统安装不说了，网上教程多得是。Icc和ifort可以申请免费非商业版本，ic

2、c和ifort都各自带了一个MKL，使用的时候别搞混了。装2011的时候会缺组件，用yum都可以免费下载。装编译器的时候会要求关闭selinux，按照给出的步骤关闭即可。之后会说系统不兼容，但是可以继续装，默认安装路径是在/opt下面。装完之后会有提示，把安装目录/bin/ifortvars.sh 写到环境变量中，注意32/64位系统的参数不一样。C语言编译器建议用icc，毕竟是intel出品，针对自家cpu肯定有大量优化，效率上高于gcc是肯定的。这是装完之后的提示：     For csh/tcsh:      

3、;  $ source install-dir/bin/compilervars.csh intel64     For bash:        $ source install-dir/bin/compilervars.sh intel64     To invoke the installed compilers:        For C+: icpc  &#

4、160;     For C: icc        For Fortran: ifort之后重启或者重新登录，输入# which icc/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/bin/intel64/icc# which ifort/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/bin/intel64/ifort能找到路径说明安装对了，然后再开始下一步，安装openmpi1.2 openmpi安装我在这里吃过很大的亏，所以单独拿

5、出来讲。Openmpi开源，网上自己下载。解压后进入文件夹，输入./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort（参考了 CentOS5.2+mkl 10.1.0.015+openmpi 1.3.2+ifort 11.0.074编译vasp5.2）icc是C语言编译，icpc是C+编译，ifort是Fortran编译，输入./configure help会有说明，这里要与VASP使用相同的编译器，不加参数的话就会调用gcc编译去了。强烈建议安装在默认目录，我第一次装没装在默认目录，之后运行需要手动加一大堆参数。之后按次序输入make,make ins

6、tall，安装完成，加入环境参数。这里要加入三个环境参数：export PATH=/usr/local/bin:$PATHexport LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib/openmpi:$LD_LIBRARY_PATHexport LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH具体路径找自己的，其中少了第三个路径的话可以编译文件，但是运行编译后的文件会说找不到库函数。强烈建议安装完成之后进入解压文件夹（不是安装目录）下的example文件夹中测试程序，输入make之后会自动编译，完成之后输入mpirun np 8 he

7、llo_f90,如果安装正确，会出现：Hello, world, I am            0  of           8Hello, world, I am            1  of           8Hello,

8、world, I am            2  of           8Hello, world, I am            3  of           8Hello, world, I am   &#

9、160;        4  of           8Hello, world, I am            5  of           8Hello, world, I am         &#

10、160;  6  of           8Hello, world, I am            7  of           88是我服务器的cpu数量。我在网上看到很多人没有经过这一步测试就直接去编译VASP，结果两个软件的错误都堆在了一起，到底哪一步错了都不知道。这里还有一个严重的错误是提示找

11、不到mpivars.sh文件，我曾经用ubuntu12.04+icc2013+ifort2013编译到了这一步，最后不得不放弃，换成了centos+2011版编译器，小木虫上的人都说是2013版有问题。其实是缺少了MPI runtime这个运行组件，这个不用注册可以直接在intel官网上下载安装（/opt/intel目录下会多出一个impi文件夹），然后把目录添加进环境变量就行了。2013版应该也能编译，当时是不知道是缺这个组件就直接重装系统了。最后就进军VASP了二、VASP.lib及其它库函数编译Lib编译非常简单，参考（CentOS5.2+mkl 10.1.0.015+openmpi 1

12、.3.2+ifort 11.0.074编译vasp5.2）把编译器路径改一下就行CPP = /opt/intel/cce/10.1.018/bin/icc -E -P -C $*.F >$*.fCC= /opt/intel/cce/10.1.018/bin/iccFC= /opt/intel/Compiler/11.0/074/bin/intel64/ifort然后make就编译完成了，会有一个警告提示，不用管。之后编译MKL和GotoBLAS, GotoBLAL可免费下载（或者完全只用MKL也行），MKL编译还是参考那篇文章，进入/opt/intel/mkl/10.1.0.015/in

13、terfaces/fftw3xf make libem64t compiler=intel 完成之后在该目录下得到一个新文件和文件夹，然后编译GotoBLAS，解压后进入文件夹，make（这个不能像上面一样加参数，没研究过怎么改编译器），最后成功会有提示，默认gcc编译。里面有一个测试文件夹，我进去之后make提示说缺少文件，不过不影响后面VASP的编译，前提是编译完GotoBLAS后有正常结束提示，会显示用的编译器和其它信息。还有一个bug是对于某些CPU编译会出错，此时要用命令make TARGET=NEHALEM，而且必须联网，编译过程中会下载文件。完成这些工作之后就

14、能进行最后一步VASP主程序编译了。三、VASP主程序编译个人觉得最难的一步莫过于编辑makefile文件，第一次看的时候就像看天书一样，虽然作者给了很多注释，但依然搞不清什么地方该注释，什么地方要取消注释。尤其是网上流行的各个makefile文件版本都不相同，让人十分困惑。makefile文件非常简单，把注释都拿掉了之后就变成：.SUFFIXES: .inc .f .f90 .F（*）SUFFIX=.f90（*）FC=/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/bin/intel64/ifortFCL=$(FC)CPP_ =  ./prep

15、rocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P C -traditional > $*$(SUFFIX) （*）CPP     = $(CPP_)  -DHOST="LinuxIFC"           -DCACHE_SIZE=12000 -DPGF90 -Davoidalloc           -DRPROMU_DGEMV  -DR

16、ACCMU_DGEMVFFLAGS =  -FR -assume byterecl -heap-arrays 64（*）OFLAG=-O2 -ip（*）OFLAG_HIGH = $(OFLAG) （*）OBJ_HIGH =（*）OBJ_NOOPT =（*）DEBUG  = -FR -O0（*）INLINE = $(OFLAG) （*）BLAS=LAPACK=LIB  = -L./vasp.5.lib -ldmy      ./vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPAC

17、K)      $(BLAS)FFT3D   =-#mpi-FC=/usr/local/bin/mpif90FCL=$(FC)CPP    = $(CPP_) -DMPI  -DHOST="LinuxIFC" -DIFC      -DCACHE_SIZE=8000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf      -DMPI_BLOCK=8000  -D

18、RPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMVBLAS=LAPACK=SCA=LIB     = -L./vasp.5.lib -ldmy        ./vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK)       $(SCA) $(LAPACK) $(BLAS)FFT3D   =这份文件可以分为两部分，前半部分有大量的注释，有很多参数路径之类的需要手动调整。后半部分是编译文件

19、的部分，调用各种程序来编译VASP，而我们关心的只是文件的前半部分。以上列出的是文件前半部分不带注释的内容，我标了（*）的地方，在文件的前半部分中是唯一的，必须要写的。不带（*）的地方，可以分为两部分，每个部分都一模一样，分别是：FC=FCL=CPP=BLAS=LAPACK=SCA=LIB=FFT3D  =可以对照着一份完整的makefile文件看一下，FC=FCL是指定的编译程序，串行是ifort,并行是mpif90.cpp是可带参数的相当于gcc的命令，貌似用来预处理？BLAS、LAPACK是相应库函数的路径，最终都会被包含在LIB路径下面（注意到LIB=最后有$(LA

20、PACK)$(BLAS)），还有就是独立的FFT3D。整个makefile的前半部分就是在选择参数和路径，用于后半部分的文件编译。带（*）的部分是必须有的，可以认为是基本参数。其余部分很明显是并行和串行编译的命令，编译的时候选其中一组就行。这一部分实际上就传递了四个变量而已，分别是编译器FC，预处理命令CPP，库函数路径LIB和FFT3D，注意到串行和并行的FFT3D文件是不一样的。BLAS、LAPACK已经被包括在了LIB中，makefile文件的后半部分是没有这两个变量的。所以这份文件就非常好理解了，串行和并行有各自独立的四个变量，调试好带（*）的基本参数，选好串行或者并行编译，其余部分注释掉就OK。现在更改库文件之类的操作就很好理解了，我使用GotoBLAS编译的