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文档简介
1、遗传密码表以及氨基酸详表-第二位碱基第二位碱基第二位碱基第二位碱基-UCAG第位碱基Uuuu (Phe/F)苯丙氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UUG (Leu/L)亮氨酸UCU (Ser/S)丝氨酸UCC (Ser/S)丝氨酸UCA (Ser/S)丝氨酸UCG (Ser/S)丝UAU 酸UAC 酸UAAUAG(Tyr/Y)酪氨(Tyr/Y)酪氨(终止)(终止)UGU (Cys/C)半胱氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UGA (终止)UGG (Trp/W)色氨氨酸nRecu (Pro/P)MCAU(His/H)组氨CGU (Arg/R)精氨第CUU (Leu/L
2、)亮氨酸氨酸CCC (Pro/P)腼酸CAC(His/H)组氨酸CGC (Arg/R)精氨位CCUC (Leu/L)亮氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸氨酸CCA (Pro/P)脯酸CAA(Gln/Q)谷氨酸CGA (Arg/R)精氨懒基CUG (Leu/L)亮氨酸氨酸酰胺酸CCG (Pro/P)脯CAG (Gln/Q)谷氨CGG (Arg/R)精氨氨酸酰胺酸ACU (Th/T)苏AAU (Asn/N)天冬AGU (Ser/S)丝氨第位碱基AAUU (Ile/I)异亮氨酸AUC (Ile/I)异亮氨酸AUA (Ile/I)异亮氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始)氨酸ACC (Thr/T)苏
3、氨酸ACA (Thr/T)苏氨酸ACG (Thr/T)苏酰胺AAC (Asn/N)天冬 酰胺AAA (Lys/K)赖氮 酸AAG (Lys/K)赖氮酸AGC (Ser/S)丝氨 酸AGA (Arg/R)精氨 酸AGG (Arg/R)精氨氨酸酸酸GCU (Ala/A)丙GAU(Asp/D)天冬GGU (Gly/G)甘氨第GUU (Val/V),氨酸氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GAC(Asp/D)天冬酸GGC (Gly/G)甘氨位碱基GGUC (Val/V)缎氨酸GUA (Val/V)缀氨酸氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GAA(GIu/E)谷氨酸GGA (Gly/G)甘氨GUG (Val/V
4、)绿氨酸氨酸酸酸GCG (Ala/A)丙GAG (Glll/E)谷氨GGG (Gly/G)甘氨氨酸酸酸密码子反表AlaAGCUzGCQGCA.GCGLeuLUUAZUUG,CUU,CUCZCUAZCUGArgRCGU,CGCZCGA/CGG,AG/K/AGGLysKAAA,AAGAsnNAAU,AACMetMAUGAspDGAU,GACPheFUUU,UUCCysCUGU,UGCProPCCUZCCC,CCA,CCGGinQCAA,CAGSerSUCUZUCCZUCA,UCG,AGU,AGCGluEGAA,GAGThrTACUzACQACAzACGGlyGGGU,GGC,GGA,GGGTrpW
5、UGGHisHCAU,CACTyrYUAU,UACHeIAUU,AUC,AUAVaiVGUUZGUC,GUA,GUG起始AUG终止UAG,UGA,UAA中文名称英文名称短写缩写缀氨酸ValineVVai酪氨酸TyrosineYTyr色氨酸TryptophanwTrp苏氨酸ThreonineTThr中文名称英文名称短写缩写丝氨酸SerinesSer硒半胱氨酸*SelenocysteineuSec毗咯赖氨酸*Pyrrolysine0Pyl脯氨酸ProlinepPro苯丙氨酸PhenylalanineFPhe蛋氨酸MethionineMMet赖氨酸LysineKLys亮氨酸LeucineLLeu异亮
6、氨酸IsoleucineIlie组氨酸HistidineHHis甘氨酸GlycineGGly谷氨酰胺GlutamineQGin谷氨酸Glutamic acid / GlutamateEGlu半胱氨酸CysteineCCys中文名称英文名称短写缩写天冬氨酸Aspartic acid / AspartateDAsp天冬酰胺AsparagineNAsn精氨酸ArginineRArg丙氨酸AlanineAAla除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N) oGlx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gin、Q)。X
7、ie、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(He、I)。Xaa (亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。结构邈翌以下是标准遗传密码所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。1-丙氨酸(Ala / A)1-精氨酸(Arg / R)天冬酰胺(Asn / N)1-天冬氨酸 (Asp / D)1-半胱氨酸 (Cys / C)一谷氨(Glu / E)谷氨酰胺(Gin / Q)甘氨酸(Gly / G)一组氨i异亮氨酸(He / I)1-亮氨酸(Leu / L)1-赖氨酸 (Lys / K)蛋氨酸(Met / M)苯丙氨酸(Phe / F)(Pro / P)RN(Tyr / Y)一缀氨酸
8、(Vai / V)一硒半胱氨酸(Sec / U)毗咯赖氨酸(Pyl / 0)主要化学性质王辑以下的分子量是根据各元素的同位素在自然界的生度所做的平均值。此外由于 形成肽键时,会减少一个水分子,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表 数值少了 18. 01524 Dao氨基酸分子量(近)£1pKi ( a -C00H)pKa ( a -M)丙氨酸89. 094046.012. 359. 87半胱氨酸121.154045. 051.9210. 70硒半胱氨酸169. 06天冬氨酸133.103842. 851.999. 90谷氨酸147.130743. 152. 109. 47苯丙氨酸1
9、65. 191845. 492. 209. 31甘氨酸75. 067146. 062. 359. 78组氨酸155.156347. 601.809. 33异亮氨酸131. 174646. 052. 329. 76赖氨酸146. 189349. 602. 169. 06哦咯赖氨酸255. 31亮氨酸131.174646.012. 339. 74蛋氨酸149. 207845. 742. 139. 28天冬酰胺132. 119045. 412. 148. 72氨基酸分子量(近)£1pKi ( a -C00H)pKa ( a -M)脯氨酸115.131946. 301.9510. 64谷氨酰
10、胺146. 145945. 652. 179.13as®174. 2027410. 761.828. 99丝氨酸105. 093445. 682. 199.21苏氨酸119.120345. 602. 099.10缀氨酸117. 147846. 002. 399. 74色氨酸204. 228445. 892. 469.41酪氨酸181.191245. 642. 209.21支链性质编辑以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。氨基 酸支链疏水 性pKa极性一电荷一香灰一脂一族 芳族或肪范德瓦尔 斯半径丙氨酸-CHsX一一67半胱氨酸-CH2sHX8. 18酸性86氨
11、基 酸支链疏水 性pKag 性电 荷芳香 族 或胆 肪族范德瓦尔 斯半径硒半胱氨 酸-CSeHX5. 73一天冬氨酸-CH2coOH一3. 90X酸性一91谷氨酸-CH2cHzcOOH一4. 07X酸性一109苯丙氨酸-CH2C6H5X芳香性135甘氨酸-H一一48组氨酸-CH2-CsHsN26. 04X弱碱 性芳香性118异亮氨胃-CH(CH$)CH2cHsX一脂肪性124赖氨酸-(CH2)龈10. 54X碱性135毗咯赖氨 酸-C12H21N3O3亮氨酸- CH2cH (绥)2X一一脂肪性124蛋氨酸-CH2CH2SCH3X一一124天冬酰胺-CH2C0NH2X96氨基 酸支链疏水 性pK
12、ag 性电 荷芳香 族 或胆 肪族范德瓦尔 斯半径脯氨酸- CH2cH2cH2-X一一一90谷氨酰胺-CH2cH3C0NH2一一X一114精氨酸-(CIDjNH-CCNH)12. 48X碱性148丝氨-CH20H一一X一一73苏氨酸-CH (OH) CH,X弱酸 性93缀氨-ch(ch$)2X一SUB脂肪性105色氨酸-CIL-CsHsNX一芳香性163酪氨酸-CHz-C 此 OHX10. 46X芳香性141基因表达与生物化学健氨基 酸短写缩 写密码子在蛋白质中 出现频率 (%)对人类的必 需性丙氨酸AAlaGCU, GCC, GCA, GCG7.8,半胱氨酸CCysUGU, UGC1.9氨基
13、 酸短写缩写密码子在蛋白质中 出现频率 (%)对人类的必 需性硒半胱氨 £USecUGA,天冬氨酸DAspGAU, GAC5.3,谷氨酸EGluGAA, GAG6.3,苯丙氨百FPheUUU, UUC3.9X甘氨酸GGlyGGU, GGC, GGA, GGG7.2,组氨酸HHisCAU, CAC2.3异亮氨酸1lieAUU, AUC, AUA5.3X赖氨KLysAAA, AAG5.9X毗咯赖氨 酸0PylUAG亮氨酸LLeuUUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG9.1X蛋氨MMetAUG2.3X天冬酰胺NAsnAAU, AAC4.3,氨基 酸短写缩写密码子在蛋白质中 出现频率 (%)对人类的必 需性脯氨酸PProCCU, CCC, CCA, CCG5.2,谷氨酰胺Q
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