千种单基因病计划

1、千种单基因病计划计划启动背景随着医学、生物学等基础学科的发展，以及相应科学技术的进步，尤其是人类基因组计划、人类单 体型图计划的启动，极大的推动了科学家对疾病在基因组学方向的研究。更多的疾病致病基因、易感基因 被人们发现，这些研究成果在临床实践中的应用，为部分疾病的治疗及用药提供了更多科学的个性化指导,让患者对于疾病也有了更为积极的态度。但在患病群体中，有一群特殊的人，他们就是罕见病患者；由于 各种原因，至今只有少数罕见病有能够医治的药物，更多的罕见病发病机理尚不明确，这些都呼唤我们给 予这个特殊的群体更多的爱和关心。自国际上将第二代测序技术运用于寻找罕见病致病基因以来，华大基 因就致力于利用

2、大规模的测序平台和强大的信息分析团队，与国内外科学家和医疗科研单位合作，力图在 几年内找出大量罕见遗传病的致病基因，为罕见病研究提供理论基础，推动罕见病的临床诊断、治疗与预 防。计划进展：2010年5月，华大基因发起“千种单基因病研究计划”。至2011年5月，国内外已有60多家科研医疗单位参与到该计划中，启动项目200多个，发表科研文章 3篇，另有多篇文章在投稿和撰写中，有 50多个项目处于后期验证阶段。计划新举措：2011年，深圳华大基因研究院决定投入专项科研经费，邀请更多的合作伙伴参与到“千种单基因病 计划”中，共同推动人类单基因遗传病的基因组学研究，为人类的健康事业做出贡献。人类孟德尔遗

3、传学的在线版本( /sites/entrez?db=omim)记录了不同遗传模式下的孟德尔遗传病、线粒体遗传病、疑似孟德尔遗传的疾病，给遗传病研究者提供了资源平台。 单基因遗传病种类涉及全身多个系统，部分疾病会累及多个组织和器官，下表列举了各个系统部分疾病。疾病系统疾病列举OMIM ID英义名中文名(注：标有“*”的为疾病的中文症状描述。视觉系统%613626MYOPIA 18; MYP18近视#613756RETINITIS PIGMENTOSA 49; RP49视网膜色素变性口腔和牙齿#217080Jalili Syndrome锥杆营养不

4、良(CRD和牙釉质发育不 全%119530OROFACIAL CLEFT1; OFC1口面裂免疫系统#611943Riddle Syndrome主要特点是对电离辐射敏感，免疫缺 陷，学习困难和不寻常的脸部外观 *#120100FAMILIAL COLD AUTOINFLAMMATORYSYNDROME 1家族性寒冷性尊麻疹呼吸系统%142340DIAPHRAGMATIC HERNIA, CONGENITAL先天性膈疝#267450Respiratory Distress Syndrome InPremature Infants早产儿呼吸窘迫综合症内分泌和代谢 系统#211180Bowen-Co

5、nradi Syndrome主要特点是低出生体重，小头，面部 畸形和不能茁壮成长*#188400Digeorge SyndromeDiGeorge氏综合症多系统疾病#203800Alstrom SyndromeAlstrom综合征常染色体隐性遗传病#302060Barth Syndrome巴特综合征X连锁遗传肌肉骨骼系统和结缔组织%166300OSTEOLYSISHEREDITARYOFCARPAIBONESWITH OR WITHOUT NEPHROPATHY遗传性的伴随或不伴随肾病腕骨骨质 溶解#610713Brachydactyly - Syndactyly Syndrome先天性并指短

6、指畸形精神健康和 行为#600795Frontotemporal Dementia, Chromosome3-Linked;Ftd33号染色体连锁性额融痴呆#609056Amish Infantile Epilepsy SyndromeAmish婴儿癫痫综合症大脑和神经 系统%601992FRIEDREICH ATAXIA2弗里德赖希共济失调%114100BASAL GANGLIA CALCIFICATION, IDIOPATHIC, CHILDHOOD-ONSET基底核钙化耳鼻喉%600674DEAFNESS, AUTOSOMAL RECESSIVE 5; DFIB5染色体隐性遗传耳聋%60

7、0792MICROTIA-ANOTIA小耳畸形-无耳畸形皮肤毛发和 指甲#308100Ichthyosis,X-Linked;XliX连锁型鱼鳞病#613737ACNE INVERSA, FAMILIAL, 3家族性座疮心血管系统#192600Cardiomyopathy,Familial Hypertrophic 1家族性肥厚型心肌病1型#613695LONG QT SYNDROME 5; LQT5QT延长综合征消化系统#211600Cholestasis,Progressive FamilialIntrahepatic,1; Pfic1进行性家族性肝内胆汁瘀积1型%609919GALLBL

8、ADDER DISEASE 3胆囊疾病血液和淋巴 系统#602014Hypomagnesemia 1,Intestinal低镁血症#312060Properdin Deficiency, X-LinkedX连锁备解素缺乏泌尿和生殖 系统#125800Diabetes Insipidus,Nephrogenic, Autosomal肾性尿崩症%279000YOUNG SYNDROME扬氏综合征先天性肿瘤#156530Metatropic Dysplasia变形性骨发育不良#155755Melanoma-Astrocytoma Syndrome黑色素瘤-星形细胞瘤综合征单基因遗传病的基因组学研究方

9、法:高通量测序技术的迅猛发展，给科学家带来了一个不容错过的历史机遇，尤其是单基因遗传病致病 基因的研究。国际上应用高通量测序技术研究单基因遗传病的报道近年来层出不穷，主要的研究策略为以 下三种：外显子捕获测序、目标区域捕获测序、全基因组重测序。下表中列举了利用以上三种策略寻找到单基因遗传病致病基因的案例:文早名期刊名策略测序样本Exome sequencing identifies the cause of a mendilian disorderNature Genetics全外显子捕获 测序三个独立家系 的四名米勒综 合症患者Whole-GenomeSequencing in a Patient withCharcot-Marie-ToothNeuropathyThe NEW ENGLANDJOURNAL ofMEDICINE全基因组重测 序11先证者WDR62 is associated with the spindle pole and is