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文档简介

1、    中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶基因克隆与序列分析    刘巧英+李梦歌+刘雪飞+余昊+王运兵摘要:采用兼并引物和race的技术,在中黑盲蝽(adelphocoris suturalis jakovlev)中获得丝氨酸蛋白酶的全长cdna序列,将该基因命名为asjsp,cdna全长为958 bp,开放阅读框为885 bp,推测编码295个氨基酸,预计分子量为31.20 kda,等电点pi为9.38,预测分子式为c1 374h2 222n390o407s15,不稳定系数为31.94,总亲水性系数为0.114,为疏水性稳定蛋白质。序列分析表明asjsp与其他盲蝽

2、科昆虫已知丝氨酸蛋白酶的核苷酸序列一致性为55.70%。关键词:中黑盲蝽(adelphocoris suturalis jakovlev);丝氨酸蛋白酶;rt-pcr;序列分析:s433.3 :a :0439-8114(2016)21-5659-05doi:10.14088/ki.issn0439-8114.2016.21.056cloning and sequence analysis of serine proteinase of adelphocoris suturalis jakovlevliu qiao-ying, li meng-ge, liu xue-fei, yu hao, w

3、ang yun-bing(school of resourse and environment science,henan institute of science and techology,xinxiang 453003,henan,china)abstract: rt-pcr with degenerate primers and race were used to amplify partial cdna fragments and full cdna,one serine protease gene from adelphocoris suturalis jakovlev was i

4、dentified, designated asjsp. the full-length cdnas of asjsp is 958 bp,this gene contains 885 bp open-reading frames(orf) which encodes a putative 295 amino acid protein,with a predicted molecular mass of 31.20 kda and isoeletric point(pi) of 9.38. its predicted molecular formula is c1 374h2 222n390o

5、407s15. bioinformatical analysis showed that it is a instability index is 31.94 and the gravy 0.114,suggesting that it is a stable hydrophobic protein. sequences analysis showed that asjsp had 55.70% identity with complete serine protease genes from other miridae insects.key words:adelphocoris sutur

6、alis jakovlev;serine proteinase;rt-pcr;sequence analysis絲氨酸蛋白酶主要消化昆虫食物中的蛋白质类营养物质,并参与合成与降解昆虫体内的蛋白质,是大多数昆虫消化系统内较为重要的消化酶,其主要包含弹性蛋白酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白酶等1-5。目前,已有一些关于半翅目盲蝽科昆虫的丝氨酸蛋白酶方面报道,研究发现lygus rugulipennis和creontiades dilutus等盲蝽科昆虫唾液中富含胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶类6-9,豆荚盲蝽lygus hesperus唾液腺内的总蛋白酶活性也以胰蛋白酶活性为主10-12。zhu等13发现美国牧草

7、盲蝽取食后,主要依靠其唾液腺内的丝氨酸蛋白酶先进行初步消化,之后其他肠道内的蛋白酶进一步消化,吸收蛋白质类营养物质,且丝氨酸蛋白酶的活性占其唾液腺内总蛋白酶活性的80%。以上研究结果说明,在半翅目昆虫消化系统内丝氨酸蛋白酶是较重要的消化酶。中黑盲蝽(adelphocoris suturalis jakovlev)为半翅目盲蝽科昆虫,是中国一种重要的盲蝽类害虫,广泛分布于长江流域和黄河流域14。中黑盲蝽的寄主植物种类众多,已报道有100余种,包括棉花等多种作物15。20世纪90年代末,由于农业产业结构调整以及bt棉花广泛种植减少化学农药的使用等原因,中黑盲蝽种群数量上升、为害加重,成为中国棉花等

8、作物的主要害虫16-19。由于其食性杂、天敌控制作用弱、寄主广泛及行动敏捷等特点,在作物大面积生产时增加了一定的防控测报难度。虽然,在一些半翅目盲蝽科植食性昆虫种类上,针对丝氨酸蛋白酶类消化酶已进行了分子生物学方面的研究,如豆荚盲蝽lygus hesperus及美国牧草盲蝽,但是目前关于中黑盲蝽的研究国内鲜见报道。本研究采用rt-pcr和race技术,克隆中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶基因的cdna序列asjsp,并对其进行初步分析,以期为中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶的分子消化机制奠定基础。1 材料与方法1.1 试验材料供试虫源:中黑盲蝽成虫采自河南省新乡县,采回后在实验室用新鲜四季豆人工饲养,室内温度条件(2

9、6±0.5) ,相对湿度60%70%,光周期168 h(ld)。饲养密度为4060头/盒,供试所用昆虫为羽化后的中黑盲蝽成虫。 1.2 试剂和仪器主要试剂:rna提取试剂盒(reeasy mini kit)购自qiagen公司。cdna第一链合成试剂盒(primerscript 1st strand cdna synthesis kit)购自宝生物工程有限公司。胶回收试剂盒(gel extraction kit)购自omega公司。marker 、marker 购自tiangen公司。depc购自上海索莱宝科技有限公司。50×tae缓冲液购自上海双螺旋生物科技有限公司。其他

10、所用化学试剂为国产分析纯。仪器:neofuge 13r型高速台式冷冻离心机;tgradient型梯度pcr仪;jy600c型君仪电泳仪和jy-sp-bt型电泳槽;tanon3500型tanon凝胶成像系统;skanit re for multiskan go 3.2型全波长酶标仪;eppendorf移液枪;pyx-300q-a型智能光照培养箱;jj-cj-1fd型超净工作台。1.3 试验方法1.3.1 中黑盲蝽总rna的提取 将实验室饲养的中黑盲蝽成虫置于1.5 ml预冷的离心管中,加适量液氮研磨至粉末,按照rna提取试剂盒(reeasy mini kit)的具体方法提取中黑盲蝽总rna。1.

11、3.2 中间片段的获取 cdna的第一链合成按试剂盒(primerscript 1st strand cdna synthesis kit)说明书进行。pcr反应体系包括depc-treat water 34.75 l,10×pcr buffer 5 l,10 mmol/l dntps 4 l,正向引物2 l,反向引物2 l,cdna 2 l,taq酶0.25 l。pcr反应热循环参数:预变性94 3 min;94 变性 30 s,54 退火40 s,72 延伸10 min,34个循环;72 延伸10 min。正向引物序列:5-tcgtccaagccgactcat-3。反向引物序列:

12、5-acgcagatagcagcaca-3。1.3.3 全長cdna的获取 3端cdna扩增:反应采用3race system for rapid amplification of cdna ends(invitrogen)推荐的方法进行, 以总rna为模板,反转录酶合成cdna。再以反转录产物为模板,用引物5-gcctcttccatcaacttcaac-3与通用引物uap配对扩增3端。pcr产物稀释100倍作为模板,用上游引物5-agaactctgactgtttgtccg-3与下游引物uap进行第二次pcr,扩增产物回收、测序。5端cdna 扩增:按照5race system for rap

13、id amplification of cdna ends(version 2.0)推荐方法进行,以总rna为模板,用引物5-caagggtgtatctgttg-3,在反转录酶催化下合成cdna。转录产物经s.n.a.p纯化后进行tdt 加尾。最后,以加尾产物为模板,用引物5-ggtggtgtcaagtttctttgg-3与通用引物aap进行5端扩增。1.3.4 pcr产物的回收与序列测定 pcr扩增产物在1%的琼脂糖凝胶上进行电泳,在凝胶成像系统中观察并保存结果,切割目的条带按照凝胶回收试剂盒(gel extraction kit)的方法回收pcr产物,并于-20 保存回收目的产物。最后,将

14、纯化后的pcr产物送生工生物工程有限公司进行测序。1.4 数据分析采用blast获得的全长cdna序列,使用clustalx1.8 软件对这些序列进行比对。采用软件mega4.0进行kimura双参数遗传距离分析,构建nj进化树,bootstrap估算重复1 000次,检验分子系统树各处的置信度。利用tmpred软件(http://software/tmpred_form.html)预测跨膜结构;采用expasy生物信息学资源网站的protparam工具(http://protparam/)分析基本理化性质及protscale工具(

15、http://tools/protscale.html)分析疏水性;使用signalp工具(http:/www.cbs.dtu.dk/services/signalp/)预测信号肽。2 结果与分析2.1 总rna的提取及测序结果通过检测,提取的中黑盲蝽成虫rna的od260 nm/od280 nm值为1.926,当od260 nm/od280 nm>1.8时,说明样品纯度较高,可以满足后续试验的要求。经测序,得到中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶cdna基因,命名为asjsp,长度为958 bp,推测其开放阅读框为885 bp,编码295个氨基酸,以atg为起始密码子,以ta

16、g为终止密码,结果如图1所示。2.2 序列同源性分析由图2可知,中黑盲蝽asjsp与其他盲蝽科昆虫已知丝氨酸蛋白酶的蛋白序列的一致性为55.70%。asjsp与creontiades dilutus(登录号:aal15154.1)的一致性为84.41%;与绿盲蝽apolygus lucorum(登录号:afx73399.1)的一致性为32.93%;与其他盲蝽科的丝氨酸蛋白酶蛋白序列的一致性均大于31.64%。2.3 不同目丝氨酸蛋白酶的系统发育树应用mega4.0软件neighbor joining(nj)法对包括asjsp在内的10种不同种类昆虫的丝氨酸蛋白酶进行系统发育进化树的构建(图3)

17、。结果显示,膜翅目、鞘翅目、半翅目昆虫丝氨酸蛋白酶较为分化,位于不同的分支上,可能与该目昆虫食性的不同及繁多的种有一定关系。中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶asjsp先与creontiades dilutus聚在一起,又跟绿盲蝽apolygus lucorum聚在一起,说明中黑盲蝽与creontiades dilutus(登录号:aal15154.1)进化关系最近,与绿盲蝽apolygus lucorum(登录号:jq609682.1)进化关系次之,与其他7种昆虫的进化关系较远。 2.4 中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶基本理化性质预测分析通过expasy生物信息学资源网站的protparam工具推测中黑盲蝽丝氨酸蛋

18、白酶的基本理化性质,发现此蛋白质共包含295个氨基酸,预测分子式为c1 374h2 222n390o407s15,理论分子量为31.20 kda,等电点pi为9.38,不稳定系数为31.94,摩尔消光系数为33 055,总平均亲水性系数为0.114,故推测此蛋白质为稳定的疏水性蛋白质。使用tmpred软件预测跨膜结构,发现其有3个跨膜区,分别位于第120,5976和198215位,故推测该蛋白质为跨膜蛋白质。使用signalp工具对信号肽进行预测,发现中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶基因asjsp所编码的蛋白质具有信号肽结构,该信号肽位于120位氨基酸残基处。3 讨论通過rt-pcr和race技术获得了丝

19、氨酸蛋白酶基因的全长cdna序列asjsp。通过对比氨基酸序列的同源性,asjsp与其他盲蝽科昆虫已知丝氨酸蛋白酶的氨基酸序列的一致性为55.70%,与creontiades dilutus(登录号:aal15154.1)的一致性最高,推测获得的克隆蛋白序列是丝氨酸蛋白酶家族中的一员。经过生物信息学分析,推测中黑盲蝽丝氨酸蛋白酶基因asjsp所编码的蛋白质是一个疏水蛋白质,信号肽的切割位点可能是前20位氨基酸。研究表明,丝氨酸蛋白酶是昆虫消化系统中较为重要的蛋白酶。如华北大黑鳃金龟(holotrichia oblita)的丝氨酸蛋白酶hosp1、棉铃虫(helicoverpa armigera

20、)的丝氨酸蛋白酶ha-tlp及桔小实蝇(bactroceran)的丝氨酸蛋白酶bdorser,这些酶在消化系统中均发挥重要作用20-22。绿盲蝽(apolygus lucorum)取食不同的寄主植物后,其丝氨酸蛋白酶基因alsp3和alsp4在不同性别成虫的体内表达量均有明显差异23,24。为深入地探究中黑盲蝽的消化系统中丝氨酸蛋白酶的作用,本研究获得中黑盲蝽的丝氨酸蛋白酶基因,同时为以后研究中黑盲蝽体内的消化代谢提供理论基础。参考文献:1 ryan c a. protease inhibitors in plants:genes for improving defenses against

21、insects and pathogensj.annual review of phytopathology,1990,28(1):425-449.2 wolfson j l,murdock l l.diversity in digestive proteinase activity among insectsj.journal of chemical ecology, 1990,16(4):1089-1102.3 johnston k a,lee m j,gatehouse j a,et al. the partial purification and characterisation of

22、 serine protease activity in midgut of larval helicoverpa armigeraj.insect biochemistry,1991,21(4):389-397.4 christeller j t,laing w a,markwick n p,et al. midgut protease activities in 12 phytophagous lepidopteran larvae:dietary and protease inhibitor interactionsj.insect biochemistry and molecular

23、biology,1992,22(7):735-746.5 colebatch g,cooper p,east p.cdna cloning of a salivary chymotrypsin-like protease and the identification of six additional cdnas encoding putative digestive proteases from the green mirid,creontiades dilutus(hemiptera:miridae)j. insect biochemistry and molecular biology,

24、2002,32(9):1065-1075.6 goodchild a j p.a study of the digestive system of the west african cacao capsid bugs (hemiptera, miridae)c.proc zool soc lond,1952,122:543-572.7 hori k. some variations in the activities of salivary amylase and protease of lygus disponsi linnavuori:hemiptera:miridaej.applied

25、entomology and zoology,1970,5(2):51-61.8 cohen a c. organization of digestion and preliminary characterization of salivary trypsin-like enzymes in a predaceous heteropteran,zelus renardiij.journal of insect physiology,1993, 39(10):823-829. 9 colebatch g,east p,cooper p.preliminary characterisation o

26、f digestive proteases of the green mirid,creontiades dilutus(hemiptera:miridae)j.insect biochemistry and molecular biology,2001,31(4):415-423.10 agusti n,cohen a c. lygus hesperus and l. lineolaris (hemiptera:miridae),phytophages,zoophages,or omnivores:evidence of feeding adaptations suggested by th

27、e salivary and midgut digestive enzymesj.journal of entomological science, 2000,35(2):176-186.11 zeng f,zhu y,cohen a.partial characterization of trypsin-like protease and molecular cloning of a trypsin-like precursor cdna in salivary glands of lygus lineolarisj.comparative biochemistry and physiolo

28、gy part b:biochemistry and molecular biology,2002,131(3):453-463.12 zeng f,zhu y c,cohen a c.molecular cloning and partial characterization of a trypsin-like protein in salivary glands of lygus hesperus(hemiptera:miridae)j.insect biochemistry and molecular biology,2002,32(4):455-464.13 zhu y c,zeng

29、f,oppert b. molecular cloning of trypsin-like cdnas and comparison of proteinase activities in the salivary glands and gut of the tarnished plant bug lygus lineolaris(heteroptera:miridae)j.insect biochemistry and molecular biology,2003,33(9):889-899.14 lu y,wu k,jiang y,et al. mirid bug outbreaks in multiple crops correlated with wide-scale adoption of bt cotton in chinaj. science,2010,328(5982):1151-1154.15 陸宴辉,吴孔明.棉花盲椿象及其防治m.北京:金盾出版社,2008.16 吴孔明.我国bt棉花商业化的环境影响与风险管理策略j.农业

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