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文档简介
1、论文实例:遗传性牙龈纤维瘤病和牙本质生成不全作者简介:肖尚喜,男,1969年12月出生,1997年 09月师从于中国科学技术大学刘兢教授,于xx年03月获 博士学位。摘要遗传性牙龈纤维瘤病 (hereditarygingivalfibromatosis, hgf)是一种较罕见 口腔遗传性疾病,有孤立和综合征两种发病形式。其主要 的遗传方式为常染色体显性遗传。临床特征为上下颌牙龈或全口牙龈呈慢性、进行性、弥漫性增生肥大, 严重影响美观和口腔功能。最近,该病的致病基因被定位 于2p21区11c m的候选区域。为了进一步方便克隆hgf的 致病基因,我们收集了国内5个hgf家系。利用2p21区域 更精
2、细的strp标记,将候选区域定位于d2s 2144和d2s21 63两个位点之间,与hart报道的候选区域有的重叠区。 ncx 1和calm2过去一直被认为是2个重要的疾病候选基因, 现已被反射杂种制图的结果排除在我们定位的候选区域之 外。我们的cp突变筛选结果显示,该候选区域另4个重要 的候选基因 cyp1b1. prkr、prkcn、fez2 以及应用 g ecan、 genfi nder和grail预测出的功能与hgf相关的ncx1样的 基因都与hgf无因果关系。此外,在收集的5个家系中,睢宁家系的所有患者都 是在一周岁以内患病,而其它家系都在2岁以后才开始发 病,因此我们称之为早发性牙
3、龈纤维瘤病。该家系的致病 基因不与2p21的str标记连锁,全基因组扫描和连锁分析 将该家系的hgf致病基因定位于5ql3-q22的d 5s1404和 d5s 1462两位点之间。首次运用家系连锁分析的方法为hgf 表型异质性提供了分子遗传学基础。牙本质生成不全是一种常染色体显性遗传性疾病,其 病因为牙本质生成和矿化紊乱。最近,该病的致病基因的 候选区域已从的范围缩小到。我们利用国内5个dgi-ii大 家系,将致病基因的候选区域进一步缩小至800kbo突变筛 选试验的结果显示,在淮阴家系中,d基因第三内含子剪接 位点的供位gt突变为at,在转录过程中可能导致d基因第 三外显子的缺失;在南京家系
4、中,d基因第一外显子的最后 一位密码子cca颠换为aca(p17t);在徐州家系中,d基因 第二外显子的第一位密码子gtt转换为ttt (v18f) o其它 基因都没有与dgi-i i呈因果关系的突变,只是发现了一些 编码区的单核昔酸态(c)o但我们不能排除这些基因的内 含子和以及一些调节区可能存在的突变。800kb的区域相对 较小、易于操作,因此我们构建了覆盖候选区域的 baccont igs,同时也构建了候选区域高覆盖率的b ac测序 亚克隆库,为建立候选区域的转录图谱及测序提供了基 础。关键词:遗传性牙龈纤维瘤病牙本质生成不全ti型定 位候选克隆全基因组扫描连锁分析mainga ndcl
5、oningo fhereditar ygingivalfibromatosi sanddent inogenesis imperfecta, typellhe reditarygi ngivalfibr omatosis(h gf)isanoralinheritablediseasecharacterizedbyaslowlyprogreiveenlargementofthegingivaltiuessurroundingboththemaxillaryandthemand, anautosomaldominantgingivalfibionoftheunderlyinggenesreoibl
6、eforthedisorder, wecollectedfiveher editarygin givalfi,high-resol utionradia tionhybrid maingshowedthattwoimportantgenes, calm2andncxlwhichprevio,prkr, prkcn, pez2andtheotherrelevantgene (ncx-like)whi chwaspredi ctedbygeca n, genfinde randgrailfailedtorevealanydisease-ecificmutatioinaffectedindividu
7、alsandnormalcontrols, suggestingthatmutatiointhesegenesmaynotplayacausativer oleinthepa thogenesis ofdisorder allaffectedindividualsinthefifthfamily (pedigree )“ early-oettype ” , w eidentifiedanewgeneticlinkage ( zmax= 0 =), andthetelomericboundarytod5s1453aumingcompietepenetranceandnophenocopy.den
8、tinog enesisimperfectatypeii,ehavedemotratedthatagtoatraitionwasdetectedinthedonorlicesite (gt)(p17t).agtottaversationinthefirinnon - codingandregulationalregioofthesegenes,thebaccontigsaingthecriticalintervalwerecrmapandthesequenceoftheregionandw illaidinth eultimatec loningofth edgi-iiloc usinotherd giiiofthe regionandw illaidinth eultimatec loningifth edgi-iiloc usinotherd giilfamil ies,
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