细菌的分类及命名

1、一、细菌分类学一、细菌分类学对细菌进行对细菌进行分类，分类，命名与鉴定命名与鉴定的的 一门学科。一门学科。任务：任务：在全面了解在全面了解细菌生物学特征细菌生物学特征的基础上，的基础上，研究它们的研究它们的种类种类，探索其，探索其起源起源，演化演化以以及与及与其他类群之间的亲缘关系其他类群之间的亲缘关系，进而提，进而提出能反映出能反映自然发展的分类系自然发展的分类系统，并将细统，并将细菌加菌加以分门别类以分门别类。细菌分类学细菌分类学包括分类，命名和鉴定包括分类，命名和鉴定1、细菌分类：、细菌分类：根据细菌各自的特征，并根据细菌各自的特征，并按照按照亲缘关系亲缘关系分类，以不同等级分类，以不同

2、等级编排系编排系统统。分类有两种：。分类有两种： 细菌的生理生化分类法细菌的生理生化分类法，包括有传，包括有传统分类法和数值分类法。统分类法和数值分类法。 细菌核酸、蛋白质结构的同源程度细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法进行分类法，称种系分类或自然分类。，称种系分类或自然分类。2、细菌命名、细菌命名：在分类基础上，给每种：在分类基础上，给每种细菌一个细菌一个科学名称科学名称，便于交流并保证所，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。有的科研工作者给予同样名称。3、细菌鉴定：、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则，将未知细菌按分类原则，确定细菌的分类地位确定细菌的分类地位。 古菌古菌细菌细菌

3、3、细菌的分类单元、细菌的分类单元 细菌的分类单元与动植物一样，依次为细菌的分类单元与动植物一样，依次为科及科以上的划分在细菌不太完善，且随科及科以上的划分在细菌不太完善，且随着研究的深入科属的划分会发生变动着研究的深入科属的划分会发生变动Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus RosenbachRosenbach 1884 1884属名葡萄球菌属名葡萄球菌种名金黄色种名金黄色命名人的姓命名人的姓命名年份命名年份金黄色葡萄球菌的学名为金黄色葡萄球菌的学名为Peptostreptococcus foetidusPeptostreptococcus f

4、oetidus （ VeillonVeillon ）SmithSmith属名消化链球菌属名消化链球菌种名恶臭种名恶臭原命名者原命名者改名者恶臭消化链球菌的学名恶臭消化链球菌的学名恶臭消化链球菌是由恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的首先发现和定名的，后，后 Smith 重新定为现名。重新定为现名。 这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有应用价值。应用价值。形态形态染色染色培养培养细胞壁结构细胞壁结构生理生化生理生化抗原特性抗原特性1）DNA碱基碱基G

5、+C%比例的测定比例的测定u亲缘关系相近的种比也相近，亲缘关系相近的种比也相近，比差别大亲缘关系必然远比差别大亲缘关系必然远（G+C）%=100% A+T+G+CG+C简称简称GC比比u种内差距种内差距2.54.0, 种间种间5%, 属间属间差距差距10% 2）核酸分子杂交法）核酸分子杂交法DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA 方法方法: : u待测菌株待测菌株dsDNA-ssDNA u参照菌株，同位素标记的参照菌株，同位素标记的ssDNA检测杂合检测杂合DNA的放射性强度的放射性强度，参照菌株自，参照菌株自身为身为DNA复性的放射性强度复性的放射性强度100% uDNA-DN

6、A杂交同源性性杂交同源性性 60%为同种为同种 70%同一亚种同一亚种 2060%为同一属为同一属3）rRNA寡核苷酸编目分析寡核苷酸编目分析urRNA是细胞中的是细胞中的“活化石活化石”原核生物：原核生物：23s、16s、5s 真核生物：真核生物：28s、18s、5.8s u16s或或18s用作系统分类用作系统分类：（提出三域：（提出三域学说）学说）u生理功能重要又恒定、含量高易提取、生理功能重要又恒定、含量高易提取、核苷酸序列保守、分子质量适中、信息核苷酸序列保守、分子质量适中、信息量大易于分析量大易于分析球菌球菌杆菌杆菌丝状或树枝状丝状或树枝状葡萄球菌葡萄球菌链球菌链球菌粪肠球菌粪肠球菌

7、微球菌微球菌MZN染色阴性染色阴性MZN染色阳性染色阳性牛放线菌牛放线菌粘性放线菌粘性放线菌星形奴卡菌星形奴卡菌刚果嗜皮菌刚果嗜皮菌产芽胞产芽胞无芽胞无芽胞抗酸染色阳性抗酸染色阳性抗酸染色阴性抗酸染色阴性梭菌梭菌芽胞杆菌芽胞杆菌炭疽杆菌炭疽杆菌分支杆菌分支杆菌牛分支杆菌和禽分支杆菌牛分支杆菌和禽分支杆菌鼠麻风杆菌鼠麻风杆菌副结核分支菌副结核分支菌棒状杆菌棒状杆菌化脓放线菌化脓放线菌马红球菌马红球菌产单核李氏杆菌产单核李氏杆菌猪丹毒杆菌猪丹毒杆菌球菌球菌/球杆菌球杆菌杆菌杆菌MZN染色阴性染色阴性MZN染色阴性染色阴性弧状杆菌弧状杆菌中等大小杆菌中等大小杆菌螺旋状菌螺旋状菌丝状菌丝状菌弯曲菌弯曲菌弧菌弧菌耐瑟菌耐瑟菌生摩拉菌生摩拉菌不动杆菌不动杆菌肠杆菌科肠杆菌科