蛋白质和蛋白质药物ppt课件

1、1基因信息传递基因信息传递第第 三三 篇篇欢 迎2(二二) 蛋白质的构象蛋白质的构象(conformation)l蛋白质的分子构象又称空间结构、立体结构、高级结构或三维构象等。它包括二级结构，三级结构和四级结构。l 蛋白质分子构象是指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列分布及肽键的走向。3维持蛋白质构象的化学键维持蛋白质构象的化学键 l 蛋白质一级结构的主要化学键是肽键也有少量二硫键。而维蛋白质一级结构的主要化学键是肽键也有少量二硫键。而维持蛋白质空间结构的化学键主要是一些次极键。次极键虽然键能持蛋白质空间结构的化学键主要是一些次极键。次极键虽然键能小，稳定性差，但由于数目众多，因此在维持

2、蛋白质分子的空间小，稳定性差，但由于数目众多，因此在维持蛋白质分子的空间构象中起极为重要的作用。构象中起极为重要的作用。l主要的次极键有：氢键，疏水键，盐键，配位键主要的次极键有：氢键，疏水键，盐键，配位键, 二硫键。二硫键。4l1、氢键、氢键 由连接在一个电负性大的原子上的由连接在一个电负性大的原子上的H与另一个电负性大的原与另一个电负性大的原子相互作用而成，氢键是次极键中键能最弱的，但数目最多，所子相互作用而成，氢键是次极键中键能最弱的，但数目最多，所以是最重要的次极键，也是维持蛋白质二级结构的主要次极键。以是最重要的次极键，也是维持蛋白质二级结构的主要次极键。l2、疏水键、疏水键 由两个

3、非极性基团，因避开水相而群集在一起的作用力，是由两个非极性基团，因避开水相而群集在一起的作用力，是维持蛋白质三级，四级结构的主要次极键。维持蛋白质三级，四级结构的主要次极键。 5l3、盐键、盐键(又叫离子键又叫离子键) 它是蛋白质分子中带正电荷基团和负电荷基团之间的静电吸引它是蛋白质分子中带正电荷基团和负电荷基团之间的静电吸引所形成的化学键。所形成的化学键。l4、配位键、配位键 蛋白质与金属离子结合中，常含有配位键，如细胞色素，血红蛋白质与金属离子结合中，常含有配位键，如细胞色素，血红蛋白等均含有铁与蛋白质形成的配位键。蛋白等均含有铁与蛋白质形成的配位键。l5、二硫键、二硫键 是由两个硫原子间

4、所形成的化学键是由两个硫原子间所形成的化学键(较强的化学键较强的化学键)。 * *蛋白质三级结构的稳定主要靠次级键，包括氢键、盐键、疏水键以及范德华力蛋白质三级结构的稳定主要靠次级键，包括氢键、盐键、疏水键以及范德华力( (Van der Wasls力力) )等。等。 二硫键二硫键6.7HNCOCRHHNCOCRHNHCOCRHHNCOHNCOCRHCOHN氢键氢键8谷赖CH(CH2)2NHCO_CCOCOH(CH2)4NHONH3+氨酸氨酸盐键盐键9氨天门冬CHONHCCCOCOHCH2NHO丝酸氨酸CH2酯键酯键10CCHNHCOCHCH3CH2CH3CH3CH2CH3CHNHCO疏水键疏

5、水键 *蛋白质的二级结构是指多肽链中主链原子的局部蛋白质的二级结构是指多肽链中主链原子的局部空间排布，不涉及侧链部分的构象。空间排布，不涉及侧链部分的构象。二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构(secondary structure)(secondary structure)主要化学键：主要化学键：氢键氢键二级结构的主链结构单元二级结构的主链结构单元肽单元肽单元11.12多肽链的主链结构多肽链的主链结构 *肽单元肽单元 参与肽键的参与肽键的6个原子个原子 C1、C、H、O、N、C2处于处于同一平面，称为肽单元同一平面，称为肽单元C1、C2为为反式构反式构型型13.14C CC C33C C

6、22C C11C CNNNNHHHHHHOOOOR R肽平面肽平面 1肽平面肽平面 2-螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠(-pleated sheet)-转角转角 (turn or -bend)无规卷曲无规卷曲 (random coil) 肽单元上肽单元上C所连的两个单键的自由旋转角度，决定两个相连肽单元的相对空间所连的两个单键的自由旋转角度，决定两个相连肽单元的相对空间位置，由于旋转角度的不同，形成了几种二级结构形式：位置，由于旋转角度的不同，形成了几种二级结构形式：15.16左手螺旋与右手螺旋左手螺旋与右手螺旋17螺旋主要的结构特点螺旋主要的结构特点右手型螺旋结构模型18螺旋主要的结构

7、特点螺旋主要的结构特点俯视图19二级结构（二级结构（ -螺旋、分子内氢键螺旋、分子内氢键) C ONHCRCHONC OCHHCNHCRCHONHHNCOCHOCCHONHCRCHORR氢键氢键氢键氢键0.54nm20 ONHONHRRONHONHRRONHONHRONHONHRRONHONHRRONHONHR氢键氢键多肽链多肽链 -折叠形构象折叠形构象 21*-helix：以以-碳原子为转折点，碳原子为转折点，以肽键平面为单位，以肽键平面为单位，盘曲成右手螺旋状的盘曲成右手螺旋状的结构。结构。螺旋上升一圈含螺旋上升一圈含3.6个氨基酸残基，螺距个氨基酸残基，螺距0.54nm氨基酸的侧链伸向氨

8、基酸的侧链伸向螺旋的外侧。螺旋的外侧。螺旋的稳定是靠氢螺旋的稳定是靠氢键。氢键方向与长轴键。氢键方向与长轴平行。平行。结构特点结构特点氢氢键键 2223-螺旋v（1）螺旋走向，稳定以氢键连接，氢键与轴平行。v（2）侧基R伸向螺旋外侧。v（3）棒状结构，高度压缩，紧密排列。v（4）规律排列v（5）由1条充分伸展的肽链的肽键平面折叠成的右手螺旋。v（6）每隔3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm。v（7）1个螺圈内有13个原子。24 四种不同的-螺旋模型25三股螺旋三股螺旋又称胶原螺旋、超螺旋 胶原纤维中原胶原蛋白分子的排列26胶原蛋白的三股螺旋胶原蛋白的三股螺旋272 2、-折叠折叠(

9、 (-片层片层) )28b-折叠折叠(b-片层片层)-pleated sheet1）多肽链充分伸展，每个肽单元以）多肽链充分伸展，每个肽单元以C 为旋转点，折叠成锯齿状的结构，为旋转点，折叠成锯齿状的结构，R基团交替的位于锯齿状结构上下方。基团交替的位于锯齿状结构上下方。2）两条以上的肽链或一条肽链内的若干肽段并行排列，走向可以相同，也）两条以上的肽链或一条肽链内的若干肽段并行排列，走向可以相同，也可以不同。可以不同。3） -pleated sheet的稳定靠氢键。的稳定靠氢键。29.30两条以上肽链并列时两条以上肽链并列时, -片层有片层有顺向顺向反向反向平行平行3132 -折叠v-折叠是由

10、两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩状-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直，两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm。v-折叠有两种类型。一种为平行式，即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式，即相邻两条肽链的方向相反。33折叠结构折叠结构折叠片示意图34-螺旋和螺旋和 - -折叠结构比较折叠结构比较区别点区别点 -螺旋螺旋 -折叠折叠形形 状状 螺旋状螺旋状 锯齿状锯齿状氢氢 键键 链内，与长轴平行链内，与长轴平行 链间，与长轴垂直链间，与长轴垂直R基团基团 较大较大 较小较小延伸性延伸性 较大较大 较小较小

11、升升1AA残基高度残基高度 0 .15nm 0.36nm举举 例例 毛发角蛋白毛发角蛋白 蚕丝蛋白蚕丝蛋白353 3、 -转角和无规卷曲转角和无规卷曲HCNCONHHCCHOCR3NHCOCHR2R4R1HHCNCONHHCCHOCR3NHCOCHR2R4R1H36转角转角转角结构通常负责各种二级结构单元之间的连接作用，它对于确定肽链的走向起着决定性的作用。37转角结构转角结构转角38转角结构转角结构转角39turn and random coil氢键氢键无规卷曲无规卷曲:是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 40-转角v-转角也称-回折或发夹结

12、构，存在于球状蛋白中。v在-转角部分，由四个氨基酸残基组成;v弯曲处的第一个氨基酸残基的 -C=O 和第四个残基的 N-H 之间形成氢键，形成一个不很稳定的环状结构。41无规卷曲无规卷曲42无规卷曲无规卷曲多肽链主链不规则随机盘曲形成的构象。无规卷曲与生物活性有关，对外界理化因子极为敏感。43 三. “模体模体”（motif）-超二级结构超二级结构 一个蛋白质分子中可以有二个或三个具有二级结构的肽段，在空间位置上相一个蛋白质分子中可以有二个或三个具有二级结构的肽段，在空间位置上相互接近，形成特殊的空间结构。互接近，形成特殊的空间结构。44.45超二级结构超二级结构超二级结构是指二级结构的基本结

13、构单位（螺旋、折叠等）相互聚集，形成有规律的二级结构的聚集体。三级结构的构件（1）（2）（3）迂回（4）折叠桶(5) 超二级结构可直接作为三级机构的“模模体体”（motif）或结构域的组成单位，是）或结构域的组成单位，是介于二级结构和结构域之间的一个结构介于二级结构和结构域之间的一个结构层次，这主要是氨基酸侧链基团相互作层次，这主要是氨基酸侧链基团相互作用的结果。用的结果。46若干相邻的二级结构单元组合在一起，相互作用，形成有规则的（在空间上可若干相邻的二级结构单元组合在一起，相互作用，形成有规则的（在空间上可辨认的）二级结构组合体。辨认的）二级结构组合体。常见类型：常见类型：、 47（1 1

14、）复绕螺旋4849（2 2）单元的手性5051（3 3）迂回迂回 A.迂回 B.希腊钥匙 C.双希腊钥匙52（4 4）折叠桶折叠桶 反平行折叠桶折叠桶的各种形式53（5 5）54组合组合 组合组合55超二级结构类型超二级结构类型 X 56三、结构域结构域的定义 多肽链上由相邻二级结构单元联系而成的局部性区域是多肽链的独立折叠单位结构域的大小变化很大 常见的范围在100-200个残基之间57结构域结构域(structural domain) l结构域是蛋白质三维折叠中的一个层次，主要是相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构，在此基础上，进一步折叠成近乎球状，相对独立的三维实体，这个区域称为结

15、构域。l 由此可见：结构域： 1）构成基础是超二级结构，2）相当独立区域，3）属于三级结构。l 而超二级结构概念：蛋白质分子中-螺旋，-折叠，-转角等集合在一起，彼此相互作用，形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体，称超二级结构，有三种类型。 58结构域免疫球蛋白最突出的例子59结构域木瓜蛋白酶内的2个结构域彼此很不相同60结构域弹性蛋白酶的二个结构域彼此非常相似61细胞色素细胞色素b 乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 免疫球蛋白免疫球蛋白62五、蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构指多肽链中所有氨基酸残基的空间关系，其具有二级结构、超二级结构或结构域蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构( (tertiary

16、 structure) ) *蛋白质的三级结构是指在各种二级结构的基础上再进一步盘曲或折迭。也就蛋白质的三级结构是指在各种二级结构的基础上再进一步盘曲或折迭。也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。 肌红蛋白肌红蛋白（myoglobin，Mb）一条）一条多肽链多肽链/血红素辅基血红素辅基/153个氨基酸个氨基酸/有有8段段-螺旋螺旋结构结构(A、B、C、D、E、F、G及及H）功能功能: 储存储存O263.64J.C.Kendrew和和M.F.Peruz用用X-衍射法测定了血红蛋白衍射法测定了血红蛋白和肌红蛋白的三级结构获得和肌红蛋白的三级结构获得了了

17、1962年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖65血红素的结构式血红素的结构式肌红蛋白结合氧示意图肌红蛋白结合氧示意图吡咯环/甲炔基桥/配位键66.67蛋白质的三级结构总结v蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在二级结构基础上，肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。v维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水键，在蛋白质三级结构中起着重要作用。六、蛋白质的四级结构六、蛋白质的四级结构（quaternary structure）二条或二条以上具有独立三级结构的多肽二条或二条以上具有独立三级结构的

18、多肽链通过次级键形成的空间结构。其中，每链通过次级键形成的空间结构。其中，每个具有独立三级结构的多肽链称为亚基个具有独立三级结构的多肽链称为亚基(subunit)(subunit)。 血红蛋白结构示意图血红蛋白结构示意图 主要稳定因素：氢键、离子键主要稳定因素：氢键、离子键蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局及相互作用，称为蛋基接触部位的布局及相互作用，称为蛋白质的四级结构。白质的四级结构。68.69蛋白质的四级结构 70(2) 蛋白质的四级结构是由两个或两个以上的亚基之间相互作用，彼此以非共价键相连而形成的更复杂的构象。四级结构实际上就是亚基的

19、立体排布、相互作用及接触部位的布局。 维持蛋白质四级结构的主要化学键是疏水键，它是由亚基间氨基酸残基的疏水基相互作用而形成的。亚基之间不含共价键，亚基间次级键的结合比二、三级结构疏松，因此在一定的条件下，四级结构的蛋白质可分离为其组成的亚基，而亚基本身构象仍可不变。 71一种蛋白质中，亚基结构可以相同，也可以不同。相同的称为同型亚基，不同的则称为异型亚基。如烟草斑纹病毒的外壳蛋白是由2200个相同的亚基形成的多聚体；正常人血红蛋白A是两个亚基与两个亚基形成的四聚体；天冬氨酸氨甲酰基转移酶由六个调节亚基与六个催化亚基组成。由210个亚基组成具有四级结构的蛋白质称为寡聚体，更多亚基数目构成的蛋白质

20、则称为多聚体。 72没有四级结构的蛋白质：没有四级结构的蛋白质：1. 1. 只有一条多肽链的蛋白质。只有一条多肽链的蛋白质。2. 2. 虽然有多条多肽链，但他借助于共价虽然有多条多肽链，但他借助于共价 键相连（如：胰岛素和键相连（如：胰岛素和IgGIgG等等3. 3. 多聚体、多酶复合体、不属于四级结构范畴。多聚体、多酶复合体、不属于四级结构范畴。73胰岛素的二聚体胰岛素的二聚体74蛋白质的四级结构总结v蛋白质的四级结构(Quaternary Structure)是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式；各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系

21、。v这种蛋白质分子中，最小的单位通常称为亚基或亚单位Subunit，它一般由一条肽链构成，无生理活性；v维持亚基之间的化学键主要是疏水力。v由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白；7576四级结构四级结构 77蛋白质的结构蛋白质的结构78 小小 结结79蛋白质的结构层次可总结为蛋白质的结构层次可总结为: :一级结构（肽链结构，指多肽链中的氨基酸排列顺序）一级结构（肽链结构，指多肽链中的氨基酸排列顺序）二级结构（多肽链主链骨架盘绕折叠形成的有规律性的结构）二级结构（多肽链主链骨架盘绕折叠形成的有规律性的结构）超二级结构（相邻二级结构的聚集体）超二级结构（相邻二级结构的聚集体）结构域（在空间上

22、可明显区分的相对独立的区域性结构）结构域（在空间上可明显区分的相对独立的区域性结构）三级结构（球状蛋白质中所有原子在空间的相对位置）三级结构（球状蛋白质中所有原子在空间的相对位置）四级结构（亚基聚合体）四级结构（亚基聚合体）8081氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键，均为次级键氢键、范德华力虽然键能小，但数量大疏水相互作用力对维持三级结构特别重要盐键数量小二硫键对稳定蛋白质构象很重要，二硫键越多，蛋白质分子构象越稳定离子键离子键氢键氢键范德华力范德华力疏水相互作用力疏水相互作用力82七蛋白质和多肽合成基本原理七蛋白质和多肽合成基本原理 化学合成法（自学）化学合成法（自学）蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成 在生物技术突飞猛进的今天，医药生物技术首先在该在生物技术突飞猛进的今天，医药生物技术首先在该领域取得突破性进展，在新药研究，开发，生产和改造传领域取得突破性进展，在新药研究，开发，生产和改造传统制药工业中，医药生物技术的应用越来越广泛。其中蛋统制药工业中，医药生物技术的应用越来越广泛。其中蛋白质和多肽类药物以及单克隆抗体的研究开发在现代生物白质和多肽类药物以及单克隆抗体的研究开