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文档简介
1、第五讲第五讲 拉丁方实验拉丁方实验 1 知识目标: ?掌握拉丁方试验设计方法; ?掌握拉丁方试验结果统计分析方法。 技能目标: ?学会拉丁方试验设计; ?学会拉丁方试验结果统计分析。 2 例 1: 某农场为饲养肉用仔鸡而配制的 “维生素添加剂” 的 试验,不仅记录 分析它对生长发育的效果 ,而且还计 算出喂青料 (对照组) 每 只 鸡分担青 料费用和试验组(喂维生素添加剂)每 只鸡分担的费用 ,进而 计 算 出 饲喂 维生素添加剂的肉鸡全年可节约的费。 完全方案 在列出因素水平组合(即处理组)时 ,要求每一 个因素的每个水平都要碰见一次,这时,水平组 合(即处理组)数等于各个因素水平数的乘积。
2、 例如以3种饲料配方对3个品种肉鸡进行试验。 两个因素分别为饲料配方(A)、肉鸡品种(B)。 饲料配方(A)分为 A1、 A2、 A 3水平, 品种(B) 分为B1、B2、B3水平 。共有 A 1B1、A1B2、A1B3、 A2B1、 A2B2、 A 2B3、 A3B1、 A3B2、A3B3 共33=9 个水平组合(处理)。这 9个水平组合(即处理组) 就构成了这两个因素的试验方案。 (二)拟定试验方案 1、根据试验的目的、任务和条件挑选试验因素 拟定方案时,在正确掌握生产中存在的问题后, 对试验目的、任务进行仔细分析,抓住关键,突 出重点。 首先要挑选对试验指标影响较大的关键因素。 若只考察
3、一个因素,则可采用单因素试验。若是 考察两个以上因素,则应采用多因素试验。如进 行猪饲料添加某种微量元素的饲养试验,在拟定 试验方案时,设置一个添加一定剂量微量元素的 处理和不添加微量元素的对照,得到 一 个包 含2 个处理的单因素试验方案 或设置几个加不同剂量微量元素处理组、一个 不添加微量元素对照,即一个包含多个处理的单因 素试验方案。若进行微量元素不同添加剂量与不同 品种猪的饲养试验,则安排一个二因素试验方案。 注意:一个试验中研究的因素不宜过多,否则 处理数太多,试验过于宠大,试验干扰因素难以控 制。凡是能用简单方案的试验,就不用复杂方案。 2、根据各试验因素的性质分清水平间差异 各因
4、素水平可根据不同课题、因素的特点及 动物的反应能力来确定,以使处理的效应容易表现 出来。 (1)水平的数目要适当 水平数目过多,不仅难以反映出各水平间的 差异,而且加大了处理数;水平数太少又容易漏 掉一些好的信息,至使结果分析不全面。 (2)水平间的差异要合理 有些因素在数量等级上只需少量的差异就反映 出不同处理的效应。如饲料中微量元素的添加等。 而有些则需较大的差异才能反应出不同处理效应 来,如饲料用量等。 (3)试验方案中各因素水平的排列要灵 活掌握 采用等差法(等间距法)、等比法和随机法3 种。以玉米赤霉醇为例说明: 等差法 是指各相邻两个水平数量之差相等, 如赋形剂(不含玉米赤霉醇)各
5、水平的排列为: 10mg、20mg、30mg,其中20mg为中心水平, 向上向下都相隔10mg。 等比法 是指各相邻两个水平的数量比值相同, 如赋形剂各水平的排列为 7.5mg 、15mg 、30mg 、 60mg, 相邻两水平之比为1:2。 随机法 是指因素各水平随机排列,如赋形剂 各水平排列为15mg、10mg、40mg 、30mg各水 平的数量无一定关系。 3、试验方案中必须设立作为比较标准的对照 动物试验 目的:通过比较来鉴别处理效应大小、 好坏等。则试验方案应包括:各试验处理,比较 的对照 。任何试验都不能缺少对照,否则就不能 显示出试验的处理效果 。根据研究的目的与内容, 选择不同
6、的对照形式。 如进行添加微量元素试验中,添加微量元素为 处理组,不添加微量元素为对照,此时对照为空 白对照。进行几种微量元素添加量的比较试验。 各个处理可 互为对照,不必再设对照。在 对某种动物作生理生化指标检验时,所得数据 是否异常应与动物的正常值作比较,动物的正 常值就是所谓的 标准对照。在杂交试验中,要 确定杂交优势的大小,须以亲本作对照,这就 是试验对照。 另外, 自身对照,即处理与对照在同一动 物上进行,如动物 用药前与用药后生理指标的 比较等。 处理间比较时,除了试验处理不同外,其它 所有条件应当尽量一致,才具有可比性,使处 理间的比较结果可靠。 如 不同种鼠的药物比较试验 ,各参
7、试鼠除 了品种不同外,其它如性别、年龄、体重等应 一致,饲料和饲养管理等条件都应相同,才能 准确评定品种的优劣。 试验处理间遵循唯一差异原则 三、完全随机设计的优缺点 完全随机设计是一种最简单的设计方法: 完全随机设计的主要优点 1、设计容易 处理数与重复数都不受限制, 适用于试验条件、环境、试验动物差异较小的 试验。 2、统计分析简单 无论所获得的试验资 料各处理重复数相同与否,都可采用 t 检验或 方差分析法进行统计分析。 完全随机设计的完全随机设计的主要缺点主要缺点 1、由于未应用试验设计三原则中的 局部控制原则 ,非 试 验因素的影响被归 入试验误差,试验误差较大,试验的精确 性较低。
8、 2、在试验条件、环境、试验动物差 异较大时,不宜采用此种设计方法。 随机单位组设计随机单位组设计 随机单位组设计的主要优点:随机单位组设计的主要优点: * 设计与分析方法简单易行。 * 由于随机单位组设计体现了试验设计三原 则,在对试验结果进行分析时,将 单位组间的变 异从试验误差中分离出来 ,有效地降低试验误差, 提高了试验精确性。 * 把条件一致的实验动物分在同一单位组, 再将同一单位组的实验动物随机分配到不同处理 组内,加大了处理组间的可比性。 随机单位组设计的随机单位组设计的主要缺点主要缺点 处理数目过多 ,各单位组内的供试动物数数 目也多,使各单位组内供试动物的 初始条件一致 有一
9、定难度 ,故在随机单位组设计中,处理数要 不超过20为宜。 配对设计是处理数为2的随机单位组设计,其 优点是结果分析简单,试验误差通常比非配对设 计小,但 试验动物配对要求严格,不允许将不满 足配对要求的试验动物随意配对。 第六节第六节 拉丁方实验设计拉丁方实验设计 拉丁方设计是从 横行和直列两 个方向进行 双重局部控制 ,使得 横 行和直列两向皆成单位组的设计。 在拉丁方设计中,每一行或每一列 都成为一个完全单位组,而每一处 理在每一行或每一列都只出现一次, 即在拉丁方设计中: 16 试验处理数 = 横行单位组数 = 直列单位组数=试验处理的重复数。 ?在拉丁方设计试验结果统计分析时, 由于
10、能将横行、直列二个单位组间的 变异从试验误差中分离出来,故拉丁 方设计的 试验误差比随机单位组设计 小,试验精确性比随机单位组设计高 17 拉丁方简介 以 n 个 拉 丁 字 母 A, B,C, 为元素,列出一个 n 阶方阵,若这 n 个拉丁方字母在这 n 阶方阵的每一行、 每一列都出现、且只出现一次,则称 该 n 阶方阵 为nn 阶 拉 丁方阵。 例如: A B B A B A A B 为22阶拉丁方,22阶拉丁方只 有这两个。 A B C B C A C A B 为33阶拉丁方。 第一行与第一列的拉丁字母按自然顺序 排列的拉丁方,叫标准型拉丁方。 33阶标准型拉丁方只有上面1种, 44阶标
11、准型拉丁方有4种, 55阶标准型拉丁方有56种。若变换标 准型的行或列,可得到更多种的拉丁方。 进行拉丁方设计时,可从上述多种拉丁 方中随机选择一种;或选择一种标准型,随 机改变其行列顺序后再使用。 常用拉丁方常用拉丁方 在 动 物 试 验 中,最 常 用 的 有33,44, 55,66阶拉丁方。如 标准型拉丁方,供进 行拉丁方设计时选用。 拉丁方实验设计方法 例4:为研究 5种不同 温度对蛋鸡产 蛋量的影响,将 5栋鸡舍温度 设为A、B、 C、D、E,把各栋鸡舍的 鸡群产蛋期 分 为5期,由于各 鸡群和产蛋期的不同对 产蛋量有较大的影响,因此采用拉丁方 设计,把鸡群和产蛋期作为单位组设置,
12、以便控制这两个方面的系统误差。 一. 选择拉丁方 要根据试验处理数即横行、直列单位组 数先确定采用几阶拉丁方,再选择标准型拉 丁方或非标准型拉丁方。 例4:试验因素为温度, 处理数为 5;鸡群 为直列单位组因素, 直列单位组数 为5;将 产蛋期作为横行单位组因素,横行单位组数 亦为5,即试验处理数、直列单位组数、横 行单位组数均为5,故应选取55阶拉丁方 拉丁方设计步骤: 25 A B C D E B A D E C C E B A D D C E B A E D A C B 本例选取第2个5 5标准型拉丁方 二. 随机排列 在选定拉丁方之后,若是非标准 型,则可直接由拉丁方中的字母获得 试验
13、设计。若是标准型拉丁方,还应 按下列要求对直列、横行和试验处理 的顺序进行随机排列。 33标准型拉丁方 : 直列随机 排列,再将第二和第三横行随机排列。 44标准型拉丁方 : 先随机选择4个 标准型拉丁方中的一个;再 将 所 有直列 和第二、三、四横行随机排列,或 将 所 有的直列、横行随机排列;最后将处理随 机排列。 55标准型拉丁方 :先随机选择 4个 标准型拉丁方中的一个;然后将所有的 直 列、横行及处理都随机排列。 ? 对选定的对选定的55标准型拉丁方进行随机排列标准型拉丁方进行随机排列: ? 先从随机数字表()第 22行、第8列97 开始,向右连续抄录3个5位数,抄录时舍 去“0”、
14、“6以上的数”和重复出现的数, 抄录的3个五位数字为:13542,41523, 34521。 ? 再将上面选定的55拉丁方的直列、横行 及处理按这 3个五位数的顺序重新随机排 列。 28 1、直列随机 将拉丁方的各直列 顺序按13542顺序重排。 2、横行随机 再 将直列重排后的 拉丁方的各横行按41523顺序重排 3、把5种不同温度按第三个 5位数34521顺序 排列 即:A=3,B=4,C=5,D=2,E=1,从而 得出55拉丁方设计,如下表: 括号内数字表示 温度编号;第一鸡群在第个 产蛋期用第2种温度,第二鸡群在第个产蛋期用 第1种温度,.。试验要严格按此设计实施 试验结果的统计分析
15、试验结果分析:是将两个单位组因素与试 验因素一起,按 三因素试验单独观测值的方 差分析法进行 ,要 假 定 3个因素之间不存在 交互作用。将横行单位组因素记为 A ,直列 单位组因素记为B,处理因素记为C,横行单 位组数、直列单位组数与处理数记为r,对拉 丁方试验结果进行方差分析的数学模型为: (i = j = k = 1,2,r) 式中: m 为总平均数; ai 为第i 横行单位组效应; 为第j直列单位组效应, 为第k处理效应。 单位组效应? i、 通常是随机的,处理效应 通 常 是固定的,且有 ; 为随机误差,相互独立,且都服从N(0,2) )()()(kijkjikij x?am? j
16、? )(k ? j ? )(k ? 0 1 )( ? ? ? ? ? k k )(kij ? 33 注 意: k 不是独立的下标,因为i、j 一经 确定,k 亦随之确定。 变异和自由度划分式为: SST = SSA+SSB+SSC+SS e dfT = df A+ dfB+ dfC +dfe 例例4 试验结果 5种不同温度对产蛋量影响试验结果 对表4-2资料进行方差分析: 1、计算各项平方和与自由度 矫正数 C = x2./r 2 = 5492/52 = 12056.04 总平方和 SST =x 2ij(k)-C = 232 + 212 + 192 12056.04 = 12157 12056
17、.04 = 100.96 横行平方和 SS A =x 2i./r- C =(1082+1052+1042)/5-12056.04 = 27.36 直列平方和 SS B =x 2.j/ r C = (1092+1082+1062)/5-12056.04 = 22.16 处理组平方和 SSC =x 2(k)/ r - C =(116 2+1142+1012)/5-12056.04 = 33.36 37 总自由度 dfT= r 2-1=52-1=24 横行自由度 dfA= r-1=5-1=4 直列自由度 dfB= r-1=5-1=4 误差平方和 SS e= SS T- SS A- SS B- SS
18、c =100.96-33.36-27.36-22.16 = 18.08 处理自由度 dfC= r-1=5-1=4 误差自由度 dfe=dfT-dfA-dfB-dfC =24444=12 2、列出方差分析表,进行 F 检验 经F 检验,产蛋期间和鸡群间差异显著, 温度间差异显著。 在拉丁方设计中,横行、直列单位组因 素是为控制和降低试验误差而设置的非试验 因素,即使显著一般也不对单位组间进行多 重比较。下面对不同温度平均产蛋量间作进 行多重比较。 3、多重比较 列出多重比较表,见下表。 标准误为: 由dfe = 12和k = 2,3,4,5从q值表查 得临界q值:q0.05和q0.01,并与 相
19、乘得 值,列于下表: 55. 055 . 1?nMSS ex x S a LSR 不同温度平均产蛋量多重比较表(q法) 多重比较结果表明:温度A、B、D平 均产蛋量显著地高于E,即第3、4、2种温 度的平均产蛋量显著高于第 1种温度的平 均产蛋量,其余之间差异不显著。第1种 和第5种温度平均产蛋量最低。 q 值和LSR值表 拉丁方实验设计方法拉丁方实验设计方法 例8 下表是家兔在不同部位注射某药物后生疱疹 的尺寸。家兔共6只,编号为、 、。注射部位6处,代号为a、b、c、d、e、 f,其a、b、c在脊椎,d、e、f在两侧,注射次 序用1、2、3、4、5、6表示。该表为:第一次 注射1号兔在b处
20、注射,所生疱疹为7.5 cm2 ; 号兔在e处注射,所生疱疹为8.5 cm2 ;余类推。 可见,资料是按家兔编号、注射部位、注射次 序三个标志来分组的。这种分组与一般的按三 个标志的分组(如性别、年龄、病型)又不一 样,而是按拉丁方实验设计安排的。 42 表中可见,三个分组因素各分六组,且每次 注射时(纵行)没有相同的部位,每个动物 (横行)也没有重复的部位,即拉丁方的同一 纵行内与同一横行内没有相同的字母, 这是拉丁方设计的要求。 这种设计既控制了动物的个别 差异,也控 制了因注射日期(次序)不同而可能产生的差 异,因此其设计控制得更为严密 常用的拉丁方见前表 44 方差分析方差分析 ? 求
21、校正数 c(264.2)2/361938.93 ? 总离均差平方和=(7.52+8.52+7.32+ +7.12+7.32)-(264.2) 2/36=53.02 ? 动物间离均方和 SS动物= ? 注射次序间 SS注射= ? 部位间 SS部位= ? 误差 53.0212.1815.936.3413.14 18.1293.1938 6 1 .457 .514 .41 222 ? ? ? ? ? 34. 693.1938 6 8 .427 .467 .41 222 ? ? ? ? ? 45 93.1593.1938 6 7.433.4443 222 ? ? 家兔疱疹资料的方差分析 方差分析 自由
22、 度 离均差平方和 均方 f F 0.05(5,20) 总计 35 53.02 动物间 5 15.93 3.18 4.84 2.71* 注射次序间 5 12.18 2.43 3.69 部位间 5 6.34 1.23 1.87 误差 20 13.14 0.657 46 家兔部位间的f值小于2.71 ,差别不显著; 各家兔间、注射次序间有显著性差异 拉丁方设计优点 1、精确性高 在不增加试验单位情况下,比随机单位 组设计多设置了一个单位组因素,能将横行 和直列两个单位组间的变异从试验误差中分 离出来,故试验误差比随机单位组设计小, 试验精确性也比随机单位组设计高。 2、试验结果的分析简便 拉丁方设
23、计的优缺点拉丁方设计的优缺点 拉丁方设计的主要缺点 横行单位组数,直列单位组数,试验处理数与试验 处理重复数必须相等,则处理数受到一定限制 处理数少,则重复数少,估计试验误差自由度 就小,影响检验灵敏度;若处理数多,则重复数 多,横/直列单位组数也多,使试验量大,同一单 位组内试验动物初始条件亦难一致。故只宜用5-8 个处理试验。 在4个以下处理的设计中,为使估计误差自由 度不少于12,可采用 复拉丁方设计,同一个拉丁 方试验重复进行数次,将试验数据合并分析,以 增加误差项自由度。 试验时,某些单位组因素,如动物的药效阶段, 试验因素各处理要逐个在不同药效阶段实施,如 果前一阶段有残效,在后一
24、阶段试验中,就 会 产 生系统误差,影响试验的准确性。应根据实际情 况,安排适当的试验间歇期以消除残效。 横行、直列单位组因素与试验因素间不存在交 互作用 ,否则不能采用拉丁方设计。 拉丁方试验的注意事项 在生物医学试验研究中,对于单因素或 两因素试验,因其因素少 ,试验的设计 、 实施与分析都比较简单 。 但在实际研究中 ,常需同时考察 3个或 以上试验因素 。若全面试验 ,则试验规模 很大 ,常因试验条件限制而难于实施 正交设计就是安排多因素试验 、寻求最 优水平组合的一种高效率试验设计方法。 50 定量分析中的常见错误辨析定量分析中的常见错误辨析 ?忽视t检验方差分析的前提条件; ?误用
25、成组分析t检验分析配对的资料; ?误用t检验处理析因设计的资料; ?误用t检验处理重复测量3因素设计资 料; 51 思思 考考 题 题 忽视忽视t检验检验方差分析的前提条件方差分析的前提条件 题目:血清肿瘤标志在结直肠癌诊断中作用。研究 CEA、 CA19-9、CA72、CA242,4项肿瘤标志在术前、术后及 转移复发有无差异,分别检测 58名术前患者,30名术 后患者,19名转移复发患者的 4项指标,并进行 t检验, 结果如下: 不同时期 CEA ( g/L ) CA19-9 (10 3U/L) CA 73-4 (10 3U/L) CA 242 (10 3U/L) 术前 n=58 34.0
26、79.0 209.0 73 9.0 7.2 4.8 111.0 197 .0 术后 n=30 2.02.2* 11.0 10. 9* 4.3 2.8* * 210.8 17. 5* 转移复发 n=19 88.0 107. 0 212.0 52 9.0 9.8 3.2 148.0 240 52 与术前比较,*:p0.05, *: p 0.01 分析:标准差是均值2倍以上,为偏态分布, 组间标准差悬殊,方差不齐,不能t检验; 资料分术前、术后、复发,是一个因素3个 水平,t 检验仅使用于单组、配对、成组 资料; 正确方法:选择偏态的秩和检验;单因素3 水平的方差分析; 53 误用成组分析t检验分析
27、配对的资料 ? 题目:动脉插管灌注化疗几栓塞治疗恶性细胞肿瘤。 插管技术对8例恶性细胞肿瘤进行灌注化疗,测治疗前 后的血hcc放免值,并进行t检验分析p0.05,结果如 下:(绒促性素) 病例 灌注治疗前 X 1 灌注治疗前 X 2 lgX 1 lgX 2 1 1280000 210000 6.1072 5.3222 2 75500 3300 4.08779 3.5185 3 12450 2210 4.0952 3.34444 4 1500000 9.3 6.1761 0.9685 5 10000 2500 4.000 0.3979 6 9700 1203 3.9868 3.0803 7 15
28、88 4825 4.1928 3.6835 8 4223 914 3.6256 2.9609 54 ? 分析:1. 为自身配对设计。原作者把治疗前后 数据当成独立数据,把治疗前后当成成组设计成组设计 用t 检验分析,与设计不符。2. 对数变化后,依 然要进行正态性分析,经检验,对数后仍然不不 正态,故不适合t检验 ? 正确方法:1. 计算治疗前后的差值,将其转化 为单组设计资料,比较差值的均值与0的差别是 否有统计学意义;2. 对差值也要进行适当变化, 并正态检验,是否满足 t 检验条件。 55 误用t检验处理析因设计的资料 ? 题目:格列本脲对糖尿病及正常大鼠心肌磺酸类 药物受体mRNA的影
29、响。将大鼠分成 4组,格列本 脲治疗对正常与糖尿病大鼠心肌 Sur 1, SUR2, Kir 6.2 的影响, 结果如下,并采用 t检验分析: 组 别 鼠 数 SUR 1 SUR 2 Kir 6.2 糖尿病组 8 3510 15235 356 糖尿病格列本脲治疗组 14 3414 15351 367 非糖尿病组 9 318 11941 378 非糖尿病格列本脲治疗组 13 4317* 16251* * 419 56 与非糖尿病组比较:与非糖尿病组比较:* t =2.2, P=0.039; * t =2.1, P=0.045 ? 分析:4组,实际是2因素(是否患病、是否服药 )、 2水平(是、否);只用组别表示,掩盖了因素间个 水平的相互关系,误以为是 1因素4水平; t检验 分析是错误的; ? 正确方法:要用2因素2水平的方差分析,确定可 能存在的交互作用效应。 有无糖尿 病 是否服格列本脲 鼠 数 SUR 1 SUR 2 Kir 6.2 有 不服 8 3510 15235 356 有 服 14 3414 15351 367 无 不服 9 318 11941 378 无 服 13 4317 16251 419 57 误用t检验处理重复测量3因素设计资料 题目:腹膜透析患者应用转换酶抑制剂(AC
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