第十二章蛋白质的生物合成翻译

1、蛋白质的生物合成（翻译）Protein Biosynthesis，Translation,第 十 二 章,蛋白质生物合成（翻译,蛋白质生物合成是指以mRNA为模板合成蛋白质多肽链的过程；多肽链中的氨基酸排列顺序是由模板mRNA中的密码子决定的，因此这一过程又称翻译,1,DNA,RNA,蛋白质,转录,翻译,逆转录,复制,遗传信息传递 的中心法则,蛋白质的生物合成（翻译,翻译后的修饰,蛋白质合成后 的定向运输,抗菌药物,蛋白质合成体系Protein Biosynthesis System,第 一 节,20种氨基酸(AA)作为原料 酶及众多蛋白因子，如：IF、eIF ATP、GTP、无机离子,参与蛋

2、白质生物合成的物质包括,三种RNA mRNA（messenger RNA, 信使RNA） rRNA（ribosomal RNA, 核蛋白体RNA） tRNA（transfer RNA, 转移RNA,一、翻译模板mRNA及遗传密码,mRNA是遗传信息的携带者,遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位，转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质，为多顺反子(polycistron) 。 真核mRNA只编码一种蛋白质，为单顺反子(single cistron),mRNA上存在遗传密码 (19611965年 Marshall Niren

3、berg等1968年 Robert W. Holley，Har Gobind Khorana，Marshall W. Nirenberg,mRNA分子上从5至3方向，由AUG开始，每3个核苷酸为一组，决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号，称为三联体密码(triplet codon,起始密码(initiation codon): AUG （GUG少数原核,终止密码(termination codon): UAA，UAG，UGA,从mRNA 5端起始密码子AUG到3端终止密码子之间的核苷酸序列，各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链，称为开放阅读框架(open reading f

4、rame, ORF,5.UAAAGGGUAUG.UAAAGAAAGA3,ORF,1. 连续性(commaless,遗传密码的特点,编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读，密码间既无间断也无交叉,UAAGAUGAACAGCUUAUGAUGC,AUG,AGC,AAC,UUA,基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生插入或缺失，可能导致框移突变(frameshift mutation,赏花归去马如飞， 去马如飞酒力微。 酒力微醒时已暮， 醒时已暮赏花归,赏花归去马如飞酒力微醒时已暮 采莲人在绿杨津一阙新歌声嗽玉,重叠基因（噬菌体、线粒体DNA 、质粒DNA、细菌染色体、病毒,2. 简并性(de

5、generacy,遗传密码中，除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外，其余氨基酸有2、3、4个或多至6个三联体为其编码,目 录,简并性(degeneracy,目 录,偏爱性,大肠杆菌核糖体蛋白中亮氨酸（89）使用频率 1209个密码子 UUA UUG CUU CUC CUA CUG 1 2 4 3 0 79,3. 通用性(universal,蛋白质生物合成的整套密码，从原核生物到人类都通用。 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。 已发现少数例外，如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体,4. 摆动性(wobble,转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结合

6、，但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律，称为摆动配对,U,摆动配对,目 录,密码子、反密码子配对的摆动现象,二、核蛋白体是多肽链合成的装置,目 录,1950年,不同细胞核蛋白体的组成,核蛋白体的组成,目 录,原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式,A位：氨基酰位 (aminoacyl site,P位：肽酰位 (peptidyl site,E位：排出位 (exit site,目 录,三、tRNA与氨基酸的活化,反密码环,氨基酸臂,tRNA的三级结构示意图,tRNA与酶结合的模型,tRNA,氨基酰-tRNA合成酶,ATP,氨基酸,一）氨基酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA sy

7、nthetase,氨基酸的活化,第一步反应,氨基酸 ATP-E 氨基酰-AMP-E AMP PPi,目 录,第二步反应,氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰-tRNA AMP E,目 录,氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。 氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。 氨基酰-tRNA的表示方法： Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet,真核生物： Met-tRNAiMet 原核生物： fMet-tRNAifMet,二）起始肽链合成的氨基酰-tRNA,蛋白质生物合成过程 The Process o

8、f Protein Biosynthesis,第 二 节,翻译的起始(initiation) 翻译的延长(elongation) 翻译的终止(termination,整个翻译过程可分为,翻译过程从阅读框架的5-AUG开始，按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链，直至终止密码出现,一、肽链合成起始,指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物 (translational initiation complex,原核、真核生物各种起始因子的生物功能,一）原核生物翻译起始复合物形成,核蛋白体大小亚基分离； mRNA在小亚基定位结合； 起始氨基酰-tRNA的结合； 核蛋白体大

9、亚基结合,IF-3,IF-1,1. 核蛋白体大小亚基分离,目 录,IF-3,IF-1,2. mRNA在小亚基定位结合,目 录,S-D序列 （Shine-Dalgarno序列，核蛋白体结合位点,IF-3,IF-1,3. 起始氨基酰tRNA( fMet-tRNAimet )结合到小亚基,目 录,IF-3,IF-1,IF-2,GTP,GDP,Pi,4. 核蛋白体大亚基结合，起始复合物形成,目 录,IF-3,IF-1,IF-2,GTP,GDP,Pi,目 录,二）真核生物翻译起始复合物形成,核蛋白体大小亚基分离； 起始氨基酰-tRNA结合； mRNA在核蛋白体小亚基就位； 核蛋白体大亚基结合,eIF-3

10、,eIF-2B,1. 核蛋白体大小亚基分离,目 录,60S,40S,eIF-6,IF-1,2.起始氨基酰-tRNA结合,IF-6,40S,IF-3,3. mRNA在小亚基定位结合,目 录,eIF-6,40S,eIF-3,4. 核蛋白体大亚基结合，起始复合物形成,目 录,目 录,40S,Met,5帽子,3PolyA尾,终止密码子,AUG,60S,二、肽链合成延长,指根据mRNA密码序列的指导，依次添加氨基酸从N端向C端延伸肽链，直到合成终止的过程,肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行，又称为核蛋白体循环(ribosomal cycle)，每次循环增加一个氨基酸，包括以下三步： 进位(entran

11、ce) 成肽(peptide bond formation) 转位(translocation,延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation factor, EF) 原核生物：EF-T (EF-Tu, EF-Ts) EF-G 真核生物：EF-1 、EF-2,肽链合成的延长因子,又称注册(registration,一）进位,指根据mRNA下一组遗传密码指导，使相应氨基酰-tRNA进入核蛋白体A位。 核蛋白体对氨基酰-tRNA进位具有校正作用,目 录,延长因子EF-T催化进位（原核生物,目 录,Tu,Ts,GTP,GDP,Tu,Ts,GTP,目 录,二）成肽,是由（数种大亚基蛋白）转肽酶

12、(transpeptidase)催化的肽键形成过程,三）转位,延长因子EF-G有转位酶( translocase )活性，可结合并水解1分子GTP，促进核蛋白体向mRNA的3侧移动,fMet,fMet,目 录,真核生物肽链合成的延长过程与原核基本相似，但有不同的反应体系和延长因子。 另外，真核细胞核蛋白体没有E位，转位时卸载的tRNA直接从P位脱落,四）真核生物延长过程,三、肽链合成的终止,当mRNA上终止密码出现后，多肽链合成停止，肽链从肽酰-tRNA中释出，mRNA、核蛋白体等分离，这些过程称为肽链合成终止,终止相关的蛋白因子称为释放因子 (release factor, RF,一是识别终

13、止密码，如RF-1特异识别UAA、UAG；而RF-2可识别UAA、UGA。 二是诱导转肽酶改变为酯酶活性，相当于催化肽酰基转移到水分子-OH上，使肽链从核蛋白体上释放,释放因子的功能,原核生物释放因子：RF-1，RF-2，RF-3 真核生物释放因子：eRF,原核肽链合成终止过程,RF,目 录,核蛋白体循环（广义,指核蛋白体从肽链合成起始到肽链合成终止释放后，又重新合成新的肽链的循环过程,翻译的能量消耗： 活化 ：2ATP 进位 1GTP 转位 1 GTP 合成一个AA至少需要 4 ATP,多聚核蛋白体(polysome,使蛋白质合成高速、高效进行,目 录,电镜下的多聚核蛋白体现象,目 录,蛋白

14、质合成后加工和输送Posttranslational Processing 进入细胞核、线粒体或其他细胞器； 分泌到体液，输送到其靶器官和靶细胞,蛋白质的靶向输送(protein targeting,蛋白质合成后需要经过复杂机制，定向输送到最终发挥生物功能的细胞靶部位，这一过程称为蛋白质的靶向输送,所有靶向输送的蛋白质结构中存在分选信号，主要为N末端特异氨基酸序列，可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位，这一序列称为信号序列,信号序列(signal sequence,靶向输送蛋白的信号序列或成分,一）分泌蛋白的靶向输送,真核细胞分泌蛋白等前体合成后靶向输送过程首先要进入内质网,信号肽(signal

15、 peptide,各种新生分泌蛋白的N端有保守的氨基酸序列称信号肽。（13-36 AA,分三个区段： N端侧碱性区 1个或几个带正电 Lys 、Arg 中间疏水核心区 10-15个疏水AA Leu、Ile C端加工区 极性小侧链AA Gly、Ala、Ser 信号肽酶裂解位点,信号肽的一级结构,信号肽引导真核分泌蛋白进入内质网,目 录,导肽：N端20-35AA 富含Ser、Thr、碱性AA,二）线粒体蛋白（90%）的靶向输送,二）线粒体蛋白的靶向输送,目 录,三）细胞核蛋白的靶向输送,目 录,蛋白质生物合成的干扰和抑制Interference & Inhibition of Protein Bi

16、osynthesis,第 四 节,蛋白质生物合成是很多天然抗生素和某些毒素的作用靶点。它们就是通过阻断真核、原核生物蛋白质翻译体系某组分功能，干扰和抑制蛋白质生物合成过程而起作用的。 可针对蛋白质生物合成必需的关键组分作为研究新抗菌药物的作用靶点。同时尽量利用真核、原核生物蛋白质合成体系的任何差异，以设计、筛选仅对病原微生物特效而不损害人体的药物,抗生素(antibiotics) 是微生物产生的能够杀灭或抑制细菌的一类药物,抗代谢药物 指能干扰生物代谢过程，从而抑制细胞过度生长的药物，如：6-MP,某些毒素也作用于基因信息传递过程,一、抗生素类,抗生素抑制蛋白质生物合成的原理,嘌呤霉素作用示意图,四环素族,目 录,二、其他干扰蛋白质生物合成的物质,毒素(toxin) 干扰素(interferon,白喉毒素(diphtheria toxin)的作用机理,白喉毒素,干扰素的作用机理,1. 干扰素诱导eIF2磷酸化而失活,2. 干扰素诱导病毒RNA降解,蛋白质的生物合成，即翻译，就是将核酸中由 4 种核苷酸序列编码的遗传