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文档简介

外文数据库PUBMED检索,PubMed数据库,PubMed简介 PubMed的检索规则 PubMed的检索方法 PubMed全文获取方式,一、PubMed简介,网址:/pubmed/ 或 (com; org; net) 世界最具权威性的医学文献数据库,由NLM (美国国立医学图书馆) NCBI (美国国家生物技术信息中心)向因特网用户提供免费文献检索服务(自1997-6-26起),收录70余个国家5400多种生物医学期刊的题录与文摘,其中收录中文刊100余种,是世界上最权威的医学数据库。 现有1950年以来的2200多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1700多万条) 目前每年增加60余万条文献记录 记录中90%的文献为英文。,PubMed简介,MEDLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录标有:PubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每条记录标有:PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966,PubMed收录数据,MEDLINE Inprocess 最新的MEDLINE处理中数据,未标引,无MeSH字段。每条记录标有:PubMed-in process。 Publisher-Supplied 出版商提供的电子文献题录,每条记录标有: PubMed-as supplied by publisher,分为两类: MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。 Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录,一直标注PubMed-as supplied by publisher或PubMed,PubMed收录数据,PubMed数据类型(状态),PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献按处理过程分4种类型(或状态),PubMed主页,初识 PubMed,使用帮助,常用工具,更多服务,检索词输入框,标题,作者,出处,处理状态,非英文的文献 篇名上有中括 号 且注明 有语种,英文文献,土耳其语, 篇名 ,布尔逻辑运算 截词检索 强制检索 字段检索,二、PUBMED的检索规则,可输入单词、词组或句子进行检索 可用的逻辑运算符:AND、NOT、OR(必须大写) 布尔逻辑运算顺序是从左至右,圆括号优先,布尔逻辑运算,截词检索,可使用截词符*,扩大检索范围,提高查全率。,Vaccina Vaccine Vaccines Vaccination vaccinated,Vaccin*,截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。,Vaccin*ti,强制检索,词组强制检索(精确检索)用双引号,例: “single cell,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 词组强制和截词检索时,系统的智能词语匹配功能将不再被执行。例如:liver cancer将不映射到 MeSH 词 Liver Neoplasms,强制检索,普通检索,“single cell“,single cell,字段限定检索,可在检索词后加字段名,进行限定字段检索。如:查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. 检索式: DNAmh AND crickau AND 1993dp,字段限制检索 其规则是:检 索词+字段 标识,DNAmh AND crickau AND 1993dp,常用字段(检索时大小写都可以),三、PUBMED的检索方法,基本检索,主题检索,高级检索,(一)基本检索,检索某主题的文献 检索某一作者发表的文献 检索发表在某期刊上的文献 ,在检索框中键入一个或多个英文单词(大写或小写均可),点击GO按钮。PubMed系统会自动在主题词表,期刊刊名表,著者全称表及著者索引中查询与输入的词相匹配的形式,这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。,1.某一主题的检索,检索有关肿瘤(cancer)的文献,cancer,“neoplasms“MeSH Terms OR “neoplasms“All Fields OR “cancer“All Fields,书写规则:姓前名后,姓用全称,名缩写。 考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将检索成smith ja,smith jb,smith jr 等。 精确检索:可以用双引号将作者名引起来,再加作者字段限定AU,如:“smith j“au,实现精确查找。,2.检索某一作者发表的文献,作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写), 之间不用标点 键入作者姓名,smith j,精确检索避免 PubMed自动 词汇转换。,“smith j“au,规则:全称或ISSN号或MEDLINE认可的标准缩写, ta 如:检索细胞生物分子期刊,在检索框中键入期刊名,molecular biology of the cell,系统会将它转换成mol biol celljournal进行检索。或直接输入Medline的期刊标准缩写形式(mol biol cell),输入刊物的ISSN:1059-1524。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词,如:cancer, science,cell等,PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索。因此,需要将检索请求进行标准化处理,即在杂志名后面加TA。如:“cell”ta,3.检索某一期刊上的文献,mol biol cell,期刊的一般检 索,是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号,期刊的标准检 索,是在期刊 名后面加字段 限定TA. 比 如:“cell“ta,“cell“ta,Filter是一个条件限定,可以进行年龄组、性别、人或动物、出版类型、时间、语言等方面的选择,将检索的文献限定在一定范围内。,4. Filter 限定检索,文献年限,文献可获取性,文献类型,研究对象类型,清除,我不记得字段,我想看看之前的操作,有高级检索呢,(二)高级检索(advanced search),字段选择,检索历史,1、点击主页右下角的MeSH Database进入主题词检索界面; 2、输入检索词后,点击go按钮,系统将显示与该词有关主题词; 3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、组配的副主题词; 4、选择合适的主题词与副主题词后,点击send to按钮,进入检索表达式浏览窗口; 5、点击Search PubMed将显示检索结果。,(三)主题检索( Mesh Database),主题词MeSH检索,主题词数据库 在PubMed首 页导航栏的右 下角,主题词数据库,主题词MeSH检索,输入普通词 查找对应主题词,主题词MeSH检索,一般一个主题 词还要配合一 个副主题词进 行组合检索,选择副主题词,选中副主题词,添加到检索框中,查看检索式,检索,比较,主题词检索举例,1、检索肾衰竭(Kidney Failure )治疗(therapy)方面的文献。 2、缺血性心脏病(ischemic heart disease)引起心力衰竭(heart failure)老年人方面的带文摘的文献。,通过PubMed检索出来的文献,部分通过浏览摘要即可,有的还需要查看全文,以作进一步的研究,全文的获取方法主要有: 一:免费的全文,四、PUBMED全文获取,PubMed收录 的文献大约有 5%是免费的 可以直接打开 全文,免费全文,点击打开全文,PubMed全文获取,打开PDF全文,免费的全文并 不代表学术价 值低,大部分 的生命科学的 全文都是免费 的,二:学校已订购的全文 如果需要的文献,学校已订购了该文献所在的全文数据库,可以直接打开或到相应的全文数据库中查找。,学校已订购,SpringerLink 和EBSCO

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