SciFinderScholar使用介绍.ppt

SciFinder Scholar使用介绍,CAS上海代表处 高级培训专员 xxx Tel：021-6xxxxxxx7 Email：S,Chemical Abstract Service化学文摘社,我们专注于：,推动研究、发展与创新 为全球科技与创新领域提供领先的、整合的，全面的信息解决方案 To encourage the increase and diffusion of chemical knowledge for the benefit of industry and education,Chemical Abstract Service化学文摘社今天：,全球最大的学协会组织 本部拥有800多博士从事文献编辑工作 为全球超过1200多个学校提供SFS桌面检索平台,提纲,SciFinder Scholar数据库介绍 SciFinder Scholar检索方法及信息挖掘手段 SciFinder Scholar中的检索方式 SciFinder Scholar中的文献检索及后处理 SciFinder Scholar中的物质检索及后处理 SciFinder Scholar中的反应检索及后处理 SciFinder Scholar检索注意问题,SciFinder Scholar数据库背景,SciFinder Scholar 2007,1907年,1977年,1997年,2002年,2007年,SciFinder Scholar包含的内容,期刊,专利,论文,会议报告,提炼出溶剂，催化剂，产率等反应信息,结构信息,物性数据,合成信息,SciFinder Scholar包含的内容,CAplus:每天更新3000条以上记录 Registry：每天大约新增4000个新的物质 CASReact：每周更新30000到50000条单步和多步反应 Medline：每周更新4次,提纲,SciFinder Scholar数据库介绍 SciFinder Scholar检索方法及信息挖掘手段 SciFinder Scholar中的检索方式 SciFinder Scholar中的文献检索及后处理 SciFinder Scholar中的物质检索及后处理 SciFinder Scholar中的反应检索及后处理 SciFinder Scholar检索注意问题,SciFinder Scholar的检索方式,主题,机构名,专利号,作者名,结构，亚结构,俗名,分子式,官能团,相似结构,所以， 在SciFinder Scholar中， 只要得到一点信息，就可以获得最为全面的 文献 物质 反应,SciFinder Scholar中文献检索及后处理,SciFinder Scholar中文献检索的方法 通过文献标示符去找文献 浏览核心期刊 通过主题，作者名，机构名去找文献,通过文献标示符去找文献,浏览核心期刊,通过主题，作者名，机构名去找文献,主题检索举例,提出问题 获得关于纳米结构材料方面的参考文献,存在问题： 获得2007年以后专利文献 这些专利中都出现了什么样的内容 是否可以用系统的方法对这些文献进行分类,我们用nano structure with material来做初次的检索,“Closely associated with one another” 表示在同一个句子当中出现,获取文摘,获取全文,分析/限定,我们注意到所列文献中出现了 Nanoindentation,nanotube 这样的词 那是SciFinder能够自动识别同义词，近义词，缩写，并有截词，断词等功能,SFS2007新功能 系统分类,一共11种分析手段,分析工具提供11种分析方法，包括索引词，作者名，机构名，文献类型，期刊名称，出版年限等。 在这些分析工具中， 索引词（Index Term）：可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 学科分析（CA Section Title）：可以帮助我们对文献进行学科分类,一共7种限定手段,限定工具提供7种限定方法，包括主题词，作者名，机构名，文献类型等。 在这些限定工具中， 主题词（Research Topics）：可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献 文献类型（Document Type）：可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型,限定工具-获得来自2007年以后的文献,分析工具-Document Type分析,分析工具-Index Term分析,一级目录,二级目录,点击感兴趣的二级分类，在这里可以出现一些索引词条,系统分类工具Categorize,作者名检索举例,姓，一定要写全,名，只写首字母,这里我们来查一下顾忠伟老师发表的文章,选择所有的可能 Gu Z Gu Z W Gu ZhongW Gu Zhong Wei Gu Zhong W ,文献检索小结,SciFinder Scholar文献检索小结,向SciFinder Scholar提一个最为广泛的问题 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来不断的修正我们 的检索思路 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围 可以通过SciFinder Scholar的Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵感 尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益 使用Categorize可以让系统来实现自动分类 通过Get Related来获得更多的信息，可以实现从文献到物质，反应，引文的链接,SciFinder Scholar中物质检索及后处理,SciFinder Scholar中物质检索的方法 通过物质标示符去找物质 通过结构和分子式找物质,通过物质标示符去找物质,可以输入物质名称，CAS No，俗名，商品名,通过结构和分子式找物质,结构检索举例,结构工具,结构相关工具,铅笔,元素周期表,可变基团,重复基团工具,结构模版,橡皮,正电子,选择工具,原子锁定工具,碳链工具,常用基团,R基团定义工具,可变位置连接工具,多元环工具,旋转工具,负电子,环锁定工具,索套选择工具,精确结构检索,得到物质的盐，或者其他的混合物,亚结构检索,得到物质的修饰信息,33246种修饰信息,我们做科研 往往是希望得到我们不知道的信息 那么对于这33246种物质，我们如何去分析来获得我们需要的信息呢？,强大的后处理功能,6大分析功能,分析功能提供6大功能，其中 真实原子附属分析（Real-atom attachments):能够分析出原子的修饰情况 可变基团分析（Variable Group composition）：能分析结构中定义的可变基团 R基团分析（R-Group Composition）：可以分析结构中定义的R基团 环骨架分析（Ring Skeletons）：可以分析结构的环结构，包括环上的原子和环上的单双键。,7大限定功能,对于上面的3万多种物质，如果我只想获得具有红外光谱数据的物质，那么，我应该选择什么呢？,限定功能提供结构再次限定，同位素是否包含限定，金属是否包含限定，理化性质限定等。 通常可以通过结构的再次限定（Chemical Structure）去对结构再次修饰 或者通过理化性质（Property Date）去找到符合理化性质要求的物质,或得具有红外光谱信息的物质,实际上 我们有的时候，更多关注的是结构上面的信息,修饰信息？ 修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息？ ,修正结构,对所得结果再次使用真实原子附属性分析,有的时候， 我们对我们关心的结构只有一定的了解，不确定的信息太多 我们来看我们所要找的结构：,结构中含有苯环，苯环上含有一个杂环 杂环为5元环，6元环或7元环，且杂原子不能直接接在苯环上 杂环上原子必须是O或者S 苯环上与杂环相邻的位置接个Br 苯环上某2个处于间位的C必须有1个C接卤素，但是接什么卤素不确定 该2个位置之间的C必须接一个基团，该基团可以是H，OH，X,得到具备一定条件的结构信息,问题： 存在多少种环结构 X= F，Cl， Br，I 分别有多少种物质 R2=H，OH，X分别有多少物质,R1= O,S R2= H,OH,X,环骨架分析,可变基团分析,R基团分析,相似结构检索,得到相似结构信息,精确结构检索，获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等 亚结构检索，所画的结构必须存在 相似结构检索，获得相似度在60分以上的结构,物质检索小结,分子式检索举例,分子式输入规则 CH写在前面，其他按照字母顺序 对于多组分物质，用“.” 将不同的组分分开 聚合物括号表示，括号外用x表示起始物，用n表示终产物 区分大小写,SciFinder Scholar中反应检索及后处理,SciFinder Scholar查询举例-反应信息的查询,反应查询工具,SciFinder Scholar查询举例-反应信息的查询,反应位置标记工具,反应箭头,反应官能团列表,反应原子标记工具,反应角色工具,一共10种分析手段,分析工具提供反应中的催化剂（Catalyst），溶剂（Solvent），反应步数（Number of steps) ，产率( Product Yield) 等的分析,一共4种限定手段,限定工具，可以根据进一步的条件去限定反应中出现的物质（Reaction Structure),以及反应类型（Reaction Classification）等,溶剂分析,通常 我们需要一些对我们科研有参考意义的反应,官能团之间的反应 亚结构反应检索 对反应位置和原子有特定要求的反应,拓展思路的反应检索,官能团之间的反应,假如我们只想得到一步反应,假如我们规定反应物必须是乙酰氯,那么如何获得不是从乙酰氯出发的反应呢？ 让我们先返回初次检索到的683条反应。,再按照上面的检索获得从乙酰氯出发的反应，一共16条,运用Combine功能将不需要的答案集排除,检索思路回顾,获得1步从酰卤到醛的反应,限定反应物获得反应物是乙酰氯的反应,运用Combine功能将乙酰氯是产物的反应去除,COMBINE-SciFinder Scholar2007新功能,可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操作,*.SFR格式保存-SciFinder Scholar2007新功能,将结果保存成书签，可以使用SFS再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作,亚结构反应检索,想获得1步合成该物质的反应,亚结构反应检索,必须的条件： 羟基接的C必须是CH2 整个C链不允许是某个环结构的部分结构 其余的3个C原子链接什么基团对反应没 有影响,据此，我们修改我们的检索方式,亚结构反应检索,用环锁定功能，锁定C链，保证其不成为环结构的一部分,用原子锁定功能，锁定C原子，保证C 原子上两个H不被取代,对反应位置和原子有特定要求的反应,O原子反应前后必须配对 C=O键必须发生反应 除已有的环外，不能成环,用mapping tool键标示O原子反应前后位置,用site marking tool键标示C=O键反应的位置。,用Lock out ring tool键锁定环,对反应作出条件限定,SciFinder Scholar反应检索小结,多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率等信息 如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考 信息 当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查 询，可以获得更多的参考信息,提纲,SciFinder Scholar数据库介绍 SciFinder Scholar检索方法及信息挖掘手段 SciFinder Scholar中的检索方式 SciFinder Scholar中的文献检索及后处理 SciFinder Scholar中的物质检索及后处理 SciFinder Scholar中的反应检索及后处理 SciFinder Scholar检索注意问题,SciFinder Scholar检索注意问题,Explore by Research Topic Explore by Document Identifier Explore by Substance Identifier,Explore by Research Topic -Tips,一般最佳在23个Concepts（关键词），最多不超过5个 最好使用介词而不用Boolean运算符，如AND 、OR、NOT；介词能被识别； 识别常用缩写、单复数、过去式等； 支持同意词，近义词检索； 不能用！或*（删减字符或通配符） 可用括号，括号内为前词的同义词； 修饰语不能自行分配，需各自写明；,Explore by Document Identifier-Tips,Explore by Substance Identifier-Tips,最多输入25条； Read File必须是 .txt文件； 每个条目输入200字符； 可以有空格，不区分大小写； 如果检索结果不理想，也可在主题检索中再检； 支持俗名，商品名检索,SciFinder Scholar的程序安装,SciFinder Scholar 客户端程序： SciFinder Scholar2007.exe 安装过程中，提示： Do you have a disk labeled Custom Site Files? （选择 No） site.prf （site）文件 只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:ScholarCHLR目录下 还可安装 ViewerLite用于查看3D结构,运行SciFinder Scholar,可能1：（并发用户数限制）,解决方法：请耐心等候