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文档简介
基础实松技能培洌
实脍操作手册
实验安排表
时间实验名称主要内容
微量移液器的校准与使用
pH计的校准与使月
上午实验一、基本实验技能
电子天平的校准与使用
第一天常用仪器介绍
8.18液体培养基的配制
固体培养基的配制
下午实验二、基本实验准备
细菌的液体培养接种
实验常用试剂配制等
第二天上午实验三、植物基因组DNA提取植物基因组提取
8.19下午实验四、感受态制备感受态制备
第三天I.T-实验五、PCR扩增、琼脂糖凝胶回收PCR反应、产物回收纯化
8.20下午实验六、TA克隆-连接转化连接转化涂板
第四天上午实验六、TA克隆•鉴定•菌落PCR签定菌落PCR鉴定
8.21下午实验七、植物RNA提取、逆转录RNA提取逆转录
上午实验六、TA克隆-鉴定-质粒提取质粒提取鉴定
第五天
下午实验八、荧光定量PCR荧光定量
8.22
分子实验总结
第六天上午实验九、蛋白提取、蛋白定量蛋白提取、蛋白定量
8.24下午实验十、蛋白电泳制胶、电冰、染色
第七天
全天实验H--、WesternBlot实验(DAB显色)转膜、封闭、一抗、二抗、显色
8.25
包被、封闭、一抗、二抗、显色、
上午实验十二、ELISA检测
终止
第八天
下午实验十三、细胞培养细胞培养基本方法
8.26
蛋白实验总结
三个实验,DNA、RNA提取、荧光
定量PCR操作。每组派出一个学员
上午综合测试(现场考核操作)
第九天进行抽签,抽到一种实验方案及一
8.27个学员,现场进行操作,结果评比。
下午总结报告评选优秀学员和优秀小组
植物基因组DNA提取
实验材料:
植物样本,植物基因组DNA提取试剂盒,B-疏基乙醇,氯仿,无水乙醇
实验仪器、耗材:移液器、电泳仪、离心机、研钵、研钵棒、剪刀、天平、液氮
实验前准备:
1.BufferGP1在使用前请加入代疏基乙醇,5mlBu^erGP1加5pl即疏基乙醇。加入p-
筑基乙醇的BufferGP1室温可保存1个月。
2.预热水浴锅65度,珞加入配制好的疏基乙醇预热。
3.第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明在BufferGW1和BufferGW2中加入无水乙醇。
4.称取植物样本约100mg。
5.在研磨植物材料前,向研钵中倒入酒精,放入剪刀、钥匙高温消毒。
6.研钵、剪刀、钥匙冷却后,将液氮加入在研钵口以预冷研钵。
实验步骤:
1.取植物新鲜组织约100mg,用剪刀将样本剪碎,放入研钵,加入液氮充分研磨至粉末状。
将粉末转移到离心管中。
注意:冻存材料直接研磨,绝对不能化冻。而且粉末应在化冻前转移,否则内源性DNase
有可能降解基因组DNAo
2.加入700H65℃预热的BufferGP1(BufferGP1在使用前请加入B-筑基乙醇,5mlBuffer
GP1加53小毓基乙醵),迅速颠倒混匀后,将离心管置于65℃水浴20分钟,水浴过
程中颠倒离心管混匀样品数次。
3.加入7007氯仿.充分混匀,12,000rpm(〜13,400xg)离心5分钟。小心将上层水相
转入一新的离心管中,加入700ulBufferGP2,充分混匀。
4.将上步所得溶液全部加入到已装入收集管(CollectionTube)的吸附柱(SpinColumnDM)
中。若一次不能加完溶液,可分多次转入。10,000rpm(〜11,500xg)离心1分钟,倒
掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5.向吸附柱中加入500ulBufferGW1(使用前检杳是否"加入无水乙醇),10,000rpm离
心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6.向吸附柱中加入500ulBufferGW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),10,000rpm离
心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7.12,000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
(乙醇一定要吹干,否则电泳点样时,样品上漂)
8.将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50ulBufferGE,室温放
置2・5分钟,10,000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,・20℃保存DNA。
9.电泳检测。
感受态制备
实验材料:
菌株:Top10(Str+)、LB固体培养基,LB液体培养基,洗脱液,保存液
实验方法:Cacl2法制备TOP10感受态
实验仪器、耗材:4度离心机,分光光度计、50ml离心管、-80度低温冰箱
试剂配制方法:
1L液体LB培养基:10g蛋白陈+5g酵母粉+10g氯化钠,加蒸镭水至1000ml。
100ml固体LB培养基:1g蛋白陈+0.5g酵母粉+1g氯化钠+1.5g琼脂粉,加蒸储水至
100mL
1L洗脱液:16.264gMgCI2・6H2。(80mM)+2.94gCaCI2-2H2O(20mM)
200ml保存液:2.205gCaCI2-2H2O(75mM)+30ml甘油(15%)
灭菌条件:122℃20min
实验步骤:
1.菌种的划线培养
第一天下午4:30分
从-80℃取甘油菌,在•次性LB平板上进行划线接菌,在37。(:恒温培养箱过夜培养。
2.接菌小摇与培养基的制备
第二天下午4:30分
取过夜培养平板,用枪头挑菌于50ml液体LB培养管内,37℃,250rpm摇菌过夜。
3.扩大培养
第三天早上8:30分
取过夜小摇菌液按1:100比例加入250ml三角瓶(含100ml液体LB培养基)进行
扩大培养,期间监测OD值。
4.冰冻,离心,收菌
当OD600=0.4~0.5之间时,将摇菌三角瓶置于冰上,冰浴30min。
然后将菌液分别加入50ml离心管中4℃,3500rpm,离心10min收集菌体,
5.洗脱,冰冻,离心
将收集的菌体加入洗脱液12.5ml,混匀,冰浴20min。
(每菌液量加12.5ml洗脱液,也可根据总体积调整洗脱液的大小。)
4℃,3500rpm,离心10min,收集菌体。
6.分装保存
加入保存液5ml(每100ml菌液量),混匀,分装细胞即可。
PCR扩增
实验材料:
GFP模板(约750bp),GFPForwardPrimer,GFPReversePrimer,TaqMasterMix
实验仪器、耗材:PCR仪、移液器、PCR管、1.5ml离心管、电泳仪、照胶仪
实验步骤:
1.配制PCR反应体系:
每组做两个重复。
试剂50pl反应体系
2xTaqMasterMix(含染料)25pl
GFPForwardPrimer,10pM1pl
GFPReversePrimer,10pM1Ml
Grp模板1pl
RNase-FreeWater22pl
Total50pl
2.PCR反应条件:
步骤温度时间
预变性94℃2min
变性94MC30s、
退火55℃30sr30个循环
1minJ
延伸72℃
终延伸72℃2min
3.结果检测:反应结束后,取35Hl反应产物电泳检测,并准备进行琼脂糖凝胶回收。
琼脂糖凝胶回收纯化
实验材料:琼脂糖凝胶胶块、琼脂糖凝胶回收纯化试剂盒、无水乙醇
实验仪器、耗材:切胶仪/照胶仪、小刀、移液器、分光光度计、水浴锅、1.5ml离心管
实验前准备:预热水浴锅至50度。
实验步骤
1、取2个1.5ml干净的离心管,称取空管重量,将重星标记于管型上。
2、将单一目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分),放入离心管中,称重,
计算胶块重量。
注意:若胶块的体积过大,可将胶块切成碎块。
3、向胶块中加入3倍体积BufferPG(如凝胶重为100mg,其体积可视为100pl,依此类推)。
4、50℃孵育10分钟,其间每隔2-3分钟温和地上下颠倒离心管,以确保胶块充分溶解。如果
还有未溶的胶块,可再补加一些溶胶液或继续放置几分钟,直至胶块完全溶解
注意;1)当琼脂糖凝胶浓度>2%时,适当延长孵育时间。
2)胶块完全溶解后最好将胶溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在较高温度时结合
DNA的能力较弱。
5、柱平衡:向已装入收集管(CollectionTube)中的吸附柱(SpinColumnDM)中加入200
plBufferPS,17,900xg(-13,000rpm)离心2分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重
新放回收集管中。
6、将步骤3或4所得溶液加入到己装入收集管的吸附柱中,室温放置2分钟,17,900xg
(-13,000rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
注意:吸附柱容积为700川,若样品体积大「700川可分批加入。
7、向吸附柱中力口入5003BufferPG,17,900xg(-13,000rpm)离心1分钟,倒掉收集管中
的废液,将吸附柱放回收集管中。
8、向吸附柱中加入750plBufferPW(使用前请先检杳是否已加入无水乙醇),17,900xg
(-13,000rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
9、17,900xg(-13,000rpm)离心1分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置尸室温数分钟,
以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶
切、PCR等)。为确保下游实验不受残留乙醉的影响,建议将吸附柱开盖,置于室温放置
数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的乙醇。
10、将吸附柱放到一个新的1.5ml离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加353BufferEB
(pH8.5),室温放置2分钟。17,900xg(-13,000rpm)离心1分钟,收集DNA溶液。-20℃
保存DNA。
注意:1)洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5
(可以用NaOH将水的pH值调到此范围)。
2)为了提高DNA的回收量,可将离心得到的溶液重新滴加到吸附柱中,重复步骤10,
3)洗脱体积不应小于30pl,体积过少会影响回收效率。
4)如果使用TE洗脱,需要考虑其中含有的EDTA是否会影响后续的酶促反应。
5)I可收大于10kb的DNA片段时,BufferEB应在50℃水浴中预热,适当延长吸附和洗脱时间,
可增加回收效率。
11、结果检测:
1)浓度检测:对回收后的PCR产物进行浓度测定。
2)电泳检测:取43回收前的PCR产物、2.5川回收前的PCR产物及5川回收后的PCR产物进
行电泳检测。
TA克隆
连接、转化、涂板、鉴定
一、连接:
实验材料:pUC-T载体、回收纯化的DNA片段(750bp)
实验仪器、耗材:移液器、PCR管、PCR仪
实验步骤:
1.计算插入片段的体积;
1)在进行克隆时,载体pUC-T和插入片段的摩尔比一股为1:2-1:10,本实验我们选择1:3。
2)本实验使用的载体pUC-T浓度为50ng/川,50ng的摩尔数约为0.03pmol,因此本实验插
入片段的摩尔数为0.09pmol,插入片段为750bp,那么本实验插入片段DNA的使用量(ng)
=0.09x10-3x660x750(插入片段bp数)=44.55ng。
3)插入片段的体积(3)=插入片段DNA的使用量(ng)/插入片段的浓度(ng/pl)
本次我们使用的插入片段为上次实验中胶回收片段,因此胶回收片段的浓度为40.6ng//,那
么,插入片段的体枳(川)=44.55/40.6=1.097,即在反应体系中加入13插入片段。
2.按以下体系配制反应液:
每组做4个。
试剂体积
pUC-T(50ng/pl)1Ml
插入片段(750bp)Xpl
RNase-FreeWaterYpl
SolutionBuffer,2x5pl
Total103
3.混匀,22℃孵育30分钟,或者16℃过夜连接。
二、转化:
实验材料:TOP10感受态细胞、自制感受态细胞、LB液体培养基
实验仪器、耗材:移液器、超净台、浮漂、摇床、水浴锅
实验前准备:预热水浴锅至42度。
实验步骤:
1.取TOP10感受态细胞置于冰浴中,待感受态细胞融化后,进行以下实验。
2.实验组:将103连接产物加入至1003Top10感受态细胞中,用移液器轻轻吹打混匀,
冰浴30分钟。每组共做2个。
对照组:将10pl连接产物加入至1003自制感受态纽胞中,用移液器轻轻吹打混匀,冰浴
30分钟。每组做2个。
3.将离心管置于42℃水浴,热击90秒,迅速将离心管转移到冰浴中,冰上静置2-3分钟。
4.向离心管中加入900PL的LB液体培养基(不含抗生素),混匀后置于37℃摇床,150rpm
振荡培养45分钟,使菌体复苏。
三、涂板、培养:
实验材料:LB固体培养基、LB液体培养基、氨苦、IPTG、X-gal
实验仪器、耗材:涂布棒、超净台、移液器、培养箱
实验步骤:
1.倒板:
在LB固体培养基中加入氨节后,进行倒板。
将100mg/mL的氨节稀释1000倍使用。(300ml培养基+300PL的100mg/mL氨苇)
注意!培养基温度应在50-60度时,再加入氨茉。
2.将40PL的20mg/mL的X-gal和20PL50mg/mL的IPTG涂布于含氨茉青霉素的LB平板上,
用无菌的涂布棒均匀涂开。
3.离心,倒掉上清,将沉淀中全部转化后的培养物,加到平板上,用无菌的涂布棒将细
胞均匀涂开。
4.将平板置于室温下至液体被完全吸收,倒置平板,37℃培养箱,过夜培养。
四、观察、鉴定:
1.观察蓝色和白色菌落,计算白色和蓝色菌落数。
2.菌落PCR鉴定
实验材料:TaqMasterMix>菌液、M13ForwardPrimer>M13ReversePrimer>LB液体培
养基、氨茉
实验耗材:超净台、15ml离心管、摇床、PCR仪、移液器、LB液体培养基
实验步骤:
选择平板,每个平板挑取白色菌落(4个)和蓝色菌落(2个),分另ij放入50plRNase-Free
Water中,取23进行菌落PCR鉴定。剩下的48川等待菌落PCR结果,选取阳性克隆,于当
日下午接种于5ml含氨节青霉素的LB液体培养基中,置于37℃摇床,250rpm振荡培养过夜,
用于第二日提取质粒。
1)配制PCR反应体系:
试剂203反应体系
2xTaqMasterMix10pl
M13ForwardPrimer,10pM0.5pl
M13ReversePrimer,10pM0.5pl
菌液2Ml
RNase-FreeWater7Ml
Total20pl
2)配制除菌液外的预混体系,并分装到PCR管中,每个管中加入183的预混体系。
3)模板加入:每个管中分别加入23菌液。混匀,短暂离心。
4)PCR反应条件:
步骤温度时间
预变性94℃2min
变性94℃30s'
退火55℃30s>30个循环
延伸72℃1minJ
终延伸72℃2min
5)结果检测:反应结束后,取53反应产物直接电泳检测结果。
3.高纯质粒提取鉴定
实验材料:菌液,高纯质粒提取试剂盒,无水乙醇
实验仪器、耗材:移液器、电泳仪
实验前准备:
1)BufferP1中力「入RNaseA。
2)第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明在BufferPW中加入无水乙醇。
实验步骤:
1.取2nli(根据培养菌体的浓度选择合适的量,建议最多不超过5ml)过夜培养的菌液,加
入离心管中,12,000rpm(~13,400xg)离心2-3分钟收集细菌,尽量吸弃全部上清。
注意:质粒拷贝数较低或>10kb时,可以使用更多菌液通过二次离心将菌体沉淀收集到同
一个离心管中,同时后续所加试剂BufferP1、P2及N3的量需加倍。所加试剂的量
必须能够充分裂解菌体,菌体过多、裂解不充分都会降低质粒的提取效率。
2.向留有菌体沉淀的离心管中加入250ulBufferP1(请先检查是否已加入RNaseA),使用
移液器或涡旋振荡器充分混匀,悬浮细菌沉淀。
注意:如果菌块未彻底混匀,将会影响裂解效果,使提取量和纯度偏低。
3.向离心管中加入250ulBufferP2,温和地上下颠倒混匀6-8次,使菌体充分裂解,室温放
置3-5分钟。此时溶液应变得清亮粘稠。
注意:不耍剧烈震荡,以免造成所提质粒中基因组DNA污染。如果溶液未变得清亮,提示
可能菌量过大,裂解不彻底,应减少菌体量。
4.向离心管中加入350ulBufferN3,立即上下颠倒混匀6-8次,此时出现白色絮状沉淀,室
温放置5分钟。12,000rpm离心10分钟。
注意:BufferN3加入后应立即混匀,避免产生局部沉淀。
5.柱平衡:向已装入收集管(CollectionTube)的吸附柱(SpinColumnCM)中力口人2003
BufferPS,12,000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6.将步骤4中所得的上消液转移到吸附柱(已装入收集管)中,12,000rpm离心1分钟,倒掉
收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:吸附柱的最大容枳为7003,所以第4步中所得溶液分2次过柱。
7.向吸附柱中加入500ulBufferPB,12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附
柱重新放回收集管中,
注意:如果宿主菌是endA-宿主菌(DH5a,TOP10等),此步可省略。如果宿主菌是
endA+宿主菌(TG1,BL21,HB101,JM101,ET12567等),这些宿主菌含
有大量的核酸耐,易降解质粒DNA.推荐采月此步,如果提取低擀贝质粒推荐采用
此步。
8.向吸附柱中加入600川BufferPW(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1
分钟,倒掉收集管中的废液。
9.重复步骤8。
10.将吸附柱重新放回收集管中,12,000rpm离心2分钟,倒掉废液,将吸附柱置于室温干燥5
分钟。
注意;这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的防促反应(酶
切、PCR等)。
11.将吸附柱置于一个新的收集管中,向吸附膜的中间部位加入50-100ulBufferEB,室温放
置2-5分钟,12,000rpm离心2分钟,将质粒溶液收集到离心管中。-20。(:保存质粒。
注意:1)为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,重复步骤11。
2)BufferEB在65—70℃水浴预热,适当延长吸附和洗脱的时间,可以增加提取效率。
3)洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5
范围内(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0会降低洗脱效率。
4)洗脱缓冲液体积不应少「503,体积过小影响回收效率。
12.结果检测:取53产物进行电泳检测。
植物总RNA提取
材料:
植物样本,超纯RNA提取试剂盒,氯仿,75%乙醇(无RNase的水配制)
实验仪器、耗材:移液器、电泳仪、4度离心机、分光光度计、研钵、研钵棒、天平、
液氮
实验前准备:
1.配制75%乙醇,用无RNase的水配制。
2.称取植物样本100mg。
3.在研磨植物材料前,向研钵中倒入酒精,放入剪刀、钥匙高温消毒。
4.研钵、剪刀、钥匙冷却后,将液氮加入在研钵中以预冷研钵。
实验步骤:
注意:低温冰上操作
1.样品处理:称取植物样本100mg,将植物样本剪碎后,放入研钵中,加入液氮,充分
研磨,研磨充分后,加入1mlBufferRLT,
注意:样品体积不超过BufferRLT体积的10%。
2.样品中加入BufferRLT后反更吹打几次,使样本充分裂解。室温放置5分钟,使蛋白核酸
复合物完全分离。
3.每1mlBufferRLT加入200山氯仿的比例加入氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放
置2分钟。
4.4℃12,000rpm(~13,400xg)离心10分钟,此时样品分为三层:红色有机相,中间层和
上层无色水相,RNA主要在上层水相中,将上层水相移到一个新的RNase-Free离心管(自
备)中。
5.在得到的水相溶液中加入等体积的70%乙醇(无RNase的水配制),颠倒混匀。
6.将上步所得溶液全部加入到已装入收集管(CollectionTube2ml)的吸附柱(SpinColumn
RM)中。若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000rpm离心20秒,倒掉收集管中的
废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7.向吸附柱中加入/00JlBufferRW1,12,。。。rpm离心2U秒,倒掉收集管中的废液,将吸
附柱重新放回收集管中。
8.向吸附柱中加入500HBufferRW2(使用前检杳是否已加入无水乙醇),12,000rpm离
心20秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
9.重复步骤8,,
10.12,000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
11.将吸附柱置于一个新的无RNase离心管(CollectionTube1.5ml)中,向吸附柱的中间部
位加入30-50ulRNase-FreeWater,室温放置1分钟,12,000rpm离心1分钟,收集RNA
溶液,-70°C保存RNR,防止降解。
12.检测:
1)电泳检测。
2)RNA浓度和纯度测定:
纯度:OD260,,QD280=1.921<1.8蛋白质或酚类污染>2.2RNA水解
浓度:RNA(且g/旦I)=40*OD26O乂稀释倍数
逆转录CDNA合成
实验材料:
HiFi-ScriptcDNA第一链合成试剂盒,RNA(植物RNA实验提取)
实验仪器、耗材:
PCR仪、PCR管、移液器
实验步骤:
1.将RNA模板、PrimerMix.dNTPMix、DTT、RTBuffer>HiFi-ScriptRNase-FreeWater
溶解并置于冰上备用。
2.根据以下表格配置反应体系,总体积为203。
RNA终浓度建议为印g,需要根据测定的RNA浓度,计算逆转录中需要的RNA体积。
试剂20pl反应体系
dNTPMix,2.5mMEach4pl
PrimerMix2Ml
RNATemplateXpl(1|jg)
5xRTBuffer4pl
DTT,0.1M2Ml
HiFi-Script,200U/pl1pl
RNase-FreeWaterY
Total20pl
3.涡旋震荡混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
4.42℃孵育50分钟,85'C孵育5分钟。反应结束后,短暂离心,置于冰上冷却。
5.逆转录产物可直接用于PCR和荧光定量PCR,或置于-20℃长期保存。
荧光定量PCR
实验材料:
UltraSYBRGreenMixture,cDNA,actinForwardPrimer、actinReversePrimer
实验仪器、耗材:
荧光定量PCR仪、PCR管、1.5ml离心管、移液器、八连管离心机
实验步骤:
1.模板稀释:
注意:每稀释一个倍数,需要将溶液混匀,并短暂离心。
编号模板稀释倍数水用量模板用量
110倍90pl10pl(原液)
2100倍90pl10pl(从1号管取)
2.配制PCR预混反应体系:
做8个样本,配制10个样本的预混体系,配制方式如下:
配制10个样本的
试剂20pl反应体系
预混体系
2xUltraSYBRMixture100pl10pl
ForwardPrimer,10pM4pl0.4pl
ReversePrmer,10pM4pl0.4pl
AcDNAOpl2Ml
RNase-FreeWater72pl7.2pl
Total18020
3.将配制的预混体系,分装到八连管中。共8个孔,每个孔中加入183的预混体系。
4.模板加入:
每个孔中分别加入2「模板,加样顺序如下:
加样孔12345678
样品原原稀释稀释稀释稀释水水
液液10倍10倍100倍100倍
加入体积2pl2pl2pl2pl2pl2pl2Pl2Ml
5.混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
6.荧光定量PCR反应程序:
步骤温度时间
预变性95℃10min
变性95℃10sI
40个循环
1min)
退火/延伸60℃
融解曲线分析
注意事项:
1.首先配制预混体系,再将预混体系分装到八连管中。
2.稀释模板时,需要混匀。
3.不要直接在八连管管壁或管盖上做标记!
植物总蛋白提取
实验材料:植物样本、植物蛋自抽提试剂
实验仪器、耗材:研钵、研钵棒、移液器、1.5ml离心管、4度离心机、天平、液氮
注意:低温冰上操作
实验前准备:
1.将蛋白酶抑制剂混合物加入植物蛋白抽提试剂中,按照1:99比例加入,使蛋白酶抗制剂
混合物在抽提试剂中成1x工作液。
配制方法:990川植物蛋白抽提试剂+10川蛋白能抑制剂混合物,冰上放置待用。
2.称取植物样本约100mg。
3.在研磨植物材料前,先将液氮加入在研钵中以预冷研钵。
实验步骤:
1.称量100mg植物组织,用剪刀将样本剪碎,放入研钵,加入液氮充分研磨至粉末状。
将粉末转移到离心管中。
2.按照组织:抽提试剂=1:5(g/ml)的比例加入蛋白抽提试剂,100mg植物组织加入5003
蛋白抽提试剂。涡旋混匀,冰上孵育30分钟,期间涡旋混匀3次。
3.4℃12,000rpm,离心20分钟。
4.将上清转移至新的离心管中。冰上放置,准备蛋臼定量,或将提取的蛋白-20℃保存。
蛋白定量
实验材料:提取的植物蛋白、BCA定量试剂盒
实验仪器、耗材:移液器、酶标仪/分光光度计、酶标条、酶标板、1.5ml离心管、PCR管
实验步骤:
1.标准品稀释(按照下表进行标准品稀释)。
管号稀释液用量(U1)标准品用雷(ul)最终浓度(ugml)
A01002000
B2002001000
C200200(从B管中取)500
D200200(从C管中取)250
E200200(从D管中取)125
F400100(从E管中取)25
G20000(空白)
3.配置BCA工作液:根据标准品和样品的数量,将试剂A和试剂B以50:1的体枳比
混匀(6mlA液+120plB液)
微孔法:
1)将253稀释好的样品与稀释好的标准品分别添加于96孔板的微孔中。
2)各孔中加入200plBCA工作液,充分混匀。
3)盖上96孔板盖,37℃孵育30分钟。
4)冷却至室温。
5)用酹标仪测定562nm处的吸光值。
6)绘制标准曲线,计算样品中的蛋白浓度。
试管法:
1)将1003稀释好的样品与稀释好的BSA标准品分别加到作好标记的试管中。
2)各试管中各加入2mlBCA工作液,充分混匀。
3)37℃水浴中孵育30分钟或室温孵育2小时。
4)将各管冷却至室温。
5)用分光光度计测定562nm处的吸光值。
6)绘制标准曲线,计算样品中的蛋白浓度。
注意事项:
标准品测定需在10min内完成,否则会影响蛋白定量的准确度。
蛋白电泳(制胶、SDS-PAGE电泳)
实验材料:
SDS凝胶制备试剂盒、电泳缓冲液、提取的蛋白或全细胞裂解液、广谱彩虹预
染中分子量蛋白Marker、SDSLoadingBuffer:还原,5x)、G250蛋白快速染色
试剂、若干蒸储水
实验仪器、耗材:
蛋白电泳仪、制胶仪、水平摇床、15ml离心管、5ml移液器、微量移液器、1.5ml离心管
配制溶液:
•配制10%APS溶液:-20度保存
0.5gAPS+5ml蒸储本、2.5gAPS+25ml蒸储水
•配制200ml电泳缓冲液:CVV0045Tris-GlycineSDS(ph8.3,10X)
2()mlTris-GlycincSDS+180nil蒸储水
•配制1mlloadingbuffer:
200ul5Xloadingbuffer+800ul蒸储水
实验步骤:
一.制胶:
1.参照凝胶模具说明书,装配好凝胶模具。
2.根据分离蛋白的大小配制分离胶和浓缩胶。
SDS分离胶的浓度与最佳分离范围
SDS分离胶浓度最佳分离范围
6%胶50-150kD
8%胶30-90kD
10%胶20-80kD
12%胶12-60kD
15%胶10-40kD
3.配制10%分离胶:
将不同体积的30%Acr-Bis(29:1),分离胶缓冲液和双蒸水在小烧杯或试管中混合。
加入10%APS和TEMED,轻轻搅拌使其混匀,避免产生气泡。
配制SDS分离胶
分离所需各组分体积(单位:ml)
凝胶
胶浓30%Acr-分离胶缓汨液
体积双蒸水10%APSTEMED
度Bis(29:1)(4x)
10%5ml2.081.671.250.050.002
10ml4.173.332.50.10.004
15ml6.255.03.750.150.006
20ml8.36.750.20.008
4.待胶濯至距离玻琏板顶端1.5cm的时候停止灌狡,加入蒸储水水封。静置40分钟
至1小时。
5.待分离胶凝固后(水层胶层中间出现折线),倒掉蒸储水,用滤纸将水溶液吸干。
6.配制5%浓缩胶:
配制5%SDS浓缩胶
所需各组分体积(单位:ml)
凝胶
30%Acr-Bis(浓缩胶缓冲液10%APTEME
体积双蒸水
29:1)(4x)SD
2ml1.140.340.50.020.002
4ml2280.6810.040.004
6ml3.421.021.50.060.006
8ml4.561.362.00.080.008
7.将浓缩胶溶液加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端。
注意:灌胶速度要快,防止凝胶。
8.将梳子插入凝胶内,避免产生气泡。静置20分钟,等待浓缩胶聚合。
9.待凝胶聚合后,小心地拔出梳子,以免破坏加样孔。赶走气泡。
二.SDS电泳:
1.在电泳槽的内外槽灌至电泳缓冲液。
2.制备样品:
1)植物蛋白样品:
根据植物蛋白定量结果,计算蛋白提取液加入量,制备上样溶液。
蛋白提取液+5x上样缓冲液+蒸储水
制备的样品,煮沸5分钟,12,000rpm离心5分钟,取上清,上样。
2)全细胞裂解液:可以直接上样,上样203,约40ug.
3.上样:K562全细胞裂解液上样顺序如下:
泳道12345678910
样品1x上样Marker样品样品样品样品样品样品样品1x上样
缓冲液1234567缓冲液
体积10pl5pl20320pl20pl20pl20川20320川10pl
4.电泳:浓缩胶80V,约20分钟,分离胶100V,约1小时。
四、考马斯亮蓝染色
注:将提取的植物蛋白进行电泳,电泳后进行考马斯亮蓝染色。全细胞裂解液电泳后,进行
westernblot检测。
1.将电泳后的PAGE胶取出放入容器中,加入适量蒸偏水(以充分覆盖PAGE胶为
宜),加热至沸腾后5分钟,弃去蒸储水:
2.加入适量考马斯亮蓝染色液(液面覆盖凝胶即可)加热至沸腾后5分钟,弃染色液;
3.加入适量蒸储水,加热至沸腾后5分钟,弃蒸储水,重复此步骤至背景清晰。
4.观察拍照。
WesternBlot
溶液配制:
•配制500ml1XTBST溶液:
50mlTBST(ph8.3,10X)+450ml蒸储水
•配制100ml5%牛奶封闭液:4度保存
5克脱脂奶粉+100ml1XTBST
•配制100ml转膜缓冲液(甲醇):CW0044Tris-Glycine(ph8.3,10X)
1()mlTris-Glycine+20ml甲醇+70ml蒸锵水(4度保存)
一.转膜及染色
实验材料:NC膜、滤纸、转膜缓冲液、丽春红染色试剂
实验仪器、耗材:转膜仪
实验步骤:
1.电泳完成后,小心打开玻璃板,去除浓缩胶,将分离胶剥离后,放入转膜缓冲液中平衡。
2.用剪刀剪相同大
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