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文档简介
生物医药基地westernblot技术手册
1.westernblot主要试剂的配方
1.15义电泳缓冲液配方(IL)
Tris-Base15.1g
甘氨酸(Glycine)94g
SDS5g
留意事项:
a.加水时应尽量避开气泡的产生,否则会造成过多SDS的损耗。
b.配制好的溶液放于4度冰箱保存,使用时用纯水稀释至IX使用。
1.2IX转膜液配方[1L)
甘氨酸(Glycine)2.9g
Tris-Base5.8g
SDS0.37g
甲醇200ml
留意事项:
a.参加适量的纯水,用磁力转子将各组分溶解后参加甲醇溶液,最终
用纯水定容至1L(甲醇气味大,通风厨内配制,并留意戴口罩)。
b.加水时应尽量避开气泡的产生,否则会造成过多SDS的损耗。
1.310XTBS配方UL)
Tris-Base24.2g
NaCl80g
留意事项:
参加适量的纯水溶解各组分后,使用浓盐酸或浓氢氧化钠溶液调整
溶液的PH至7.6(一般溶解后溶液是偏碱的,所以选用浓盐酸调整
PH至7.6即可)。
b.使用PH计调整溶液的PH前,要依据说明书校准PH计。
c.PH调整至7.6后,用纯水定容至1L,使用时稀释10倍至1义使用。
d.配制TBST时,在1XTBS中依据1:1000的比例参加吐温20充分
混匀即可。
1.430%丙烯酰胺单体储存液配方(100ml)
丙烯酰胺(Acrylamide)29g
N,N、・亚甲双丙烯酰胺
(N,N'-MethyleneBisacrylamide)1g
留意事项:
a.将各组分溶于总体积为60ml的纯水中,加热至37C完全溶解,用
纯水定容至100ml。
b.用装0.45|im膜的滤器过滤,置于棕色瓶中保存于4℃冰箱保存。
c.丙烯酰胺有神经毒性,操作时戴手套,并留意不要造成试验台面
等的污染。
1.5上液(IMTris-HClPH=6.8)配方(50ml)
Tris-Base6.057g
三蒸水40ml
留意事项:用浓盐酸调整PH至6.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰
箱保存。
1.6下液fIMTris-HCl,pH8.8)[50ml)
Tris-Base9.08g
三蒸水40ml
留意事项:用浓盐酸调整PH至8.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰
箱保存。
2.WesternBlot主要流程
2.1蛋白样品的提取
2.1.1常用裂解液及其特点
产品编号POO13P00J3BP00I3CP0013DP0013EP0013G
Western及IP
产品名称RIPA裂解液(强)RIPA裂解液(中)RIPA裂解液(弱)NPT0裂解液SDS裂解液
细胞裂解液
1%NP-40,
1%TritonX-1%TritonX-100,1%1%NP-4O,0.5%
有效裂解成分0.25%!%NP-401%SDS
100deoxycholate,0.1%SDSdeoxycholate,0.1%SDS
deoxycholate
裂解强度温和强中温和温和强
对膜蛋白的提取一般很好较好一般一般很好
对胞浆蛋白的提取很好很好很好很好很好很好
对核蛋白的提取较好很好较好较好较好很好
胞浆磷酸化素门提取很好很好很好很好很好很好
细胞核转录因子提取很好很好很好很好很好很好
含蛋白酶抑制剂是是是是是是
含磷酸酯酶抑制剂是是是是是足
主要用途WB,IP.co-lPWB,IPWB.IPWB,IP,co-IPWB,IP.co-IPWB.ChIP
2.1.2医药基地常用蛋白质提取方法
(1)RIPA强裂解法:
a.取适量胰酶消化细胞[针对对贴壁细胞,悬浮细胞可省略此步),
收取细胞,PBS洗两遍,600g离心5min,尽量去除PBS,向细胞沉
淀中参加适量的预加了蛋白醐抑制剂PMSF的RIPA强裂解液(803
——200ul不等,依据自己细胞量的多少定)。
b.冰上裂解40min,每5min猛烈涡旋一次。
c.充分裂解后,14000rpm,4℃离心15min,将上清转至另一预冷的
EP管中(不要吸到管底的沉淀)。
留意事项:
a.整个过程尽量在冰上操作,由于蛋白在常温降解速度很快,而在
冰上则能显著的减慢这一过程。
b.PMSF有毒,留意戴手套,并留意不要造成试验台面等的污染。
(2)SDS煮沸法(此方法对Caspase家族切割条带具有特效):
a.收取细胞,PBS洗两遍,600g离心5min,尽量去除PBS。
b.向细胞沉淀中参加适量的预加了蛋白酶抑制剂PMSF的SDS裂解
液(80ul—2003不等,依据自己细胞量的多少定)。
c.将EP管放在加热器上95-100℃加热20min以上,加热至样品中的
核酸粘稠物(细胞内核酸)完全溶解为止。
d.充分裂解后,14000rpm,4℃离心15min,将上清转至另一预冷的
EP管中(不要吸到管底的沉淀)。
留意事项:
a.由于加热的温度很高为95℃,煮沸的全过程中,不要离开蛋白样
品,防止EP管炸开而损失蛋白样品,甚至蛋白样品被蒸干。具体技
巧与方法:放物体压住EP管,待加热时间快完毕时,停顿加热,冷
却到肯定时间,轻轻拿开物体,轻轻拿出EP管。
b.尽快将核酸粘稠物煮化,缩短提取蛋白时间。具体技巧与方法:
加热前适度涡旋,加热过程中用剪去尖端的枪头吹打样品。
c.提取的蛋白样品置于・20℃保存。
⑶细胞刮法(针对贴壁细胞)
a.倒掉培育基,PBS洗培育皿2次。
b.吸尽残留的PBS,参加预加了PMSF的SDS裂解液50-500U1,快速
用细胞刮将细胞刮下,并将裂解后的细胞转移到EP管中,其他步骤
同SDS煮沸法。
留意事项:整个过程尽量在冰上操作以减慢蛋白的降解。
2.2蛋白样品的定量
本试验室承受BCA法测定蛋白质浓度,具体步骤:
a.将各蛋白样品稀释20倍(依据自己蛋白样品的浓度可加大稀释倍
数)至总体积为40ul或以上,以供每个样品3个复孔。
b.将蛋白样品和蛋白标准品参加96孔板中,每孔10ul,每个样品3
个复孔。
c.配制显色液,充分混匀,参加96孔板,每孔lOOulo
d.37℃孵育30min,酶标仪检测吸光度。
留意事项:
a.尽量将样品加在96孔板的中间位置,避开酶标仪检测时的边缘效
应。
b.参加样品和显色液的过程中尽量避开气泡的产生。
c.选用准确度高的移液枪,尽量使用进口的枪头。
2.3SDS聚丙烯酰胺凝胶的配制
2.3.1不同浓度胶的最正确分别范围
SDS-分别胶浓度最正确分别范
6类胶50-150kD
8用胶30-90kD
10%胶20-80kD
|12%胶
12-60kD
15%胶10-40kD
2.3.2不同浓度胶的配制
成分配制不同体积SDS-分别股所需各成分的体积(若升)
_________6%胶5ml10ml15ml201nl30ml50nli
蒸藤水2.04.06.08.012.020.0
30%Acr-Bis(29:l)1.02.03.04.06.010.0
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%过硫酸铉0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0040.0080.0120.0160.0240.04
成分配制不同体积SDS-分别胶所需各成分的体积(圣升)
8%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸饱水1.73.356.710.016.7
30%Aci-Bis(29:l)1.32.74.05.38.013.3
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%过硫酸钺0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0030.0060.0090.0120.0180.03
成分配制不同体枳SDS-分别股所需各成分的体积(毫升)
10%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸徽水1.32.74.05.38.013.3
30%Acr-Bis(29:l)1.73.35.06.710.016.7
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%过疏酸钺0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
成分配制不同体积SDS-分别股所需各成分的体积(亮升)
12%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸懦水1.02.03.04.06.010.0
30%Acr-Bis(29:l)2.04.06.08.012.020.0
IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%过硫酸镣0.050.10.150.20.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
成分配制不同体积SDS-分别股所需各成分的体积(宅升)
15%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml
蒸馀水0.51.01.52.03.05.0
30%Acr-Bis(29:l)2.55.07.510.015.025.0
IMTris,pll8.81.93.85.77.611.419.0
10%SDS0.050.10.150.20.30.5
10%过硫酸核0.05|0.1|0.150.2I0.30.5
TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02
依据如下表格配制SDS-的浓缩胶(也称为积存胶、上层
胶)
成分配制不同体积SDS-浓缩股所需各成分的体积(定升)
8|10|
5%股2346
5.5|
蒸饰水1.42.12.74.16.8
30%Acr-Bis(29:l)0.330.50.671.01.31.7
IMTris,pH6.80.250.380.5|0.751.01.25
10%SDS0.020.030.040.060.080.1
10%过硫酸筱0.020.030.040.060.080.1
TEMED0.0020.0030.0040.0060.0080.01
2.4WesternBlot主要步骤
(1)样品制备(具体方法参见2.1.2)
进展Western杂交时还需设置内或外参照,通常用beta-actin和
GAPDHo
留意事项:一般上样20〜30pg已足够,如待检蛋白为低丰度蛋白,
可加大上样量至lOOgg,但电泳条带易拖尾,可制备亚细胞组份浓缩
目的蛋白或承受更敏感的检测方法。
(2)电泳分别(参照SDS-电泳方法)
留意事项:
a.胶版都是周密的玻璃器材,使用时轻拿轻放,制止将胶板放到烘
箱烘烤。
b.电泳槽和胶槽中的电泳液要充分,可以避开跑出“笑脸”和“哭
脸'。
C.依据试验者的样品数选择相应的泳道数,样品的两侧需参加蛋白
marker,便于剪切目的蛋白条带。剩余的泳道参加等体积的1XSDS
填充,以平衡盐离子电压,这样可以防止蛋白条带跑歪。两侧的蛋白
marker可选择不同的用量,然后依据蛋白marker的深和浅区分点样
的挨次。
d.WesternBlot中使用过的任何器材、试剂、仪器,全部要放归原位
或恢复到使用前的状态。
(3)转膜
杂交膜的选择是打算Westernblot成败的重要环节°应依据杂交
方案、被转移蛋白的特性以及分子大小等因素,选择适宜材质、孔径
和规格的杂交膜。用于Westernblot的膜主要有两种:硝酸纤维素膜
(NC)和PVDF膜(基地目前使用)。NC膜是蛋白印迹试验的标准固
相支持物,在低离子转移缓冲液的环境下,大多数带负电荷的蛋白质会
与膜发生疏水作用而高亲和力的结合在一起,但在非离子型的去污剂
作用下,结合的蛋白还可以被洗脱下来。依据被转移的蛋白分子量大
小,选择不同孔径的NC膜。由于随着膜孔径的不断减小,膜对低分
子量蛋白的结合就越结实。通常用0.45摩和0.2即两种规格的NC
膜。大于20kD的蛋白可用0.45pm的膜,小于20kD的蛋白就要用
0.2|im的膜了,如用0.45|xm的膜就会发生“Blowthrough”的现象。
PVDF膜灵敏度、区分率和蛋白亲和力比常规的膜要高,格外适合于
低分子量蛋白的检测。但PVDF膜在使用之前必需分别用纯甲醇、纯
水、转膜液浸泡饱和5mino
蛋白质常用的转移方法主要有两种:槽式湿转(基地目前使用)
和半干转移。前者操作简洁,转移效率高;而后者适用于大胶的蛋白
转移,所用缓冲液少。
操作步骤:
a.将胶浸于转移缓冲液中平衡10mino如检测小分子蛋白,可省略此
步,因小分子蛋白简洁集中出胶。
b.依据胶的大小剪取膜和滤纸6片,放入转移缓冲液中平衡lOmino
c.装配转移三明治:海绵+3层滤纸+胶+膜+3层滤纸+海绵,每层放
好后,用试管赶去气泡。切记:胶放于负极面(黑色面)。
d,将转移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面对黑色面),加转移缓
冲液,插上电极,选择稳流200mA,l-2h(依据分子量的大小打算电
泳时间)。留意:应再次检查“三明治”和电极是否装配正确,电源
是否接通。
e.转膜完毕后,切断电源,取出杂交膜
留意事项:
a.PVDF膜是比较贵重的试验用品,使用时要节约使用,依据胶的大
小来裁剪PVDF膜。
b.做“三明治”的过程中,膜与胶之间不能有气泡。
c.活化PVDF膜要充分,假设消灭点点白斑,说明活化不充分,需
要延长活化时间。
d,转膜液可回收4次使用,回收次数过多影响试验结果。
e.分子量大的蛋白需延长转膜时间,小分子量蛋白则可适当增加转
膜液中甲醇的比例。
f.转膜完毕后,将膜与胶接触的一面标记为正面。
(4)免疫杂交与显色
a.用25mlTBS洗膜5min,室温,摇动。
b.置膜于25ml封闭缓冲液中lh,室温,摇动。
c.15mlTBS/T洗3次(5min/T)。
d.参加适宜稀释度的一抗,室温孵育l-2h(一抗无法回收)或4℃
过夜(一抗可回收屡次),缓慢摇动。
留意事项:
a.一抗为贵重的试验用品,使用前必读:本试验室有比较齐全和充
分的抗体库,全部(或大局部)购置的抗体在基地OA系统中均有具
体资料记录,首先试验者需要在OA系统中确定基地购置了目的蛋白
相关的抗体,然后确定所购置的抗体的生产商以及货号,再依据这些
信息登陆相应生产商的网页,具体查阅试验者马上使用一抗的用途
(VCB、IP、Flow、IF等)、一抗来源(便于选择适宜的二抗)、目的
条带的分子量大小(便于依据蛋白marker剪切目的条带)、一抗的特
异性、一抗使用的稀释比例。把握这些资料前方能开头下一步的试验。
b
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