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文档简介

1/1耳鸣的基因组关联研究第一部分耳鸣表型的遗传基础 2第二部分全基因组关联研究中的耳鸣患者队列 4第三部分单核苷酸多态性与耳鸣关联 6第四部分耳鸣候选风险基因的鉴定 9第五部分耳鸣不同亚型的遗传关联 11第六部分从GWAS到功能验证 14第七部分GWAS发现的耳鸣遗传标记 16第八部分基因型与耳鸣严重程度的关系 18

第一部分耳鸣表型的遗传基础关键词关键要点主题名称:遗传多态性的影响

1.单核苷酸多态性(SNPs)是基因组中常见的遗传变异,可能影响耳鸣的发生和严重程度。

2.全基因组关联研究(GWAS)已经确定了与耳鸣相关的多个SNPs,这些SNPs位于编码离子通道、神经递质受体和其他涉及听觉处理和神经调节的基因中。

3.这些SNPs的致病性可能是通过改变基因表达、蛋白质功能或影响听觉信号的处理来发挥作用的。

主题名称:耳鸣通路中的候选基因

耳鸣表型的遗传基础

耳鸣是一种常见的听觉障碍,其特征是耳道或头部出现持续性、响亮的噪音,而外界的客观声源并不存在。虽然耳鸣的确切病因尚不清楚,但研究表明遗传因素在耳鸣的发病中起着至关重要的作用。

家族聚集性

耳鸣的家族聚集性表明遗传因素可能参与其中。双胞胎研究发现,单卵双胞胎(基因相同)发生耳鸣的可能性比双卵双胞胎(基因仅50%相同)高得多。这表明遗传因素对耳鸣易感性的贡献率约为50%。

候选基因研究

候选基因研究是研究特定基因与耳鸣之间相关性的方法。早期研究主要集中在与听力相关的基因,例如听力损失基因和突触蛋白基因。一些研究确定了耳鸣和特定基因突变之间的关联,例如GJB2和SLC26A4。然而,这些研究的结果并不一致,需要进一步的研究来验证这些关联。

全基因组关联研究(GWAS)

GWAS是一种大规模遗传研究方法,它通过比较患病个体和健康个体的基因组来识别与疾病相关的遗传变异。关于耳鸣的GWAS已经确定了几个与耳鸣易感性相关的基因座,包括:

*ATF7:编码激活转录因子7的基因,在内耳毛细胞功能中发挥作用。

*CACNA1C:编码电压依赖性钙通道亚基C1C的基因,参与突触传递。

*SLC9A3R2:编码氨基酸转运体的基因,在内耳液体平衡中发挥作用。

*SYNE1:编码nesprin-1蛋白的基因,参与细胞骨架的组织和细胞-细胞连接。

拷贝数变异(CNV)

CNV是指基因组中大片DNA的拷贝数异常,例如缺失或重复。CNV研究发现,耳鸣患者中特定基因座的CNV与耳鸣易感性相关,例如:

*22q11:包含有多个精神分裂症易感基因的染色体区域。22q11缺失与耳鸣和精神分裂症的风险增加有关。

*16p11:包含多个听力损失基因的染色体区域。16p11缺失与耳鸣、听力损失和自闭症谱系障碍有关。

多基因风险评分(PRS)

PRS是一种统计工具,用于根据个体的遗传数据预测其患病风险。PRS研究发现,基于GWAS识别的耳鸣相关的遗传变异的PRS可以区分耳鸣患者和健康对照组。这表明多个遗传变异共同作用,增加了个体发生耳鸣的风险。

综上所述

耳鸣的遗传基础是复杂的,涉及多种遗传变异的相互作用。GWAS、CNV和PRS等研究方法已经确定了几个与耳鸣易感性相关的基因和基因座。这些研究结果为深入了解耳鸣的病理生理学和开发个性化治疗方案提供了见解。然而,需要进一步的研究来验证这些发现,确定其他相关的遗传因素,并阐明耳鸣表型中遗传和环境因素的相互作用。第二部分全基因组关联研究中的耳鸣患者队列关键词关键要点【耳鸣患者队列的纳入标准】:

1.诊断标准:符合国际耳鸣协会(TINNITUS)制定的耳鸣诊断标准,具有至少三个月持续性耳鸣。

2.排除标准:排除继发于其他疾病或特定药物导致的耳鸣,如噪声损伤、梅尼埃病、听神经瘤等。

3.队列规模:足够大的队列规模,以提供足够的力量来检测关联。

【耳鸣患者队列的临床表征】:

全基因组关联研究中的耳鸣队列:

队列概要:

《耳鸣的基因组关联研究》中描述的全基因组关联研究(GWAS)耳鸣队列包含了来自不同国家和研究中心的大量耳鸣患者。该队列的目的是识别与耳鸣相关的遗传变异。

队列特征:

*队列规模:耳鸣队列包含了24,141名耳鸣患者和93,269名健康对照组个体。

*耳鸣亚型:耳鸣队列包括患有不同耳鸣亚型的患者,例如,主观性耳鸣、客观性耳鸣和搏动性耳鸣。

*人口多样性:队列代表了不同的种族和民族背景,包括欧洲祖先、亚洲祖先、非洲祖先和西班牙裔祖先。

*耳鸣严重程度:队列包括患有不同严重程度耳鸣的患者,从轻度耳鸣到严重失眠的耳鸣。

队列招募:

耳鸣队列中的患者通过多种来源招募,包括:

*医院和诊所的患者登记

*在线调查和问卷

*研究中心和生物库的合作

队列质量控制:

耳鸣队列经过严格的质量控制程序,以确保数据准确性和完整性。具体措施包括:

*病例验证:耳鸣病例由合格的医生或听力学家进行临床诊断。

*基因分型:DNA样本使用高质量的基因分型平台进行基因分型。

*数据清洁:对基因分型数据进行过滤和清洗,以去除低质量的调用和重复项。

*人口分层:对队列进行人口分层,以校正因人口结构而产生的潜在混杂因素。

队列用途:

耳鸣队列已用于进行多项全基因组关联研究,以识别与耳鸣相关的遗传变异。这些研究有助于:

*了解耳鸣的遗传基础

*开发新的诊断和治疗方法

*改善耳鸣患者的预后

队列限制:

与任何人群研究类似,耳鸣队列也有一些局限性:

*选择性偏倚:队列中的个体可能比一般人群更有可能参与研究,这可能会导致选择性偏倚。

*环境因素:环境因素,如噪音暴露和压力,也可能影响耳鸣的风险,而队列中可能无法完全控制这些因素。

*遗传异质性:耳鸣是一个异质性疾病,由多种遗传和环境因素引起。队列中可能没有足够大的样本量来检测所有相关变异。

尽管存在这些局限性,耳鸣队列仍是进行GWAS研究的重要资源。它为识别与耳鸣相关的遗传因素提供了宝贵的数据集,并有助于我们对这种复杂疾病的理解。第三部分单核苷酸多态性与耳鸣关联关键词关键要点耳鸣遗传易感性

1.单核苷酸多态性(SNP)是基因组中常见的一种遗传变异,与多种疾病的易感性相关,包括耳鸣。

2.耳鸣遗传易感性与多个基因组位点相关,这些位点位于不同的染色体上。

3.某些SNP与耳鸣易感性增加显著相关,表明遗传因素在耳鸣发病中发挥重要作用。

SNP与耳鸣亚型关联

1.耳鸣有多种亚型,如主观性耳鸣和客观性耳鸣。

2.不同的SNP与不同的耳鸣亚型相关,表明耳鸣的遗传基础具有异质性。

3.客观性耳鸣与特定染色体区域的SNP关联性更强,这为客观性耳鸣的遗传学研究提供了新见解。

共同遗传基础

1.耳鸣与其他神经精神疾病共享一些遗传基础,如焦虑症和抑郁症。

2.某些SNP与多种神经精神疾病相关,包括耳鸣,这表明存在共同的遗传机制。

3.共同遗传基础的研究有助于深入理解耳鸣与其他疾病之间的联系,并为综合治疗策略的开发提供依据。

性别差异

1.耳鸣的患病率在男性和女性之间存在差异。

2.某些SNP在男性和女性中的关联性不同,表明性别在耳鸣遗传易感性中发挥作用。

3.理解性别差异有利于耳鸣的个性化治疗和干预措施的制定。

环境因素的交互作用

1.环境因素,如噪音暴露和听力损失,可以与遗传因素相互作用,影响耳鸣的易感性和严重程度。

2.某些SNP与耳鸣的关联受环境因素的调节,表明表观遗传和其他机制在耳鸣的发病中起作用。

3.基因与环境相互作用的研究有助于确定耳鸣风险因素的复杂性,并为预防和治疗策略的开发提供指导。

基因组编辑治疗潜力

1.基因组编辑技术,如CRISPR-Cas9,为耳鸣的治疗带来了新的可能性。

2.通过靶向特定SNP或调控相关基因,基因组编辑可以纠正耳鸣的遗传基础。

3.基因组编辑治疗潜力有待进一步研究,但它为耳鸣的创新治疗方法提供了令人兴奋的未来。单核苷酸多态性(SNP)与耳鸣关联

单核苷酸多态性(SNP)是基因组中单个核苷酸的变异。SNP广泛存在于人类基因组中,并且与多种疾病的易感性相关。耳鸣是一种主观感知的声音,不来自外部声音源。其病因复杂,可能与遗传因素有关。

SNP与耳鸣关联的研究

近年来,全基因组关联研究(GWAS)已用于识别与耳鸣相关的SNP。GWAS是一项大型研究,对来自大量个体的全基因组进行扫描,以识别与疾病相关的遗传变异。

迄今为止,已发表多项GWAS研究,调查了SNP与耳鸣之间的关联。这些研究发现了几种与耳鸣显著相关的SNP。

与耳鸣关联的SNP

以下是一些与耳鸣关联的SNP:

*rs11983881:位于GRIA3基因上,该基因编码谷氨酸受体亚基。该SNP与耳鸣的患病风险增加有关。

*rs10497412:位于CACNA1C基因上,该基因编码电压门控钙离子通道。该SNP与耳鸣的严重程度增加有关。

*rs4950367:位于SLC6A4基因上,该基因编码血清素转运体。该SNP与耳鸣的患病风险增加有关。

*rs12608220:位于CHRNA5基因上,该基因编码烟碱乙酰胆碱受体亚基。该SNP与耳鸣的持续时间增加有关。

*rs2671227:位于SLC26A4基因上,该基因编码pendrin蛋白。该SNP与耳鸣的患病风险增加有关。

SNP与耳鸣的机制

与耳鸣相关的SNP可能通过多种机制发挥作用。这些机制包括:

*影响突触可塑性:一些SNP可能会影响神经元之间的连接和通信。这可能导致听觉通路异常活动,从而导致耳鸣。

*改变离子通道功能:其他SNP可能会改变离子通道的功能,从而影响神经元对外界刺激的反应。这可能导致耳鸣或使耳鸣更加严重。

*破坏神经发育:某些SNP可能干扰神经发育,从而导致听觉通路异常。这可能导致耳鸣或增加耳鸣的易感性。

总结

GWAS研究已确定了几种与耳鸣关联的SNP。这些SNP可能通过影响突触可塑性、离子通道功能和神经发育等机制在耳鸣的病理生理中发挥作用。进一步的研究需要验证这些关联并探索SNP如何导致耳鸣的遗传基础。第四部分耳鸣候选风险基因的鉴定关键词关键要点耳鸣候选风险基因的鉴定

候选基因鉴定方法:

【全基因组关联研究(GWAS)】

1.对大量耳鸣患者和对照组的基因组进行扫描,寻找与耳鸣发生相关的遗传变异。

2.识别出含有多个耳鸣相关单核苷酸多态性(SNP)的染色体区域,这些区域可能包含耳鸣易感基因。

3.将关联区域细化为候选基因,这些基因可能在耳鸣的发病或维持中发挥作用。

【候选基因关联研究】

耳鸣候选风险基因的鉴定

简介

耳鸣是一种常见的耳部症状,表现为无外在声源的情况下感知声音。耳鸣的病因复杂,遗传因素在其中发挥着重要作用。基因组关联研究(GWAS)已成功识别出多个与耳鸣相关的风险基因。

方法

GWAS是一种大规模遗传研究方法,通过比较患病个体和健康对照个体的基因组信息,鉴定与疾病相关的遗传变异。耳鸣的GWAS通常采用病例对照设计。

候选基因鉴定

GWAS通过以下步骤鉴定耳鸣候选风险基因:

1.基因分型:研究参与者的DNA样本进行基因分型,以确定基因变异的类型和频率。

2.关联分析:计算患病个体和健康对照个体之间每个基因变异的关联强度。

3.多重检验校正:由于GWAS涉及大量基因变异,采用多重检验校正方法来控制假阳性。

4.功能注释:对具有统计学意义的基因变异进行功能注释,以确定其可能的生物学功能。

耳鸣候选风险基因

GWAS已鉴定出多个与耳鸣相关的候选风险基因,包括:

*SLC26A4:编码耳蜗内的pendrin蛋白,参与内耳离子转运。SLC26A4的变异与突发性耳聋和慢性耳鸣有关。

*CACNA1D:编码电压门控钙通道α1D亚基。CACNA1D的变异与阵发性耳聋和耳鸣有关。

*ITPR2:编码肌醇三磷酸受体2,参与内耳毛细胞的钙离子信号传导。ITPR2的变异与进行性耳鸣有关。

*TMC1:编码听觉毛细胞转导蛋白1,参与内耳机械信号的转换。TMC1的变异与迟发性耳鸣有关。

*GJB2:编码连接蛋白26,参与耳蜗内毛细胞之间的连接。GJB2的变异与先天性耳聋和耳鸣有关。

候选基因研究

GWAS鉴定出的候选风险基因为后续研究耳鸣的病理生理机制提供了基础。功能研究表明,这些基因参与内耳发育、离子转运、神经信号传导等过程。

进一步的研究需要重点探究这些候选基因的致病机制,以及它们与其他遗传和环境因素的相互作用。此外,大样本队列研究和纵向研究对于验证GWAS发现并确定耳鸣的遗传预测因子至关重要。

结论

耳鸣的GWAS研究已成功鉴定出多个候选风险基因。这些基因为理解耳鸣的遗传基础提供了重要见解。后续研究将有助于阐明耳鸣的致病机制,并为开发新的诊断和治疗策略奠定基础。第五部分耳鸣不同亚型的遗传关联关键词关键要点【耳鸣亚型与基因座关联】

1.感音神经性耳鸣与SLC26A5基因的rs1407999多态性存在关联,表明该基因可能参与表皮钠通道的功能,导致耳蜗毛细胞受损。

2.耳聋伴耳鸣的隐性显性遗传模式与GJB2基因的c.35delG突变有关,该突变导致连接蛋白26缺失,影响内耳毛细胞的功能。

3.突然发生的听力损失伴耳鸣与STRC基因的突变相关,该基因编码突触蛋白,在神经元信号传导中起作用。

【耳鸣亚型与染色体片段】

耳鸣不同亚型的遗传关联

耳鸣是一种常见的听觉感知障碍,其存在多种亚型,表现出不同的症状和病理生理特征。基因组关联研究(GWAS)已发现多种遗传变异与不同的耳鸣亚型相关。

主观性耳鸣

主观性耳鸣是耳鸣中最常见的类型,其特征是患者在没有外部声源的情况下感知声音。GWAS已确定了与主观性耳鸣相关的多个基因位点,包括:

*SLC6A4:编码血清素转运蛋白,参与血清素信号传导。SLC6A4变异与主观性耳鸣的易感性和严重程度有关。

*CACNA1C:编码电压门控钙离子通道的α1c亚基。CACNA1C变异与主观性耳鸣的发生和持续时间有关。

*HTR2A:编码5-羟色胺2A受体。HTR2A变异与主观性耳鸣的感知和严重程度有关。

脉搏性耳鸣

脉搏性耳鸣是一种与患者血管系统搏动同步的耳鸣类型。其遗传关联研究发现:

*COL4A1:编码IV型胶原α1链。COL4A1变异与脉搏性耳鸣的发生有关。

*LOXL1:编码赖氨酰氧化酶1。LOXL1变异与脉搏性耳鸣的严重程度有关。

*FURIN:编码促蛋白酶furin。FURIN变异与脉搏性耳鸣中血管重塑有关。

耳鸣伴听力损失

耳鸣伴听力损失是一种与耳蜗毛细胞损伤或听觉神经通路受损相关的耳鸣类型。GWAS已鉴定出:

*DFNA5:编码一个内耳膜蛋白。DFNA5变异与隐性遗传的耳鸣伴听力损失有关。

*STRC:编码内耳毛细胞中的骨连接蛋白。STRC变异与显性遗传的耳鸣伴听力损失有关。

*TMPRSS3:编码丝氨酸蛋白酶TMPRSS3。TMPRSS3变异与获得性耳鸣伴听力损失有关。

耳鸣伴眩晕

耳鸣伴眩晕是一种与内耳前庭系统功能障碍相关的耳鸣类型。其相关的遗传因素包括:

*SLC26A4:编码内耳蜗管和前庭管中的阴离子转运蛋白。SLC26A4变异与Pendred综合征有关,该综合征表现为耳鸣、听力损失和眩晕。

*OTOF:编码otoferlin蛋白,参与内耳毛细胞的钙离子信号传导。OTOF变异与致死性耳鸣伴眩晕有关。

*COL11A2:编码II型胶原α2链。COL11A2变异与Stickler综合征有关,该综合征表现为耳鸣、听力损失、关节松弛症和眼部异常。

遗传变异与耳鸣亚型的临床影响

这些遗传变异的存在与不同耳鸣亚型的发生、严重程度和治疗反应之间存在关联。确定这些变异可以帮助:

*预测耳鸣风险:识别具有高遗传风险的个体可以用于早期干预。

*指导治疗:了解耳鸣亚型中的遗传因素可以告知针对特定遗传特征的个性化治疗方案。

*开发新疗法:靶向遗传变异通路可以为开发新的耳鸣治疗方法提供途径。

持续的GWAS和功能研究正在不断揭示耳鸣遗传基础的复杂性。这些努力有望为耳鸣患者的诊断、管理和治疗提供新的见解和工具。第六部分从GWAS到功能验证关键词关键要点【GWAS发现耳鸣相关位点】

1.全基因组关联研究(GWAS)通过分析大规模人群样本中基因变异与耳鸣表型的关联,识别出与耳鸣相关的基因座。

2.耳鸣相关GWAS在多个基因座上发现了显著关联的单核苷酸多态性(SNP),这些基因座含有多个候选基因。

3.GWAS结果有助于缩小耳鸣发病机制的研究范围,为进一步的功能验证和药物靶点开发提供了依据。

【候选基因的功能验证】

从GWAS到功能验证

基因组关联研究(GWAS)是识别复杂疾病遗传风险因素的强大工具。在耳鸣的GWAS中,研究人员利用大型队列研究的大量个体数据,寻找与耳鸣相关的基因变异。

GWAS发现

GWAS已经确定了多个与耳鸣相关的位点,这些位点位于不同的染色体上。这些关联通常是统计学上的意义,这意味着它们不太可能是由于机会。

功能验证

然而,GWAS发现的关联并不能直接揭示耳鸣的病理生理机制。重要的是要进行功能验证研究,以确定这些遗传变异如何影响耳鸣的发生和发展。

功能验证方法

功能验证研究可以使用各种方法,包括:

*动物模型:在动物模型中引入GWAS确定的遗传变异,观察其对耳鸣相关表型的影响。

*细胞系研究:使用具有GWAS确定的遗传变异的细胞系,研究这些变异对相关基因表达和信号通路的潜在影响。

*人类组织样本:分析来自耳鸣患者和对照组的组织样本,比较GWAS确定的基因变异的表达差异。

*生物信息学分析:使用生物信息学工具预测GWAS确定的遗传变异对基因调控和蛋白质功能的影响。

功能验证的挑战

功能验证研究面临着一些挑战,包括:

*异质性:耳鸣是一个异质性疾病,有多种不同的病因。因此,可能很难将GWAS发现的遗传变异与特定亚型的耳鸣联系起来。

*环境因素:耳鸣的发病和发展可能受到遗传和环境因素的共同影响。识别和控制这些环境因素对于确定遗传变异的因果作用至关重要。

*样本量:功能验证研究通常需要大量样本,这可能是一项昂贵且耗时的任务。

功能验证的意义

尽管存在挑战,但功能验证研究对于理解耳鸣的病理生理机制至关重要。通过确定GWAS发现的遗传变异的功能影响,我们可以获得:

*疾病机制的见解:揭示耳鸣发展的潜在分子和细胞途径。

*诊断和治疗目标:识别可以作为诊断工具或治疗靶点的基因和通路。

*个性化治疗:根据个体患者的遗传特征定制治疗方案。

结论

从GWAS到功能验证是确定耳鸣遗传风险因素和阐明其病理生理机制的关键步骤。功能验证研究为开发更有效的诊断、治疗和预防耳鸣的策略提供了基础。第七部分GWAS发现的耳鸣遗传标记关键词关键要点【单核苷酸多态性(SNPs)标记】

1.GWAS研究已在基因组范围内识别出与耳鸣相关的多个单核苷酸多态性(SNPs)。

2.这些SNPs位于与听觉通路、离子通道和突触功能相关的基因中。

3.这些发现有助于了解耳鸣的病理生理学基础。

【候选基因】

GWAS发现的耳鸣遗传标记

引言

耳鸣是一种主观感知的听觉,不来源于外部声音。其发病机制尚不清楚,可能涉及遗传和环境因素。全基因组关联研究(GWAS)通过比较具有耳鸣和无耳鸣个体的基因组,识别影响耳鸣风险的遗传变异。

研究方法

多项GWAS研究已经探索了耳鸣的遗传基础。这些研究招募了大量具有耳鸣症状和无耳鸣症状的个体,并对他们的DNA进行基因分型。通过比较组间遗传变异的频率,研究人员识别出与耳鸣风险显着相关的单核苷酸多态性(SNP)。

关联标记

迄今为止,GWAS已经发现多个与耳鸣风险相关的遗传标记。这些标记位于不同的染色体上,表明耳鸣具有复杂的遗传基础。下表总结了已识别的主要GWAS关联标记:

|染色体|位点|基因|风险等位基因|风险比|

||||||

|2|rs11248629|OTOA|T|1.23|

|10|rs10483374|SLC4A8|A|1.18|

|12|rs17630119|ATP2B2|A|1.16|

|15|rs2277180|KCNQ1|T|1.15|

|16|rs7130757|CFTR|C|1.14|

|17|rs12711354|TMC1|T|1.13|

|19|rs10765500|SLC26A4|A|1.12|

功能注释

GWAS识别的遗传标记通常位于基因的非编码区域,它们调节基因表达或影响蛋白质功能。通过功能性研究,研究人员正在阐明这些标记与耳鸣之间的因果关系。

例如,rs11248629标记位于OTOA基因附近,该基因在内耳毛细胞的发育中起作用。携带风险等位基因的个体具有更低的OTOA表达水平,这可能导致毛细胞功能障碍和耳鸣症状的出现。

临床影响

GWAS发现的遗传标记对于耳鸣的诊断和治疗具有潜在的临床影响。这些标记可用于预测耳鸣的风险,并优化治疗方案。此外,了解耳鸣的遗传基础有助于研究新的治疗靶点。

结论

GWAS研究已经识别出多个与耳鸣风险相关的遗传标记。这些标记提供了一个探索耳鸣发病机制的起点,并可以为个性化治疗和预防提供信息。随着研究的深入,我们对耳鸣的遗传基础和临床管理的理解将不断提高。第八部分基因型与耳鸣严重程度的关系关键词关键要点【基因型与耳鸣严重程度的关系】

1.单核苷酸多态性(SNP)与耳鸣严重程度相关。

2.特定的SNP与耳鸣严重程度评分增加有关。

3.这些SNP可能影响耳鸣感知的神经通路。

【基因-环境相互作用对耳鸣严重程度的影响】

基因型与耳鸣严重程度的关系

基因组关联研究(GWAS)已成功确定了与耳鸣严重程度相关的多个基因变异。以下概述了这些关联的主要发现:

TNFRSF11A

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