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文档简介
分子生物学chapter4DNA复制Chapter4TheReplicationofDNA
Chapter8ofthebook分子生物学chapter4DNA复制IntroductionWhenwilltheDNAreplicationhappen?
分子生物学chapter4DNA复制DNA复制在细胞周期的S期E.coli37℃0.5h105bp/minmammaliancell500-5000bp/min分子生物学chapter4DNA复制(4)细菌(E.coli)DNA每个细胞周期只复制一次分子生物学chapter4DNA复制1、Semi-ConservativeReplication
1958Meselson-stahl设计的CsCl超离心试验证实了
DNA复制的这一特性概念:复制过程中各以双螺旋DNA的其中一条链为模
板合成其互补链,新生的互补链与母链构成子
代DNA分子分子生物学chapter4DNA复制15N标记实验·细胞生长在15N标记培养基中·转入正常N源培养基中·分离各代DNA·分析各代DNA的浮力密度15N标记DNA未标记DNACsCL密度梯度离心浮力密度
N15-DNA1.742g/mlN15-N14-DNA1.717g/mlN14-DNA1.710g/ml分子生物学chapter4DNA复制
聚合反应:substrate--dNTPPoly(核苷酸)n-3’-OH+dNTP→
Poly(核苷酸)n+1-3’-OH+
2Pi分子生物学chapter4DNA复制Thedirectionofreplication分子生物学chapter4DNA复制分子生物学chapter4DNA复制CorrectlypairedbasesarerequiredforDNA-polymerase-catalyzednucleotideaddition分子生物学chapter4DNA复制子链DNA延伸方向只能是5’-3’5’OHTCATCAC5’OH3’ppp
OH
C++
ppi
分子生物学chapter4DNA复制
如果DNA的延伸方向是3’→5’
ATCG
+5’pppOH3’GpppOHGATCG5’pppOH3’ATCG
+5’pppOH3’GpppOH
G
5’
pppa、因能量的需要,
DNA的5’端必须带有PPP游离dNTP具有ppppppOH3’ATCG
在0.2MNacl的生理环境中,使dNTP难以聚合到DNA的5’端
需要其他机制以解脱
分子生物学chapter4DNA复制TheinitiationofanewstrandofDNArequiresanRNAprimer(primase)DNAhelicasesunwindthedoublehelixinadvanceofthereplicationforkSingle-strandedDNA-bindingproteinsstabilizessDNApriortoreplicationTopoisomerasesremovesupercoilsproducedbyDNAunwindingatthereplicationforkDNApolymeraseextendtheDNAchainTable8-1(factorsinvolvedinthereplication)分子生物学chapter4DNA复制1)、解螺旋酶(helicase):又称解旋酶,通过水解ATP获得能量,解开DNA双链.
2).
单链结合蛋白(SSB):结合在DNA单链上,有时有协同效应.3)、
DNA旋转酶:消除复制叉前进过程中产生的正超螺旋,产生负超螺旋.分子生物学chapter4DNA复制TheinitiationofDNAreplication分子生物学chapter4DNA复制(1)OriCinE.colichromosomalDNA♦四个9bp的重复序列
dnaA结合位点♦三个13bp的重复序列若干GATC位点分子生物学chapter4DNA复制酵母菌的复制起点称为ARS(autonomouslyreplicatingsequence),有100多个bp。ARS包括一个共有序列(A)和附加元件(B1~B3)。A功能域为ARS的中心,可能是起始蛋白的结合位点。A的序列为(T/A)AAATA(T/C)AAA(T/A);A元件在芽殖酵母中高度保守,是复制起始所必需的。其中有富含AT的11bp序列是复制起始识别复合物(originrecognitioncomplex,ORC)结合复制起始位点所必需的,对起始因子在复制起始位点的组装起基本作用。分子生物学chapter4DNA复制Replicationfork
真核生物(Eukaryote):多复制起点即--一个genome中有多个复制单位分子生物学chapter4DNA复制分子生物学chapter4DNA复制TheinitiationofDNAreplicationDnaAistheinitiator分子生物学chapter4DNA复制primaseanRNAenzymeinvolvedinthereplicationofDNA.PrimasecatalyzesthesynthesisofashortRNAsegment(calledaprimer)complementarytoassDNAtemplate.noknownDNApolymerasescaninitiatethesynthesisofaDNAstrandwithoutaninitialRNAorDNAprimer分子生物学chapter4DNA复制
引发体(包括引发酶)pppRNA引物DNApolymeraseIIIpppDNApolymeraseIDNApolymeraseIDNAligase分子生物学chapter4DNA复制
DNALigase
所需条件:
a、
切刻的3’-OH和5’-P相邻
b、
切刻各自碱基处于配对状态
c、需要能量原核(ATP、NAD)真核(ATP)
用途:复制过程中,5’端RNA引物被置换后切刻的连接修复、重组分子生物学chapter4DNA复制DNApolymerase分子生物学chapter4DNA复制
三种DNA聚合酶的结构和功能分子生物学chapter4DNA复制3’-5’exonucleaseactivity(polymeraseI,II,III)
校对功能(proofreading)分子生物学chapter4DNA复制
5’-3’
exonucleaseactivity(polymeraseI,III)
DNApolⅠ的5’-3’外切活性有以下三个特点:
♦必须有5’-磷酸末端♦被除去的核苷酸必须是已经配对的♦被除去的可以是脱氧核糖核苷酸,也可以是核糖核苷酸(切刻平移)分子生物学chapter4DNA复制
其中DNApolⅢ
全酶有十种共22个亚基β二聚体--滑动钳分子生物学chapter4DNA复制分子生物学chapter4DNA复制InteractionbetweenDNAandDNApolymerase分子生物学chapter4DNA复制TheinitiationofDNAsynthesisinE.coli分子生物学chapter4DNA复制分子生物学chapter4DNA复制
2、真核生物的DNA聚合酶
α、β、δ、ε、γ五种
位置核内核内核内核内
线粒体
合成
与引发修复合成合成,修复复制功能酶结合前导链
后随链3’-5’校NONOYesYesYes正活性
α
β
δ
ε
γ分子生物学chapter4DNA复制Activationofthepre-RCleadstotheassemblyoftheeukaryoticreplicationfork分子生物学chapter4DNA复制Theactivationofpre-RCsistightlyregulatedbycyclin-dependentkinases(Cdks)分子生物学chapter4DNA复制
(3)复制终止a、终止序列
E.coli有两个终止区域,分别结合专一性的终止蛋白
序列一:terEterDterA
序列二:terFterBterC
每个区域只对一个方向的复制叉起作用分子生物学chapter4DNA复制分子生物学chapter4DNA复制
b、专一性终止蛋白
E.coli中由tusgene编码(terminusutilizationsubstance)通过抑制DNA螺旋酶而发挥终止作用每次复制时只使用一个终止位点ter分子生物学chapter4DNA复制5、复制忠实性的保证
1、DNApol的3’5’外切酶活性
(exonucleaseactivity)
2、DNApol只能从引物的3’
端延伸DNA
(需要RNA引物)
a、碱基配对协同性导致最初几个碱基错配率高,且不易校正
b、RNA引物最终被降解而避免错误
3、后随链的不连续合成因其有利于错配碱基的校正分子生物学chapter4DNA复制
3.6.真核生物DNA的复制(DNAreplicationinEukaryote)
分子生物学chapter4DNA复制
3.真核生物DNA复制的引发酶
●DNApolα+primase形成紧密的复合物
6-9NtRNAasprimer
●引发酶(primase):50-60kd
●作用方式为阵发性的,每次作用拷贝6~15个核苷酸
●既能利用NTP,又能利用dNTP
●SV40体外DNA复制情况分析
分子生物学chapter4DNA复制端粒位于真核生物染色体DNA的3’末端,由独特的DNA重复序列及相关蛋白组成的复合体。端粒的功能:①维持染色体的完整性,决定细胞的寿命。若无端粒,两个染色体末端很可能融合一起。②解决末端复制问题,端粒酶能与端粒作用,延伸其长度。端粒的结构①DNA端粒由简单的串联重复序列组成人和其他脊椎动物:AGGGTT纤毛原生动物四膜虫:GGGGTT和GGGGTTTT面包酵母:G1-3T和G1-5A共同特点:富含G;长度达几百到几kb;人类DNA端粒长几kb到几十kb。分子生物学chapter4DNA复制端粒酶(Telomerase)是催化端粒合成的酶。它是由一条RNA和多种蛋白质构成的核糖核蛋白复合体。端粒酶中的蛋白部份具有逆转录酶活性,能以其自身携带的RNA为模板逆转录合成端粒DNA。分子生物学chapter4DNA复制端粒酶的作用机制:端粒酶的RNA分子与端粒DNA配对,以RNA为模板进行类似逆转录合成DNA,向5’→3’延伸端粒至模板RNA末端后,延长的DNA末端与RNA模板解离,端粒酶移动,重新定位于延长后的DNA3’端,开始下一轮延长过程,如此反复可达数百次合成几百个或数千个重复序列。(3)补齐过程
通过TG链的回折形成发夹结构(G·G氢键)---尺蠖模型
→→实现端粒酶位置的调整分子生物学chapter4DNA复制大多数体细胞不合成端粒酶,每次分裂后端粒就变短(约30~200bp)。当端粒比正常的长度短数kb时细胞就不再分裂。所以端粒变短是一种老化的象征。实验证明将端粒酶加进体细胞,可以增加体细胞分裂次数。癌细胞主要特性是能无限期的分裂增生,这需要不断表达端粒酶。实验发现癌细胞的端粒酶活性很强。这点可被用来检验癌细胞。分子生物学chapter4DNA复制实验表明--人体细胞通过监测失去的端粒的重复数而计数细胞分裂次数,当端粒长度下降到某一临界值时,细胞终止分裂---衰老、死亡“多莉”的衰老
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